Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
| Les deux révisions précédentesRévision précédenteProchaine révision | Révision précédente | ||
| documentation:tools:software:matlab [2018/02/26 15:00] – [Matlab] ltaulell | documentation:tools:software:matlab [2023/05/04 11:34] (Version actuelle) – [Exemples de scripts de soumission] ltaulell | ||
|---|---|---|---|
| Ligne 2: | Ligne 2: | ||
| ^ Version | ^ Version | ||
| - | | | + | | |
| - | | | **modulefile** : Matlab/R2015b | + | | | **modulefile** : Matlab/ |
| + | | R2019b (9.7.0.1296695) | ||
| + | | | **modulefile** : Matlab/ | ||
| + | | R2019b (9.7.0.1296695) | ||
| + | | | **modulefile** : Matlab/R2019b | ||
| - | Pour utiliser les modules, consulter [[documentation: | + | * Pour utiliser les modules, consulter [[documentation: |
| - | + | ||
| - | + | ||
| - | | + | |
| - | + | ||
| - | + | ||
| - | L' | + | |
| + | * L' | ||
| + | * Pour afficher la liste des toolbox installées, | ||
| ===== Exemples de scripts de soumission ===== | ===== Exemples de scripts de soumission ===== | ||
| <note warning> | <note warning> | ||
| - | Ces scripts sont donnés à titre d' | ||
| - | </ | ||
| - | * exemple | + | Ce script est donné à titre d'exemple, merci de le modifier selon vos besoins. \\ |
| - | <code bash batchrun.csh> | + | </note> |
| - | # | + | |
| - | ###### Select resources ##### | + | |
| - | #$ -N nom_job | + | |
| - | #$ -cwd | + | |
| - | #$ -V | + | |
| - | #$ -j y | + | |
| - | #$ -q matlab | + | |
| - | # | + | |
| - | ##### Change to current working directory ##### | ||
| - | cd ${SGE_O_WORKDIR} | ||
| - | ##### Set environment ##### | + | <code bash script.matlab> |
| - | source / | + | #!/bin/bash |
| - | module load Matlab/ | + | |
| - | + | ||
| - | ##### Execute Program ##### | + | |
| - | + | ||
| - | matlab -nodisplay -nodesktop -nojvm -nosplash < program_matlab.m | + | |
| - | + | ||
| - | # | + | |
| - | </ | + | |
| - | + | ||
| - | Pour soumettre il faut lancer : | + | |
| - | <code bash> | + | |
| - | qsub batchrun.csh | + | |
| - | </ | + | |
| - | (qui doit être exécutable, | + | |
| - | + | ||
| - | * exemple 2 | + | |
| - | + | ||
| - | <code bash script.matlab > | + | |
| - | #!/bin/tcsh | + | |
| ###### Select resources ##### | ###### Select resources ##### | ||
| #$ -N nom_job | #$ -N nom_job | ||
| #$ -cwd | #$ -cwd | ||
| #$ -V | #$ -V | ||
| - | #$ -j y | ||
| #$ -q matlab | #$ -q matlab | ||
| ##### For larger memory ##### | ##### For larger memory ##### | ||
| - | ##$ -q matlabbig | + | ###$ -q matlabbig |
| # config env | # config env | ||
| - | source / | + | source / |
| - | module load Matlab/R2015b | + | ml use / |
| - | + | module load Matlab/R2019b | |
| - | ##### Change to current working directory ##### | + | |
| - | set WORKDIR=${SGE_O_WORKDIR} | + | |
| - | cd ${WORKDIR} | + | # change to current submit dir |
| + | # important, elsewhere, job is started from ~/ | ||
| + | cd "${SGE_O_WORKDIR}" | ||
| ##### Execute Program #### | ##### Execute Program #### | ||
| Ligne 83: | Ligne 51: | ||
| Pour soumettre il faut lancer : | Pour soumettre il faut lancer : | ||
| <code bash> | <code bash> | ||
| - | | + | qsub script.matlab |
| </ | </ | ||