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Impact des éléments transposables sur l'évolution de la régulation des gènes : Exemple du sexe chez les poissons téléostéens

Date
mar 18 mai 2021
Horaires

14H

Intervenant(s)

Soutenance de thèse de M. Corentin DECHAUD sous la direction de M. Jean-Nicolas VOLFF

Langue(s) des interventions

Description générale

Pour essayer de comprendre l'origine de la diversité des systèmes de régulation liés au sexe chez les poissons téléostéens, je me suis intéressé au rôle potentiel des éléments transposables (ET). Les  ET sont des séquences d'ADN endogènes capables de se déplacer ou de se copier dans les génomes. Bien que souvent neutres, et parfois délétères pour leur hôte, les ET peuvent aussi transporter des séquences régulatrices, comme des sites de fixation de facteurs de transcription, et les disséminer à travers les génomes. Leur forte diversité dans les génomes de poissons constitue un réservoir de séquences régulatrices disponibles. Pour tester l’influence potentielle des ET sur les systèmes de régulation du sexe, j'ai utilisé des données de séquençage d'ARN issues de gonades mâles et femelles d'Oryzias latipes, le médaka japonais. Dans un premier temps, j'ai analysé l'expression des gènes et des éléments transposables et mis en évidence des régions du génome enrichies en gènes et éléments transposables différentiellement exprimés entre les gonades mâles et femelles. De plus, les gènes et les éléments transposables proches le long des chromosomes ont tendance à présenter des biais d'expression similaires. Plusieurs autres observations suggèrent un rôle régulateur de certains éléments transposables. Dans un deuxième axe et de manière complémentaire, j'ai mis en évidence des familles d'éléments transposables physiquement enrichies dans l'environnement des gènes sexe-biaisés. Une famille candidate a été étudiée plus en détail, et j'ai pu mettre en évidence dans ces éléments des sites de fixation de facteurs de transcription connus pour être impliqués dans la fonction sexuelle.

Gratuit
Disciplines