Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
| Les deux révisions précédentesRévision précédenteProchaine révision | Révision précédente | ||
| documentation:tools:software:trimmomatic [2017/04/03 13:02] – cpetit | documentation:tools:software:trimmomatic [2020/08/25 15:58] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1 | ||
|---|---|---|---|
| Ligne 4: | Ligne 4: | ||
| ^ Version | ^ Version | ||
| - | | 0.36 | N/A | N/A | /applis/PSMN/generic/Trimmomatic/ | + | | 0.36 | N/A | N/A | /usr/share/java/trimmomatic.jar | |
| - | | | **modulefile** : Trimmomatic/ | + | | | **modulefile** : aucun |||| |
| <code bash> | <code bash> | ||
| - | module load Trimmomatic/0.36 | + | # usage type |
| + | TRIMMOMATIC=/usr/ | ||
| java -jar $TRIMMOMATIC PE/SE -options -de -trimm -o -matic | java -jar $TRIMMOMATIC PE/SE -options -de -trimm -o -matic | ||
| </ | </ | ||
| - | les modulefiles '' | + | <code bash> |
| + | ## Example | ||
| + | ## Quick start | ||
| + | # Paired End | ||
| + | java -jar <path to trimmomatic.jar> | ||
| + | </code> | ||
| + | |||
| + | |||
| + | |||