Picard
- a set of command line tools for manipulating high-throughput sequencing (HTS) data and formats such as SAM/BAM/CRAM and VCF.
| Version | Compilateur | Interconnexion | chemin d'accès | OS |
|---|---|---|---|---|
| 2.8.1 | java-1.8.0_151 | N/A | /usr/bin | N/A |
| modulefile : picard/2.3.0 | ||||
| 2.3.0 | N/A | N/A | /applis/PSMN/generic/picard/2.3.0/ | N/A |
| modulefile : picard/2.3.0 | ||||
Pour utiliser les modules, consulter Environment Modules
Usage :
$PICARD est une variable d'environnement exposée par le modulefile picard/<version>.
java -jar $PICARD --help ou java -jar $PICARD PicardTool --help