====== breseq ======

  * a computational pipeline for finding mutations relative to a reference sequence in short-read DNA re-sequencing data for haploid microbial-sized genomes. 

^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^
|  0.32.0  |  N/A  |  N/A  |  ''${APPLIS}/Core/breseq/0.32.0''  |  Debian 9  |
| | **modulefile** : ''breseq/0.32.0''  ||||

Pour utiliser les modulefiles, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]]

<code bash>APPLIS=/applis/PSMN/debian9/software</code>


==== Doc Admin-sys PSMN ====

  * http://barricklab.org/twiki/pub/Lab/ToolsBacterialGenomeResequencing/documentation/index.html

Dépendances sur ''Bowtie2/2.3.3'' et ''R/3.4.3'' inclusent dans le modulefile.


===== Site officiel =====

  * http://barricklab.org/twiki/bin/view/Lab/ToolsBacterialGenomeResequencing
  * https://github.com/barricklab/breseq