2023

titre

Evidence that endosperm turgor pressure both promotes and restricts seed growth and size

auteur

Audrey Creff, Olivier Ali, Camille Bied, Vincent Bayle, Gwyneth Ingram, Benoit Landrein

article

Nature Communications, 2023, 14 (1), pp.67. ⟨10.1038/s41467-022-35542-5⟩

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titre

Revisiting the relationship between turgor pressure and plant cell growth

auteur

Olivier Ali, Ibrahim Cheddadi, Benoit Landrein, Yuchen Long

article

New Phytologist, 2023, 238 (1), pp.62-69. ⟨10.1111/nph.18683⟩

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2021

titre

Endosperm turgor pressure both promotes and restricts seed growth and size

auteur

Audrey Creff, Olivier Ali, Vincent Bayle, Gwyneth Ingram, Benoit Landrein

article

2021

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titre

BVPy: A FEniCS-based Python package to ease the expression and study of boundary value problems in Biology.

auteur

Florian Gacon, Christophe Godin, Olivier Ali

article

Journal of Open Source Software, 2021, 6 (59), pp.1-6. ⟨10.21105/joss.02831⟩

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2020

titre

Microtubule-Mediated Wall Anisotropy Contributes to Leaf Blade Flattening

auteur

Feng Zhao, Fei Du, Hadrien Oliveri, Lüwen Zhou, Olivier Ali, Wenqian Chen, Shiliang Feng, Qingqing Wang, Shouqin Lü, Mian Long, René Schneider, Arun Sampathkumar, Christophe Godin, Jan Traas, Yuling Jiao

article

Current Biology - CB, 2020, 30 (20), pp.3972. ⟨10.1016/j.cub.2020.07.076⟩

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2019

titre

Regulation of plant cell wall stiffness by mechanical stress: a mesoscale physical model

auteur

Hadrien Oliveri, Jan J. Traas, Christophe Godin, Olivier Ali

article

Journal of Mathematical Biology, 2019, 78 (3), pp.625-653. ⟨10.1007/s00285-018-1286-y⟩

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titre

Simulating Turgor-Induced Stress Patterns in Multilayered Plant Tissues

auteur

Olivier Ali, Hadrien Oliveri, Jan Traas, Christophe Godin

article

Bulletin of Mathematical Biology, 2019, 81 (8), pp.1-23. ⟨10.1007/s11538-019-00622-z⟩

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2018

titre

Transcriptional induction of cell wall remodelling genes is coupled to microtubule-driven growth isotropy at the shoot apex in Arabidopsis

auteur

Alessia Armezzani, Ursula Abad, Olivier Ali, Amélie Andres Robin, Laetitia Vachez, Antoine Larrieu, Ewa Mellerowicz, Ludivine Taconnat, Virginie Battu, Thomas Stanislas, Mengying Liu, Teva Vernoux, Jan Traas, Massimiliano Sassi

article

Development (Cambridge, England), 2018, 145 (11), ⟨10.1242/dev.162255⟩

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2017

titre

DRACO-STEM: An Automatic Tool to Generate High-Quality 3D Meshes of Shoot Apical Meristem Tissue at Cell Resolution

auteur

Guillaume Cerutti, Olivier Ali, Christophe Godin

article

Frontiers in Plant Science, 2017, 8, pp.353. ⟨10.3389/fpls.2017.00353⟩

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2016

titre

Force-Driven Polymerization and Turgor-Induced Wall Expansion

auteur

Olivier Ali, Jan Traas

article

Trends in Plant Science, 2016, 21 (5), pp.398 - 409. ⟨10.1016/j.tplants.2016.01.019⟩

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titre

Force-Driven Polymerization and Turgor-Induced Wall Expansion

auteur

Olivier Ali, Jan Traas

article

Trends in Plant Science, 2016, 21 (5), pp.398 - 409. ⟨10.1016/j.tplants.2016.01.019⟩

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2015

titre

A Computational Framework for 3D Mechanical Modeling of Plant Morphogenesis with Cellular Resolution

auteur

Frédéric Boudon, Jérôme Chopard, Olivier Ali, Benjamin Gilles, Olivier Hamant, Arezki Boudaoud, Jan Traas, Christophe Godin

article

PLoS Computational Biology, 2015, 11 (1), pp.1-16. ⟨10.1371/journal.pcbi.1003950⟩

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2014

titre

Physical Models of Plant Development

auteur

Olivier Ali, Vincent Mirabet, Christophe Godin, Jan Traas

article

Annual Review of Cell and Developmental Biology, 2014, 30 (1), pp.59 - 78. ⟨10.1146/annurev-cellbio-101512-122410⟩

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titre

An Auxin-Mediated Shift toward Growth Isotropy Promotes Organ Formation at the Shoot Meristem in Arabidopsis

auteur

Massimiliano Sassi, Olivier Ali, Frédéric Boudon, Gladys Cloarec, Ursula Abad, Coralie Cellier, Xu Chen, Benjamin Gilles, Pascale Milani, Jìrí Friml, Teva Vernoux, Christophe Godin, Olivier Hamant, Jan Traas

article

Current Biology - CB, 2014, 24 (19), pp.2335-2342. ⟨10.1016/j.cub.2014.08.036⟩

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2011

titre

Cooperativity between Integrin Activation and Mechanical Stress Leads to Integrin Clustering.

auteur

Olivier Ali, Hervé Guillou, Olivier Destaing, Corinne Albiges-Rizo, Marc R. Block, Bertrand Fourcade

article

Biophysical Journal, 2011, 100 (11), pp.2595-604. ⟨10.1016/j.bpj.2011.03.028⟩

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titre

Cooperativity between integrin activation and mechanical stress leads to integrin clustering

auteur

Olivier Ali, Hervé Guillou, Olivier Destaing, Corinne Albiges-Rizo, Marc R Block, Bertrand Fourcade

article

Biophysical Journal, 2011, 100 (11), pp.2595-2604. ⟨10.1016/j.bpj.2011.03.028⟩

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2009

titre

Excitable waves at the margin of the contact area between a cell and a substrate.

auteur

Olivier Ali, Corinne Albiges-Rizo, Marc R. Block, Bertrand Fourcade

article

Physical Biology, 2009, 6 (2), pp.25010. ⟨10.1088/1478-3975/6/2/025010⟩

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2008

titre

Physical model for membrane protrusions during spreading.

auteur

François Chamaraux, Olivier Ali, Sébastien Keller, Franz Bruckert, Bertrand Fourcade

article

Physical Biology, 2008, 5 (3), pp.36009. ⟨10.1088/1478-3975/5/3/036009⟩

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