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R Statistical Computing
R 3.6.1
Version | Compilateur | chemin d'accès | OS |
3.6.1 | GCC/7.2.0 | ${SITE}/Core/R/3.6.1/bin | Debian 9 |
| modulefile : R/3.6.1 |
${SITE}=/applis/PSMN/debian9/software
Pour utiliser les modules, consulter Environment Modules
libraries
igraph
ade4
ggplot2
seqinr
multitaper
doMC
iterators
foreach
XNomial
data.table
devtools
ape
phangorn
Bioconductor(3.9)
DESeq
xtable
BiocGenerics
bsseq
glmnet
DSS
Biobase
DESeq2
EBSeq
goseq
memoise
BiSeq
DEXSeq
GenomicRange
GenomicAlignments
Repitools
Rsubread
ggbio
AnnotationDbi
Git
methylKit
goldmine
methylaction
tailfindr
Pasha
R 3.4.3
Version | Compilateur | chemin d'accès | OS |
3.4.3 | GCC/7.2.0 | ${SITE}/Core/R/3.4.3/bin | Debian 9 |
| modulefile : R/3.4.3 |
${SITE}=/applis/PSMN/debian9/software
Pour utiliser les modules, consulter Environment Modules
libraries
igraph
ade4
ggplot2
seqinr
multitaper
doMC
iterators
foreach
XNomial
data.table
devtools
phangorn
ape
Git
methylKit
goldmine
methylaction
Bioconductor(3.6)
DESeq
xtable
BiocGenerics
bsseq
glmnet
DSS
Biobase
DESeq2
EBSeq
goseq
memoise
BiSeq
DEXSeq
GenomicRange
GenomicAlignments
Repitools
Rsubread
ggbio
aod
R 3.2
Version | Compilateur | chemin d'accès | OS |
3.2.4 | GCC/7.2.0 | ${SITE}/Core/R/3.2.4/bin | Debian 9 |
| modulefile : R/3.2.4 |
${SITE}=/applis/PSMN/debian9/software
Pour utiliser les modules, consulter Environment Modules
libraries
Les packages suivants (ainsi que leurs dépendances) sont installés :
igraph
ade4
ggplot2
seqinr
multitaper
doMC
iterators
foreach
XNomial
data.table
devtools
phangorn
ape
Refs & docs externes