Le Hub Bioinformatique est une structure destinée à soutenir les analyses des projets de séquençage génomique à la disposition des membres du laboratoire RDP. Il vise à développer une culture commune autour de l’analyse des données génomiques (au sens large) au sein du laboratoire, en soutenant, formant et collaborant avec les membres du laboratoire qui entreprennent des projets bioinformatiques, ainsi qu’en promouvant les bonnes pratiques dans le traitement des données NGS.

Organisation interne

Le Hub Bioinformatique a été créé en 2024 et est composé de deux entités distincte :

• le Tech Hub, composé des ingénieurs en charge des projets (fournissant les livrables définis au moment de la soumission du projet)
• le COPIL Hub, composé de six représentants d’équipes RDP, et dont le rôle est d’évaluer les projets soumis au Hub et de gérer leur priorisation.

Les projets sont évalués et traités mensuellement.

Les activités du Hub

Nous intervenons dans

• l’analyse de données de séquençage transcriptomique et (épi)génomique (bulk RNA-seq, ChIP-seq, single-cell, long reads…)
• le soutien des membres du laboratoire (mise à disposition de facilité de calculs...)
• le (co)encadrement d’étudiants en bioinformatique
• la diffusion de connaissances et compétences (formations internes…)
• …

En 2025, plus de 40 projets ont été pris en charge par le Hub.