Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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faq:chimie:cp2k [2022/03/03 16:27] – [Submission script] tjiangfaq:chimie:cp2k [2022/04/22 08:54] (Version actuelle) – [Submission script] tjiang
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 cp md.inp "${SCRATCHDIR}" cp md.inp "${SCRATCHDIR}"
 cd "${SCRATCHDIR}" || { echo "cannot cd to ${SCRATCHDIR}"; exit 1; } cd "${SCRATCHDIR}" || { echo "cannot cd to ${SCRATCHDIR}"; exit 1; }
-mpirun -x LD_RUN_PATH -x LIBRARY_PATH -x CPATH -x LD_LIBRARY_PATH -hostfile $TMPDIR/machines -np $NSLOTS cp2k.popt -i md.inp > md.out+mpirun -x LIBRARY_PATH -x CPATH -x LD_LIBRARY_PATH -hostfile $TMPDIR/machines -np $NSLOTS cp2k.popt -i md.inp > md.out 
 + 
 +#Please change the outputfiles_only to the output files you need to copy back
 cp -- outputfiles_only "${SGE_O_WORKDIR}" cp -- outputfiles_only "${SGE_O_WORKDIR}"
 rm -rf "${SCRATCHDIR}" rm -rf "${SCRATCHDIR}"
 </code> </code>
faq/chimie/cp2k.1646324843.txt.gz · Dernière modification : 2022/03/03 16:27 de tjiang