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Méchanotransduction en développement

Personnel du RDP

Olivier HAMANT

olivier.hamant
(33) 4 72 72 88 75
DR2 INRA

Jan TRAAS

jan.traas
(33) 4 72 72 88 74
DR1 INRA

Christophe TREHIN

Christophe.Trehin
(33) 4 26 23 39 78
MC UCBL

Steve de BOSSOREILLE

steve.de.bossoreille.de.ribou
(33) 4 72 72 88 99
CDD IR

Mengying LIU

mengying.liu
(33) 4 26 23 38 32
CDD TR INRA

Thomas STANISLAS

thomas.stanislas
(33) 4 72 72 88 25
Postdoc INRA

Stéphane VERGER

stephane.verger
(33) 4 72 72 88 99
Postdoc INRA

Feng ZHAO

feng.zhao
(33) 4 72 72 86 02
Postdoc INRA

Chie KODERA

chie.kodera
Postdoc CNRS



2018


S. Verger, Y. Long, A. Boudaoud & O. Hamant* "A tension-adhesion feedback loop in plant epidermis". eLIFE 7 e34460 (2018)
V. Mirabet*, P. Krupinski, O. Hamant, E.M. Meyerowitz, H. Jönsson & A. Boudaoud.* "The self-organization of plant microtubules inside the cell volume yields their cortical localization, stable alignment, and sensitivity to external cues". PLoS Comput. Biol. 14 e1006011 (2018)
L. Hong#, M. Dumond#, M. Zhu, S. Tsugawa, C.-B. Li, A. Boudaoud, O. Hamant & A.H.K. Roeder* "Heterogeneity and Robustness in Plant Morphogenesis : From Cells to Organs". Annual Reviews of Plant Biology 69 469–495 (2018)
Malivert A, Hamant O, Ingram G. "The contribution of mechanosensing to epidermal cell fate specification.". Curr Opin Genet Dev. (2018)
PMID : 30006098

Amélie Andres-Robin, Mathieu Reymond, Antoine Dupire, Virginie Battu, Nelly Dubrulle, Grégory Mouille, Valérie Lefebvre, Jerome Pelloux, Arezki Boudaoud, Jan Traas, Charles Patrick Scutt, Françoise Monéger "Evidence for the control of Arabidopsis gynoecium morphogenesis by ETTIN via cell wall dynamics". Plant Physiology American Society of Plant Biologists (2018)
http://www.plantphysiol.org/content/early/2018/09/20/pp.18.00745

Negrutiu I, Hamant O "Anthropocène". In : Dictionnaire juridique des transitions écologiques. 104-107 eds: François Collart Dutilleul, Valérie Pironon, Agathe Van Lang (2018)

2016


"N. Hervieux, M. Dumond, A. Sapala, A.-L....". (2016)
N. Hervieux, M. Dumond, A. Sapala, A.-L. Routier-Kierzkowska, D. Kierzkowski, A. Roeder, R.S. Smith, A. Boudaoud* & O. Hamant*. A mechanical feedback restricts sepal growth and shape in Arabidopsis. Curr Biol. 26, 1019–1028 (2016).

"S. Tsugawa, N. Hervieux, O. Hamant, A....". (2016)
S. Tsugawa, N. Hervieux, O. Hamant, A. Boudaoud, R.S. Smith, C.-B. Li* & T. Komatsuzaki. Extracting subcellular fibrillar alignment with error estimation : Application to microtubules. Biophys. J. 110, 1836–1844 (2016).

"J Gruel, B Landrein, P Tarr, C Schuster, Y...". (2016)
J Gruel, B Landrein, P Tarr, C Schuster, Y Refahi, A Sampathkumar, O Hamant, EM Meyerowitz and H Jönsson (2016) An epidermis-driven mechanism positions and scales stem cell niches in plants. Sci. Adv. 2 : e1500989 (2016)

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M. Louveaux, J.-D. Julien, V. Mirabet, A. Boudaoud* & O. Hamant*. A cell division rule based on tensile stress in Arabidopsis thaliana. Proc. Natl. Acad. Sci. USA in press (2016).

"L. Hong+, M. Dumond+, S. Tsugawa+, A. Sapala,...". (2016)
L. Hong+, M. Dumond+, S. Tsugawa+, A. Sapala, A.-L. Routier-Kierzkowska, Y. Zhou, C. Chen, A. Kiss, M. Zhu, O. Hamant, R. S. Smith, T. Komatsuzaki, C.-B. Li, A. Boudaoud* & A. H. K. Roeder*. Variable cell growth yields reproducible organ development through spatiotemporal averaging
. Dev. Cell in press (2016).

"M. Louveaux, S. Rochette, L. Beauzamy, A....". (2016)
M. Louveaux, S. Rochette, L. Beauzamy, A. Boudaoud & O. Hamant*. The impact of mechanical compression on cortical microtubules in Arabidopsis : a quantitative pipeline. Plant J. in press (2016).

"Interplay between miRNA regulation and mechanical stress for CUC gene expression at the shoot apical meristem.". (2016)
PMID12345
F. Kateryna, B. Landrein & O. Hamant*. Interplay between miRNA regulation and mechanical stress for CUC gene expression at the shoot apical meristem. Plant Signal. Behav. 11, e1127497 (2016).

2015


"F. Boudon, J. Chopard, O. Ali, B. Gilles, O....". (2015)
F. Boudon, J. Chopard, O. Ali, B. Gilles, O. Hamant, A. Boudaoud, J. Traas* & C. Godin*. A computational framework for 3D mechanical modeling of plant morphogenesis with cellular resolution. PLoS Comput. Biol. 11, e1003950 (2015).

"B. Landrein, Y. Refahi, F. Besnard, N....". (2015)
B. Landrein, Y. Refahi, F. Besnard, N. Hervieux, V. Mirabet, A. Boudaoud, T. Vernoux & O. Hamant*. Meristem size contribute to the robustness of phyllotaxis in Arabidopsis. J. Exp. Bot. 66, 1317–1324 (2015).

"L. Beauzamy, M. Louveaux, O. Hamant & A....". (2015)
L. Beauzamy, M. Louveaux, O. Hamant & A. Boudaoud*. Mechanically, the shoot apical meristem of Arabidopsis behaves like a shell inflated by a pressure of about 1 MPa. Front. Plant Sci. 6,1038 (2015).

"B. Landrein, A. Kiss, M. Sassi, A. Chauvet,...". (2015)
B. Landrein, A. Kiss, M. Sassi, A. Chauvet, P. Das, M. Cortizo, P. Laufs, S. Takeda, M. Aida, J. Traas, T. Vernoux, A. Boudaoud & O. Hamant*. Mechanical stress contributes to the expression of the STM homeobox gene in Arabidopsis shoot meristems. eLIFE 4:e07811 (2015).

"P. Barbier de Reuille, A.-L. Routier-Kierzkowska,". (2015)
P. Barbier de Reuille, A.-L. Routier-Kierzkowska, D. Kierzkowski,G.W. Bassel, T. Schüpbach, G. Tauriello, N. Bajpai, S. Strauss, A. Weber, A. Kiss, A. Burian, H. Hofhuis, A. Sapala, M. Lipowczan,M.B. Heimlicher , S. Robinson,E.M. Bayer, K. Basler, P. Koumoutsakos, A.H.K. Roeder, T. Aegerter-Wilmsen, N. Nakayama, M.Tsiantis, A. Hay, D. Kwiatkowska, I. Xenarios, C. Kuhlemeier & R.S. Smith (2015) MorphoGraphX : A platform for quantifying morphogenesis in 4D. eLife 4:e05864, http://dx.doi.org/10.7554/eLife.05864

2014


"Sassi M, Ali O, Boudon F, Cloarec G, Abad U,...". (2014)
Sassi M, Ali O, Boudon F, Cloarec G, Abad U, Cellier C, Chen X, Gilles B, Milani P, Friml J, Vernoux T, Godin C, Hamant O, Traas J. (2014) An auxin-mediated shift toward growth isotropy promotes organ formation at the shoot meristem in Arabidopsis. Curr Biol. 24(19):2335-42.

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Traas J, Sassi M. (2014) Plant development : from biochemistry to biophysics and back. Curr Biol. 24(6):R237-8.

"Besnard F, Refahi Y, Morin V, Marteaux B,...". (2014)
Besnard F, Refahi Y, Morin V, Marteaux B, Brunoud G, Chambrier P, Rozier F, Mirabet V, Legrand J, Lainé S, Thévenon E, Farcot E, Cellier C, Das P, Bishopp A, Dumas R, Parcy F, Helariutta Y, Boudaoud A, Godin C, Traas J, Guédon Y, Vernoux T (2014) Cytokinin signalling inhibitory fields provide robustness to phyllotaxis. Nature Jan 16 ;505(7483):417-21.

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Sampathkumar, A., Krupinski, P., Wightman, R., Milani, P., Berquand, A., Boudaoud, A., Hamant, O., Jonsson, H., Meyerowitz, E.M. (2014). Sub-cellular and supra-cellular mechanical stress prescribes cytoskeleton behavior in Arabidopsis cotyledon pavement cells. eLife 2014 ;3:e01967 http://dx.doi.org/10.7554/eLife.01967

2013


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2012


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Band LR, Wells DM, Larrieu A, Sun J, Middleton AM, French AP, Brunoud G, Sato EM, Wilson MH, Péret B, Oliva M, Swarup R, Sairanen I, Parry G, Ljung K, Beeckman T, Garibaldi JM, Estelle M, Owen MR, Vissenberg K, Hodgman TC, Pridmore TP, King JR, Vernoux T,* Bennett MJ.* (2012) Root gravitropism is regulated by a transient lateral auxin gradient controlled by a tipping-point mechanism. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012 Mar 20 ;109(12):4668-73. (*corr authors)

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Sassi M, Lu Y, Zhang Y, Wang J, Dhonukshe P, Blilou I, Dai M, Li J, Gong X, Jaillais Y, Yu X, Traas J, Ruberti I, Wang H, Scheres B, Vernoux T, Xu J. (2012) COP1 mediates the coordination of root and shoot growth by light through modulation of PIN1- and PIN2-dependent auxin transport in Arabidopsis. Development. 2012 Sep ;139(18):3402-12

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2011


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La Rota C, Chopard J, Das P, Paindavoine S, Rozier F, Farcot E, Godin C, Traas J, Monéger F. (2011) A data-driven integrative model of sepal primordium polarity in Arabidopsis. Plant Cell 23(12):4318-33.

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Vernoux T, Brunoud G, Farcot E, Morin V, Van den Daele H, Legrand J, Oliva M, Das P, Larrieu A, Wells D, Guedon Y, Armitage L, Picard F, Guyomarc’h S, Cellier C, Parry G, Koumproglou R, Doonan JH, Estelle M, Godin C, Kepinski S, Bennett M, De Veylder L, Traas J (2011) The auxin signalling network translates dynamic input into robust patterning at the shoot apex. Mol Syst Biol 7 : 508.

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2009


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2008


"Hamant O., Heisler MG., Jonsson H., Krupinski...". (2008)
Hamant O., Heisler MG., Jonsson H., Krupinski P., Uyttewaal M., Bokov P., Corson F., Sahlin P., Boudaoud A., Meyerowitz EM., Couder Y., Traas J. (2008) Developmental patterning by mechanical signals in Arabidopsis. Science 322 (5908), 1650-1655



L’équipe se concentre sur la morphogenèse à l’apex de la tige, plus précisément au sein du méristème apical caulinaire et des primordia de fleur.

Nos activités se regroupent dans plusieurs thématiques :
- Mécanique et développement
- Morphodynamique


Mécanique et développement

Responsable : Olivier Hamant

Au cours du développement, les changements morphologiques dépendent d’un réseau d’effecteurs moléculaires qui modifient les propriétés mécaniques des cellules, et donc leur géométrie. En retour, la croissance génère des contraintes mécaniques qui peuvent impacter le réseau de régulation moléculaire pour contrôler le développement. Plusieurs voies de mécanotransduction ont été identifiées chez les animaux, mais leur rôle dans le développement multicellulaire reste peu documenté. Les plantes sont des systèmes particulièrement adaptés à l’étude du rôle de la mécanotransduction dans le développement multicellulaire, car leur mécanique est principalement médiée par les parois. Nous avons déjà caractérisé une réponse des microtubules aux contraintes mécaniques en utilisant une série d’approches micromécaniques (Hamant et al., 2008 Science, Uyttewaal et al., 2012 Cell) et nous proposons d’identifier le rôle de la mécanotransduction dans le développement en utilisant des cultures cellulaires, les cotylédons et le méristème apical caulinaire d’Arabidopsis.


Morphodynamique

Responsable : Jan Traas

Développement de la fleur chez Arabidopsis L’architecture de la plante dépend pour une grande partie de groupes de cellules souches appelés méristèmes, qui initient les organes et en déterminent la position.

Les méristèmes définissent donc un certain nombre de traits d’intérêt agronomique évident, d’où l’importance d’étudier et comprendre leur fonctionnement. Le but de notre projet est de comprendre le fonctionnement du méristème apical caulinaire, qui génère toute la partie aérienne de la plante. Plus particulièrement, nous nous intéressons à l’initiation des boutons floraux chez la plante modèle Arabidopsis. Afin de mieux comprendre ce processus, nous utilisons des approches de génétique moléculaire et de génomique, combinées avec des approches d’imagerie in vivo. Nous menons des analyses multi-échelle à différents niveaux, moléculaire, cellulaire et tissulaire afin de les intégrer et tenter de comprendre comment les réseaux de régulations génétiques contrôlent les formes.

En parallèle, nous développons des approches de modélisation afin d’intégrer nos résultats sous forme d’un méristème virtuel, qui nous permettra de proposer de nouvelles hypothèses.

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    , par yfesseli

    L’architecture de la plante dépend pour une grande partie de groupes de cellules souches appelés méristèmes, qui initient les organes et en déterminent la position.
    Les méristèmes définissent donc un certain nombre de traits d’intérêt agronomique évident, d’où l’importance d’étudier et comprendre leur (...)