PUBLICATIONS : Jérémy JUST

Jérémy JUST

jeremy.just
(33)4 72 72 86 11
IR2 CNRS

Publications HAL

2020

titre
The molecular signatures of compatible and incompatible pollination
auteur
Chie Kodera, Jérémy Just, Martine da Rocha, Antoine Larrieu, Lucie Riglet, Jonathan Legrand, Frédérique Rozier, Thierry Gaude, Isabelle Fobis-Loisy
article
2020
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02992075/file/374843v2.full.pdf BibTex
titre
Transcriptomics at Maize Embryo/Endosperm Interfaces Identifies a Transcriptionally Distinct Endosperm Subdomain Adjacent to the Embryo Scutellum
auteur
Nicolas Doll, Jérémy Just, Véronique Brunaud, José Caïus, Aurélie Grimault, Nathalie Depège-Fargeix, Eddi Esteban, Asher Pasha, Nicholas Provart, Gwyneth Ingram, Peter Rogowsky, Thomas Widiez
article
The Plant cell, American Society of Plant Biologists (ASPB), 2020, 32 (4), pp.833-852. ⟨10.1105/tpc.19.00756⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03065555/file/200201%20TPC2019-LSB-00756R1_Merged%20PDF%20all%20files.pdf BibTex
titre
Rosa spp.
auteur
Jérémy Just, Mohammed Bendahmane
article
Trends in Genetics, Elsevier, 2020, 36 (2), pp.146-147. ⟨10.1016/j.tig.2019.11.002⟩
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2019

titre
Single and multiple gene knockouts by CRISPR–Cas9 in maize
auteur
Nicolas Doll, Laurine Gilles, Marie-France Gerentes, Christelle Richard, Jérémy Just, Yannick Fierlej, Virginia Borrelli, Ghislaine Gendrot, Gwyneth Ingram, Peter Rogowsky, Thomas Widiez
article
Plant Cell Reports, Springer Verlag, 2019, 38 (4), pp.487-501. ⟨10.1007/s00299-019-02378-1⟩
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titre
The development of a high-density genetic map significantly improves the quality of reference genome assemblies for rose
auteur
Shubin Li, Guoqian Yang, Shuhua Yang, Jérémy Just, Huijun Yan, Ningning Zhou, Hongying Jian, Qigang Wang, Min Chen, Xianqin Qiu, Hao Zhang, Xue Dong, Xiaodong Jiang, Yibo Sun, Micai Zhong, Mohammed Bendahmane, Guogui Ning, Hong Ge, Jin-Yong Hu, Kaixue Tang
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-42428-y⟩
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2018

titre
The Rosa genome provides new insights into the domestication of modern roses
auteur
Olivier Raymond, Jerome Gouzy, Jérémy Just, Hélène Badouin, Marion Verdenaud, Arnaud Lemainque, Philippe Vergne, Sandrine Moja, Nathalie Choisne, Caroline Pont, Sébastien Carrere, Jean-Claude Caissard, Arnaud Couloux, Ludovic Cottret, Jean-Marc Aury, Judit Szécsi, David Latrasse, Mohammed Madoui, Léa Francois, Xiaopeng Fu, Shu-Hua Yang, Annick Dubois, Florence Piola, Antoine Larrieu, Magali Perez, Karine Labadie, Lauriane Perrier, Benjamin Govetto, Yoan Labrousse, Priscilla Villand, Claudia Bardoux, Véronique Boltz, Celine Lopez-Roques, Pascal Heitzler, Teva Vernoux, Michiel Vandenbussche, Hadi Quesneville, Adnane Boualem, Abdelhafid Bendahmane, Chang Liu, Manuel Le Bris, Jérôme Salse, Sylvie Baudino, Moussa Benhamed, Patrick Wincker, Mohammed Bendahmane
article
Nature Genetics, Nature Publishing Group, 2018, 50 (6), pp.772-777. ⟨10.1038/s41588-018-0110-3⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01798003/file/publi18-lipm-016_1.pdf BibTex
titre
A miR172 target-deficient AP2-like gene correlates with the double flower phenotype in roses
auteur
Léa François, Marion Verdenaud, Xiaopeng Fu, Darcy Ruleman, Annick Dubois, Michiel Vandenbussche, Abdelhafid Bendahmane, Olivier Raymond, Jérémy Just, Mohammed Bendahmane
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2018, 8, pp.12912. ⟨10.1038/s41598-018-30918-4⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02389731/file/2018_Fran%C3%A7ois_Scientific_Reports_1.pdf BibTex

2017

titre
Outils chimiques, bio-informatiques et bases de données en écologie chimique
auteur
Nicolas Barthes, Jean-Claude Caissard, Jérémy Just, Xavier Fernandez
article
Écologie chimique, 2017, 978-1-78405-186-0
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2016

titre
The rosa chinensis cv. viridiflora phyllody phenotype Is associated with misexpression of flower organ identity genes
auteur
Huijun Yan, Hao Zhang, Qigang Wang, Hongying Jian, Xianqin Qiu, Sylvie Baudino, Jérémy Just, Olivier Raymond, Lianfeng Gu, Jihua Wang, Mohammed Bendahmane, Kaixue Tang
article
Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2016, 7, ⟨10.3389/fpls.2016.00996⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02640198/file/2016_Yan_Frontiers%20in%20Plant%20Science_1.pdf BibTex

2014

titre
Early allopolyploid evolution in the post-Neolithic[i] Brassica napus[/i] oilseed genome
auteur
Boulos Chalhoub, France Denoeud, Shengyi Liu, Isobel A. P. Parkin, Haibao Tang, Xiyin Wang, Julien Chiquet, Harry Belcram, Chaobo Tong, Birgit Samans, Margot Corréa, Corinne da Silva, Jérémy Just, Cyril Falentin, Chu Shin Koh, Isabelle Le Clainche, Maria Bernard, Pascal Bento, Benjamin Noel, Karine Labadie, Adriana Alberti, Mathieu Charles, Dominique Arnaud, Hui Guo, Christian Daviaud, Salman Alamery, Kamel Jabbari, Meixia Zhao, Patrick P. Edger, Houda Chelaifa-Ammari, David Tack, Gilles Lassalle, Imen Mestiri, Nicolas Schnel, Marie-Christine Le Paslier, Guangyi Fan, Victor Renault, Philippe E. Bayer, Agnieszka A. Golicz, Sahana Manoli, Tae-Ho Lee, Vinh Ha Dinh Thi, Smahane Chalabi, Qiong Hu, Chuchuan Fan, Reece Tollenaere, Yunhai Lu, Christophe Battail, Jinxiong Shen, Christine H. D. Sidebottom, Xinfa Wang, Aurelie Canaguier, Aurelie Chauveau, Aurélie Berard, Gwenaëlle Deniot, Mei Guan, Zhongsong Liu, Fengming Sun, Yong Pyo Lim, Eric Lyons, Christopher D. Town, Ian Bancroft, Xiaowu Wang, Jinling Meng, Jianxin Ma, J. Chris Pires, Graham J. King, Dominique Brunel, Régine Delourme, Michel Renard, Jean-Marc Aury, Keith L. Adams, Jacqueline Batley, Rod J. Snowdon, Jörg Tost, David Edwards, Yongming Zhou, Wei Hua, Andrew G. Sharpe, Andrew H. Paterson, Chunyun Guan, Patrick Wincker
article
Science, American Association for the Advancement of Science, 2014, 345 (6199), pp.950-953. ⟨10.1126/science.1253435⟩
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titre
Sixteen cytosolic glutamine synthetase genes identified in the Brassica napus L. genome are differentially regulated depending on nitrogen regimes and leaf senescence
auteur
Mathilde Orsel Baldwin, Michaël Moison, Vanessa Clouet, Justine Thomas, Françoise Leprince, Anne-Sophie Canoy, Jérémy Just, Boulos Chalhoub, Celine Masclaux-Daubresse
article
Journal of Experimental Botany, Oxford University Press (OUP), 2014, 65 (14), pp.3927-3947. ⟨10.1093/jxb/eru041⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01204074/file/2014_Orsel_Journal%20of%20Experimental%20Botany%20Advance_1.pdf BibTex
titre
Transcriptome and methylome profiling reveals relics of genome dominance in the mesopolyploid Brassica oleracea
auteur
Isobel A. P. Parkin, Chushin Koh, Haibao Tang, Stephen J. Robinson, Sateesh Kagale, Wayne E. Clarke, Chris D. Town, John Nixon, Vivek Krishnakumar, Shelby L. Bidwell, France Denoeud, Harry Belcram, Matthew G. Links, Jérémy Just, Carling Clarke, Tricia Bender, Terry Huebert, Annaliese S. Mason, J. Chris Pires, Guy Barker, Jonathan Moore, Peter G. Walley, Sahana Manoli, Jacqueline Batley, David Edwards, Matthew N. Nelson, Xiyin Wang, Andrew H. Paterson, Graham King, Ian Bancroft, Boulos Chalhoub, Andrew G. Sharpe
article
Genome Biology, BioMed Central, 2014, 15 (6), 18 p. ⟨10.1186/gb-2014-15-6-r77⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02639882/file/2014_Parkin_Genome%20Biology_1.pdf BibTex

2012

titre
A Dominant Point Mutation in a RINGv E3 Ubiquitin Ligase Homoeologous Gene Leads to Cleistogamy in Brassica napus
auteur
Yun-Hai Lu, Dominique Arnaud, Harry Belcram, Cyril Falentin, Patricia Rouault, Nathalie Piel, Marie-Odile Lucas, Jérémy Just, Michel Renard, Régine Delourme, Boulos Chalhoub
article
The Plant cell, American Society of Plant Biologists (ASPB), 2012, 24 (12), pp.4875 - 4891. ⟨10.1105/tpc.112.104315⟩
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titre
Prevalence of gene expression additivity in genetically stable wheat allohexaploids
auteur
Houda Chelaifa-Ammari, Veronique Chague, Smahane Chalabi, Imen Mestiri, Dominique Arnaud, Denise Deffains, Yunhai Lu, Harry Belcram, Virginie Huteau, Julien Chiquet, Olivier Coriton, Jérémy Just, Joseph Jahier, Paul Chalhoub
article
New Phytologist, Wiley, 2012, 197 (3), pp.730 - 736. ⟨10.1111/nph.12108⟩
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2011

titre
Duplication and partitioning in evolution and function of homoeologous Q loci governing domestication characters in polyploid wheat
auteur
Zengcui Zhanga, Harry Belcram, Piotr Gornickic, Mathieu Charles, Jérémy Just, Cecile Huneau, Ghislaine Magdelenat, Arnaud Couloux, Sylvie Samaind, Bikram S. Gille, Jack B. Rasmussena, Valérie Barbed, Justin D. Faris, Boulos Chalhoub
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2011, 108 (46), pp.18737 - 18742. ⟨10.1073/pnas.1110552108⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02650358/file/2011_Zhanga_Proceedings%20of%20the%20National%20Academy%20of%20Sciences%20of%20the%20United%20States%20of%20America_1.pdf BibTex

2010

titre
Genome-wide gene expression changes in genetically stable synthetic and natural wheat allohexaploids
auteur
Veronique Chague, Jérémy Just, Imen Mestiri, Sandrine Balzergue, Anne-Marie Tanguy, Cecile Huneau, Virginie Huteau, Harry Belcram, Olivier Coriton, Joseph Jahier, Boulos Chalhoub
article
New Phytologist, Wiley, 2010, 187 (4), pp.1181-1194. ⟨10.1111/j.1469-8137.2010.03339.x⟩
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titre
Impact of transposable elements on the organization and function of allopolyploid genomes
auteur
Christian Parisod, Karine Alix, Jérémy Just, Maud Petit, Véronique Sarilar, Corinne Mhiri, Malika Ainouche, Boulos Chalhoub, Marie Angele Grandbastien
article
New Phytologist, Wiley, 2010, 186 (1), pp.37-45. ⟨10.1111/j.1469-8137.2009.03096.x⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01203938/file/47729_20111114114623698_1.pdf BibTex

2008

titre
Dynamics and Differential Proliferation of Transposable Elements During the Evolution of the B and A Genomes of Wheat
auteur
Mathieu Charles, Harry Belcram, Jérémy Just, Cecile Huneau, Agnès Viollet, Arnaud Couloux, Béatrice Ségurens, Meredith Carter, Virginie Huteau, Olivier Coriton, Rudi Appels, Sylvie Samain, Paul Chalhoub
article
Genetics, Genetics Society of America, 2008, 180 (2), pp.1071-1086
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