PUBLICATIONS : Epigenetics, Chromatin and Development

Publications HAL du labo/EPI 1001887;772

2021

Journal articles

titre
Deciphering Plant Chromatin Regulation via CRISPR/dCas9-Based Epigenome Engineering
auteur
Annick Dubois, François Roudier
article
Epigenomes, MDPI, 2021, 5 (3), pp.17. ⟨10.3390/epigenomes5030017⟩
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titre
A network of transcriptional repressors modulates auxin responses.
auteur
Jekaterina Truskina, Jingyi Han, Elina Chrysanthou, Carlos Galvan-Ampudia, Stéphanie Lainé, Geraldine Brunoud, Julien Macé, Simon Bellows, Jonathan Legrand, Anne-Maarit Bågman, Margot Smit, Ondrej Smetana, Arnaud Stigniani, Silvana Porco, Malcom J. Bennett, Ari Pekka Mähönen, Francois Parcy, Etienne Farcot, François Roudier, Siobhan M Brady, Anthony Bishopp, Teva Vernoux
article
Nature, Nature Publishing Group, 2021, 589 (7840), pp.116-119. ⟨10.1038/s41586-020-2940-2⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03021204/file/Truskina_%20main_text_all-rev6_CorrLegendFig3_withallFig.pdf BibTex

2020

Journal articles

titre
Mitotic Inheritance of PRC2-Mediated Silencing: Mechanistic Insights and Developmental Perspectives
auteur
Alice Hugues, Chean Sern Jacobs, François Roudier
article
Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2020, 11, ⟨10.3389/fpls.2020.00262⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03142734/file/2020_Hugues_Front_Plant_Sci.pdf BibTex
titre
ChIP-seq and RNA-seq for complex and low-abundance tree buds reveal chromatin and expression co-dynamics during sweet cherry bud dormancy
auteur
Noémie Vimont, Fu Xiang Quah, David Guillaume Schöpfer, François Roudier, Elisabeth Dirlewanger, Philip A. Wigge, Bénédicte Wenden, Sandra Cortijo
article
Tree Genetics and Genomes, Springer Verlag, 2020, 16 (1), pp.9. ⟨10.1007/s11295-019-1395-9⟩
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2019

Journal articles

titre
Histone acetylation orchestrates wound-induced transcriptional activation and cellular reprogramming in Arabidopsis
auteur
Bart Rymen, Ayako Kawamura, Alice Lambolez, Soichi Inagaki, Arika Takebayashi, Akira Iwase, Yuki Sakamoto, Kaori Sako, David Favero, Momoko Ikeuchi, Takamasa Suzuki, Motoaki Seki, Tetsuji Kakutani, François Roudier, Keiko Sugimoto
article
Communications Biology, Nature Publishing Group, 2019, 2, ⟨10.1038/s42003-019-0646-5⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02526385/file/2019_Rymen_Com_Biol.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
ChIP-seq and RNA-seq for complex and low-abundance tree buds reveal chromatin and expression co-dynamics during sweet cherry bud dormancy
auteur
Noémie Vimont, Fu Xiang Quah, David Guillaume-Schöpfer, François Roudier, Elisabeth Dirlewanger, Philip A. Wigge, Bénédicte Wenden, Sandra Cortijo
article
2019
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https://hal.inrae.fr/hal-02788335/file/2019-Vimont-Bioxriv-Preprint_1.pdf BibTex

2018

Book sections

titre
Cell Type-Specific Profiling of Chromatin Modifications and Associated Proteins
auteur
Ana Karina Morao, Erwann Caillieux, Vincent Colot, François Roudier
article
Plant Chromatin Dynamics, pp.111-130, 2018, ⟨10.1007/978-1-4939-7318-7_8⟩
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titre
Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-Seq) for Transcription Factors and Chromatin Factors in Arabidopsis thaliana Roots: From Material Collection to Data Analysis
auteur
Sandra Cortijo, Varodom Charoensawan, François Roudier, Philip A. Wigge
article
Root Development, pp.231-248, 2018, ⟨10.1007/978-1-4939-7747-5_18⟩
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2017

Journal articles

titre
Epigenetic memory and cell fate reprogramming in plants
auteur
Kenneth D. Birnbaum, François Roudier
article
Regeneration, 2017, 4 (1), pp.15-20. ⟨10.1002/reg2.73⟩
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2016

Journal articles

titre
Transcriptional Regulation of Arabidopsis Polycomb Repressive Complex 2 Coordinates Cell-Type Proliferation and Differentiation
auteur
Miguel De Lucas, Li Pu, Gina Turco, Allison Gaudinier, Ana Karina Morao, Hirofumi Harashima, Dahae Kim, Mily Ron, Keiko Sugimoto, François Roudier, Siobhan M. Brady
article
The Plant cell, American Society of Plant Biologists (ASPB), 2016, 28 (10), pp.2616-2631. ⟨10.1105/tpc.15.00744⟩
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titre
Emerging concepts in chromatin-level regulation of plant cell differentiation: timing, counting, sensing and maintaining
auteur
Ana Karina Morao, Daniel Bouyer, François Roudier
article
Current Opinion in Plant Biology, Elsevier, 2016, 34, pp.27-34. ⟨10.1016/j.pbi.2016.07.010⟩
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