Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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documentation:examples:tutorials_scripts [2018/01/08 15:12] – [Script de soumission tcsh parallèle] ltaulell | documentation:examples:tutorials_scripts [2018/01/08 15:16] – ltaulell | ||
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Ligne 111: | Ligne 111: | ||
#$ -V | #$ -V | ||
### mails en debut et fin d' | ### mails en debut et fin d' | ||
- | #$ -m be | + | #$ -m b |
+ | #$ -m e | ||
# donné par le système de batch | # donné par le système de batch | ||
Ligne 138: | Ligne 139: | ||
==== Script de soumission bash parallèle ==== | ==== Script de soumission bash parallèle ==== | ||
+ | |||
+ | <note warning> | ||
<code bash> qsub batch.sh</ | <code bash> qsub batch.sh</ | ||
Ligne 158: | Ligne 161: | ||
#$ -V | #$ -V | ||
### mails en debut et fin d' | ### mails en debut et fin d' | ||
- | #$ -m be | + | #$ -m b |
+ | #$ -m e | ||
# donné par le système de batch | # donné par le système de batch | ||
Ligne 168: | Ligne 172: | ||
### configurer l' | ### configurer l' | ||
- | source /usr/share/modules/init/bash | + | source /usr/share/lmod/lmod/init/bash |
- | module use / | + | |
- | module load Base/psmn | + | |
- | #module load intel/ | + | |
- | module load openmpi/ | + | |
### au besoin, forcer l'env OpenMPI | ### au besoin, forcer l'env OpenMPI | ||
Ligne 207: | Ligne 207: | ||
#$ -V | #$ -V | ||
### mails en debut et fin d' | ### mails en debut et fin d' | ||
- | #$ -m be | + | #$ -m b |
+ | #$ -m e | ||
# aller dans le repertoire de travail/ | # aller dans le repertoire de travail/ | ||
Ligne 214: | Ligne 215: | ||
### configurer l' | ### configurer l' | ||
- | source /usr/share/modules/init/tcsh | + | source /usr/share/lmod/lmod/init/tcsh |
- | module use / | + | |
- | module load Base/psmn | + | |
- | module load intel/ | + | |
### execution du programme | ### execution du programme | ||
Ligne 246: | Ligne 244: | ||
#$ -V | #$ -V | ||
### mails en debut et fin d' | ### mails en debut et fin d' | ||
- | #$ -m be | + | #$ -m b |
+ | #$ -m e | ||
# aller dans le repertoire de travail/ | # aller dans le repertoire de travail/ | ||
Ligne 253: | Ligne 252: | ||
### configurer l' | ### configurer l' | ||
- | source /usr/share/modules/init/bash | + | source /usr/share/lmod/lmod/init/bash |
- | module use / | + | |
- | module load Base/psmn | + | |
- | module load intel/ | + | |
### execution du programme | ### execution du programme | ||
Ligne 290: | Ligne 286: | ||
#$ -V | #$ -V | ||
### mails en debut et fin d' | ### mails en debut et fin d' | ||
- | #$ -m be | + | #$ -m b |
+ | #$ -m e | ||
# donné par le système de batch | # donné par le système de batch | ||
Ligne 300: | Ligne 297: | ||
### configurer l' | ### configurer l' | ||
- | source /usr/share/modules/init/tcsh | + | source /usr/share/lmod/lmod/init/tcsh |
- | module use / | + | |
- | module load Base/psmn | + | |
- | #module load intel/ | + | |
- | module load openmpi/ | + | |
### au besoin, forcer l'env OpenMPI | ### au besoin, forcer l'env OpenMPI | ||
Ligne 340: | Ligne 333: | ||
#$ -V | #$ -V | ||
### mails en debut et fin d' | ### mails en debut et fin d' | ||
- | #$ -m be | + | #$ -m b |
+ | #$ -m e | ||
# donné par le système de batch | # donné par le système de batch | ||
Ligne 350: | Ligne 344: | ||
### configurer l' | ### configurer l' | ||
- | source /usr/share/modules/init/bash | + | source /usr/share/lmod/lmod/init/bash |
- | module use / | + | |
- | module load Base/psmn | + | |
- | #module load intel/ | + | |
- | module load openmpi/ | + | |
### au besoin, forcer l'env OpenMPI | ### au besoin, forcer l'env OpenMPI |