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documentation:examples:modules [2015/01/06 13:26] – modification externe 127.0.0.1documentation:examples:modules [2023/01/13 09:37] (Version actuelle) – supprimée ccalugar
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-====== Environment Modules ====== 
  
-<note important>Disponible uniquement sur Debian7</note> 
- 
-===== Usage ===== 
- 
-  * Charger l'environnement du PSMN 
-<code> 
-module use /usr/local/Modules 
-</code> 
- 
-  * Lister les modules disponibles 
-<code> 
-module avail 
-</code> 
- 
-  * Charger un module (commande utilisable dans un script) 
-<code> 
-module use soft/version 
-</code> 
- 
- 
-===== Modules disponibles (Novembre 2014) ===== 
- 
-<code> 
-~$ module avail 
- 
----------------------------- /applis/PSMN/Modules ----------------------------- 
-ADF/2010.02                                    FastTree/2.1.7                                 Primer3/2.3.4 
-ADF/2012.01                                    GMAP/2014-10-22                                R/2.15.1 
-ADF/2013.01                                    Gaussian/g03-lasim                             R/3.0.2 
-ADF/2013.01.intelmpi                           Gaussian/g09-chimie                            RSeQC/2.3.1 
-ADF/2013.01.platformmpi                        Gaussian/g09-geol                              RSeQC/2.3.3 
-Abinit/7.2.1-gnu-4.7.2-x86_64                  Gaussian/g09c01-chimie                         SAMtools/1.1 
-Abinit/7.6.4                                   Gaussian/g09c01-geol                           Spinevolution/3.4.4 
-AllPathsLG/r42874-gnu-4.7.1                    Gaussian/g09c01-icbms                          Spinevolution/3.4.5 
-Amber/12-intel-14.0.1-openmp                   Gaussian/g09d01-chimie                         Trinity/r2012-06-08 
-Amber/12-intel-14.0.1-openmpi-1.6.4            Gaussian/g09d01-geol                           Trinity/r20140413 
-Amber/12-intel-14.0.1-openmpi-1.6.4-K20-DPDP   Gaussian/g09d01-icbms                          Trinity/r20140717 
-Amber/12-intel-14.0.1-openmpi-1.6.4-K20-SPFP   Gaussian/g09d01-lasim                          VASP/4.6.36-gnu-4.7.2 
-Amber/12-intel-14.0.1-openmpi-1.6.4-M2070-DPDP HTSeq/0.5.3p3                                  VASP/5.3.2-intel-11.1-debian7 
-Amber/12-intel-14.0.1-openmpi-1.6.4-M2070-SPFP HTSeq/0.5.3p9                                  VASP/5.3.3-gnu-4.7.2 
-Amber/12-intel-14.0.1-seq                      HTSlib/1.1                                     VASP/5.3.3-intel-14.0.1-debian7 
-Amber/12-intel-14.0.1-seq-K20-DPDP             Lammps/11Nov13-mpi-1.6.4-intel-14.0.1          VASP/5.3.5-intel-14.0.1-debian7 
-Amber/12-intel-14.0.1-seq-K20-SPFP             Lammps/28Jun14-mpi-1.6.4-intel-14.0.1          VESTA/3.1.7 
-Amber/12-intel-14.0.1-seq-M2070-DPDP           MAFFT/7.187                                    VMD/1.9.1 
-Amber/12-intel-14.0.1-seq-M2070-SPFP           MIRA/4.0.2                                     Velvet/1.2.10 
-BCFtools/1.1                                   Matlab/R2011b                                  aTRAM/1.01 
-BLAT/35                                        Molden/5.0.6                                   fftw/3.3.3-intel-14.0.1 
-Base/debian7                                   Molpro/2010.1-intel-14.0.1                     fftw/3.3.3-intel-14.0.1-mpi-1.6.4 
-Base/psmn                                      Molpro/2010.1-intel-14.0.1-openmp              fftw/3.3.3-intel-14.0.1-openmp 
-Base/sge                                       MrBayes/3.2.1-intel-mpi                        intel/11.1.069 
-Base/test                                      MrBayes/3.2.1-intel-seq                        intel/12.0.084 
-Bowtie/0.12.7                                  Oases/0.2.8                                    intel/14.0.1 
-Bowtie/2.0.2                                   OpenAlea/svn-r4239                             modules.psmn 
-CP2K/2.2.426                                   ParaView/3.12.0                                openmpi/1.4.1-intel-11.1.069 
-CP2K/2.5.1                                     ParaView/4.0.1                                 openmpi/1.4.5-gnu-4.7.2 
-CP2K/2.5.1-complete                            PhyML/20120412                                 openmpi/1.5.4-gnu-4.7.2 
-CP2K/2.5.1-minimal                             PhyML/20140223                                 openmpi/1.5.4-intel-12.0.084 
-Cassandra/2.5.4                                PhyML/3.0                                      openmpi/1.6.4-gnu-4.7.2 
-Celera/WGS-7.0                                 Phylobayes/3.3b                                openmpi/1.6.4-intel-12.0.084 
-Corset/1.03                                    Phylobayes/3.3e                                openmpi/1.6.4-intel-14.0.1 
- 
-</code> 
documentation/examples/modules.1420550770.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)