2018 Déterminer si des jeux d'exons particuliers sont au sein des mêmes isochores, TADs et/ou LADs. (Finished)
Porteur du projet
Didier Auboeuf.
Personnes
Jean-Baptiste Claude, Sébastien Lemaire, Didier Auboeuf.
Problématique biologique
Déterminer si des jeux d'exons particuliers sont au sein des mêmes isochores, TADs et/ou LADs.
Questions
Nous avons défini des listes d'exons étant régulés par 33 facteurs d'épissage différents ainsi que leur appartenance à des isochores, TADs ou LADs. Nous aimerions savoir si des exons régulés par un même facteur d'épissage ont une probabilité plus importante qu'au hasard, d'être présents dans le même isochore, le même TAD ou le même LAD.
Données
Table indiquant, pour chaque exon du génome humain s'il appartient à tel ou tel isochore, LAD et TAD. Liste des exons régulés par chaque facteur d'épissage.
Date
La date du début du projet: 10/12/2018
La date d’obtention des données: 6/12/2018
La date d’obtention de l’intégralité des données. 6/12/2018
La date souhaitée de fin du projet. 28/12/2018
Attentes
Analyse statistique.