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Trimmomatic

  • a multithreaded command line tool that can be used to trim and crop Illumina (fastaq) data as well as to remove adapters.
Version Compilateur Interconnexion chemin d'accès OS
0.36 N/A N/A /applis/PSMN/generic/Trimmomatic/0.36 generic
modulefile : Trimmomatic/0.36
module load Trimmomatic/0.36  
java -jar $TRIMMOMATIC PE/SE -options -de -trimm -o -matic

les modulefiles Java/1.8.0u77 ou Java/1.7d7 peuvent être utilisés en combinaison avec Trimmomatic.

Site officiel

documentation/tools/software/trimmomatic.1491224538.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)