Epigénétique, chromatine et développement

Personnel du RDP

François ROUDIER

francois.roudier
(33) 4 72 72 86 04
PU ENS
Publications

Annick DUBOIS

annick.dubois
(33) 4 72 72 14 76
CR1 INRA
Publications

Aurélie VIALETTE

aurelie.vialette
(33) 4 72 72 14 79
PRAG ENS

Virginie BATTU

virginie.battu
(33) 4 72 72 86 07
TR UCBL

Bertrand HUGUENIN-BIZOT

bertrand.huguenin-bizot
IE CNRS

Daniel BOUYER

daniel.bouyer
(33) 4 72 72 86 11
CRN CNRS
Publications

Laëtitia De Faria

Laëtitia De Faria
Doctorante

Nathalie MATHY-FRANCHET

nathalie.mathy-franchet
(33) 4 72 72 86 11
AI CNRS





Notre équipe s’intéresse à l’une des questions centrales de la biologie qui est de comprendre comment les cellules acquièrent et maintiennent des identités et fonctionnalités distinctes au cours du développement. Si l’identité cellulaire est largement dictée par le profil transcriptionnel résultant de l’activité de facteurs de transcription spécifiques, la robustesse de cet état dépend du contexte chromatinien dans lequel agissent ces facteurs. Ainsi la progression d’une cellule au travers de stades de différenciation successifs, depuis les cellules souches jusqu’aux cellules matures, est guidée par des changements de programmes transcriptionnels régulés via une interaction bidirectionnelle entre facteurs de transcription et organisation chromatinienne.

Afin de comprendre comment la dynamique de l’épigénome permet aux cellules de répondre sélectivement aux signaux développementaux et environnementaux, nous développons des approches complémentaires visant à caractériser l’impact des mécanismes chromatiniens et processus épigénétiques dans la régulation de la différenciation cellulaire au sein des méristèmes apicaux d’Arabidopsis. Nous portons un intérêt particulier aux voies de répression transcriptionnelle associées aux complexes formés par les protéines du groupe Polycomb (PcG).

Trois axes de recherche, inclus dans une démarche intégrée combinant des approches génétiques, moléculaires et génomiques à résolution cellulaire ainsi que d’imagerie, sont développés dans le but de :

 caractériser la dynamique de l’épigénome au cours de la différenciation et révéler le rôle spécifique de régulateurs chromatiniens dans le fonctionnement des niches de cellules souches, la spécification du destin cellulaire et le maintien de l’identité cellulaire.

 déterminer l’impact de la dynamique des états chromatiniens sur le répertoire des cibles de facteurs de transcription (et vice-versa) au sein de différentes populations cellulaires.

 évaluer comment la variation épigénomique contribue à façonner les programmes développementaux au cours de l’évolution.

Les membres de l'équipe .
François Roudier Professeur ENS (Co-group leader)
Daniel Bouyer Chargé de Recherche CNRS (Co-group leader)
Annick Dubois Chargée de Recherche INRA
Nathalie Franchet-Mathy Assistante Ingénieure CNRS
Virginie Battu Technicienne de Recherche UCBL
Bertrand Huguenin-Bizot Ingénieur d’études bioinfo CDD CNRS
Laëtitia De Faria Doctorante (ED bmic)

Alumni
Allan Bernard (Etudiant M2 ENS)
Mohammad Muhieddine (Etudiant M2 ENS)
Tristan Conot (Etudiant L3 ENS)
Julia Buttin (IE bioinfo CDD ENS)
Goeffrey Schivre (Etudiant M1 U. Montpellier)
Alice Hugues (Etudiante M2 ENS)
Chean Sern Jacobs (Doctorant, ED bmic)
Marie Biharé (Etudiante M1 U. Lille)
Laure Cuby (Etudiante ESTBB Lyon)
Lucas Auroux (Etudiant M2 U. Strasbourg)
Emma Désert (Etudiante M1 UCBL1)
Colline Richard (Etudiante L3 ENS)
Julien Macé (IE Bioinfo ENS)
Marie France Gérentes (IE CDD ENS)
Aurélie Vialette (Agrégée Préparatrice ENS - postdoc)
Nicolas Dalle (Doctorant, ED bmic & ATER UCBL)
Marjorie Sublet (Etudiante ESTBB)
Mattéo Veyre (Etudiant Sup Biotech)
Alice Hugues (Doctorante, ED bmic)
Aleksandra Lefevre (Etudiante M1 ENS)
Jérémy Just (40%) (IR bioinfo CNRS)
Françoise Monéger (DR CNRS, Retraitée)