====== Bismark ======

  * A tool to map bisulfite converted sequence reads and determine cytosine methylation states


^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^
|  0.18.0  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/Bismark/0.18.0/bin/  |
| | **modulefile** : Bismark/0.18.0  |||
|  0.15.0  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/Bismark/0.15.0/bin/  |
| | **modulefile** : Bismark/0.15.0  |||

Pour utiliser les modulefiles, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]]




==== Doc Admin-sys PSMN ====

   * Dépendances sur ''Bowtie/2.3.3'' et ''SAMtools/1.6'' incluses dans les modulefile ''Bismark/0.18.0'' et ''Bismark/0.15.0''.





===== Site officiel =====

  * https://github.com/FelixKrueger/Bismark
  * http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/bismark/