2023

titre

Water fluxes contribute to growth patterning in shoot meristems

auteur

Juan Alonso-Serra, Ibrahim Cheddadi, Annamaria Kiss, Guillaume Cerutti, Claire Lionnet, Christophe Godin, Olivier Hamant

article

2023

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2022

titre

bHLH heterodimer complex variations regulate cell proliferation activity in the meristems of Arabidopsis thaliana

auteur

Eliana Mor, Markéta Pernisová, Max Minne, Guillaume Cerutti, Dagmar Ripper, Jonah Nolf, Jennifer Andres, Laura Ragni, Matias D Zurbriggen, Bert de Rybel, Teva Vernoux

article

iScience, 2022, 25 (11), pp.105364. ⟨10.1016/j.isci.2022.105364⟩

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titre

Benchmarking of deep learning algorithms for 3D instance segmentation of confocal image datasets

auteur

Anuradha Kar, Manuel Petit, Yassin Refahi, Guillaume Cerutti, Christophe Godin, Jan Traas

article

PLoS Computational Biology, 2022, 18 (4), pp.e1009879. ⟨10.1371/journal.pcbi.1009879⟩

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2021

titre

A quantitative gibberellin signalling biosensor reveals a role for gibberellins in internode specification at the shoot apical meristem

auteur

Teva Vernoux, Bihai Shi, Amelia Felipo-Benavent, Guillaume Cerutti, Carlos Galvan-Ampudia, Lucas Jilli, Geraldine Brunoud, Jérome Mutterer, Lali Sakvarelidze-Achard, Jean-Michel Davière, Alejandro Navarro-Galiano, Ankit Walia, Shani Lazary, Jonathan Legrand, Roy Weinstein, Alexander Jones, Salomé Prat, Patrick Achard

article

2021

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2020

titre

Temporal integration of auxin information for the regulation of patterning

auteur

Carlos Galvan-Ampudia, Guillaume Cerutti, Jonathan Legrand, Geraldine Brunoud, Raquel Martin Arevalillo, Romain Azaïs, Vincent Bayle, Steven Moussu, Christian Wenzl, Yvon Jaillais, Jan U Lohmann, Christophe Godin, Teva Vernoux

article

eLife, 2020, 9, ⟨10.7554/eLife.55832⟩

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2019

titre

Treex : a Python package for manipulating rooted trees

auteur

Romain Azaïs, Guillaume Cerutti, Didier Gemmerlé, Florian Ingels

article

Journal of Open Source Software, 2019, 4 (38), pp.1-2. ⟨10.21105/joss.01351⟩

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2018

titre

From spatio-temporal morphogenetic gradients to rhythmic patterning at the shoot apex

auteur

Carlos Galvan-Ampudia, Guillaume Cerutti, Jonathan Legrand, Romain Azaïs, Geraldine Brunoud, Steven Moussu, Christian Wenzl, Jan U Lohmann, Christophe Godin, Teva Vernoux

article

2018

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titre

Bark and Leaf Fusion Systems to Improve Automatic Tree Species Recognition

auteur

Sarah Bertrand, Rihab Ben Ameur, Guillaume Cerutti, Didier Coquin, Lionel Valet, Laure Tougne

article

Ecological Informatics, 2018, ⟨10.1016/j.ecoinf.2018.05.007⟩

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titre

An image analysis pipeline to quantify emerging cracks in materials or adhesion defects in living tissues

auteur

Stéphane Verger, Guillaume Cerutti, Olivier Hamant

article

Bio-protocol , 2018, 8 (19), pp.1-16. ⟨10.21769/BioProtoc.3036⟩

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titre

An Image Analysis Pipeline to Quantify Emerging Cracks in Materials or Adhesion Defects in Living Tissues

auteur

Stéphane Verger, Guillaume Cerutti, Olivier Hamant

article

Bio-protocol , 2018, 8 (19)

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2017

titre

DRACO-STEM: An Automatic Tool to Generate High-Quality 3D Meshes of Shoot Apical Meristem Tissue at Cell Resolution

auteur

Guillaume Cerutti, Olivier Ali, Christophe Godin

article

Frontiers in Plant Science, 2017, 8, pp.353. ⟨10.3389/fpls.2017.00353⟩

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2015

titre

Tree leaves extraction in natural images: Comparative study of pre-processing tools and segmentation methods

auteur

Manuel Grand-Brochier, Antoine Vacavant, Guillaume Cerutti, Camille Kurtz, Jonathan Weber, Laure Tougne

article

IEEE Transactions on Image Processing, 2015, 24 (5), pp.1549-1560. ⟨10.1109/TIP.2015.2400214⟩

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2014

titre

Leaf margins as sequences: A structural approach to leaf identification

auteur

Guillaume Cerutti, Laure Tougne, Didier Coquin, Antoine Vacavant

article

Pattern Recognition Letters, 2014, 49 (2014), pp.177-184. ⟨10.1016/j.patrec.2014.07.016⟩

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2013

titre

Segmentation et interprétation d'images naturelles pour l'identification de feuilles d'arbres sur smartphone

auteur

Guillaume Cerutti

article

2013

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titre

Understanding Leaves in Natural Images - A Model-Based Approach for Tree Species Identification

auteur

Guillaume Cerutti, Laure Tougne, Julien Mille, Antoine Vacavant, Didier Coquin

article

Computer Vision and Image Understanding, 2013, 117 (10), pp.1482-1501. ⟨10.1016/j.cviu.2013.07.003⟩

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