Compilation et d'exécution d'un programme (Fortran)

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Le programme SommeVecVecSEQ.f90 effectue la somme des deux vecteurs A et B. Le résultat est mis dans C.

Définition de l'environnement :

• définition de l'environnement :

module avail 

module load GCC/7.2.0 

• vérification de la version du compilateur

gfortran --version
GNU Fortran (GCC) 7.2.0
Copyright (C) 2017 Free Software Foundation, Inc. 

Compilation :

gfortran -o SommeVecVecSEQ.exe SommeVecVecSEQ.f90 

Le fichier binaire (exécutable) SommeVecVecSEQ.f90.exe a été généré.

./SommeVecVecSEQ.exe

Le résultat est affiché a l'écran :

Les deux vecteurs :

A =            1           2           3           4           5           6           7           8          9          10

B =            9           8           7           6           5           4           3           2          1           0

Le vecteur somme :

C =           10          10          10          10          10          10          10          10         10          10

On utilise un script de soumission batch.sh, pour le shell bash (ou batch.csh pour soumettre le job sur les clusters de calcul.

C'est le script de soumission qui configure l'environnement puis appelle votre binaire (avec ses options, s'il en a) sur le noeud d'execution.

SGE → batch.csh → binaire

qsub batch.csh
Your job 335982 ("SommeVecVecSEQ") has been submitted
qstat

job-ID  prior   name             user         state submit/start at     queue                  slots ja-task-ID 
-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 335982 0.00000 SommeVecVecSEQ   ccalugar     qw    02/14/2018 10:37:46

qstat

job-ID  prior   name             user         state submit/start at     queue                  slots ja-task-ID 
-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 335982 0.07300 SommeVecVecSEQ   ccalugar     r    02/14/2018 10:38:54  E5_test@c8220node145         1 

• La sortie de l'écran (sortie standard) est redirigée dans le fichier SommeVecVecSEQ.o335982
• La sortie erreur (erreur standard) est redirigée dans le fichier SommeVecVecSEQ.e335982

cat SommeVecVecSEQ.o335982

Les deux vecteurs :
A =            1           2           3           4           5           6           7           8           9          10
B =            9           8           7           6           5           4           3           2           1           0
Le vecteur somme :
C =           10          10          10          10          10          10          10          10          10          10