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faq:chimie:orca

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faq:chimie:orca [2021/10/08 13:51] – [Submission script] tjiangfaq:chimie:orca [2022/03/03 16:30] (Version actuelle) – [Submission script] tjiang
Ligne 30: Ligne 30:
     exit 1     exit 1
 fi fi
-#rm -rf "${SCRATCHDIR}"+echo "Creating scratch for this job: ${SCRATCHDIR}"
 mkdir -p "${SCRATCHDIR}" mkdir -p "${SCRATCHDIR}"
  
Ligne 37: Ligne 37:
 cd  "${SCRATCHDIR}" || { echo "cannot cd to ${SCRATCHDIR}"; exit 1; } cd  "${SCRATCHDIR}" || { echo "cannot cd to ${SCRATCHDIR}"; exit 1; }
 /home/tjiang/softs/orca/4_0_1_2_linux_x86-64_openmpi202/orca "${input}" > "${SGE_O_WORKDIR}/${output}" /home/tjiang/softs/orca/4_0_1_2_linux_x86-64_openmpi202/orca "${input}" > "${SGE_O_WORKDIR}/${output}"
-cp -- * "${SGE_O_WORKDIR}"+cp -- outputfiles_only "${SGE_O_WORKDIR}"
 cd "${SGE_O_WORKDIR}" || { echo "cannot cd to ${SGE_O_WORKDIR}"; exit 1; } cd "${SGE_O_WORKDIR}" || { echo "cannot cd to ${SGE_O_WORKDIR}"; exit 1; }
 rm -rf "${SCRATCHDIR}" rm -rf "${SCRATCHDIR}"
  
 </code> </code>
faq/chimie/orca.1633701073.txt.gz · Dernière modification : 2021/10/08 13:51 de tjiang
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