Au travers des Spécialités du Centre en Bactériologie, Virologie et Immunologie, les chercheurs du CIRI travaillent notamment à "Comprendre les maladies infectieuses pour mieux les contrôler". 

Pluralisme théorique, méthodologique et épistémologique définisse le Centre Max Weber. 

Le CRAL est un laboratoire de recherche fondamentale en astrophysique et de développement d’instruments destinés aux grands observatoires.

Le Centre de RMN à très haut champ de Lyon, en France, abrite des groupes de recherche multidisciplinaires qui participent activement au développement de la spectroscopie RMN en chimie, en physique et en biologie, y compris en médecine.

Le GATE Lyon-Saint-Etienne étudie les interactions et la coordination entre agents économiques : formation de réseaux, coopération entre agents, externalités.

Laboratoire unique en France par son positionnement chronologique, ses terrains de prédilection que sont le quart sud-est de la France et le monde méditerranéen , sa pratique de l’interdisciplinarité et du comparatisme entre les mondes chrétiens et musulmans, mais aussi à l'intérieur même de ces aires culturelles.

L’Institut d’Asie Orientale (IAO) est un centre de recherche en sciences humaines et sociales qui associe des chercheurs spécialisés en anthropologie, droit, économie, géographie, histoire, littérature, philosophie et science politique dont les travaux portent principalement sur l’Asie de l’Est et du Sud-Est, en particulier la Chine, la Corée, le Japon, le Laos, Taiwan, la Thaïlande et le Vietnam.

L'Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon (IGFL) développe un projet original et ambitieux: rassembler dans une unité de lieu des scientifiques de haut niveau provenant d'horizons très variés pour développer des recherches en génomique fonctionnelle.

L’IHRIM (Institut d’Histoire des Représentations et des Idées dans les Modernités) est une UMR transséculaire (XVIe-XXe siècles) et pluridisciplinaire (philosophie, littératures française et étrangères, musicologie, études théâtrales, histoire de l’art, histoire des sciences et des techniques).

Le laboratoire ICAR se caractérise par des activités scientifiques pluridisciplinaires focalisées sur l’analyse multidimensionnelle des usages de la langue dans l’interaction et dans le texte, appréhendée de manière outillée sur de grands corpus de données orales interactives et textuelles.