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faq:chimie:vasp [2021/10/08 13:45] – [Submission script] tjiangfaq:chimie:vasp [2022/03/01 12:36] (Version actuelle) – [Submission script] tjiang
Ligne 53: Ligne 53:
  
 else else
-    echo "/scratch not found, cannot create ${SCRATCHDIR}+    echo "/scratch not found, cannot create ${SCRATCHDIR}"
     exit 1     exit 1
 fi fi
Ligne 63: Ligne 63:
  
 cd "${HOMEDIR}" || { echo "cannot cd to ${HOMEDIR}"; exit 1; } cd "${HOMEDIR}" || { echo "cannot cd to ${HOMEDIR}"; exit 1; }
 +#Creating POTCAR, contribution of Stephan
 +rm POTCAR ; for i in `awk '{if(NR==6){print $0}}' POSCAR`  ; do cat ~tjiang/vasp/PSEUDOS_DATABASIS/2013/gw/potpaw/pbe/$i/POTCAR >> POTCAR ; done:w
 +
 +
 #for normal calculation #for normal calculation
 /bin/cp -f INCAR KPOINTS POTCAR POSCAR WAVECAR "${SCRATCHDIR}/" /bin/cp -f INCAR KPOINTS POTCAR POSCAR WAVECAR "${SCRATCHDIR}/"
Ligne 83: Ligne 87:
 #cp -- WAVECAR CHG* OUTCAR POSCAR OSZICAR XDATCAR CONTCAR vasprun.xml "${HOMEDIR}/" #cp -- WAVECAR CHG* OUTCAR POSCAR OSZICAR XDATCAR CONTCAR vasprun.xml "${HOMEDIR}/"
 # Minimum copy back # Minimum copy back
-cp -rf OUTCAR POSCAR OSZICAR XDATCAR CONTCAR "${HOMEDIR}/"+ 
 +bzip2 OUTCAR 
 +#gzip OUTCAR 
 +cp -rf OUTCAR.bz2 POSCAR OSZICAR XDATCAR CONTCAR "${HOMEDIR}/"
 # copy back for neb calculation, numbering depends on the number of images # copy back for neb calculation, numbering depends on the number of images
 #cp -rf OUTCAR POSCAR OSZICAR XDATCAR CONTCAR 00 01 02 "${HOMEDIR}/" #cp -rf OUTCAR POSCAR OSZICAR XDATCAR CONTCAR 00 01 02 "${HOMEDIR}/"
 # Zip OUTCAR to save space # Zip OUTCAR to save space
 cd "${HOMEDIR}/" || { echo "cannot cd to ${HOMEDIR}"; exit 1; } cd "${HOMEDIR}/" || { echo "cannot cd to ${HOMEDIR}"; exit 1; }
-bzip2 OUTCAR 
-#gzip OUTCAR 
  
 # Cleaning up # Cleaning up
faq/chimie/vasp.1633700735.txt.gz · Dernière modification : 2021/10/08 13:45 de tjiang