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documentation:tools:software:bcftools [2015/01/06 13:27] – modification externe 127.0.0.1documentation:tools:software:bcftools [2020/08/25 15:58] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1
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 ====== BCFtools ====== ====== BCFtools ======
 +
 +  * BCFtools implements utilities for variant calling (in conjunction with [[documentation:tools:software:samtools|SAMtools]]) and manipulating Variant Call Format (VCF) files and its binary counterpart BCF files.
 +
  
 ^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ ^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^
-|  1. |  gnu-4.7.2   N/A  |  /applis/PSMN/debian7/BCFtools/1.1/bin/  |  Debian  | +|  1. |  GCC/6.4.  N/A  |  ''${APPLIS}/MPI/GCC/6.4.0/OpenMPI/3.0.0/BCFtools/1.6''   Debian  | 
-| | **modulefile** : BCFtools/1.1  ||||+| | **modulefile** : ''GCC/6.4.0/OpenMPI/3.0.0/BCFtools/1.6''  |||| 
 +|  1.3.1  |  gnu 6.3.0   N/A   /usr/bin/   Debian 9  | 
 +| | **modulefile** : **aucun**  |||| 
 + 
 + 
 +<code bash>APPLIS=/applis/PSMN/debian9/software</code> 
 + 
 +Pour utiliser les modulefiles, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]] 
  
-Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]]+==== Users documentation ====
  
-{{INLINETOC}}+   * http://www.htslib.org/doc/bcftools.html
  
  
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   * http://www.htslib.org/download/   * http://www.htslib.org/download/
 +  * https://github.com/samtools/bcftools
documentation/tools/software/bcftools.1420550824.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)