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Agenda de l'ENS de Lyon

Etude Des Interactions Supramoléculaires Entre Complexes De Lanthanides Et Acides Aminés : Application En Cristallographie Des Protéines.

Date
jeu 02 déc 2021
Horaires

14H

Intervenant(s)

Soutenance de thèse de Mme DENIS-QUANQUIN Sandrine sous la Direction de M. MAURY Olivier

Organisateur(s)
Langue(s) des interventions
Description générale

Ces travaux de thèse présentent la mise au point d’une méthode pour analyser le mode d’interaction en solution entre un complexe de lanthanides [Ln(DPA)3]3- et des protéines. Cette méthode est basée sur la mesure de diffusion par RMN de ces systèmes, qui mettent en jeu des lanthanides paramagnétiques. Après une étape d’optimisation sur un système simple diamagnétique, l’influence du paramagnétisme a été évaluée. Il apparait qu’un temps de relaxation T1 raccourci n’empêche pas systématiquement la mesure d’un coefficient de diffusion. 
La mesure de diffusion a montré son intérêt comme première étape d’une étude complète par RMN et Modélisation Moléculaire de systèmes biologiques. Cette méthode permet de caractériser une interaction supramoléculaire entre un complexe de lanthanide paramagnétique et différents partenaires en solution (petite molécule, peptide ou protéine). Elle est applicable même dans le cas d’une interaction faible ou d’un système très dynamique, et il est possible de combiner les atouts de la RMN paramagnétique et ceux des mesures de diffusion pour caractériser finement ces interactions. Le complexe [Ln(DPA)3]3-, qui est utilisé pour la détermination de structures cristallines, permet ainsi de comparer les structures d’un système protéine/complexe à l’état solide (cristal) et en solution.
La méthodologie de mesure de diffusion par RMN mise en place dans cette thèse a été utilisée avec succès pour caractériser divers systèmes supramoléculaires au laboratoire. Une étude combinant mesure de diffusion, RMN paramagnétique et Modélisation Moléculaire illustre ainsi l’intérêt de cette méthode pour un système impliquant un complexe de lanthanide.

Gratuit

Mots clés

Disciplines