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What genome expression can reveal for evolution and development

Soutenance HDR

Mercredi 23 nov 2016
14h00
Résumé d'Habilitation à Diriger des Recherches de Marie SÉMON (Section CNU n°64 - Biochimie, Biologie Moléculaire)

Intervenant(s)

Résumé d'Habilitation à Diriger des Recherches de Marie SÉMON (Section CNU n°64 - Biochimie, Biologie Moléculaire)

Description générale

L’étude des modes d’évolution de l’expression des gènes bénéficie de l’accumulation de données de génomique comparée. La plupart de mes recherches antérieures porte sur l’étude des liens entre l'expression du génome (le transcriptome) et diverses caractéristiques de son architecture. Un travail récent sur le lien entre l'expression méiotique et la composition des gènes illustre ce premier axe.
Les modes d'évolution de l'expression des gènes ont été largement étudiés en comparant des adultes de différentes espèces. Mais qu’en est-il des embryons?
Pour d’abord comprendre ce que mesure réellement le transcriptome d'un organe en développement, nous avons comparé le développement des molaires supérieure et inférieure de souris. Leur transcriptome révèle des différences de composition cellulaire, essentielles pour comprendre leur différence de forme chez l’adulte.
Nous avons poursuivi cette étude par des comparaisons des molaires de souris et de hamster. Nous observons une divergence rapide du transcriptome congruente avec une dérive rapide du développement, déconnectée de la morphologie adulte. Par la suite, nous comparerons les transcriptomes développementaux des molaires de deux rongeurs, la souris et l’acomys, chez qui la morphologie adulte est très similaire, mais a évolué de manière convergente.
L’étude des bases génomiques de la convergence est un moyen de mesurer les contraintes évolutives : Si les changements génomiques sont convergents eux-mêmes, alors le nombre de chemins évolutifs est limité.
Un projet collaboratif est présenté, avec une étude de l'adaptation convergente à la vie en milieu aride, impliquant la comparaison de nombreux transcriptomes de rongeurs.

Complément

Site Monod, en Salle de l'école, 1 place de l'école, au rez-de-chaussée

Disciplines