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documentation:tools:software:salmon [2018/02/20 10:47] – créée cpetitdocumentation:tools:software:salmon [2022/03/09 10:23] (Version actuelle) – [Salmon] ltaulell
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 ====== Salmon ====== ====== Salmon ======
  
-  * Unsupervised RNA-Seq-based genome annotation+  * Salmon is a wicked-fast program to produce a highly-accurate, transcript-level quantification estimates from RNA-seq data.
  
 ^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ ^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^
-|  0.9.1  |  N/A  |  N/A  |  ''/applis/PSMN/generic/Salmon/0.9.1/bin''   Generic  |+|  1.7.0  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/Salmon/1.7.0/bin  |  Generic / Debian 
 +| | **modulefile** : Salmon/1.7.0  |||| 
 +|  0.13.1  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/Salmon/0.13.1/bin  |  Generic / Debian 
 +| | **modulefile** : Salmon/0.13.1  |||| 
 +|  0.9.1  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/Salmon/0.9.1/bin  |  Generic / Debian  |
 | | **modulefile** : Salmon/0.9.1  |||| | | **modulefile** : Salmon/0.9.1  ||||
 +|  0.7.2  |  N/A  |  N/A  |  /usr/bin  |  Generic / Debian  |
 +| | **modulefile** : aucun  ||||
  
  
- 
-<code bash>APPLIS=/applis/PSMN/debian9/software</code> 
  
 Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]] Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]]
  
  
 +===== Site officiel =====
 +
 +   * https://github.com/COMBINE-lab/salmon
 +   * http://salmon.readthedocs.io/en/latest/index.html
documentation/tools/software/salmon.1519123620.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)