Modules python

Python 3.8.3

 python3.8 -m pip list | awk '{print "  * "$0}' 
  • adjustText 0.7.3
  • alabaster 0.7.12
  • anndata 0.7.5
  • annoy 1.17.0
  • appdirs 1.4.4
  • asciitree 0.3.3
  • astroid 2.4.1
  • atomicwrites 1.4.0
  • attrs 19.3.0
  • autopep8 1.5.3
  • Babel 2.8.0
  • backcall 0.1.0
  • beniget 0.2.1
  • bigfloat 0.4.0
  • biopython 1.77
  • black 19.10b0
  • bleach 3.1.5
  • CacheControl 0.12.6
  • certifi 2020.6.20
  • cffi 1.14.0
  • chardet 3.0.4
  • click 7.1.2
  • cloudpickle 1.4.1
  • ClusterShell 1.8.3
  • cmake 3.17.3
  • coloredlogs 14.0
  • colormath 3.0.0
  • ConfigArgParse 1.2.3
  • cryptography 2.9.2
  • cutadapt 2.10
  • cycler 0.10.0
  • Cython 0.29.19
  • datrie 0.8.2
  • decorator 4.4.2
  • defusedxml 0.6.0
  • demuxEM 0.1.5.post1
  • DendroPy 4.4.0
  • diff-match-patch 20181111
  • dill 0.3.1.1
  • dnaio 0.4.2
  • docopt 0.6.2
  • docutils 0.16
  • drmaa 0.7.9
  • entrypoints 0.3
  • ete3 3.1.1
  • execo 2.6.4
  • fabio 0.10.2
  • fasteners 0.16
  • fbpca 1.0
  • fitsne 1.1.1
  • flake8 3.8.2
  • forceatlas2-python 1.1
  • freetype-py 2.1.0.post1
  • frozendict 1.2
  • future 0.18.2
  • gast 0.3.3
  • geosketch 1.2
  • gitdb 4.0.5
  • GitPython 3.1.2
  • gnureadline 8.0.0
  • gprof2dot 2019.11.30
  • gprofiler-official 1.0.0
  • graphviz 0.14
  • h5py 2.10.0
  • harmony-pytorch 0.1.5
  • hdf5plugin 2.3.0
  • hdf5storage 0.1.15
  • hdmedians 0.13
  • helpdev 0.7.1
  • hnswlib 0.5.0
  • HTSeq 0.12.4
  • humanfriendly 8.2
  • idna 2.9
  • imagecodecs 2020.5.30
  • imageio 2.8.0
  • imagesize 1.2.0
  • intel-openmp 2021.1.2
  • intervaltree 2.1.0
  • invoke 1.4.1
  • ipykernel 5.3.0
  • ipython 7.14.0
  • ipython-genutils 0.2.0
  • isort 4.3.21
  • jedi 0.15.2
  • jeepney 0.4.3
  • Jinja2 2.11.2
  • JIT 0.0.1
  • joblib 0.15.1
  • json5 0.9.5
  • jsonschema 3.2.0
  • jupyter-client 6.1.3
  • jupyter-console 6.1.0
  • jupyter-core 4.6.3
  • jupyterlab 2.1.4
  • jupyterlab-server 1.1.5
  • keyring 21.2.1
  • kiwisolver 1.2.0
  • lazy-object-proxy 1.4.3
  • leidenalg 0.8.3
  • lightgbm 3.1.1
  • llvmlite 0.35.0
  • lockfile 0.12.2
  • loguru 0.5.0
  • loompy 3.0.6
  • louvain 0.7.0
  • lxml 4.5.1
  • lzstring 1.0.4
  • Mako 1.1.2
  • Markdown 3.2.2
  • MarkupSafe 1.1.1
  • matplotlib 3.3.1
  • mccabe 0.6.1
  • Mikado 1.2.4
  • mistune 0.8.4
  • mkl 2021.1.1
  • more-itertools 8.3.0
  • mpi4py 3.0.3
  • mpmath 1.1.0
  • msgpack 1.0.0
  • multiprocess 0.70.9
  • multiqc 1.9
  • mysql-connector 2.2.9
  • natsort 7.0.1
  • nbconvert 5.6.1
  • nbformat 5.0.6
  • ndim 0.1.4
  • networkx 2.4
  • nose 1.3.7
  • notebook 6.0.3
  • numba 0.52.0
  • numcodecs 0.7.3
  • numpy 1.18.4
  • numpy-groupies 0+unknown
  • numpydoc 1.0.0
  • opencv-contrib-python 4.2.0.34
  • orthopy 0.8.4
  • packaging 20.4
  • pandas 1.0.3
  • pandocfilters 1.4.2
  • parso 0.5.2
  • pathos 0.2.5
  • pathspec 0.8.0
  • pathtools 0.1.2
  • patsy 0.5.1
  • pegasusio 0.2.9
  • pegasuspy 1.2.0
  • pexpect 4.8.0
  • pickleshare 0.7.5
  • Pillow 7.1.2
  • pip 21.0
  • pkgconfig 1.5.1
  • plotly 4.7.1
  • pluggy 0.13.1
  • ply 3.11
  • pox 0.2.7
  • ppft 1.6.6.1
  • prometheus-client 0.8.0
  • prompt-toolkit 3.0.5
  • protobuf 3.12.1
  • psrecord 1.2
  • psutil 5.7.0
  • ptyprocess 0.6.0
  • py 1.8.1
  • pyarrow 3.0.0
  • pybedtools 0.8.1
  • pyBigWig 0.3.17
  • pybind11 2.6.2
  • pycodestyle 2.6.0
  • pycparser 2.20
  • pydocstyle 5.0.2
  • pyfaidx 0.5.8
  • pyfasta 0.5.2
  • pyflakes 2.2.0
  • Pygments 2.6.1
  • pylint 2.5.2
  • pynndescent 0.5.1
  • PyOpenGL 3.1.5
  • pyparsing 2.4.7
  • PyQt5 5.12.3
  • PyQt5-sip 12.7.2
  • pyqtgraph 0.10.0
  • PyQtWebEngine 5.12.1
  • pyrsistent 0.16.0
  • pysam 0.15.4
  • pytest 5.4.2
  • python-dateutil 2.8.1
  • python-igraph 0.8.3
  • python-jsonrpc-server 0.3.4
  • python-language-server 0.31.10
  • python-magic 0.4.18
  • python-pptx 0.6.18
  • pythran 0.9.5
  • pytz 2020.1
  • PyVTK 0.5.18
  • PyWavelets 1.1.1
  • pyxdg 0.26
  • PyYAML 5.3.1
  • pyzmq 19.0.1
  • QDarkStyle 2.8.1
  • QtAwesome 0.7.2
  • qtconsole 4.7.4
  • QtPy 1.9.0
  • quadpy 0.16.2
  • ratelimiter 1.2.0.post0
  • regex 2020.5.14
  • requests 2.23.0
  • restructuredtext-lint 1.3.0
  • retrying 1.3.3
  • rope 0.17.0
  • rpy2 3.3.3
  • ruamel.yaml 0.16.10
  • ruamel.yaml.clib 0.2.0
  • scanorama 1.7
  • scikit-bio 0.5.6
  • scikit-image 0.17.2
  • scikit-learn 0.24.1
  • scikit-misc 0.1.3
  • scipy 1.4.1
  • seaborn 0.10.1
  • SecretStorage 3.1.2
  • Send2Trash 1.5.0
  • setuptools 46.4.0
  • silx 0.12.0
  • simplejson 3.17.0
  • six 1.15.0
  • smmap 3.0.4
  • snakemake 5.18.1
  • snowballstemmer 2.0.0
  • sortedcontainers 2.1.0
  • spectra 0.0.11
  • Sphinx 3.0.4
  • sphinxcontrib-applehelp 1.0.2
  • sphinxcontrib-devhelp 1.0.2
  • sphinxcontrib-htmlhelp 1.0.3
  • sphinxcontrib-jsmath 1.0.1
  • sphinxcontrib-qthelp 1.0.3
  • sphinxcontrib-serializinghtml 1.1.4
  • spyder 4.1.3
  • spyder-kernels 1.9.1
  • SQLAlchemy 1.3.17
  • SQLAlchemy-Utils 0.36.6
  • statsmodels 0.11.1
  • sympy 1.6
  • tabulate 0.8.7
  • tbb 2021.1.1
  • terminado 0.8.3
  • testpath 0.4.4
  • texttable 1.6.3
  • threadpoolctl 2.0.0
  • tifffile 2020.5.30
  • toml 0.10.1
  • toolz 0.11.1
  • toposort 1.5
  • torch 1.7.1
  • tornado 6.0.4
  • tqdm 4.47.0
  • traitlets 4.3.3
  • typed-ast 1.4.1
  • typing-extensions 3.7.4.3
  • tzlocal 2.1
  • ujson 1.35
  • umap-learn 0.5.0
  • urllib3 1.25.9
  • vext 0.7.3
  • vext.wx 0.7.0
  • vispy 0.6.4
  • watchdog 0.10.2
  • wcwidth 0.1.9
  • webencodings 0.5.1
  • wheel 0.34.2
  • wrapt 1.12.1
  • wurlitzer 2.0.0
  • xlrd 2.0.1
  • XlsxWriter 1.2.8
  • xopen 0.8.4
  • yapf 0.30.0
  • zarr 2.6.1
  • zipfile2 0.0.12

Python 3.6.1

 python3.6 -m pip list | awk '{print "  * "$0}' 
  • alabaster 0.7.12
  • altgraph 0.16.1
  • appdirs 1.4.3
  • args 0.1.0
  • asn1crypto 0.24.0
  • attrs 17.4.0
  • auxlib 0.0.42
  • backcall 0.1.0
  • bam2x 0.2.6
  • beniget 0.2.1
  • bigfloat 0.4.0
  • biopython 1.78
  • bitarray 0.8.1
  • bitstring 3.1.5
  • bleach 2.1.2
  • blist 1.3.6
  • bx-python 0.8.1
  • certifi 2020.6.20
  • cffi 1.11.2
  • chardet 3.0.4
  • click 6.7
  • clint 0.5.1
  • cmake 3.17.3
  • coloredlogs 14.0
  • colorlog 3.1.2
  • colormath 3.0.0
  • conda 4.3.16
  • ConfigArgParse 0.14.0
  • cryptography 2.1.4
  • cutadapt 1.15
  • cycler 0.10.0
  • Cython 3.0a5
  • datrie 0.7.1
  • deap 1.0.2
  • decorator 4.4.2
  • deepdiff 3.3.0
  • DendroPy 4.3.0
  • dill 0.2.8.2
  • distribute 0.7.3
  • docopt 0.6.2
  • docutils 0.16
  • drmaa 0.7.9
  • ecdsa 0.13
  • entrypoints 0.2.3
  • enum34 1.1.6
  • ete3 3.1.1
  • execo 2.6.3
  • fabio 0.6.0
  • fastnumbers 3.0.0
  • frozendict 1.2
  • funcsigs 1.0.2
  • future 0.16.0
  • gast 0.3.3
  • gitdb2 2.0.5
  • GitPython 2.1.11
  • gnureadline 6.3.8
  • gprof2dot 2017.9.19
  • hdf5plugin 2.0.0b0
  • hdf5storage 0.1.15
  • hmmlearn 0.2.0
  • html5lib 1.0.1
  • HTSeq 0.11.2
  • humanfriendly 8.2
  • idna 2.6
  • imageio 2.9.0
  • importlib 1.0.4
  • importlib-metadata 1.7.0
  • intervaltree 2.1.0
  • intervaltree-bio 1.0.1
  • invoke 0.22.0
  • ipykernel 4.7.0
  • ipython 6.2.1
  • ipython-genutils 0.2.0
  • ipywidgets 7.1.0
  • jedi 0.11.1
  • Jinja2 2.10
  • JIT 0.0.1
  • joblib 0.11
  • jsonpickle 1.0
  • jsonref 0.2
  • jsonschema 3.2.0
  • jupyter 1.0.0
  • jupyter-client 5.2.1
  • jupyter-console 6.1.0
  • jupyter-core 4.4.0
  • kiwisolver 1.1.0
  • liac-arff 2.1.0
  • llvmlite 0.33.0
  • lxml 4.2.5
  • lzstring 1.0.3
  • macholib 1.11
  • Mako 1.0.7
  • Markdown 2.6.11
  • MarkupSafe 1.0
  • matplotlib 3.3.1
  • Mikado 2.0rc2
  • mistune 0.8.3
  • mock 2.0.0
  • mpi4py 3.0.3
  • mpmath 1.0.0
  • msgpack 1.0.0
  • multiprocess 0.70.6.1
  • multiqc 1.9
  • mysql-connector 2.1.4
  • nbconvert 5.3.1
  • nbformat 4.4.0
  • ndim 0.1.4
  • netaddr 0.7.19
  • netifaces 0.10.5
  • netket 2.1.1
  • networkx 2.5
  • nose 1.3.7
  • notebook 5.3.0rc1
  • numba 0.50.1
  • numexpr 2.7.0
  • numpy 1.19.0rc1
  • numpy-groupies 0+unknown
  • orthopy 0.8.4
  • pandas 0.22.0
  • pandocfilters 1.4.2
  • paramiko 2.1.2
  • parso 0.1.1
  • pathos 0.2.2.1
  • paycheck 1.0.2
  • pbr 2.0.0
  • pefile 2018.8.8
  • pexpect 4.3.1
  • pickleshare 0.7.4
  • Pillow 7.2.0
  • pip 20.2.2
  • pkgconfig 1.5.1
  • plotly 4.7.1
  • pluggy 0.6.0
  • ply 3.11
  • pox 0.2.4
  • ppft 1.6.4.8
  • prompt-toolkit 2.0.9
  • protobuf 3.5.1
  • ptyprocess 0.5.2
  • pudb 2017.1.4
  • py 1.5.2
  • pyasn1 0.4.2
  • pybedtools 0.7.10
  • pyBigWig 0.3.17
  • pycosat 0.6.3
  • pycparser 2.18
  • pycrypto 2.6.1
  • pyfaidx 0.5.5.2
  • pyfasta 0.5.2
  • Pygments 2.2.0
  • PyInstaller 3.4
  • pyopencl 2018.1.1
  • PyOpenGL 3.1.1a1
  • pyparsing 2.2.0
  • PyQt5 5.10.1
  • pyrsistent 0.16.0
  • pysam 0.16.0.1
  • pytest 3.4.1
  • python-dateutil 2.6.0
  • python-lzo 1.11
  • python-magic 0.4.15
  • python-pptx 0.6.16
  • python-rapidjson 0.9.1
  • pythran 0.9.5
  • pytools 2018.1
  • pytz 2017.2
  • PyVTK 0.5.18
  • PyWavelets 1.1.1
  • PyYAML 4.2b4
  • pyzmq 17.0.0b3
  • qtconsole 4.3.1
  • QtPy 1.4.0
  • quadpy 0.16.2
  • quast 4.6.3
  • ratelimiter 1.2.0.post0
  • requests 2.23.0
  • restructuredtext-lint 1.3.0
  • retrying 1.3.3
  • rpy2 3.0.1
  • rpy2-bioconductor-extensions 0.2.5.dev0
  • ruamel.yaml 0.15.35
  • scikit-image 0.17.2
  • scikit-learn 0.19.1
  • scipy 1.4.1
  • seaborn 0.9.0
  • Send2Trash 1.4.2
  • seqlearn 0.2
  • setuptools 28.8.0
  • silx 0.7.0
  • simplegeneric 0.8.1
  • simplejson 3.13.2
  • sip 4.19.8
  • six 1.11.0
  • smmap2 2.0.5
  • snakemake 5.4.1
  • sortedcontainers 1.5.9
  • spectra 0.0.11
  • SQLAlchemy 1.3.19
  • SQLAlchemy-Utils 0.33.11
  • sympy 1.1.1
  • tables 3.6.0
  • tabulate 0.8.3
  • terminado 0.8.1
  • testpath 0.3.1
  • tifffile 2020.9.3
  • toml 0.10.1
  • tomlkit 0.6.0
  • tornado 5.0a1
  • tqdm 4.46.0
  • traitlets 4.3.2
  • twobitreader 3.1.6
  • ujson 1.35
  • urllib3 1.22
  • urwid 1.3.1
  • vext 0.7.0
  • vext.pyqt4 0.5.20
  • vext.wx 0.6.8
  • virtualenv 15.1.0
  • vispy 0.5.2
  • ViTables 3.0.0
  • wcwidth 0.1.7
  • webencodings 0.5.1
  • wheel 0.33.0
  • widgetsnbextension 3.1.0
  • wrapt 1.11.1
  • XlsxWriter 1.1.2
  • xopen 0.3.2
  • zipfile2 0.0.12
  • zipp 3.1.0

Python 2.7.13

pip list --format=legacy | awk '{print "  * "$0}'
  • altgraph (0.16.1)
  • appdirs (1.4.3)
  • args (0.1.0)
  • ase (3.15.0)
  • asn1crypto (0.23.0)
  • attrs (17.4.0)
  • backports.functools-lru-cache (1.4)
  • backports.shutil-get-terminal-size (1.0.0)
  • bam2x (0.2.6)
  • bigfloat (0.4.0)
  • biopython (1.70)
  • bitarray (0.8.1)
  • bitstring (3.1.5)
  • blist (1.3.6)
  • bx-python (0.8.1)
  • bz2file (0.98)
  • certifi (2017.11.5)
  • cffi (1.11.2)
  • chardet (3.0.4)
  • click (6.7)
  • clint (0.5.1)
  • clipper (0.2.0)
  • colormath (3.0.0)
  • conda (4.3.16)
  • configparser (3.5.0)
  • cryptography (2.1.3)
  • cutadapt (1.16)
  • cycler (0.10.0)
  • Cython (0.27.3)
  • deap (1.0.2)
  • decorator (4.1.2)
  • dis3 (0.1.3)
  • distribute (0.7.3)
  • docopt (0.6.2)
  • ecdsa (0.13)
  • enum34 (1.1.6)
  • ete2 (2.3.10)
  • ete3 (3.1.1)
  • Flask (0.12.2)
  • funcsigs (1.0.2)
  • future (0.16.0)
  • gprof2dot (2017.9.19)
  • GPy (1.9.2)
  • h5py (2.7.1)
  • hmmlearn (0.2.0)
  • HTSeq (0.9.1)
  • idna (2.6)
  • intervaltree (2.1.0)
  • intervaltree-bio (1.0.1)
  • ipaddress (1.0.18)
  • ipython (5.5.0)
  • ipython-genutils (0.2.0)
  • itsdangerous (0.24)
  • Jinja2 (2.10)
  • joblib (0.11)
  • liac-arff (2.1.0)
  • libtiff (0.4.2)
  • lxml (4.1.1)
  • lzstring (1.0.3)
  • macholib (1.11)
  • MACS2 (2.1.1.20160309)
  • Mako (1.0.7)
  • Markdown (2.6.9)
  • MarkupSafe (1.0)
  • matplotlib (1.5.3)
  • mock (2.0.0)
  • mpi4py (2.0.0)
  • mpmath (1.0.0)
  • multiqc (1.4)
  • netaddr (0.7.19)
  • netifaces (0.10.5)
  • networkx (2.0)
  • nose (1.3.7)
  • numpy (1.14.0)
  • pandas (0.22.0)
  • paramiko (2.1.2)
  • paramz (0.9.1)
  • pathlib2 (2.3.0)
  • paycheck (1.0.2)
  • pbr (2.0.0)
  • pdb-clone (1.10)
  • pefile (2018.8.8)
  • pexpect (4.3.1)
  • pickleshare (0.7.4)
  • Pillow (5.0.0)
  • pip (9.0.3)
  • pluggy (0.6.0)
  • ProfileNJ (20161018)
  • prompt-toolkit (1.0.15)
  • ptyprocess (0.5.2)
  • pudb (2017.1.4)
  • py (1.5.2)
  • pyasn1 (0.3.7)
  • pybedtools (0.7.10)
  • pycosat (0.6.3)
  • pycparser (2.18)
  • pycrypto (2.6.1)
  • pyDNase (0.2.6)
  • pyfasta (0.5.2)
  • Pygments (2.2.0)
  • PyInstaller (3.4)
  • pyopencl (2018.1.1)
  • PyOpenGL (3.1.1a1)
  • pyparsing (2.2.0)
  • pysam (0.13)
  • pytest (3.4.1)
  • python-dateutil (2.6.1)
  • python-lzo (1.11)
  • pytools (2018.1)
  • pytz (2017.3)
  • PyVTK (0.5.18)
  • PyWavelets (0.5.2)
  • PyYAML (3.12)
  • QtPy (1.3.1)
  • quast (4.6.3)
  • requests (2.18.4)
  • RiboCode (1.2.7)
  • RSeQC (2.6.4)
  • ruamel.ordereddict (0.4.13)
  • ruamel.yaml (0.15.35)
  • scandir (1.6)
  • scikit-image (0.13.1)
  • scikit-learn (0.19.1)
  • scipy (1.0.0)
  • seqlearn (0.2)
  • setuptools (39.0.1)
  • silx (0.7.0)
  • simplegeneric (0.8.1)
  • simplejson (3.12.0)
  • six (1.11.0)
  • sklearn (0.0)
  • sortedcontainers (1.5.7)
  • spectra (0.0.11)
  • subprocess32 (3.5.0rc1)
  • traitlets (4.3.2)
  • twobitreader (3.1.6)
  • urllib3 (1.22)
  • urwid (1.3.1)
  • vext (0.7.0)
  • vext.pyqt4 (0.5.20)
  • vext.pyqt5 (0.5.21)
  • vext.wx (0.6.8)
  • virtualenv (15.1.0)
  • wcwidth (0.1.7)
  • Werkzeug (0.14.1)
  • xopen (0.3.2)
  • zipfile2 (0.0.12)
documentation/tools/langages/python/modules.txt · Dernière modification: 2021/02/01 09:16 par ltaulell