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documentation:tools:software:r [2021/08/17 13:56] – [Installation de Libraries dans votre /home] ltaulelldocumentation:tools:software:r [2022/07/11 06:05] (Version actuelle) – [R 4.0] ltaulell
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 R is a free software environment for statistical computing and graphics. R is a free software environment for statistical computing and graphics.
 +===== R 4.1 =====
 +^  Version  ^  Compilateur  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^
 +|  4.1.2  |  foss/2021b  |  **depending on partition**  |  **Debian 11**  |
 +| | **modulefile** : ''R/4.1.2-foss-2021b''  |||
 +|  4.1.1  |  GCC/8.2.0  |  ''${SITE}/Core/R/4.1.1/bin''  |  **Debian 9**  |
 +| | **modulefile** : ''R/4.1.1''  |||
 +
 +<code>
 +${SITE}=/applis/PSMN/debian9/software
 +</code>
 +
 +Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]]
 +
 +=== libraries ===
 +
 +Pour cette version de R, il est maintenant conseillé d'installer les packages supplémentaires dans votre home. Voir la documentation à [[documentation:tools:software:r#installation_de_libraries_dans_votre_home|la fin de cette page]].
 +
 +
 ===== R 4.0 ===== ===== R 4.0 =====
 ^  Version  ^  Compilateur  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ ^  Version  ^  Compilateur  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^
 +|  4.0.4  |  gcc 10.2.1-6  |  ''/usr/bin''  |  **Debian 11**  |
 +| | **modulefile** : ''none''  |||
 |  4.0.3  |  GCC/8.2.0  |  ''${SITE}/Core/R/4.0.3/bin''  |  **Debian 9**  | |  4.0.3  |  GCC/8.2.0  |  ''${SITE}/Core/R/4.0.3/bin''  |  **Debian 9**  |
 | | **modulefile** : ''R/4.0.3''  ||| | | **modulefile** : ''R/4.0.3''  |||
 +
  
 <code> <code>
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 <note important>**DESeq** et **DESeq2** ne sont pas installable sur notre version 4.0.3. Si vous avez besoin de l'un ou l'autre, utilisez la version R/3.6.1</note> <note important>**DESeq** et **DESeq2** ne sont pas installable sur notre version 4.0.3. Si vous avez besoin de l'un ou l'autre, utilisez la version R/3.6.1</note>
 +
 +Pour cette version de R, il est maintenant conseillé d'installer les packages supplémentaires dans votre home. Voir la documentation à [[documentation:tools:software:r#installation_de_libraries_dans_votre_home|la fin de cette page]].
 +
 ===== R 3.6 ===== ===== R 3.6 =====
 ^  Version  ^  Compilateur  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ ^  Version  ^  Compilateur  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^
Ligne 227: Ligne 251:
     library(Package_name)     library(Package_name)
  
-A noter que les dépendances du package doivent être installées sur le PSMN ou dans votre /home+A noter que les dépendances du package doivent être installées sur le PSMN ou dans votre ''/home''.
- +
-Il faudra également considerer le fait que votre package n'entre pas en conflit avec des installations déjà existantes.+
  
 +Il faudra également considérer le fait que votre package n'entre pas en conflit avec des installations déjà existantes.
  
 ==== Refs & docs externes ==== ==== Refs & docs externes ====
documentation/tools/software/r.1629208588.txt.gz · Dernière modification : 2021/08/17 13:56 de ltaulell