Les cours sont présentés de manière cohérente au sein de thématiques scientifiques du Master SdM, mais le choix des cours, hors enseignements obligatoires, reste assez libre. Un minimum de crédits ECTS doit être acquis pour valider une majeure Physique ou Chimie.
Majeure Chimie
Anglais 1 ou LV2
Layla Roesler
Pour chaque cours, le niveau de langue requis (B1, B2, C1, selon l’échelle du cadre européen des langues) est précisé.
L’année se structure autour de deux axes pour des cours de niveaux B1/B2/B2+/C1/C1+:
- Cours à thèmes ou compétences scientifiques : science, civilisation/histoire, littérature, anglais pour la recherche, communication orale.
- Préparation à la certification Cambridge English (CAE) en 3 étapes graduées : step 1 (B1), step 2 (B2), step 3 (C1)
L’évaluation prend en compte le contrôle continu et l’assiduité aux cours.
Les primo-arrivants doivent passer un test de niveau.
Plus d'informations sont disponibles sur le site du centre de langue.
L’évaluation est répartie équitablement entre Contrôle Continu (assiduité prise en compte) (50%) et examen final (50%). Les épreuves comprennent une présentation orale à partir d’un article de spécialité et un examen "Aural Comprehension".
Les étudiants étrangers peuvent substituer le module d’Anglais par un module de Français Langue Étrangère.
Chimie expérimentale 1
Thibault Fogeron
Thibault Fogeron
Martin Vérot
Pablo Mariani
Marine Labro
Louise Pinet
Chimie expérimentale 1 (L3) ou équivalent.
Le but de ce module est de permettre aux étudiants de chimie de consolider les gestes opératoires de base qu’ils ont pu acquérir en licence, tout en offrant une formation à des techniques de synthèse et de caractérisation physico-chimiques nouvelles.
Outre des synthèses classiques de chimie organique, les étudiants pourront ainsi se familiariser avec la synthèse de complexes de métaux de transition, de nanoparticules d’or ou de perovskites (chimie organométallique et inorganique).
Les techniques de caractérisation mises en œuvre iront de la spectroscopie UV-visible à des techniques de caractérisation électrochimique, en passant par l’élaboration de rendement quantique de fluorescence ou encore par l’utilisation de spectroscopie RMN pour déterminer un excès énantiomérique.
6 TP de 4h à réaliser en binôme, chaque vendredi.
TP I : Synthèse de perovskites et détermination d'un rendement quantique
TP II.1 : Addition de Mickaël énantiosélective (synthèse)
TP II.2 : Addition de Mickaël énantiosélective (purification et détermination d'un excès énantiomérique par RMN)
TP III : Synthèse et caractérisation de nanoparticules d'or
TP IV : Synthèse d'un complexe de métal de transition sous atmosphère inerte
TP V : Caractérisation électrochimique d'un complexe de métal de transition
Contrôle continu : compte-rendu de TP sous forme de réponses aux questions des enseignants, à rendre d’une séance à l’autre.
Tenue d’un cahier de laboratoire, écrit sur place et évalué en fin de module par les enseignants.
Chimie expérimentale 2 : TFC
Belén Albela
Bruno Sécordel
Vincent Wieczny
Floris Chevallier
Laurent Bonneviot
Jens Hasserodt
Laure Guy
Carine Michel
Belén Albela
Chimie Expérimentale 1 (M1) ou équivalent.
Cet enseignement s’appuie une démarche de projet à partir de sujets ouverts et balayant de larges pans de la chimie sélectionnés parmi les problèmes du Tournoi Français des Chimistes de l’année en cours (TFChim, https://www.tfchim.fr/). Il est attendu une démarche autant bibliographique qu’expérimentale.
L’objectif est d’utiliser les différentes techniques de synthèse et de caractérisation physico-chimiques, découvertes dans les modules précédents de chimie expérimentale. Chaque sujet sera abordé par un binôme d’étudiants, en tant que porteurs de projet. Ils seront accompagnés dans leurs démarches par des enseignants-chercheurs référents.
- Six séances de 4h de pratique expérimentale au laboratoire (vendredi matin ou après-midi).
- Des séances de tutorat le mercredi après-midi qui permettront de discuter avec les encadrants de l’avancement du projet, et de le présenter aux autres étudiants du groupe.
- Contrôle continu : recherche bibliographique, mise en place des expériences, tenue du cahier de laboratoire, analyse des résultats obtenus.
- Présentation orale du projet.
Anglais 2 ou LV2
Layla Roesler
Pour chaque cours, le niveau de langue requis (B1, B2, C1, selon l’échelle du cadre européen des langues) est précisé.
L’année se structure autour de deux axes pour des cours de niveaux B1/B2/B2+/C1/C1+:
• Cours à thèmes ou compétences scientifiques : science, civilisation/histoire, littérature, anglais pour la recherche, communication orale.
• Préparation à la certification Cambridge English (CAE) en 3 étapes graduées : step 1 (B1), step 2 (B2), step 3 (C1)
L’évaluation prend en compte le contrôle continu et l’assiduité aux cours.
Plus d'informations sont disponibles sur le site du centre de langue.
L’évaluation est répartie équitablement entre Contrôle Continu (assiduité prise en compte) (50%) et examen final (50%). Les épreuves comprennent une présentation orale à partir d’un article de spécialité et un examen "Aural Comprehension".
Les étudiants étrangers peuvent substituer le module d’Anglais par un module de Français Langue Etrangère.
Seminaires et professionnalisation
Sébastien Manneville (Physique) et Jens Hasserodt (Chimie)
Dans le cadre de l'UE « Séminaires et Professionnalisation », les étudiant.e.s assistent à des séminaires ainsi qu'à quelques réunions obligatoires qui ont lieu le mercredi après-midi. Les séminaires spécifiques à la formation Sciences de la Matière ont lieu à l'ENS de Lyon et sont donnés par des chercheur.se.s invité.e.s à présenter leur domaine et leurs recherches. A ces séminaires s'ajoutent divers événements qui ont lieu sur le site de l'Université Lyon 1 à Villeurbanne : les « grandes conférences de la FRAMA » (Fédération de Physique de Lyon), les « cours du Collège de France hors les murs », ainsi que le cycle de conférences « Physique et Chimie au Printemps ». L'UE comprend également une série de présentations plus générales sur les débouchés de la formation, sur les liens entre science et société ou encore visant à l'acquisition de « soft skills » utiles quelle que soit l'orientation future des étudiant.e.s.
L'UE « Séminaires & Professionnalisation » est évaluée par un rapport écrit de 2 pages sur un des séminaires de l'année, ainsi que par l'assiduité (émargement à au moins 6 séminaires sur l'année et présence aux réunions).
Projet en chimie expérimentale
Jens Hasserodt, Tangui Le Bahers
Bruno Sécordel, Jens Hasserodt, Tangui Le Bahers
Chimie Expérimentale 1 (CHIM4103) et Chimie Expérimentale 2 (CHIM4104) ou équivalent
Deux possibilités sont offertes aux étudiants en début de module :
- Poursuivre les projets du Tournoi Français des Chimistes de l’année universitaire en cours (TFChim, https://www.tfchim.fr/), déjà commencé en Chimie Expérimentale 2 (CHIM4104). Les expériences seront effectuées dans les laboratoires d’enseignement de l’ENS de Lyon.
- Préparer un nouveau projet inscrit dans les thématiques propres à un des laboratoires de l’ENS de Lyon ou bien de l’Université Lyon 1. Le projet doit être original et comporter un travail de recherche bibliographique, suivi de sessions expérimentales ou numériques, qui seront effectuées au sein du laboratoire d’accueil.
Pour les étudiants qui vont poursuivre la préparation des projets du TFChim :
- Six séances de 4h de pratique expérimentale au laboratoire (vendredi matin ou après-midi).
- Des séances de tutorat le mercredi après-midi qui permettront de discuter avec les encadrants de l’avancement du projet, et de le présenter aux autres étudiants du groupe.
- Des séances d’entraînement pour préparer spécifiquement l’épreuve orale du TFChim.
Pour les étudiants effectuant un projet dans un laboratoire de recherche : 24h de pratique expérimentale ou numérique au laboratoire, à définir avec l’encadrant.
Pour les étudiants qui vont poursuivre la préparation d’un projet du TFChim :
- Contrôle continu : recherche bibliographique, mise en place des expériences, tenue du cahier, analyse des résultats obtenus, travail en équipe.
- Présentation orale selon le format du TFChim.
Pour les étudiants effectuant un projet dans un laboratoire de recherche :
- Contrôle continu : recherche bibliographique, mise en place des expériences, tenue du cahier, analyse des résultats obtenus.
- Rapport écrit type article scientifique : introduction, résultats, discussion, conclusions et références (10 pages maximum).
- Présentation orale devant un jury.
Stage de recherche de 3 mois Chimie
Vincent Krakoviack (Chimie)
Description spécifique pour chaque étudiant.e.
Stage dans un organisme de recherche public ou privé, de recherche fondamentale ou appliquée, en France ou à l'étranger. Ce stage sera de 12 semaines de présence à temps plein et se terminera par la rédaction d'un rapport et la réalisation d’une soutenance devant un jury composé de chercheurs et/ou enseignants-chercheurs. Il s'agit pour l'étudiant de prendre contact avec le monde de la recherche, encadré par un responsable, impliqué dans un réel sujet de recherche et participant aux diverses activités de l’équipe.
La note de l’examen tiendra compte du rapport écrit, de la soutenance (exposé + questions) et de l’avis du maître de stage.
Stage de recherche en chimie
Matthias PAULY
Ce stage, qui dure tout le semestre (24 semaines), permet d'acquérir une vraie expérience en laboratoire de recherche. L'étudiant·e choisira librement son sujet et son laboratoire d'accueil, en France ou à l’étranger, avec l'accord des responsables de formation.
- Mener en laboratoire un projet de recherche individuel sur un temps "long"
- Mettre en œuvre un protocole de recherche, de sa conception à la rédaction d'un rapport
- Acquérir une expérience de recherche sur un format préparant à la thèse
- Apprendre à communiquer ses résultats avec rigueur, devant un public expert
- Débattre de ces résultats
Stage de 24 semaines à effectuer entre début janvier et mi-juillet dans le domaine de la recherche en chimie, dans un laboratoire académique (sauf cas particulier, tels que les Doubles Diplômes EPFL/Centrale/Polimi). Le sujet pourra avantageusement être dans la continuité du rapport bibliographique.
Rapport écrit + soutenance orale. Un jury est composé spécifiquement pour chaque stage en invitant deux membres experts du sujet.
Matière condensée
Benjamin Huard
B. Huard
D. Amans
R. Houvenaghel
S. Joubaud
Les prérequis pour suivre ce cours sont les suivants : mécanique quantique (niveau L3), thermodynamique statistique (niveau L3).
La matière condensée étudie les systèmes où les interactions et corrélations entre un grand nombre de constituants donnent naissance à des comportements collectifs et à des phénomènes émergents. Un de ses principaux sujets d’étude est l’état solide.
C’est un domaine extrêmement fertile et actif. C’est aussi le sous-domaine de physique qui compte de loin le plus de physiciennes et physiciens. C’est un domaine qui va des applications qui changent concrètement nos vies (comme les semiconducteurs pour l’éclairage, l’informatique, ou les communications) aux concepts mathématiques les plus abstraits qui tissent des liens vers d’autres disciplines (topologie, physique des hautes énergies, astrophysique, …) en passant par la chimie des matériaux.
Le cours et les travaux dirigés permettront notamment de répondre aux questions suivantes. Comment la matière est-elle structurée ? À quelle vitesse peut-on refroidir la matière en s’approchant du zéro absolu ? Qu’est-ce qui rend un matériau conducteur ou isolant ? Transparent ou opaque ? Que sont les quantas d’excitation dans la matière ? Quelle est la forme des ondes sonores classiques et quantiques ? Quels effets quantiques peut-on observer dans les conducteurs mésoscopiques ? Comment figer les électrons par le désordre ou les interactions ?
Parmi les thèmes de recherche actuels dans ce domaine, et qui nécessitent une bonne compréhension des bases données dans ce module, on peut citer le transport cohérent dans les systèmes mésoscopiques, la localisation d'Anderson et la localisation à N corps dans les systèmes désordonnés, les effets Hall quantiques entiers et fractionnaires, les phases de Berry et la topologie des bandes de Bloch, les isolants et semi-métaux topologiques, les instabilités des liquides de Fermi, les aspects modernes du magnétisme quantique (spinons, lacune de Haldane, liquides de spin et code torique), la condensation de Bose-Einstein, la superfluidité et la supraconductivité, les bits quantiques supraconducteurs et semi-conducteurs, la supraconductivité à haute température, les supraconducteurs topologiques et les fermions de Majorana. Le domaine a par ailleurs des liens directs avec d'autres domaines, en particulier les gaz atomiques ultra-froids, les cristaux photoniques et la science de l'information quantique.
Le cours de matière condensée introduit les bases de ce domaine. Il est donc essentiel pour suivre les modules plus spécialisés comme celui de supraconductivité, superfluidité et magnétisme, de physique quantique à N corps, de nanophysique et de phases topologiques.
- Introduction
- Sonder la structure de la matière
- Diffraction élastique des rayons X
- Réseau réciproque
- Diffraction inélastique des neutrons
- Types de cristaux (ionique, covalent, métallique, moléculaire, hydrogène)
- Décrire les vibrations de la matière
- Modes de vibration dans un cristal classique
- Capacité calorifique des isolants
- Excitation quantique de vibration : le phonon
- Sonder les phonons
- Structure électronique de la matière (en négligeant les interactions)
- Modèles de Drude et de Hall
- Théorème de Bloch
- Structure de bandes
- Modèle des liaisons fortes
- Fonctions de Wannier
- Graphène
- Capacité calorifique des métaux
- Transport des électrons : théorie semi-classique
- Dynamique des paquets d’onde dans les bandes de Bloch
- Trous
- Equation de Boltzmann
- Conducteurs mésoscopiques
- Bruit de grenaille
- Semiconducteurs
- Localisation d’Anderson et localisation faible
Examen écrit de 3h en fin de semestre.
Le cours est structuré suivant ce livre :
Modern Condensed Matter Physics
Steven M. Girvin, Kun Yang
Les livres suivants sont également d’excellentes références :
The Oxford Solid State Basics (introduction au domaine niveau L3)
Steven H. Simon
Solid State Physics (grand classique des années 1970)
N.W. Ashcroft, N.D. Mermin
Introduction to Solid State Physics (introduction au domaine niveau L3)
Charles Kittel
Principles of Condensed Matter Physics (bon livre pour la matière molle)
Paul Chaikin, T.C. Lubensky
Modélisation quantique des matériaux
Tangui Le Bahers
Tangui Le Bahers
Raphael Rullan
Modélisation Quantique des Molécules (M1 S1A), Modélisation Moléculaire (L3), Mécanique Quantique (L3) ou équivalent.
Ce cours a trois objectifs généraux :
1- Familiariser les étudiants aux concepts fondamentaux de structure électronique des solides (théorie du gaz d’électron libre, théorie des liaisons fortes, modèle des bandes…).
2- Présenter la manière dont les méthodes de chimie quantique modernes (principalement la DFT) s’adaptent aux systèmes périodiques.
3- Donner une première expérience de calculs périodiques avec un code utilisant une base localisée (CRYSTAL) et un code utilisant une base d’ondes planes (VASP) sur des systèmes réalistes (matériaux semiconducteurs, surface de catalyseur…)
Partie I : Structure électronique des solides
Modèle du gaz d’électrons libre
Loi d’Ohm
Théorie des bandes
Propriétés des solides (masse effective, interaction lumière-matière)
Partie II : calcul de chimie quantique pour les solides
Maillage en points-k
Bases localisées
Bases d’ondes planes
Spécificité des calculs de chimie quantique en condition aux limites périodiques
Partie III : Quelques illustrations
Systèmes 3D-périodique (propriétés élastiques, propriétés opto-électroniques de semiconducteurs)
Systèmes 2D-périodiques (nanoparticules sur surface)
Systèmes 1D-périodique (nanotube de porphyrine)
TP :
Utilisation du code CRYSTAL pour étudier le diamant
Utilisation du code VASP pour étudier une surface de palladium
Un mini projet à réaliser parmi 7 sujets proposés (thématique : catalyse, photocatalyse, photonique, métaux moléculaires, semiconducteurs).
Les étudiants seront évalués sur la base d’un rapport lié au projet qu’ils auront réalisés lors des TD/TP.
Modélisation quantique des molécules
Tangui Le Bahers
Tangui Le Bahers
Bogdan Marekha
Modélisation Moléculaire (L3), Mécanique Quantique (L3) ou équivalent.
Ce cours présente le concept de surface d’énergie potentielle et les méthodes qui permettent de remonter à des propriétés chimiques (thermodynamiques, cinétiques…) à partir de cette surface. Sur le plan théorique, ce cours introduit la théorie de la fonctionnelle de la densité, la méthode de chimie quantique la plus utilisée aujourd’hui. Nous verrons comment la densité électronique peut servir à la fois d’objet pour déterminer l’énergie d’un système mais aussi d’objet d’analyse de la liaison chimique, comme les orbitales moléculaires dans les théories de la fonction d’onde.
Partie I : Introduction à la surface d’énergie potentielle
1- Qu’est ce qui caractérise une réaction ?
2- La surface d’énergie potentielle.
3- Comment calculer l’énergie d’un système ?
Partie II : La théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT)
1- Principe de la DFT
2- La DFT dans le cadre de la méthode Kohn-Sham
Partie III : Se déplacer sur la surface d’énergie potentielle
1- Optimisation de géométrie
2- Recherche des états de transitions
3- Extraction des grandeurs thermodynamiques et cinétiques
Partie IV : La densité électronique comme objet d’analyse
Examen écrit et évaluation des projets par un oral et un rapport écrit.
Principes de base de la RMN
Louise Pinet
Louise Pinet
Gabriel Balavoine
Sami Jannin
Quantum mechanics (L3) or equivalent.
This course is aimed at students who already have some familiarity with NMR spectroscopy, and who wish to deepen their understanding of how NMR experiments actually ‘work’. We concentrate on the description of common experiments, and explain in detail the phenomena behind these experiments. The quantum mechanical tools needed to analyse pulse sequences are introduced step by step, and are then applied to a series of one-dimensional and two-dimensional NMR experiments (COSY, DQF-COSY, TOSCY, DQ spectroscopy, INEPT, HSQC, HMQC, HMBC). Finally, we introduce the quantum mechanical tools needed for understanding electronic spins, and how they are observed by EPR spectroscopy.
- Introduction to NMR spectroscopy
- Energy levels and NMR spectra
- The vector model of pulsed NMR and pulse sequences
- Introduction to relaxation
- Fourier transformation and NMR
- The quantum mechanics on one nuclear spin
- Product operators
- Two-dimensional NMR (COSY, DQF-COSY, TOSCY, DQ spectroscopy, INEPT, HSQC, HMQC, HMBC)
- EPR
Assessment is made by a single written examination (2h) given at the end of the course.
Spectroscopie électronique
Bogdan Marekha
Bogdan Marekha
Eliott Vandevoir
L3 : Mécanique quantique, Modélisation Moléculaire, Atome Molécules et Liaisons, Théorie des groupes et Spectroscopies.
La spectroscopie électronique permet de sonder la structure électronique des couches de valence et de cœur à l'aide des rayonnements UV-visible et X, respectivement. Nous aborderons les spectroscopies d'absorption, d'émission et de photoémission d'électrons dans un cadre commun, fondé sur l'étude des transitions entre des états couplés par l'interaction avec le rayonnement. Nous présenterons les règles de sélection, les facteurs influençant l'allure des spectres, ainsi que la mise en œuvre expérimentale et les principales applications. Les séances de TD porteront sur l'étude de cas concrets et de modèles simples.
Plan du cours
1. Interaction lumière-matière
Mots clés : règle d'or de Fermi, moment dipolaire de transition, règles de sélection
2. Spectroscopie d'absorption électronique
Mots clés : principe de Franck-Condon, symétrie des transitions électroniques, solvatochromisme
3. Spectroscopie d'émission
Mots clés : diagramme de Perrin-Jablonski, décalage de Stokes, règle de Kasha-Vavilov, rendement quantique, anisotropie de fluorescence
4. Spectroscopie de photoémission d'électrons et méthodes apparentées
Mots clés : UPS, XPS, XES, XAS, théorème de Koopmans
- appliquer les règles de sélection aux transitions électroniques ;
- relier les caractéristiques spectrales à la structure électronique et à l'environnement chimique ;
- choisir une technique spectroscopique adaptée à une problématique donnée.
Examen écrit de 2h.
Spectroscopie : Cours et exercices
J. Michael Hollas
Photophysique et photochimie : des fondements aux applications
J. Delaire, J. Piard, R. Méallet-Renault, G. Clavier
Spectroscopie moléculaire
E. Biémont
Molecular spectroscopy
J. L. McHale
Modern optical spectroscopy
W. W. Parson
Catalyse: du fondamental aux applications industrielles
Pascal Raybaud
P. Raybaud + Intervenants IFPEN
Matériaux et Nanomatériaux : concepts et applications (L3, fortement conseillé), Physique – Chimie – Biologie (L3, fortement conseillé), Réactivité en chimie organique (L3, conseillé), Chimie expérimentale 1 (L3, conseillé), ou équivalent.
Le cours vise, d’une part, à acquérir les connaissances sur les principes fondamentaux de la catalyse et, d’autre part, à comprendre leurs mises en œuvre au travers de grandes familles grandes familles de réactions catalytiques. Les concepts clefs des catalyseurs hétérogènes (métalliques, oxydes...), homogènes (organométalliques) et enzymatiques seront enseignés.
Pour les aspects fondamentaux, le cours expliquera le rôle d’un catalyseur et la spécificité de la catalyse hétérogène via la description des étapes de la réaction d’une molécule sur une surface. En particulier, les étapes d’adsorption et d’activation d’une molécule seront présentées. Différents modèles thermodynamiques et cinétiques d’adsorption et de réaction seront introduits.
Par ailleurs, le cours présentera différents exemples révélant l’enjeu de la catalyse dans des procédés industriels éco-efficients, de la conversion de la biomasse ou du recyclage des plastiques. Le lien entre produits visés, spécifications, conditions réactionnelles et choix optimaux des catalyseurs sera illustré. Il visera une compréhension du fonctionnement des catalyseurs grâce à une description des phénomènes réactionnels depuis l'échelle atomique jusqu'à l’échelle industrielle. Le cours permettra aussi d’acquérir des connaissances sur différentes approches expérimentales (préparation, caractérisation et test) et théoriques (simulation quantique, modélisation cinétique) utilisées dans le contexte de la recherche en catalyse.
Note : Les TD (1/3 heures) seront constitués d’exercices d’application et d’analyses d’articles
Partie I : Principes fondamentaux de la catalyse
I.1 Enjeux et rôle des catalyseurs
I.2 Interaction molécule/surface - Physisorption/Chimisorption
I.3 Etude thermodynamique de l’adsorption (isotherme de Langmuir, modèle BET)
I.4 Modèles cinétiques de la réaction (état de transition, Langmuir-Hinshelwood)
Partie II. Cas d’études en catalyse hétérogène
II.1 Activation des liaisons C-C et C-H en catalyse métallique : hydrogénation, déshydrogénation, hydrogénolyse
II.2 Activation des liaisons C-S, C-N, C-O en catalyse par les sulfures : hydrotraitement et hydrodéoxygénation de la biomasse
II.3 Activation des liaisons C-C et C-O par catalyse acide et bifonctionnelle : isomérisation, craquage, déshydratation
II.4 Transformation de la biomasse en carburants et intermédiaires de la chimie
II.5 Préparation des catalyseurs
Partie III. Autres catalyses
III.1 Catalyse homogène
III.2 Catalyse enzymatique
Examen écrit (2h)
Macromolecules
Julien Leclaire
J. Leclaire
E. Moulin
B. Sécordel
Fundamental Organic Chemistry L3 S1AFundamental Organic Chemistry L3 S1A
- Interdisciplinary teaching unit accessible to students attending the Inorganic, (nano)materials, catalysis (IMC) and Supramolecular, Organic and Biochemistry curriculum to better understand the reactivity and physical chemistry of macromolecules.
- Understand and use the general principles of polymer design and the associated analytical tools enabling to explore their properties and how these are correlated to their structure
- Opening toward industrial application (traditional material such as polyurethanes, polycarbonates, polyolefins, polylactic acids but also biosourced, renewable and self-repairing polymers, including biomacromolecules).
1. Macromolecules and reactivity : from synthesis to self-assembling and repair (step growth, chain growth, living polymerization, metathesis, co-polymerization, reticulation, reversible (non)-covalent, chain recombination, etc..)
2. Structure – Properties relationship : from conformation and tacticity to remarkable thermomechanical and electrical properties under extreme stress (average molecular weight, dispersity, topology, rheological, thermomechanical, swelling, adhesion, conductivity
3. Macromolecules and biological medium
a. Biomacromolecules: from the building blocks of life to self-replication
b. From Biocompatible materials to hybrid conjugates
4. Integration of macromolecules into material and devices : from separative chemistry (chromatography and beyond) to artificial muscles, solar and fuel cells. Initiation to eco-design.
Written final exam (1 h 30) and quiz during sessions + article analysis.
Eléments de la série d: fondamentaux
Belen Albela et Thibault Fogeron
Belén Albela
Thibault Fogeron
Atomes et Molécules (L3), Modélisation Moléculaire (L3), théorie des groupes (L3) ou équivalent.
Ce cours a pour but d’apporter les différents outils pour décrire les complexes de métaux d. Ces complexes de métaux de transition seront décrits à la voie du point de vue de leur structure chimique et électronique. L’accent sera particulièrement mis sur les effets d’environnement et la chimie orbitalaire des complexes de métaux de transition. Enfin, sur le plan expérimentale, différentes voies de synthèse de ces complexes seront présentées.
- Introduction –nomenclature
- Chimie organométallique
- Champ cristallin/champ de ligand
- Géométrie des complexes
- Cinétique de la complexation
- Thermodynamique de la complexation
- Stratégie de synthèse des complexes
Examen écrit + prise en compte de la participation aux TDs et aux QCM sur le portail des études
Point de vue sur un thème de recherche actuel : Atomes & Photons
Benjamin Besga
Audrey Bienfait
Benjamin Besga
Audrey Bienfait
Le cours nécessite d’avoir suivi le cours Mécanique quantique L3 ou équivalent. Il est conseillé mais pas obligatoire d’avoir suivi le cours de M1 Mécanique Quantique Avancée et le cours de M1 d’optique quantique.
Série de cours donné par un/plusieurs conférencier.es invité.es sur un domaine de recherche actuel en physique et/ou en chimie.
Cette année, le cours sera consacré à la thématique « Atomes & Photons ».
Le but du cours est de donner une description quantique de l’interaction lumière-matière. Cette interaction fondamentale se retrouve dans de nombreux systèmes des technologies quantiques. Nous explorerons différentes facettes de cette interaction : couplage fort, couplage faible et couplage collectif, ainsi que les applications au contrôle et aux mesures quantiques.
Cours 1 : introduction à l’interaction lumière-matière
Cours 2 : implémentations physiques
Cours 3 : systèmes quantiques ouverts
Cours 4 : un atome en cavité
Cours 5 : régime de couplage fort
Cours 6 : régime de couplage faible et interaction avec N modes.
Cours 7 : application aux mesures quantiques
Cours 8 : couplage collectif à N atomes
Examen écrit de 2h.
Exploring the Quantum (Haroche et Raimond)
Photons et atomes, Introduction à l’électrodynamique quantique (Claude Cohen-Tannoudji, Jacques Dupont-Roc)
Thermodynamique des systèmes physico-chimiques
Vincent Krakoviack
Vincent Krakoviack
Thermodynamique niveau prépa ou licence ; des bases de thermodynamique statistique peuvent être un plus, mais ne sont pas indispensables.
Ce cours a pour but d'introduire les concepts et modèles de la thermodynamique classique utiles à la compréhension de systèmes physico-chimiques divers, corps purs, mélanges et solutions, dans différents états de la matière et avec des niveaux variables de complexité. Son objectif est de se confronter à l'étude des systèmes réels, avec des écarts à l'idéalité pouvant être significatifs, et de montrer, par exemple, comment certains comportements macroscopiques assez génériques (tels que l'azéotropie ou la démixtion) nous informent sur la structure et les interactions des constituants microscopiques de ces systèmes. Réciproquement, on envisagera le cas de structures et interactions spécifiques (amphiphiles, mésogènes) donnant lieu à des comportements plus particuliers (micellisation, cristaux liquides).
Le cours commencera par des rappels et compléments de thermodynamique générale (conditions d'équilibre, évolution vers l'équilibre, stabilité, extensité/intensivité, potentiel chimique, relations de cohérence). Puis, on discutera
* le gaz réel (coefficients du viriel, gaz de van der Waals et apparentés, conséquences de la non-idéalité et équilibre liquide-vapeur)
* les mélanges de petites molécules, leurs diagrammes de phase et la physique des phénomènes sous-jacents,
* l'eau et les solutions aqueuses, hydrophilicité et hydrophobicité,
* les solutions de polymères (modèle de Flory-Huggins),
avec à chaque fois des exemples d'application : solubilité, phénomènes osmotiques, etc.
Examen écrit
Simulations numériques et thermodynamique statistique
Ralf Everaers
Ralf Everaers
Classical mechanics, and basic notions of thermodynamics and statistical mechanics (L3), Python
Statistical Physics deals with behavior that emerges from the interactions of many particles. Since exact analytical solutions of the governing equations only exist for a small number of models, computer simulations have become an indispensable tool in the field and neighboring disciplines like Condensed Matter Physics, Theoretical and Physical Chemistry, Chemical and Biological Physics.
The course introduces the methods employed for exploring the static and dynamic properties of particle based systems. Computational exercises, where these methods are applied to simple, but powerful models, form an integral part of the module. To some extent it offers a fresh start, if you found the subject interesting, but a little mysterious, because the course inverses the order in which the subject is typically taught: starting from simulations allows to "discover" the laws of Statistical Mechanics and Thermodynamics in a very direct and intuitive manner.
- From Mechanics to Statistical Mechanics: Just do it?
Lecture: A quote by Laplace defines a research program for modern science:
- identify particles, interactions and equations of motion
- Solve for many particles
- Observe/understand the emergent behavior
Modern computers allow for a quantitative implementation of such thought experiments.
- Simulating Gases
Lecture: We start with the simplest non-trivial many particle simulation technique: The combination of Exact Dynamics with Multi-particle collisions.
For some examples of non-interacting many-particle systems we can solve Newton's equations of motion exactly: free particles, harmonic oscillators, ... We can use these analytical solution to define the "streaming part" of a time step.
- The "collision part" adds the effect of confining walls and, most importantly, collisions between groups of neighboring particles.
- TD: From Newtonian dynamics to the ideal gas law
- Your mission is to achieve the great unification of the laws of Newton, Boyle, Charles, Avogadro and Gay-Lussac ...: do the latter "emerge" in a simple model, where gas "atoms" move ballistically in between energy- and momentum conserving collisions?
- To make this point you need to carry out a complete simulation project (run simulations for large variety of combinations of particle number, volume, box shape, internal energy and particle mass; analyze data for the instantaneous pressure; compare data sets to theory)
- Molecular Dynamics Simulations for Liquids and Solids: Basics
Lecture: For systems at higher density we can no longer neglect the effect of the interactions between the particles. The method of choice for their exploration are Molecular Dynamics simulations.
- time- vs event-based MD
- TD: The MD time step
The central part of most Molecular Dynamics algorithms is the integration of the equations of motions for particles interacting via continuously varying potentials. In this exercise we explore for the simple example of harmonic and non-linear oscillators
the (forward) Euler algorithm and
- the different formulations of the Verlet algorithm
- Molecular Dynamics Simulations: Lennard-Jones systems
In this practical 4h session you will explore the behavior of many-particle systems for a simple model system. During the TD part of the session you will learn how to run and analyze simulations of LJ systems. During the mini-project part of the session you will explore the emergent behavior on your own. The objective is
1) To observe the emergence of typical behavior of liquids and crystalline solids2) To explore the transition from the liquid to the solid state as a function of the density of the system.
- From Classical Mechanics to Statistical Mechanics and Thermodynamics
- TD: Heat Flow
- Following Laplace's instructions we have by now learned how to simulate ideal gases, systems composed of harmonic oscillators, and many-particle systems with WCA- and LJ-interactions. And we have seen that isolated many-particle systems evolve to equilibrium states, whose macroscopic properties are time-independent.
- But what happens, when we allow such systems to exchange energy?
- Lecture: A little review in the light of what you will have learned at this point:
- Classical Mechanics
- Collisions and conservation laws, Newton's, Lagrange's and Hamilton's mechanics, Noether's theorem: symmetries and conservation laws, Laplace's "instructions": give up, because we cannot predict the exact time evolution of all microscopic degrees of freedom?
- Thermodynamics
- Equilibrium states and equilibration, state variables, the basic problem of thermodynamics, entropy, thermodynamic potentials, the nature of the predictions made by thermodynamics
- Statistical Mechanics
- Phase space, trajectories, phase space densities and the link between the microscopic and the macroscopic view, entropy, the ensembles of statistical mechanics, equilibration and H-theorem
- Simple models for interacting systems
- Lattice gas, Lennard Jones particles, Ising spin model
- Classical Mechanics
- TD: Heat Flow
- Exact Enumeration and Monte Carlo Simulations
- Up this point we will have followed Laplace's instructions and carried out computer simulations, where we solve Newton's equations of motion for small model systems. But having discovered Gibb's formalism for calculating ensemble averages over phase space, a new question arises: can't we use a computer to calculate these averages for us numerically?
- TD: Exact Enumeration of the 2d Ising Model
- A classic example for the evaluation by hand of a partition functions and of an expectation value in the canonical ensemble is the behavior of a single spin in an external field.
- In this exercise we explore, how much farther we can go by numerically evaluating the partition function of 2d Ising models.
- Representations of Ising states (binary numbers vs matrices)
- Calculating observables
- Ising order parameters
- Enumerating all microstates of the 3x3 and the 4x4 Ising model
- Calculating EXACT equations of state
- Lecture:
- Instead of generating ALL possible microstates, it might be enough to generate representative samples. This is the idea behind Monte Carlo Simulations, which allow to calculate integrals over the high-dimensional phase or configuration spaces of Statistical Mechanics.
- After a brief discussion of Random or Simple Sampling, the lecture focuses on the Metropolis et al. Dynamic Monte Carlo method for Importance Sampling
- TD: Metropolis Monte Carlo Simulations of the Ising Model
- Use MC simulations to explore the behavior of the Ising model for different combinations of the reduced field and coupling strength (h,k).
- Explore
- the effect of increasing the external field in the absence of internal couplings
- the effect of increasing the internal coupling in the absence of an external field
- the effect of antiferromagnetic couplings k<0
- the effect of an additional magnetic field
- different initial conditions
- Learn about equilibrating simulations and assembling data.
- Calculating free energies
- Lecture: Thermodynamic integration
- Metropolis importance sampling and Molecular Dynamics simulations allow to measure averages of "mechanical observables," whose values are defined for individual microstates. However they provide no direct access to the equally important "thermodynamic observables” like the entropy or free energies, which are related to the absolute size of phase space.
- There is nothing strange about this inability of simulators, experimentalists do not dispose of free-energy-o-meters or entropy-o-meters either. Instead we all determine free energy DIFFERENCES via thermodynamic integration of measurable(!) derivatives of the free energy.
- Kirkwood coupling parameter scheme
- Lecture: Thermodynamic integration
Rapport résumant les results obtenus dans les exercises.
- Frenkel and Smit, Understanding Molecular Simulation
- Allen and Tildesley, Computer Simulation of Liquids
- Landau and Binder, A Guide to Monte Carlo Simulations in Statistical Physics
- Krauth, Algorithms and Computations
Dynamique moléculaire
Agilio Padua
A. Padua
T. Morosova
Statistical thermodynamics, PHYS3203.
Classical thermodynamics, PHYS3108 (recommended).
This course aims to introduce and apply molecular simulation to the study of liquids, solutions, interfaces and biomolecules. The elements making up a molecular dynamics code are presented and analysed, as well as the models describing the structures and interactions of molecules, ions and materials.
Molecular simulation enables the calculation of equilibrium and dynamic properties of complex systems, starting from a description of molecular interactions and the laws of statistical mechanics. Certain quantities are directly comparable to experiment, which is useful to validate the underlying models. Additionally, simulation gives access to many quantities that are not easily accessible through experiments, but that enhance our understanding at the microscopic scale of important aspects in physical chemistry.
Molecular dynamics methods can either be based on classical mechanics models (atomistic or coarse-grained force fields) or on forces derived from quantum mechanics (ab initio molecular dynamics). As such, it can describe matter at different scales, from the electronic structure up to the mesoscale, which in practice means (at present) length scales from the Ångstrom to the micrometer and time scales from picoseconds to the microsecond.
Through learning some of the major simulation codes presently in use, students will apply molecular dynamics to compute structural, dynamic and thermodynamic quantities, relevant to describe solvation, transport and interfacial phenomena in realistic systems.
Fundamentals of molecular dynamics: integrators, thermostats, periodic conditions.
Models describing molecular structures and interactions: force fields, bonded and nonbonded interactions; quantum chemistry methods.
Techniques and algorithms: neighbour lists, long-range forces, constraints, etc.
Using codes such as LAMMPS or Gromacs to simulate molecular and biomolecular systems.
Trajectory analysis and post-treatment.
Calculation of energetic, structural and dynamic quantities.
Written report (50%) and presentation (50%) on a case study.
Machine learning en physique et chimie
Adrien Meynard
A. Meynard
P. Petrillo
S. Roux
Mathématiques de L3 pour Physique-Chimie.
Outils de Programmation et Projets Numériques de Physique et Chimie (langage : python)
Probabilités, variables aléatoires, statistiques.
Apprendre et se familiariser avec des concepts de base d’apprentissage automatique pour les sciences physiques et chimiques, et découverte des méthodes avancées à travers des exemples appliqués à la physique et la chimie.
- Introduction aux concepts et idées d'apprentissage automatique
- Méthodes générales pour représentations, classification supervisée, clustering
- Approches actuelles en ML, réseaux de neurones
- Exemples et applications à des questions en physique et chimie (analyse de spectres, problèmes inverses en imagerie, chimioinformatique, exemples en études du climat, en astronomie, problème du repliement des protéines, etc.)
Examen écrit et projet avec rapport.
Pattern Recognition and Machine Learning. Christopher Bishop, Springer, 2006.
A high-bias, low-variance introduction to Machine Learning for physicists. Pankaj Mehta et al., Physics Reports 810 (2019) 1–124
Deep Learning. Ian Goodfellow and Yoshua Bengio and Aaron Courville. An MIT Press book, 2016
Introduction à la science du climat
Corentin Herbert
Corentin Herbert
Fanny Lhardy
Irena Vankova
Antoine Venaille
Thermodynamique, mécanique des fluides
Objectif 1: Exposer les principes généraux de la physique du climat à l’échelle globale. Ces principes permettront de comprendre le bilan énergétique du système climatique terrestre.
Objectif 2: Comprendre et appréhender les projections du Groupe d'Experts Intergouvernemental sur l'évolution du Climat (GIEC) ainsi que les enjeux du réchauffement climatique global.
L’originalité de ce cours sera d’aborder ces questions du point de vue du physicien, en mettant en avant les ordres de grandeurs et les mécanismes physiques et chimiques qui guident les raisonnements et contraignent les modèles, de façon à développer une vision quantitative du problème.
1. Introduction générale
2. Transfert radiatif, convection atmosphérique et bilan d'énergie de la planète
3. Rétroactions climatiques, sensibilité climatique
4. Circulation atmosphérique et océanique
5. Modélisation du climat et variabilité climatique
6. Le cycle du carbone et les climats du passé
7. Le changement climatique d’origine anthropique et ses impacts
Examen écrit
Climate and the oceans G.K. Vallis, Princeton primers in climate
Atmosphere, clouds and climate D. Randall, Princeton primers in climate
The global carbon cycle D. Archer, Princeton primers in climate
Elementary Climate Physics F.W. Taylor, Oxford University Press
Global Physical Climatology, D. Hartmann, Elsevier.
Du solide au matériau : relation structure-propriétés
Matthias Pauly
Matthias Pauly
Pas de pré-requis indispensables, les modules Matériaux et nanomatériaux (L3S5) et théorie des groupes (L3S6) sont conseillés.
Ce cours introduira les outils de cristallographie permettant de comprendre les structures cristallines et présentera la résolution de ces structures par la méthode de diffraction des rayons X.
Cristallographie géométrique : maille cristalline & systèmes cristallins, réseaux de Bravais, groupes d’espace.
Structures types : structures métalliques, ioniques, covalentes, moléculaires.
Radiocristallographie : interaction RX/matière, plans réticulaires, relation de Bragg, facteurs de structure.
Aspects expérimentaux : DRX au laboratoire, grands instruments (synchrotron, neutrons).
Examen écrit
Caractérisation structurale des matériaux
Sami Jannin
Sami Jannin
Clémentine Fellah
Mattias Pauly
Principe de base de la RMN (M1 S1), Mécanique Quantique (L3), Du solide au matériau (M1 S2A) ou équivalent
Tout comme la chimie moléculaire, la chimie des matériaux dispose d’outils de caractérisation permettant d’étudier et de décrire la structure de la matière à l’échelle atomique mais aussi mésoscopique. Cette UE présentera trois de ces outils avec trois intervenants spécialistes de ces domaines : la RMN des matériaux, les techniques de microscopie électronique (MEB et MET) et les techniques de microscopie à champs proches (AFM et STM).
- RMN du solide : Principe de la RMN du solide, Séquence 2D et découplage, Applications (polymères, systèmes nanoporeux…)
- Microscopie électronique : Principe de la microcopie électronique à balayage et en transmission, exemples d’applications
- Microscopie à sonde locale : Principe et exemples d’applications de la microscopie à force atomique (AFM) et de la microcopie à effet tunnel (STM).
Examen écrit
Eléments de la série d: caractérisations et applications
Thibault Fogeron
Thibaut Fogeron
Bruno Sécordel
Benjamin Abecassis
Éléments de la série d : fondamentaux (M1), théorie des groupes (L3), Spectroscopie électronique (M1) ou équivalents.
Ce cours est présente les différentes techniques physico-chimiques qui permettent de caractériser les propriétés électroniques et magnétiques des complexes d’éléments du bloc d. Le cours sera illustré par la présentation de plusieurs applications de ces complexes de métaux de transition.
A l’issu de ce cours, les étudiants seront capables de remonter aux divers relations structure-propriétés qui caractérisent les complexes de métaux de transition. Ce cours inclura aussi une formation à la lecture d’articles scientifiques sur le sujet de complexes de métaux du bloc d.
I. Caractérisation des complexes de coordination :
Spectroscopie électronique (UV-visible), Magnétisme, Résonance Paramagnétique Électronique (RPE)
II. Transfert électronique
III. Chimie Bio-Inorganique
- Présentation d’un complexe (fiche et oral, en binôme) et participation aux TD (25%).
- Examen écrit à la fin du cours (75%).
Une liste de complexes de métaux de transition emblématiques sera donnée au début du cours. Les étudiants choisiront un des complexes ou famille de complexes proposés et ils feront une recherche bibliographique pour préparer une fiche (maximum 4 pages) sur le complexe et une présentation orale qui sera effectuée à la fin du cours. Cette présentation se fera en binôme et devra comporter la synthèse, la caractérisation et des applications de ce complexe, en utilisant toutes les compétences qui seront développées lors de ce cours.
Chimie durable: milieux non conventionnels, procédés de séparation et devenir des polluants
Margarida Costa-Gomes
Margarida Costa Gomes et autres intervenants extérieurs
Les étudiants doivent avoir complété une Licence de Chimie, génie chimique ou équivalent.
La société demande à réduire l’impact des produits et procédés chimiques dans l’environnement. La recherche académique et industrielle est très active pour essayer de minimiser cet impact avec la réduction de la dépendance aux combustibles fossiles et la mise en œuvre de procédés de fabrication écoresponsables et plus durables. La chimie verte contribue à promouvoir la conception et utilisation efficace de produits chimiques et de procédés chimiques plus respectueux de l’environnement.
Lors de ce cours, des aspects clés des principales pratiques de la chimie durable seront présentés par l’équipe encadrante et des spécialistes invités chaque année. Des cas d’étude seront traités par les étudiants avec l’équipe encadrante.
- Chimie durable : défis et opportunités.
- Métriques de durabilité
- Milieux alternatifs pour des réactions et des séparations – fluides supercritiques, liquides ioniques, switchable solvents, polymères liquides, solvants eutectiques profonds.
- Méthodes alternatives de synthèse et activation – voies durables de synthèse et catalyse.
- Matières premières renouvelables, par exemple issues de la biomasse. Nouvelles technologies basées sur des matières premières renouvelables ou recyclées.
- Partage et transport de polluants entre compartiments de l’environnement.
- Traitement d’un cas d’étude basé sur le contenu du cours
- Élaboration d’un court rapport (5 pages) et présentation orale sous forme de séminaire (15 minutes) suivi d’une session de questions/réponses (15 minutes).
Photophysique et photochimie théoriques
Thomas Niehaus
Thomas NIEHAUS
Quantum mechanics L3 or equivalent.
L’interaction entre la lumière et la matière joue un rôle essentiel dans de nombreuses applications technologiques, allant de l’optoélectronique au photovoltaïque, et revêt également une grande importance en biochimie. Ce cours s’intéresse aux processus qui se produisent après l’absorption de la lumière par la matière : comment l’énergie acquise est transportée, comment elle conduit à des photoréactions souhaitées ou indésirables, puis comment elle est finalement dissipée dans l’environnement. Situé à l’interface entre la physique et la chimie, le cours traite aussi bien des molécules que des solides et des matériaux émergents.
À l’issue de ce cours, les étudiants seront capables de comprendre et d’analyser les mécanismes fondamentaux de l’interaction lumière–matière ainsi que la dynamique des états excités dans les molécules et les solides. Ils maîtriseront les bases théoriques et numériques nécessaires à l’étude des processus photophysiques et photochimiques modernes.
Les développements théoriques, fondés sur la mécanique quantique à plusieurs corps, sont complétés par des études numériques réalisées lors des séances de travaux pratiques, qui incluent également des calculs ab-initio.
Chapter 1: Introduction to photochemistry
Keywords: Spectral irradiance, quantum yields, photochemical kinetics
Chapter 2: Molecular states
Keywords: Born-Oppenheimer approximation, Classification of excited states
Chapter 3: First principles methods for excited states
Keywords: TDDFT
Chapter 4: Electronic excitation and decay
Keywords: Vibrationally resolved spectra, Huang-Rhys factors, Kasha rule
Chapter 5: Wavepacket dynamics
Keywords: Franck-Condon excitation
Chapter 6: Non-adiabatic dynamics
Projet informatique
Giovanni Granucci and Maurizio Persico, Photochemistry: A Modern Theoretical Perspective, Springer, Cham, 2018.
Vincenzo Balzani, Paola Ceroni, and Alberto Juris, Photochemistry and Photophysics: Concepts, Research, Applications, Wiley-VCH, Weinheim, 2014.
Chimie-physique des auto-assemblages
Carlos MARQUES
Benjamin ABÉCASSIS, Léo CORNE, Carlos MARQUES, Apostolos VAGIAS, Lucien ROACH
Notions de thermodynamique, et de physique et chimie de systèmes biologiques.
Ce cours présente les principes physico-chimiques qui gouvernent l'auto-assemblage de la matière depuis les échelles moléculaire et nanométrique jusqu’au échelles micrométriques. À partir du cadre thermodynamique général - énergie libre, entropie, enthalpie et interactions non-covalentes faibles - le cours progresse des molécules amphiphiles simples vers des systèmes de plus en plus complexes : micelles, bicouches lipidiques, polymersomes, cristaux liquides et assemblages biologiques. Une attention particulière est portée aux applications en chimie, biologie, médecine et en sciences de la matière.
À l'issue du cours, les étudiants seront capables de : (i) décrire et comparer les principaux mécanismes d'auto-assemblage; (ii) utiliser les concepts de paramètre d'empilement critique, de concentration micellaire critique et d'énergie de courbure pour prédire la morphologie des agrégats; (iii) relier les propriétés mécaniques et thermodynamiques des membranes à leur composition moléculaire; (iv) interpréter des données expérimentales issues des principales techniques de caractérisation structurale.
Le cours est organisé en neuf séances de 2h, construites selon une progression logique des petites molécules vers les assemblages complexes, et de l'équilibre vers les systèmes dynamiques et biologiques.
Séance 1 : Introduction et forces motrices : définitions, cadre thermodynamique, effet hydrophobe.
Séance 2 : Amphiphiles et tensioactifs : paramètre d'empilement critique, CMC, diagrammes de phases.
Séance 3 : Micelles et thermodynamique de l'agrégation : modèles d'action de masse et de pseudo-phase, cinétique.
Séance 4 : Bicouches lipidiques et membranes : mécaniques membranaires, transitions de phase, courbure biologique.
Séance 5 : Synthèse de lipides et control des propriétés des membranes.
Séance 6 : Cristaux liquides et mésophases : lyotropes et thermotropes, mésophases lamellaires, hexagonales, cubiques et bicontinues.
Séance 7 : Interactions colloïdales et stabilité : théorie DLVO, potentiel zêta, effets ioniques spécifiques, déplétion.
Séance 8 : Sujets avancés : nanotechnologie de l'ADN, auto-assemblage des protéines, principes physicochimiques de la formation de structures des diatomées.
Séance 9 : Méthodes expérimentales et conclusion : diffusion (SAXS, SANS, DLS), microscopie (cryo-TEM, AFM, fluorescence), calorimétrie, questions ouvertes.
Examen écrit basé sur l’étude d’un ou plusieurs articles scientifiques.
Textbooks
Israelachvili, J.N. Intermolecular and Surface Forces, 3rd ed., Academic Press, 2011.
Safran, S.A. Statistical Thermodynamics of Surfaces, Interfaces, and Membranes, Westview Press, 2003.
Evans, D.F. & Wennerström, H. The Colloidal Domain: Where Physics, Chemistry, Biology and Technology Meet, 2nd ed., Wiley-VCH, 1999.
Hamley, I.W. Introduction to Soft Matter: Synthetic and Biological Self-Assembling Materials, revised ed., Wiley, 2007.
de Gennes, P.G. & Prost, J. The Physics of Liquid Crystals, 2nd ed., Oxford University Press, 1993.
Russel, W.B., Saville, D.A. & Schowalter, W.R. Colloidal Dispersions, Cambridge University Press, 1989.
Bates, F.S. & Fredrickson, G.H. Block Copolymers — Designer Soft Materials, Physics Today 52(2), 32–38, 1999.
Lipid Membranes and GUVs
Dimova, R. & Marques, C.M. (eds.) The Giant Vesicle Book, CRC Press, Taylor & Francis, 2019.
Mouritsen, O.G. Life — As a Matter of Fat: The Emerging Science of Lipidomics, Springer, 2005.
Landmark Papers
Tanford, C. The hydrophobic effect and the organization of living matter, Science 200, 1012–1018, 1978.
Helfrich, W. Elastic properties of lipid bilayers: theory and possible experiments, Z. Naturforsch. C 28, 693–703, 1973.
Discher, D.E. & Eisenberg, A. Polymer vesicles, Science 297, 967–973, 2002.
Israelachvili, J.N., Mitchell, D.J. & Ninham, B.W. Theory of self-assembly of hydrocarbon amphiphiles into micelles and bilayers, J. Chem. Soc. Faraday Trans. II 72, 1525–1568, 1976.
Bangham, A.D., Standish, M.M. & Watkins, J.C. Diffusion of univalent ions across the lamellae of swollen phospholipids, J. Mol. Biol. 13, 238–252, 1965.
Imagerie moléculaire et fontionnelle in vivo
Jens Hasserodt
Jens Hasserodt
Cours de Chimie Organique, Inorganique en L3 et M1. Ayant suivi un cours d’introduction du chimiste à la biologie cellulaire et moléculaire serait avantageux mais pas impératif pour la compréhension du cours
Introduire l’étudiant chimiste à un domaine de recherche et de développement qui lui demandera de s’éloigner considérablement de ses territoires connus. L’Imagerie Moléculaire d’une espèce vivante englobe à peu près six “modalités” qui se distinguent fondamentalement par les phénomènes physiques dont ils dépendent. L’étudiant en chimie est doucement amené à saisir les enjeux différents, et ainsi comprendre les conceptions moléculaires utilisées dans l’exercice de ces modalités afin d’établir le lien entre le métabolite biologique d’intérêt et le signal physique repéré et utilisé pour construire l’image. Cette UE, proposée conjointement par le M2 SdM Chimie de l'ENS de Lyon et le M2 SOCBM de l'UCBL se déroule sur le campus de La Doua.
- Apports de l'imagerie moléculaire in vivo aux domaines biomédicaux
- Comparaison des différentes modalités d'imagerieC
- Chimie de sondes moléculaires et nanoparticulaires
- Bioanalytes cibles des sondes chimiques utilisées en imagerie in vivo
examen écrit
- The Chemistry of Molecular Imaging, Nicholas Long, Wing-Tak Wong, Eds., Wiley 2015
- Principles of Fluorescence Spectroscopy, J.R. Lakowicz, 3rd edition, Textbook, Springer 2006.
- Molecular Imaging – Principles and Practice, Ross & Gambhir, Eds., 2nd Edition, Academic Press, 2021.
Approche quantique de la réactivité catalytique
Pascal RAYBAUD
Pascal RAYBAUD
Céline CHIZALLET
Cours du M1optionnels : modélisation quantique des molécules (CHIM4104), modélisation quantique des matériaux (CHIM4105)
Les méthodes computationnelles quantiques (théorie de la fonctionnelle de la densité notamment) permettent d’explorer la réactivité de systèmes catalytiques complexes (hétérogènes ou homogènes) utilisés industriellement ou susceptibles de l’être. Le cours montre comment les approches quantiques modernes permettent :
- de comprendre la réactivité par le calcul de propriétés catalytiques (structure du site actif, effets de taille, morphologie, mécanismes)
- d’aider à l’interprétation de résultats expérimentaux (spectroscopie, cinétique)
- de prédire des propriétés clefs pour optimiser de nouveaux catalyseurs.
Le cours aborde de nombreuses études de cas illustrant des systèmes catalytiques d’intérêts industriels : surfaces de métaux, d’oxydes, sulfures, zéolithes, agrégats métalliques supportés, systèmes organométalliques… et réactions associées (hydrogénation, hydrogénolyse, désulfuration, isomérisation, craquage, oligomérisation, …)
L’objectif est d’acquérir des compétences pour comprendre et mettre en œuvre les techniques de modélisation de catalyseurs en soutien à l’approche expérimentale.
Le cours présentera les différents aspects suivants :
Rappels fondamentaux : théorie de la fonctionnelle de la densité (généralité), approches orbitalaires et structures de bandes en surface
Choix de modèles pertinents pour la description des sites actifs : moléculaires (organométalliques), périodiques (surfaces catalytiques)
Calculs de propriétés clefs pour la catalyse : structurales, morphologiques, spectroscopiques (fréquences, déplacements chimique…), thermodynamiques et cinétiques (états de transition, énergie d’activation, profils réactionnels)
- Modélisation micro-cinétique et multi-échelle
- « Catalysis by design » : vers la prédiction de descripteurs quantiques et relation structure-activité
Examen écrit
- R.G. Parr, W. Yang, « Density-Functional Theory of Atoms and Molecules », Oxford University Press, New York, 1989.
- Solids and Surfaces, A chemist’s View of Bonding in Extended Structures. R. Hoffmann. Book. VCH Publishers, Inc. (1988)
- A chemical and theoretical way to look at bonding on surfaces. R. Hoffmann. Review of Modern Physics. 60 (1988) 601.
- Theoretical Surface Science and Catalysis - Calculations and Concepts. B. Hammer, J. Norskov. Advances in Catalysis 45 (2000) 71.
- Modélisation Moléculaire – Bases théoriques (J 1 011, J 1 012, J 1 013) – Mise en œuvre (J 1 014) – Offre de logiciels et Perspectives (J 1 015). Hervé Toulhoat. Editions Techniques de l’Ingénieur.
- Ab-Initio Simulations of Materials Using VASP: Density-Functional Theory and Beyond. J. Hafner. Journal of Computational Chemistry 29 (2008) 2044.
- Density functional theory simulations of complex catalytic materials in reactive environments: beyond the ideal surface at low coverage. C. Chizallet and P. Raybaud. Catalysis Science & Technology 4 (2014) 2797.
Résonance magnétique moderne appliquée
Sami JANNIN
Sami JANNIN
Cours de RMN M1S1 : bases de la RMN en solution (approche classique et mécanique quantique).
Mettre en jeu et consolider et approfondir les notions théoriques de RMN acquises au premier semestre en s’immergeant dans certaines applications concrètes actuelles, telles que :
- L’imagerie par résonance magnétique,
- La diffusion en phase liquide,
- La dynamique et la structure de protéines,
développant ainsi une compréhension théorique et méthodologique profonde de ces applications. Certaines de ces applications seront mises en pratique ensuite dans le cours Frontiers in NMR.
- Principes de l’imagerie IRM et agents de contraste.
- Mesures de diffusion et d’échange.
- Détermination structurale.
Examen oral (30 min + 30 min de préparation)
Nanoparticules inorganiques : synthèse, propriétés et applications
Matthias PAULY
Matthias PAULY
Aucun prérequis indispensable. Avoir suivi un cours de chimie des matériaux, cristallographie et/ou physique du solide est un plus.
Ce cours porte sur les nanoparticules inorganiques, en particulier leur synthèse, leurs propriétés physico-chimiques et leurs principales applications dans les domaines de l’optique, de l’électronique, du magnétisme, de l’énergie et de la santé. À partir d’exemples récents de la littérature scientifique, il vise à fournir aux étudiants les bases nécessaires pour comprendre les effets de taille à l’échelle nanométrique, les méthodes de synthèse et les relations structure-propriétés des nano-objets. Le cours abordera les nanoparticules semi-conductrices, magnétiques et métalliques, ainsi que les phénomènes émergents associés (plasmonique, confinement quantique, superparamagnétisme, etc.). Le cours abordera également les enjeux de stabilité colloïdale, de fonctionnalisation de surface et d’assemblage de nanoparticules. À l’issue du cours, les étudiants seront capables d’identifier les principales familles de nanomatériaux, de comprendre leurs propriétés fonctionnelles, d’analyser l’influence des paramètres de synthèse sur la taille et la morphologie des nanoparticules, et de relier ces caractéristiques à leurs applications technologiques et biomédicales.
- Introduction
- Définitions et classification des nanomatériaux
- Origine, occurrence et enjeux des nanoparticules
- Effets de taille et propriétés émergentes à l’échelle nanométrique
- Nanoparticules semi-conductrices et confinement quantique
- Nanoparticules magnétiques et superparamagnétisme
- Nanoparticules métalliques et résonance des plasmons de surface
- Méthodes de synthèse et fonctionnalisation des nanoparticules inorganiques
- Contrôle de la taille, de la forme et de la composition
- Fonctionnalisation de surface
- Stabilité colloïdale (théorie DLVO)
- Assemblage de nanoparticules en matériaux nanostructurés, propriétés collectives
Contrôle continu (présentation orale) + examen écrit.
Chimie computationnelle
Agilio PADUA
Agilio PADUA
Vijay Gopal CHILKURI (Univ. Aix-Marseille)
Tangui LE BAHERS (ENS de Lyon)
Natacha GILLET (CNRS, Lyon)
CHIM4105 – Modélisation quantique des molécules
CHIM4106 – Modélisation quantique des matériaux
CHIM4211 – Dynamique moléculaire
PHYS4213 – Simulations numériques et thermodynamique statistique
Ce cours présente des méthodes avancées de chimie computationnelle permettant de décrire les molécules et les matériaux, allant des approches quantiques et classiques aux méthodes hybrides qui les combinent. Dispensé par des chercheurs qui développent et appliquent activement ces méthodes, ce cours permet aux étudiants de se familiariser directement avec les recherches actuelles à la pointe de ce domaine.
L'enseignement associe des cours magistraux et des travaux pratiques portant sur :
- Les méthodes post-Hartree-Fock, y compris la corrélation électronique.
- La modélisation des états triplets.
- La dynamique moléculaire hybride quantique/classique (QM/MM) des biomolécules.
Contrôle continu.
Aux frontières de la résonance magnétique nucléaire
Andrew PELL
Andrew PELL
Sami JANNIN (UCBL)
Personnels du CRMN
Les cours suivants de l'ENS (ou leurs équivalents dans d'autres universités) sont vivement recommandés :
M1 : Principes de base de la RMN
M2 : Résonance magnétique moderne avancée.
La résonance magnétique nucléaire (RMN) est une technique clé pour élucider la structure et la dynamique de systèmes rencontrés dans un large éventail d’applications en chimie, en science des matériaux et en biologie. Dans ce cours, nous explorerons bon nombre de ces applications. Il y a six sessions, chacune dispensée par un spécialiste d’un domaine particulier de la résonance magnétique, basé au CRMN. Chaque session comprend un cours magistral sur le sujet, suivi d’une séance pratique sur l’un des spectromètres RMN.
- Solides @ HiRes : le monde enchanté de la rotation à angle magique
- Introduction à l’hyperpolarisation en phase liquide par polarisation nucléaire dynamique par dissolution
- Introduction à la spectroscopie RMN en phase solide par rotation à angle magique, améliorée par la polarisation nucléaire dynamique (DNP)
- RMN en phase solide pour les produits pharmaceutiques
- RMN paramagnétique en phase solide
- RMN des biomolécules.
L’évaluation du cours prendra la forme d’un rapport succinct (environ cinq pages) sur l’un des six thèmes abordés.
La bibliographie pertinente sera fournie au cours de la formation.
Spectrométrie de masse avancée
Fabien CHIROT
Fabien CHIROT, Essyllt LOUARN
Connaissances de base en physico-chimie et en chimie analytique.
Ce cours vise à présenter un panorama de l'état de l'art en spectrométrie de masse (MS), y compris les domaines d'application les plus récents, en mettant l'accent sur les défis et les stratégies actuelles d'identification et de quantification de composés au sein de mélanges complexes (par exemple, dans les domaines environnemental et médical).
Compétences visées :
- Interprétation élémentaire d'un spectre de masse
- Prédiction du type d'ions attendus pour un composé donné, en fonction du type de spectromètre de masse
- Compréhension de rapports techniques et scientifiques incluant des mesures par spectrométrie de masse
- Évaluation de la pertinence de la spectrométrie de masse pour répondre à une question scientifique
Partie 1 : Concepts de base
- Spectre de masse
- Sources et analyseurs
- Anatomie d’un spectromètre de masse (focus sur le TOF avec l’autopsie d’un vrai instrument)
Partie 2 : Applications
- Spectrométrie de masse haute résolution
- Tandem-MS et structure
- Tandem-MS et quantification
- PTRMS
Des séances pratiques seront organisées sur les instruments de la plateforme de l’ILM.
Examen écrit.
Pour un panorama général : Mass spectrometry : principles and applications, Edmond de Hoffmann, Vincent Stroobant, Wiley – 2007.
De manière générale, un très bon panorama des dernières innovations et applications est disponible (nombreuses ressources sur des applications, tutoriaux, …) en consultant des ressources mises en ligne par les principaux constructeurs de spectromètres de masse (Bruker, Sciex, Shimadzu,Thermo, Waters, etc.)
Chimie des éléments f
Olivier MAURY
Olivier MAURY
M1 en chimie moléculaire ou chimie-physique. Des notions de chimie de coordination et/ou organométallique des métaux d sont appréciables.
Le cours présentera les spécificités de la chimie des éléments f et de leurs propriétés physico-chimiques. Les usages des éléments f seront décrits à travers des exemples d’applications spécifiques en catalyses et imagerie. Certains aspects sociétaux liés aux notions de criticité, de recyclage, d’environnement, en marge des notions purement scientifiques, seront abordés.
- Introduction: Elements and Ressources
- Properties of the ions
- Precursors synthesis, basic of inorganic chemistry
- Coordination chemistry
- Organometallic chemistry
- Reactivity and catalysis
- Fluorescence properties of lanthanide
- Examples of applications
L’examen sera une épreuve écrite de 2h avec polycopié et notes de cours au format papier (sans matériel informatique). A partir d’une (ou plusieurs) publications scientifiques, les étudiants seront invités à répondre à une série de question.
Caractérisation structurale avancée des matériaux
Andrew PELL
Andrew PELL
Les cours suivants dispensés à l'ENS (ou leurs équivalents dans d'autres universités) sont vivement recommandés :
- L3 : Cristallographie
- M1 : Spectroscopie électronique
- M1 : Principes fondamentaux de la RMN
- M1 : Caractérisation structurale des matériaux
Ce cours explore les méthodes permettant de déterminer la structure des matériaux et la manière dont ces caractéristiques peuvent être mises en relation avec les propriétés du matériau lorsqu'il est utilisé dans un dispositif particulier, par exemple une batterie, un catalyseur ou un émetteur de lumière semi-conducteur. La « structure » est un concept complexe dans le domaine de la chimie des matériaux, qui englobe différents aspects tels que la structure à longue portée, la structure locale, les surfaces, la morphologie des particules, la dynamique, etc. De ce fait, aucune technique ne permet à elle seule de nous fournir toutes les informations nécessaires sur la structure d’un matériau donné ; nous devons donc recourir à toute une batterie de méthodes différentes, telles que la diffraction des rayons X, la microscopie électronique, la RMN à l’état solide, la spectroscopie d’absorption des rayons X, etc. Nous examinerons ici ce que ces différentes méthodes nous apprennent sur la structure, et comment nous pouvons rassembler toutes ces informations pour obtenir une image complète et unifiée de la structure d’un matériau particulier. Enfin, nous utiliserons ces informations pour comprendre comment le matériau fonctionne, et pourquoi il présente des défaillances lorsqu’il est utilisé dans un dispositif particulier.
La dernière partie du cours comprend une série d'études de cas tirées de la littérature scientifique récente dans des domaines tels que le stockage d'énergie, le stockage d'hydrogène et l’émission de lumière par des semi-conducteurs.
- Qu'est-ce que la structure ? Cette partie aborde les différentes caractéristiques structurelles, notamment la structure à longue portée et la structure locale, la structure cristalline, le désordre structurel, le désordre de composition, la forme et la taille des particules, la structure de surface et la dynamique.
- Comment détermine-t-on la structure ? Exploration de différentes techniques, notamment la diffraction des rayons X, la diffraction des neutrons, la microscopie électronique (MEB, MET), la diffraction électronique, la structure fine d'absorption des rayons X (XAFS, XANES, EXAFS), la spectroscopie Mössbauer et la RMN à l'état solide.
- Comment relier la structure à la fonction ? Cette partie du cours prend la forme d'une série d'études de cas portant sur différents matériaux récemment présentés dans la littérature.
Examen écrit.
La documentation pertinente est mise à jour en permanence et mise à disposition sur le portail des études.
Électrochimie avancée
Christophe BUCHER
Christophe BUCHER
Prérequis : complète le cours L3 SM « électrochimie » qui a permis d’aborder des notions de
- Thermodynamique (Nernst, Pourbaix, Debye-Hückel, notions de potentiel chimique/électrochimique, …)
- Conductivité
- Cinétique (Buttler-Volmer)
Il est donc souhaitable de maitriser les aspects expérimentaux d'une mesure électrochimique. Comprendre, prévoir et exploiter des courbes i-E enregistrées en régime stationnaire. Comprendre et maitriser les concepts et les développements mathématiques sur lesquels reposent les expressions i-E en régime stationnaire dans le cas de processus limités par la diffusion des espèces à l’électrode, par la cinétique du transfert de charge ou dans le cas d'un contrôle mixte (Modèle de Buttler-Volmer, cas limites de Tafel…).
- Maitriser les aspects expérimentaux des mesures électrochimiques en régime stationnaire et transitoire (montages, électrodes, milieux).
- Comprendre le principe des expériences de voltampérométrie cyclique et les paramètres déterminant la forme des voltamogrammes.
- Comprendre l'origine et les effets de la chute ohmique et du courant capacitif.
- Maitriser les notions de réversibilité et d'irréversibilité des étapes élémentaire de transfert de charge.
- Comprendre les différentes causes d'irréversibilité et leurs effets sur les mesures de voltampérométrie cyclique
- Comprendre et analyser la réponse électrochimique de mécanismes couplés de type EC
- Maitriser les aspects expérimentaux des expériences d'électrolyse en régime potentio- ou galvano-statique (cellules, électrodes.)
- Comprendre le principe de l'électrocatalyse en phase homogène (sphère interne/externe)
- Comprendre et exploiter la réponse électrochimique d'une microélectrode
- Comprendre le principe et savoir exploiter des mesures spectro-électrochimiques (RPE, UV, IR, Fluo)
- Comprendre et maitriser les concepts et les développements mathématiques sur lesquels reposent la théorie du transfert de charge développée par Marcus
- Comprendre et maitriser les concepts et les développements mathématiques sur lesquels reposent les équations i =f(E) établies en régime transitoire :
- Cas particulier d'un saut de potentiel (expression de Cottrell)
- Cas particulier d'un balayage linéaire en tension dans le cas d'une processus E Nernstien
- Cas particulier d'un balayage linéaire en tension pour un processus E lent
- Comprendre et maitriser les concepts et les développements mathématiques sur lesquels reposent les équations i = f(E) établies en régime stationnaire ou transitoire dans le cas de mécanismes couplés simples (ErCr, ErCi)
- Rappels
- Introduction à la Voltammétrie cyclique
- Courant capacitif et chute ohmique
- Modélisation électrique d’une interface électrochimique (introduction à l’impédance)
- Régimes stationnaires et transitoires
- Electrochimie Moléculaire (organique, complexes de coordination, transduction d’un phénomène de reconnaissance, électrocatalyse, espèces adsorbées...)
- Réactions chimiques couplées au transfert d’électron (électrosynthèse, électrocatalyse…)
- Intérêt des microélectrodes
- Introduction à la spectroélectrochimie
- Rappels sur les réponses électrochimiques en régime stationnaire (modèle de Buttler-Volmer, Modèle de Marcus)
- Réponses électrochimiques en régime transitoire (Cottrel, balayage linéaire en tension…)
- Réponses électrochimiques dans le cas de processus couplés (en régime stationnaire et transitoire)
Examen écrit.
Spectroscopies moléculaires résolues en temps
Bogdan MAREKHA
Bogdan MAREKHA
Nécessaires : L3 Mécanique Quantique, Spectroscopie, Atomes-Molécules-Liaison, M1 Spectroscopie électronique.
Souhaitables : Eléments de la série d: fondamentaux + caractérisations et applications ; Lasers et Matière
Recommandés de suivre en parallèle : Theoretical photophysics and -chemistry, Advanced electromagnetism and ultrafast optics
Les spectroscopies résolues en temps permettent d’accéder directement à la dynamique de différents degrés de liberté moléculaires, tels que les vibrations, la (photo)réactivité, les changements d’état de spin ou encore les transferts d’énergie, sur des échelles de temps allant de la femtoseconde à la seconde. Les avancées technologiques récentes permettent désormais de suivre couramment ces dynamiques à leurs échelles naturelles de temps et d’énergie.
Ce cours introduit les spectroscopies moléculaires résolues en temps dans une perspective expérimentale, en mettant l’accent sur leurs applications en chimie. Nous nous intéresserons principalement aux approches pompe-sonde dans différents domaines spectraux, en utilisant des configurations à une ou deux couleurs. Les principes et les motivations de la spectroscopie bidimensionnelle seront également présentés. Les concepts essentiels seront illustrés à travers des exemples représentatifs, notamment la dynamique vibrationnelle de l’eau et des solutions aqueuses, la dynamique de transition de spin dans les complexes de métaux de transition et l’isomérisation ultrarapide dans les rhodopsines. Le cours présentera également les principales méthodes de traitement des données et d’analyse cinétique, complétées par une séance pratique d’analyse de données à l’aide d’outils Python.
L’objectif principal du cours est de fournir aux étudiants les outils nécessaires pour comprendre, concevoir et interpréter de manière critique des expériences de spectroscopie résolue en temps, et pour relier les signaux mesurés aux dynamiques moléculaires sous-jacentes.
- Introduction à la spectroscopie résolue en temps
Comment obtenir simultanément une résolution temporelle et spectrale ? Concept de pompe-sonde, réponse instrumentale, limitations expérimentales et introduction aux études de cas. - Principes de l’analyse des données résolues en temps et séance pratique au CBP
Prétraitement et représentation des données ; cinétiques et spectres résolus en temps ; fonction de réponse instrumentale ; approches sans modèle, analyse globale et analyse ciblée. - Spectroscopie résolue en temps des systèmes aqueux
Absorption transitoire dans l’infrarouge moyen de l’eau et des solutions aqueuses : déclin des populations, relaxation vibrationnelle, transfert d’énergie et dynamique d’anisotropie. Dynamique ultrarapide de solvatation étudiée par fluorescence résolue en temps : déplacement dynamique de Stokes, fonctions de réponse du solvant et relaxation orientationnelle. - Spectroscopie bidimensionnelle cohérente : 2D-IR de l’eau
Populations et cohérences ; élargissements homogène et inhomogène ; diffusion spectrale, échange chimique, couplage vibrationnel et transfert d’énergie ; sondes vibrationnelles. - Dynamique ultrarapide des rhodopsines
Photoisomérisation ultrarapide, dynamique des états excités, paquets d’ondes vibrationnels cohérents et luminescence résolue en temps. - Spectroscopie résolue en temps de la dynamique de transition de spin
Dynamiques électroniques, structurales et de spin couplées.
Examen écrit.
Time-Resolved Spectroscopy. An experimental Perspective, Th. C. Weinacht and B. J. Pearson
Modern Optical Spectroscopy, W. W. Parson
Molecular Spectroscopy, J. L. McHale
De la molécule aux matériaux pour l'optique
Stéphane PAROLA
Stéphane PAROLA, Akos BANYASZ, Chantal ANDRAUD
Principes fondamentaux de la spectroscopie, en particulier l'absorption UV-visible et la fluorescence. Bases de chimie organique et inorganique, de science des matériaux et de chimie douce.
Concepts fondamentaux de l'optique et de l'optique non linéaire
Concepts de la plasmonique
Compréhension des relations structure-propriétés optiques dans les molécules et les matériaux
Méthodes d'élaboration et de mise en forme des matériaux
Contrôle et gestion des interfaces molécule-matrice dans les matériaux hybrides
- Concepts fondamentaux de l'optique et de l'optique non linéaire
- Compréhension des relations structure-propriétés optiques (structures moléculaires, microstructures des matériaux)
- Maîtrise des spécifications des matériaux en fonction de l'application
- Méthodes d'élaboration des matériaux (procédés/mise en forme)
- Nanomatériaux et optique, concepts de plasmonique
- Contrôle et gestion des interfaces molécule-matrice dans les matériaux hybrides
- Liens entre microstructures et propriétés des matériaux
Un examen écrit, composé de quelques questions sur la matière du cours et de l'analyse d'un document scientifique.
Projet bibliographique
Matthias PAULY
Le rapport bibliographique constitue la première étape du stage, au cours de laquelle l'étudiant·e se met dans la peau d'un chercheur. Rédigé sur une dizaine de pages, il doit présenter un état de l'art du sujet qui sera approfondi par la suite lors du stage expérimental. Ce rapport devra aborder les points suivants :
- Contexte du sujet
- Enjeux associés
- État de l'art de la recherche à l'échelle internationale
- Contribution du laboratoire, le cas échéant, à cette thématique de recherche
- Présentation de l'approche qui sera développée par l'étudiant au cours du stage
L'étudiant·e effectue sa recherche bibliographique et rédige son rapport en autonomie, en lien avec l'équipe d'encadrement du futur stage du second semestre.
Rapport écrit + soutenance orale devant un jury de trois membres (deux experts, un représentant de la formation).
Stage de recherche en chimie
Matthias PAULY
Ce stage, qui dure tout le semestre (24 semaines), permet d'acquérir une vraie expérience en laboratoire de recherche. L'étudiant·e choisira librement son sujet et son laboratoire d'accueil, en France ou à l’étranger, avec l'accord des responsables de formation.
- Mener en laboratoire un projet de recherche individuel sur un temps "long"
- Mettre en œuvre un protocole de recherche, de sa conception à la rédaction d'un rapport
- Acquérir une expérience de recherche sur un format préparant à la thèse
- Apprendre à communiquer ses résultats avec rigueur, devant un public expert
- Débattre de ces résultats
Stage de 24 semaines à effectuer entre début janvier et mi-juillet dans le domaine de la recherche en chimie, dans un laboratoire académique (sauf cas particulier, tels que les Doubles Diplômes EPFL/Centrale/Polimi). Le sujet pourra avantageusement être dans la continuité du rapport bibliographique.
Rapport écrit + soutenance orale. Un jury est composé spécifiquement pour chaque stage en invitant deux membres experts du sujet.
Modélisation quantique des molécules
Tangui Le Bahers
Tangui Le Bahers
Bogdan Marekha
Modélisation Moléculaire (L3), Mécanique Quantique (L3) ou équivalent.
Ce cours présente le concept de surface d’énergie potentielle et les méthodes qui permettent de remonter à des propriétés chimiques (thermodynamiques, cinétiques…) à partir de cette surface. Sur le plan théorique, ce cours introduit la théorie de la fonctionnelle de la densité, la méthode de chimie quantique la plus utilisée aujourd’hui. Nous verrons comment la densité électronique peut servir à la fois d’objet pour déterminer l’énergie d’un système mais aussi d’objet d’analyse de la liaison chimique, comme les orbitales moléculaires dans les théories de la fonction d’onde.
Partie I : Introduction à la surface d’énergie potentielle
1- Qu’est ce qui caractérise une réaction ?
2- La surface d’énergie potentielle.
3- Comment calculer l’énergie d’un système ?
Partie II : La théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT)
1- Principe de la DFT
2- La DFT dans le cadre de la méthode Kohn-Sham
Partie III : Se déplacer sur la surface d’énergie potentielle
1- Optimisation de géométrie
2- Recherche des états de transitions
3- Extraction des grandeurs thermodynamiques et cinétiques
Partie IV : La densité électronique comme objet d’analyse
Examen écrit et évaluation des projets par un oral et un rapport écrit.
Stéréochimie 1 : fondamentaux
Jens Hasserodt
Jens Hasserodt
Nicolas De Rycke
Réactivité en Chimie Organique (L3), Synthèse de molécules organiques (L3), ou équivalent.
Le cours constitue la suite logique du cours L3 « Synthèse de molécules organiques », et approfondit considérablement la compréhension de la réactivité chimique dans un espace tridimensionnel. Un bref traitement de la théorie des groupes sera suivi par une discussion des différentes manifestations de la chiralité et de la topicité. Le chapitre de la sélectivité représente le passage logique de la stéréochimie statique à celle qui est dynamique. Au-delà des aspects fondamentaux, les étudiants seront systématiquement préparés à la conception de méthodes modernes de synthèse de composés optiquement actif.
1. Introduction
2. Symétrie Moléculaire
2.1 Éléments de symétrie, opérations de symétrie
2.2 Groupes de symétrie
3. Chiralité
3.1 Le phénomène de la chiralité
3.3 Stéréodescripteurs pour la configuration absolue et relative
3.4 Classification de la chiralité
3.5 Tentative de quantification de la chiralité
3.6 Topicité
3.7 Pseudoasymétrie en chimie organique
4. Sélectivité
4.1 Sélectivité des réactions sous contrôle cinétique
4.2 Ordre de grandeur des valeurs ΔΔG‡ pour les processus stéréosélectifs
4.3 Classification formelle des expressions de la sélectivité
5. Modèles et Hypothèses de la Stéréochimie
5.1 Le modèle de Prelog
5.2 Addition nucléophile sur les composés carbonylés (Cram, Karabatsos, Felkin-Anh, Zimmermann-Traxler)
5.3 Effets de π-stacking en synthèse asymétrique
5.4 Dépendance de la sélectivité sur la température (Eyring, Arrhenius)
5.5 Analyse conformationnelle & effet anomérique
Examen écrit de 2 heures.
Principes de base de la RMN
Louise Pinet
Louise Pinet
Gabriel Balavoine
Sami Jannin
Quantum mechanics (L3) or equivalent.
This course is aimed at students who already have some familiarity with NMR spectroscopy, and who wish to deepen their understanding of how NMR experiments actually ‘work’. We concentrate on the description of common experiments, and explain in detail the phenomena behind these experiments. The quantum mechanical tools needed to analyse pulse sequences are introduced step by step, and are then applied to a series of one-dimensional and two-dimensional NMR experiments (COSY, DQF-COSY, TOSCY, DQ spectroscopy, INEPT, HSQC, HMQC, HMBC). Finally, we introduce the quantum mechanical tools needed for understanding electronic spins, and how they are observed by EPR spectroscopy.
- Introduction to NMR spectroscopy
- Energy levels and NMR spectra
- The vector model of pulsed NMR and pulse sequences
- Introduction to relaxation
- Fourier transformation and NMR
- The quantum mechanics on one nuclear spin
- Product operators
- Two-dimensional NMR (COSY, DQF-COSY, TOSCY, DQ spectroscopy, INEPT, HSQC, HMQC, HMBC)
- EPR
Assessment is made by a single written examination (2h) given at the end of the course.
Spectroscopie électronique
Bogdan Marekha
Bogdan Marekha
Eliott Vandevoir
L3 : Mécanique quantique, Modélisation Moléculaire, Atome Molécules et Liaisons, Théorie des groupes et Spectroscopies.
La spectroscopie électronique permet de sonder la structure électronique des couches de valence et de cœur à l'aide des rayonnements UV-visible et X, respectivement. Nous aborderons les spectroscopies d'absorption, d'émission et de photoémission d'électrons dans un cadre commun, fondé sur l'étude des transitions entre des états couplés par l'interaction avec le rayonnement. Nous présenterons les règles de sélection, les facteurs influençant l'allure des spectres, ainsi que la mise en œuvre expérimentale et les principales applications. Les séances de TD porteront sur l'étude de cas concrets et de modèles simples.
Plan du cours
1. Interaction lumière-matière
Mots clés : règle d'or de Fermi, moment dipolaire de transition, règles de sélection
2. Spectroscopie d'absorption électronique
Mots clés : principe de Franck-Condon, symétrie des transitions électroniques, solvatochromisme
3. Spectroscopie d'émission
Mots clés : diagramme de Perrin-Jablonski, décalage de Stokes, règle de Kasha-Vavilov, rendement quantique, anisotropie de fluorescence
4. Spectroscopie de photoémission d'électrons et méthodes apparentées
Mots clés : UPS, XPS, XES, XAS, théorème de Koopmans
- appliquer les règles de sélection aux transitions électroniques ;
- relier les caractéristiques spectrales à la structure électronique et à l'environnement chimique ;
- choisir une technique spectroscopique adaptée à une problématique donnée.
Examen écrit de 2h.
Spectroscopie : Cours et exercices
J. Michael Hollas
Photophysique et photochimie : des fondements aux applications
J. Delaire, J. Piard, R. Méallet-Renault, G. Clavier
Spectroscopie moléculaire
E. Biémont
Molecular spectroscopy
J. L. McHale
Modern optical spectroscopy
W. W. Parson
Catalyse: du fondamental aux applications industrielles
Pascal Raybaud
P. Raybaud + Intervenants IFPEN
Matériaux et Nanomatériaux : concepts et applications (L3, fortement conseillé), Physique – Chimie – Biologie (L3, fortement conseillé), Réactivité en chimie organique (L3, conseillé), Chimie expérimentale 1 (L3, conseillé), ou équivalent.
Le cours vise, d’une part, à acquérir les connaissances sur les principes fondamentaux de la catalyse et, d’autre part, à comprendre leurs mises en œuvre au travers de grandes familles grandes familles de réactions catalytiques. Les concepts clefs des catalyseurs hétérogènes (métalliques, oxydes...), homogènes (organométalliques) et enzymatiques seront enseignés.
Pour les aspects fondamentaux, le cours expliquera le rôle d’un catalyseur et la spécificité de la catalyse hétérogène via la description des étapes de la réaction d’une molécule sur une surface. En particulier, les étapes d’adsorption et d’activation d’une molécule seront présentées. Différents modèles thermodynamiques et cinétiques d’adsorption et de réaction seront introduits.
Par ailleurs, le cours présentera différents exemples révélant l’enjeu de la catalyse dans des procédés industriels éco-efficients, de la conversion de la biomasse ou du recyclage des plastiques. Le lien entre produits visés, spécifications, conditions réactionnelles et choix optimaux des catalyseurs sera illustré. Il visera une compréhension du fonctionnement des catalyseurs grâce à une description des phénomènes réactionnels depuis l'échelle atomique jusqu'à l’échelle industrielle. Le cours permettra aussi d’acquérir des connaissances sur différentes approches expérimentales (préparation, caractérisation et test) et théoriques (simulation quantique, modélisation cinétique) utilisées dans le contexte de la recherche en catalyse.
Note : Les TD (1/3 heures) seront constitués d’exercices d’application et d’analyses d’articles
Partie I : Principes fondamentaux de la catalyse
I.1 Enjeux et rôle des catalyseurs
I.2 Interaction molécule/surface - Physisorption/Chimisorption
I.3 Etude thermodynamique de l’adsorption (isotherme de Langmuir, modèle BET)
I.4 Modèles cinétiques de la réaction (état de transition, Langmuir-Hinshelwood)
Partie II. Cas d’études en catalyse hétérogène
II.1 Activation des liaisons C-C et C-H en catalyse métallique : hydrogénation, déshydrogénation, hydrogénolyse
II.2 Activation des liaisons C-S, C-N, C-O en catalyse par les sulfures : hydrotraitement et hydrodéoxygénation de la biomasse
II.3 Activation des liaisons C-C et C-O par catalyse acide et bifonctionnelle : isomérisation, craquage, déshydratation
II.4 Transformation de la biomasse en carburants et intermédiaires de la chimie
II.5 Préparation des catalyseurs
Partie III. Autres catalyses
III.1 Catalyse homogène
III.2 Catalyse enzymatique
Examen écrit (2h)
Macromolecules
Julien Leclaire
J. Leclaire
E. Moulin
B. Sécordel
Fundamental Organic Chemistry L3 S1AFundamental Organic Chemistry L3 S1A
- Interdisciplinary teaching unit accessible to students attending the Inorganic, (nano)materials, catalysis (IMC) and Supramolecular, Organic and Biochemistry curriculum to better understand the reactivity and physical chemistry of macromolecules.
- Understand and use the general principles of polymer design and the associated analytical tools enabling to explore their properties and how these are correlated to their structure
- Opening toward industrial application (traditional material such as polyurethanes, polycarbonates, polyolefins, polylactic acids but also biosourced, renewable and self-repairing polymers, including biomacromolecules).
1. Macromolecules and reactivity : from synthesis to self-assembling and repair (step growth, chain growth, living polymerization, metathesis, co-polymerization, reticulation, reversible (non)-covalent, chain recombination, etc..)
2. Structure – Properties relationship : from conformation and tacticity to remarkable thermomechanical and electrical properties under extreme stress (average molecular weight, dispersity, topology, rheological, thermomechanical, swelling, adhesion, conductivity
3. Macromolecules and biological medium
a. Biomacromolecules: from the building blocks of life to self-replication
b. From Biocompatible materials to hybrid conjugates
4. Integration of macromolecules into material and devices : from separative chemistry (chromatography and beyond) to artificial muscles, solar and fuel cells. Initiation to eco-design.
Written final exam (1 h 30) and quiz during sessions + article analysis.
Chimie du et pour le vivant
Jens Hasserodt
Jens Hasserodt
Louise Pinet
Réactivité en chimie organique (L3), Synthèse de molécules organique (L3), Stéréochimie 1 : Fondamentaux (M1 S1), Éléments de la série d : fondamentaux (M1 S1)
Dispensée en anglais / lectures are given in English
Ce cours est une introduction à la chimie du vivant et plus spécifiquement à la chimie de l’espèce humaine.
- Phosphoryl transfer
- Chemical Mechanism & Phosphoryl transferase activity
- Basic Thermodynamics of Phosphoryl Transfer
- DNA polymerase: DNA synthesis by the CELL
- Chemical Mechanism & Phosphoryl transferase activity
- Example of a complete metabolic pathway: Glycolysis
- Peptide & Protein Synthesis
- The peptide bond & Solid-phase peptide synthesis by the CHEMIST
- The Ribosome: Peptide and protein synthesis in the CELL
- Peptide ligation and total protein synthesis by the CHEMIST
- The peptide bond & Solid-phase peptide synthesis by the CHEMIST
- Oligonucleotide synthesis on the solid phase
- DNA synthesis by the CHEMIST
- Synthesis of PCR primers and the PacMan probe: The RT-qPCR test for CORONAVIRUS (SARS-CoV19)
- DNA synthesis by the CHEMIST
- The 3rd class of biopolymers: The polysaccharides
- The stability of the bonds between monomers in biopolymers
- From pyruvate to acetate: Acetyl-CoA synthesis
- From Ac-CoA to Cholesterol: the making of Nature’s LARGEST group of natural products: The TERPENES
- Weak bonds & effects
- DNA duplex formation: Affinities & chelate effect & melting & cooperativity & anti-sense oligos & siRNA
- AVIDITY: cell-penetrating peptides & mussel-rock adhesion
- “Designer DNA”: analogs conceived by the chemist
- The reason (aetiology) for the choice of D-ribofuranose in DNA
- Self-assembly (“infinite” molecular recognition): peptide nanotubes
- FOLDING: (a) RNA folding & (b) Peptide folding into globular proteins & (c) GFP: how folding can produce new properties in proteins
Examen écrit de 2h
Eléments de la série d: fondamentaux
Belen Albela et Thibault Fogeron
Belén Albela
Thibault Fogeron
Atomes et Molécules (L3), Modélisation Moléculaire (L3), théorie des groupes (L3) ou équivalent.
Ce cours a pour but d’apporter les différents outils pour décrire les complexes de métaux d. Ces complexes de métaux de transition seront décrits à la voie du point de vue de leur structure chimique et électronique. L’accent sera particulièrement mis sur les effets d’environnement et la chimie orbitalaire des complexes de métaux de transition. Enfin, sur le plan expérimentale, différentes voies de synthèse de ces complexes seront présentées.
- Introduction –nomenclature
- Chimie organométallique
- Champ cristallin/champ de ligand
- Géométrie des complexes
- Cinétique de la complexation
- Thermodynamique de la complexation
- Stratégie de synthèse des complexes
Examen écrit + prise en compte de la participation aux TDs et aux QCM sur le portail des études
Catalyse par les métaux en synthèse organique
Floris Chevallier
Floris Chevallier
L. Garel
Réactivité en chimie organique (L3), synthèse de molécules organiques (L3), éléments de la série d – fondamentaux (M1 S1A) ou équivalent.
Ce cours présente les principes généraux de la catalyse homogène, hétérogène et enzymatique, en utilisant des notions de chimie de coordination et de chimie organique. La finalité est de connaitre les grandes réactions catalysées par des métaux de transition, la préparation de catalyseurs, les cycles catalytiques et leurs applications industrielles de la pétrochimie à la chimie pharmaceutique.
I : Réduction
II : oxydation
III : addition
IV : couplage
V : activation de liaison
VI : applications industrielles
Examen écrit
Point de vue sur un thème de recherche actuel : Atomes & Photons
Benjamin Besga
Audrey Bienfait
Benjamin Besga
Audrey Bienfait
Le cours nécessite d’avoir suivi le cours Mécanique quantique L3 ou équivalent. Il est conseillé mais pas obligatoire d’avoir suivi le cours de M1 Mécanique Quantique Avancée et le cours de M1 d’optique quantique.
Série de cours donné par un/plusieurs conférencier.es invité.es sur un domaine de recherche actuel en physique et/ou en chimie.
Cette année, le cours sera consacré à la thématique « Atomes & Photons ».
Le but du cours est de donner une description quantique de l’interaction lumière-matière. Cette interaction fondamentale se retrouve dans de nombreux systèmes des technologies quantiques. Nous explorerons différentes facettes de cette interaction : couplage fort, couplage faible et couplage collectif, ainsi que les applications au contrôle et aux mesures quantiques.
Cours 1 : introduction à l’interaction lumière-matière
Cours 2 : implémentations physiques
Cours 3 : systèmes quantiques ouverts
Cours 4 : un atome en cavité
Cours 5 : régime de couplage fort
Cours 6 : régime de couplage faible et interaction avec N modes.
Cours 7 : application aux mesures quantiques
Cours 8 : couplage collectif à N atomes
Examen écrit de 2h.
Exploring the Quantum (Haroche et Raimond)
Photons et atomes, Introduction à l’électrodynamique quantique (Claude Cohen-Tannoudji, Jacques Dupont-Roc)
Biologie moléculaire et génétique
Nathalie Alazard-Dany
Tous les intervenants viennent du Département de Biologie de l'ENSL ou UCBL:
Nathalie Alazard-Dany
Patrice Gouet
Fabien Mongelard
PCB 1&2 L3 Sciences de la Matière
Le cours se concentre sur l'échelle moléculaire et décrit la structure et la fonction des acides nucléiques: la physico-chimie de l'ADN et de l'ARN, la structure et l'organisation fonctionnelle du génome, l'expression de l'information génétique. Il traite également de la manipulation de l'information génétique et de ses applications. Le concept de signaux chimiques et leur effet et leur intégration dans la cellule sont également discutés. Le cours accompagnés de TDs à l'IBCP traitent des études cristallographiques sur les protéines.
Le cours comprend également des Travaux Pratiques présentant des techniques et des applications du génie génétique in vitro.
Moyenne de 2 notes : 1 note d’examen (écrit, 2/3) sur les cours et 1 note de présentation du projet (1/3).
Cellule et tissus biologiques
Nathalie Alazard-Dany
Tous les intervenants viennent du Département de Biologie :
Nathalie Alazard-Dany
Elena Rondeaux
Aurélie Vialette
Stéphane Vincent
PCB1&2 en L3 Sciences de la Matière
Le cours se concentre sur l'échelle cellulaire et supra-cellulaire. Il inclue l'étude du cycle cellulaire et la cancérogénèse, une introduction à la virologie et à l'immunologie avec des exemples étudiés en TD. Dans le cadre des méthodes de la Biologie Moderne, seront présentés: l'utilisation d'organismes modèles animaux (ver, mouche, souris ...) ou de plantes, ainsi que les méthodes de transgénèse.
Le cours comprend également des Travaux Pratiques illustrant les techniques de culture cellulaire et des applications à l'analyse du cycle des cellules et un projet bibliographique encadré par un.e doctorant.e en biologie.
Moyenne de 2 notes : 1 note d’examen sur les cours (écrit, 2/3) et 1 note de Projet Bibliographique (1/3).
Dynamique moléculaire
Agilio Padua
A. Padua
T. Morosova
Statistical thermodynamics, PHYS3203.
Classical thermodynamics, PHYS3108 (recommended).
This course aims to introduce and apply molecular simulation to the study of liquids, solutions, interfaces and biomolecules. The elements making up a molecular dynamics code are presented and analysed, as well as the models describing the structures and interactions of molecules, ions and materials.
Molecular simulation enables the calculation of equilibrium and dynamic properties of complex systems, starting from a description of molecular interactions and the laws of statistical mechanics. Certain quantities are directly comparable to experiment, which is useful to validate the underlying models. Additionally, simulation gives access to many quantities that are not easily accessible through experiments, but that enhance our understanding at the microscopic scale of important aspects in physical chemistry.
Molecular dynamics methods can either be based on classical mechanics models (atomistic or coarse-grained force fields) or on forces derived from quantum mechanics (ab initio molecular dynamics). As such, it can describe matter at different scales, from the electronic structure up to the mesoscale, which in practice means (at present) length scales from the Ångstrom to the micrometer and time scales from picoseconds to the microsecond.
Through learning some of the major simulation codes presently in use, students will apply molecular dynamics to compute structural, dynamic and thermodynamic quantities, relevant to describe solvation, transport and interfacial phenomena in realistic systems.
Fundamentals of molecular dynamics: integrators, thermostats, periodic conditions.
Models describing molecular structures and interactions: force fields, bonded and nonbonded interactions; quantum chemistry methods.
Techniques and algorithms: neighbour lists, long-range forces, constraints, etc.
Using codes such as LAMMPS or Gromacs to simulate molecular and biomolecular systems.
Trajectory analysis and post-treatment.
Calculation of energetic, structural and dynamic quantities.
Written report (50%) and presentation (50%) on a case study.
Machine learning en physique et chimie
Adrien Meynard
A. Meynard
P. Petrillo
S. Roux
Mathématiques de L3 pour Physique-Chimie.
Outils de Programmation et Projets Numériques de Physique et Chimie (langage : python)
Probabilités, variables aléatoires, statistiques.
Apprendre et se familiariser avec des concepts de base d’apprentissage automatique pour les sciences physiques et chimiques, et découverte des méthodes avancées à travers des exemples appliqués à la physique et la chimie.
- Introduction aux concepts et idées d'apprentissage automatique
- Méthodes générales pour représentations, classification supervisée, clustering
- Approches actuelles en ML, réseaux de neurones
- Exemples et applications à des questions en physique et chimie (analyse de spectres, problèmes inverses en imagerie, chimioinformatique, exemples en études du climat, en astronomie, problème du repliement des protéines, etc.)
Examen écrit et projet avec rapport.
Pattern Recognition and Machine Learning. Christopher Bishop, Springer, 2006.
A high-bias, low-variance introduction to Machine Learning for physicists. Pankaj Mehta et al., Physics Reports 810 (2019) 1–124
Deep Learning. Ian Goodfellow and Yoshua Bengio and Aaron Courville. An MIT Press book, 2016
Stéréochimie 2: applications
Jens Hasserodt
Jens Hasserodt
Nicolas De Rycke
Réactivité en Chimie Organique (L3), Synthèse de molécules organiques (L3), Stéréochimie 1 : Fondamentaux (M1 S1) ou équivalent.
Ce cours est la continuité de l’UE Stéréochimie 1 : Fondamentaux du M1 S1. Nous continuerons de présenter les concepts fondamentaux liés à la stéréochimique en chimie organique.
- Modèles et Hypothèses de la Stéréochimie
- Influence de la conformation sur la réactivité et la sélectivité (Curtin-Hammett, Winstein-Holness)
- Excursion : La tension de cycle
- Les règles de Baldwin
- Méthodes de Préparation des Composés Optiquement Actifs
- Synthèses asymétriques par double induction « double stéréodifférenciation »
- Synthèse asymétrique absolue (ee très faible !)
- Quelques Méthodes pour la Génération de Substances de Haute Pureté Énantiomérique
- Synthèse asymétrique avec emploi stœchiométrique d’auxiliaires chiraux
- Petite Excursion dans la Nomenclature des Hétérocycles selon les règles de la IUPAC : le système de Hantzsch-Widman-Patterson
- 7.2 Synthèse asymétrique avec emploi stœchiométrique de réactifs chiraux
- Synthèse asymétrique catalytique basée sur des centres métalliques
- Synthèse asymétrique catalytique avec des catalyseurs non-métalliques
- Sur l’efficacité biologique différente des molécules stéréoisomériques
Examen écrit de 2 heures.
Eléments de la série d: caractérisations et applications
Thibault Fogeron
Thibaut Fogeron
Bruno Sécordel
Benjamin Abecassis
Éléments de la série d : fondamentaux (M1), théorie des groupes (L3), Spectroscopie électronique (M1) ou équivalents.
Ce cours est présente les différentes techniques physico-chimiques qui permettent de caractériser les propriétés électroniques et magnétiques des complexes d’éléments du bloc d. Le cours sera illustré par la présentation de plusieurs applications de ces complexes de métaux de transition.
A l’issu de ce cours, les étudiants seront capables de remonter aux divers relations structure-propriétés qui caractérisent les complexes de métaux de transition. Ce cours inclura aussi une formation à la lecture d’articles scientifiques sur le sujet de complexes de métaux du bloc d.
I. Caractérisation des complexes de coordination :
Spectroscopie électronique (UV-visible), Magnétisme, Résonance Paramagnétique Électronique (RPE)
II. Transfert électronique
III. Chimie Bio-Inorganique
- Présentation d’un complexe (fiche et oral, en binôme) et participation aux TD (25%).
- Examen écrit à la fin du cours (75%).
Une liste de complexes de métaux de transition emblématiques sera donnée au début du cours. Les étudiants choisiront un des complexes ou famille de complexes proposés et ils feront une recherche bibliographique pour préparer une fiche (maximum 4 pages) sur le complexe et une présentation orale qui sera effectuée à la fin du cours. Cette présentation se fera en binôme et devra comporter la synthèse, la caractérisation et des applications de ce complexe, en utilisant toutes les compétences qui seront développées lors de ce cours.
Chimie durable: milieux non conventionnels, procédés de séparation et devenir des polluants
Margarida Costa-Gomes
Margarida Costa Gomes et autres intervenants extérieurs
Les étudiants doivent avoir complété une Licence de Chimie, génie chimique ou équivalent.
La société demande à réduire l’impact des produits et procédés chimiques dans l’environnement. La recherche académique et industrielle est très active pour essayer de minimiser cet impact avec la réduction de la dépendance aux combustibles fossiles et la mise en œuvre de procédés de fabrication écoresponsables et plus durables. La chimie verte contribue à promouvoir la conception et utilisation efficace de produits chimiques et de procédés chimiques plus respectueux de l’environnement.
Lors de ce cours, des aspects clés des principales pratiques de la chimie durable seront présentés par l’équipe encadrante et des spécialistes invités chaque année. Des cas d’étude seront traités par les étudiants avec l’équipe encadrante.
- Chimie durable : défis et opportunités.
- Métriques de durabilité
- Milieux alternatifs pour des réactions et des séparations – fluides supercritiques, liquides ioniques, switchable solvents, polymères liquides, solvants eutectiques profonds.
- Méthodes alternatives de synthèse et activation – voies durables de synthèse et catalyse.
- Matières premières renouvelables, par exemple issues de la biomasse. Nouvelles technologies basées sur des matières premières renouvelables ou recyclées.
- Partage et transport de polluants entre compartiments de l’environnement.
- Traitement d’un cas d’étude basé sur le contenu du cours
- Élaboration d’un court rapport (5 pages) et présentation orale sous forme de séminaire (15 minutes) suivi d’une session de questions/réponses (15 minutes).
Enjeux et stratégies en synthèse organique
Olivier Piva
Oliver Piva
Max Perlot
Réactivité en chimie organique (L3), Synthèse de molécules organiques (L3), Stéréochimie 1 : Fondamentaux (M1 S1), Catalyse par les métaux en synthèse organique (M1 S1) ou équivalent.
La synthèse totale de molécules ciblées nécessite d’élaborer une/des voies de synthèse flexibles –pour contrer d’éventuels écueils– et modulable –pour accéder rapidement et sélectivement à des analogues structuraux– (selon une approche DOS pour diversity oriented synthesis). Le premier chapitre général permettra d’acquérir le vocabulaire, le symbolisme et de définir quelques règles souvent appliquées en rétrosynthèse. En s’appuyant sur les connaissances déjà acquises (en L3 et S1), les différentes voies d’accès à des molécules cibles (plus ou moins complexes) seront analysées et comparées lors des cours suivants. Par cette approche directe, l’étudiant pourra acquérir les bons réflexes pour aborder la rétrosynthèse de molécules de plus en plus complexes, tout en assimilant de nouveaux concepts et réactions. En parallèle aux cours et aux TD, l’analyse d’une molécule sera demandée et réalisée par petits groupes. Chacun d’entre eux aura la charge de réaliser l’analyse rétrosynthétique d’une voie déjà publiée, de commenter ses étapes clé (y compris les aspects stéréochimiques) et de relever ses points forts et faiblesses possibles.
Cette approche en mode classe inversée est particulièrement adaptée à l’apprentissage de la rétrosynthèse.
Ce module est un plus pour les élèves souhaitant poursuivre en Master M2 à dominante organique.
Cours 1 et 2 : Rétrosynthèse, pourquoi ? – Généralités
Cours 3 : Séparacène : Utilisation du pool chiral (formation de liaisons C=C par réactions de Wittig, isomérisations, réductions sélectives de composés carbonylés, approche CBS)
Cours 4 : Intricatétrol : Métathèses croisées et oxydations asymétriques (Réactions d’époxydation de Sharpless, de dihydroxylation)
Cours 5 : Biselyngbiolide : Formation de macrocycle (estérification, réactions couplage catalysées par le palladium, métathèses cyclisantes…)
Cours 6 : Palmerolide : RCM, Aldolisation, réaction de Stille et Suzuki
Cours 7 : Chimie radicalaire : Règles de Baldwin, réactions tandem, SmI2
Cours 8 : Projet – Exposé par les élèves en groupe (Molécule cible/ rétrosynthèse/ synthèse)
Examen écrit final (85% de la note)
Et CC (15%) sur le projet d’analyse rétrosynthétique
(en accord avec les Modalités de Contrôle des Connaissances déclarées pour cette UE).
Imagerie moléculaire et fontionnelle in vivo
Jens Hasserodt
Jens Hasserodt
Cours de Chimie Organique, Inorganique en L3 et M1. Ayant suivi un cours d’introduction du chimiste à la biologie cellulaire et moléculaire serait avantageux mais pas impératif pour la compréhension du cours
Introduire l’étudiant chimiste à un domaine de recherche et de développement qui lui demandera de s’éloigner considérablement de ses territoires connus. L’Imagerie Moléculaire d’une espèce vivante englobe à peu près six “modalités” qui se distinguent fondamentalement par les phénomènes physiques dont ils dépendent. L’étudiant en chimie est doucement amené à saisir les enjeux différents, et ainsi comprendre les conceptions moléculaires utilisées dans l’exercice de ces modalités afin d’établir le lien entre le métabolite biologique d’intérêt et le signal physique repéré et utilisé pour construire l’image. Cette UE, proposée conjointement par le M2 SdM Chimie de l'ENS de Lyon et le M2 SOCBM de l'UCBL se déroule sur le campus de La Doua.
- Apports de l'imagerie moléculaire in vivo aux domaines biomédicaux
- Comparaison des différentes modalités d'imagerieC
- Chimie de sondes moléculaires et nanoparticulaires
- Bioanalytes cibles des sondes chimiques utilisées en imagerie in vivo
examen écrit
- The Chemistry of Molecular Imaging, Nicholas Long, Wing-Tak Wong, Eds., Wiley 2015
- Principles of Fluorescence Spectroscopy, J.R. Lakowicz, 3rd edition, Textbook, Springer 2006.
- Molecular Imaging – Principles and Practice, Ross & Gambhir, Eds., 2nd Edition, Academic Press, 2021.
Espèces radicalaires en chimie organique : propriétés, réactivité et études mécanistiques
Abderrahmane AMGOUNE
Abderrahmane AMGOUNE, Jérémy MERAD
Bases de chimie organique et de chimie-physique organique : mécanismes réactionnels, structure électronique, orbitales moléculaires, cinétique chimique, thermodynamique et notions élémentaires de spectroscopie.
Des connaissances préalables en chimie radicalaire et/ou en catalyse organométallique sont utiles mais ne sont pas strictement indispensables.
Cette UE vise à donner une compréhension approfondie des espèces radicalaires organiques et organométalliques, en mettant l’accent sur leurs propriétés stéréo-électroniques, leur réactivité élémentaire et les méthodes modernes permettant d’étudier les mécanismes réactionnels associés.
- Propriétés et réactivité des espèces radicalaires organiques et organométalliques
Notions fondamentales de structure électronique en couche ouverte ; orbitales SOMO, polarité et caractère nucléophile/électrophile des radicaux ; effets stéréo-électroniques ; stabilité et persistance ; relation structure-réactivité ; étapes élémentaires impliquant des radicaux carbonés, hétéroatomiques et organométalliques.
- Chimie radicalaire dans un contexte de synthèse durable
Méthodes douces et contrôlées de génération des radicaux ; catalyse photorédox ; processus photo-induits ; électrosynthèse organique ; activation par transfert d’électron ou transfert d’énergie ; introduction aux stratégies modernes de chimie radicalaire sous conditions douces, avec un accent sur la compréhension des principes plutôt que sur l’exhaustivité des méthodologies de synthèse.
- Études mécanistiques en chimie radicalaire
Outils expérimentaux et physico-chimiques pour l’étude des mécanismes radicalaires : expériences de piégeage, sondes radicalaires, effets isotopiques, cinétique, voltammétrie cyclique, spectroscopie RPE, extinction de fluorescence de Stern–Volmer, photophysique, spectroscopies résolues en temps et spectroscopie d’absorption transitoire. Études de cas issues de la littérature récente.
Examen écrit.
Sélection d'articles de recherche récents fournis dans le cadre du cours.
De la molécule aux matériaux pour l'optique
Stéphane PAROLA
Stéphane PAROLA, Akos BANYASZ, Chantal ANDRAUD
Principes fondamentaux de la spectroscopie, en particulier l'absorption UV-visible et la fluorescence. Bases de chimie organique et inorganique, de science des matériaux et de chimie douce.
Concepts fondamentaux de l'optique et de l'optique non linéaire
Concepts de la plasmonique
Compréhension des relations structure-propriétés optiques dans les molécules et les matériaux
Méthodes d'élaboration et de mise en forme des matériaux
Contrôle et gestion des interfaces molécule-matrice dans les matériaux hybrides
- Concepts fondamentaux de l'optique et de l'optique non linéaire
- Compréhension des relations structure-propriétés optiques (structures moléculaires, microstructures des matériaux)
- Maîtrise des spécifications des matériaux en fonction de l'application
- Méthodes d'élaboration des matériaux (procédés/mise en forme)
- Nanomatériaux et optique, concepts de plasmonique
- Contrôle et gestion des interfaces molécule-matrice dans les matériaux hybrides
- Liens entre microstructures et propriétés des matériaux
Un examen écrit, composé de quelques questions sur la matière du cours et de l'analyse d'un document scientifique.
Mécanismes réactionnels en chimie organique
Julien LECLAIRE
Julien LECLAIRE
Chimie organique, stéréochimie et rétrosynthèse
Maitriser l'approche rationnelle et déductive en chimie organique pour réduire le "par cœur" a son strict minimum. Prédire le ou les produits majoritaires de n'importe quelle réaction en analysant simplement son bilan et ses étapes. Etre en mesure de proposer un mécanisme, des intermédiaires ainsi que des outils théoriques et expérimentaux pour les valider pour n'importe quelle nouvelle réaction. Comprendre et prédire les effets de changement structuraux mais aussi de milieu et de conditions réactionnelles sur une transformation chimique.
contrôle continu (QCM et questions ouvertes a résoudre) + examen final écrit.
Biomolécules: aspects synthétiques et opportunités biologiques en glycochimie
Peter GOEKJIAN
Peter GOEKJIAN
chimie organique de synthèse
La science des sucres classiquement liée à leur rôle dans l'alimentation, les structures biologiques et la structure des acides nucléiques, a évolué considérablement. Nous discuterons de nouvelles opportunités pharmaceutiques qui se présentent en conséquence. A travers des exemples récents, nous étudierons les aspects synthétiques, pharmacologiques, et biologiques de ces applications.
examen écrit.
Chimie supramoléculaire : applications en chimie et en biologie
Julien LECLAIRE
Julien LECLAIRE
notion de base d'atomistique et d'électrostatique
L’objectif de ce cours est de définir la discipline, son omniprésence dans tous secteurs de la chimie (synthèse organique, chimie de coordination, biologie, matériaux) puis d’apporter connaissances solides en matière d’interactions et de reconnaissance moléculaire (affinité, sélectivité). Il s’agit également de faire acquérir des compétences en méthodologie expérimentale de mesure d’interactions moléculaires en solution mais aussi de développer un savoir-faire pour élaborer des partenaires moléculaires sur mesure en parcourant notamment les grandes classes de récepteurs naturels et de synthèse.
Une ouverture constante sur les applications biologiques (machines biologiques et artificielles effectuant transport, propagation de signal, réplication, inhibition) et technologiques (des machines moléculaires à l'ordinateur moléculaire en passant par les materiaux auto-reparant) des systèmes décrits est proposée. Le module s’achève sur une ouverture sur les stratégies innovantes actuelles (empreintes moléculaires, chimie combinatoire dynamique, systèmes moléculaires, auto-réplication) en chimie supramoléculaire
- Introduction
- Physical methods in supramolecular chemistry : Supramolecular chemistry at work in the lab
- Non-covalent interactions : a universal toolbox for the molecular architect
- Building Blocks and Host–Guest Chemistry : toward molecular recognition
- From innovative concepts to true applications in supramolecular chemistry
contrôle continu (QCM et questions ouvertes à résoudre) + examen final écrit.
Supramolecular Chemistry: Concepts and Perspectives-Jean-Marie Lehn, VCH Edition Wiley 2006(ISBN: 978-3-527-60743-3)
Supramolecular Chemistry, 2nd Edition Jonathan W. Steed, Jerry L. Atwood Wiley editions 2009 (ISBN: 978-0-470-51234-0)
Utilisation du fluor et des hétéroéléments en chimie organique
Benoît JOSEPH
Benoît JOSEPH
Thierry BILLARD
Chimie organique de base, rétrosynthèse, stéréochimie
La chimie des hétéroéléments (soufre, sélénium, phosphore, silicium) sera introduite en se basant sur leurs propriétés (électronégativité, polarisabilité, ….) puis se poursuivra par leurs utilisations en synthèse organique à travers différents exemples (synthèse totale, chimie médicinale,….) (intervenant: Benoît Joseph). L’importance du fluor en chimie organique sera également abordée et les principales méthodes de synthèse par fluoration nucléophile et électrophile exposées et discutées (intervenant: Thierry Billard).
Examen écrit.
Chimie hétérocyclique de molécules bioactives
Benoît JOSEPH
Benoît JOSEPH
Chimie organique et synthèse moléculaire
Les réactions de synthèse classiques et nouvellement développées des composés hétérocycliques à 5 atomes (furane, pyrrole et thiophéne) et des composés azotés hétérocycliques tels que la pyridine, la quinoléine, l’isoquinoléine et l’indole seront exposées. Parallèlement, la réactivité de ces hétérocycles sera étudiée soit pour introduire de nouvelles fonctions ou soit pour accéder à des molécules douées de propriétés biologiques ou autres.
Examen écrit.
Chimie organique par voie organométallique
Bruno ANDRIOLETTI
Bruno ANDRIOLETTI
Méthodologies de la synthèse organique
Abderrahmane AMGOUNE
Abderrahmane AMGOUNE
Jérémy MERAD
Notions de chimie radicalaire, chimie organique (mécanismes réactionnels), chimie-physique (orbitales moléculaires, contrôle cinétique et thermodynamique).
Comprendre les approches catalytiques modernes/émergentes en synthèse organique qui mettent en jeu des espèces radicalaires comme intermédiaires clés dans la création de nouvelles liaisons (carbone-carbone et carbone-hétéroatome).
- Intro générale : les radicaux libres / chimie radicalaire en synthèse organique
- Nouvelles méthodologies pour la génération contrôlée de radicaux libres : catalyse photoredox et processus catalytique photo-induits, électrosynthèse
- Les radicaux libres comme substrats en catalyse, approches modernes : la catalyse métallique et organocatalyse asymétrique
- Catalyse synergétique/coopérative : concept et étude de cas
Examen écrit.
Chem. Rev. 2013, 113, 7, 5322–5363
Acc. Chem. Res. 2016, 49, 9, 1924–1936/
Analyse structurale et conformationnelle des composés organiques
Arnaud SALVADOR
Arnaud SALVADOR
Florence GUILLIERE
Connaissances de base sur les spectres RMN 1H et 13C de molécules simples.
Notions sur les sources d'ionisation et les analyseurs en spectrométrie de masse. Bases sur l'interprétation d'un spectre de masse simple : connaître les mécanismes de fragmentations simples en impact électronique.
Analyse critique de la conformation et de la structure de molécules bioactives et leurs intermédiaires de synthèse par RMN incluant les équilibres conformationnels et structuraux
Interprétation et attribution de spectres RMN 1D/2D et de spectrométrie de masse en rapport avec les propriétés structurales et conformationnelles
Cette UE est une spécialisation pour l'analyse structurale et conformationelle par RMN et Spectrométrie de masse de molécules organiques de synthèse ou de produits bio-actifs naturels, en terme de structure covalente et de propriétés conformationnelles. Des exemples traités serviront de supports expérimentaux et seront expliqués et commentés en cours. Cette UE délivrera les compétences nécessaires pour un usage de moyens analytiques RMN et Spectrométrie de masse, qu'il s'agisse de l'aspect acquisition, de l'aspect traitement ou de l'aspect analyse critique des données en terme de structures et de modèles.
Examen écrit.
Synthèse Multi-Etapes de Molécules Complexes
Abderrahmane AMGOUNE
Abderrahmane AMGOUNE
Chimie organique classique, mécanismes réactionnels
Cette unité d’enseignement couvrira l’analyse molécules complexes, la construction des liaisons et motifs structuraux clés à l'aide de réactions classiques, et le contrôle des éléments stéréogènes. Les concepts clés de la synthèse multi-étapes (analyse rétrosynthétique et outils pour la synthèse de produits naturels en série acyclique, cyclique et polycyclique) seront présentés et illustrés par des cas d’étude.
Examen écrit.
Biomolécules 2 : lipides, aminoacides, peptides, nucléosides et acides nucléiques
Peter STRAZEWSKI
Peter STRAZEWSKI
Les contenus des UE du Master 1 en chimie organique du parcours SOCMB ou équivalent.
En marge de la chimie orientée vers une finalité visée où le chimiste cherche à obtenir une cible moléculaire ou supramoléculaire à une structure précise et bien définie, une branche émergente de la chimie organique moderne étudie la création et l’évolution autonomes de systèmes supramoléculaires voire systémiques en milieu aqueux et sans l’intervention dirigiste du chercheur. Trois grandes classes de biomolécules seront étudiées :
- Les lipides (acides gras, phospholipides, terpènes, stéroïdes)
- Les peptides (ayant un enchaînement défini ou aléatoire d’aminoacides)
- Les nucléotides (synthèses des N-hétérocycles, carbohydrates et leur phosphorylation)
Pour chacune de ces familles il sera fait une comparaison entre : la biosynthèse (sans toutefois s’attarder sur l’aspect enzymatique), la synthèse classique dirigée et la synthèse spontanée abiotique, c’est-à-dire sans groupe protecteur, sans enzyme, dans l’eau. Des conditions de formation de longues chaînes carbonées et de polymérisation par déshydratation dans l’eau seront étudiées. L’intérêt des mélanges complexes de biomolécules (des effets de matrice, d’ancrage et de compartimentation) et de leurs assemblages micro- et nanométriques (vésicules, bicouches supportées) sera abordé. Le cours est donné en français, les supports et la présentation sont écrits en anglais (sauf l’introduction).
Compétences attestées transversales :
Lecture de textes scientifiques en anglais.
Compétences attestées spécifiques :
Connaissance de l'état de l'art actuel en chimie des systèmes biomoléculaires et approche systémique de l'origine chimique du vivant.
Chapitre 1
- Substances chimiques et briques de la nature vivante
- Biopolymères et lipides
- Précurseurs naturels de C₁, C₂ et C₅
- Biosynthèse des acides gras
- Biosynthèse des isoprénoïdes, terpènes et stéroïdes
- Cycle de Krebs (oxaloacétate ⇄ citrate)
Chapitre 2
- Évolution précoce des compartiments membranaires
- Biochimie et évolution biologique des lipides
- Groupements polaires des phospholipides naturels
- Formation abiotique de longues chaînes alkyles
- Synthèse de Fischer-Tropsch des alcanes en phase gazeuse
- Synthèse de type Fischer-Tropsch des amphiphiles en phase aqueuse
- Conclusions sur la synthèse de type Fischer-Tropsch
- Lipides glycérolés abiotiques et leur auto-assemblage
- Vésicules formées à partir d’amphiphiles
- Introduction aux amphiphiles
- Forme et empilement des tensioactifs
- Taille des vésicules
- Vésicules géantes obtenues par hydratation de films lipidiques secs minces
- Dynamique des membranes vésiculaires
- Fusion, croissance, invagination et division des vésicules géantes
- Température de transition de phase principale et séparation de phases
Chapitre 3
- Formation abiotique des acides aminés et des peptides
- Structure et propriétés physico-chimiques des α-aminoacides
- L’expérience de décharge électrique de Miller-Urey
- Agents déshydratants dans l’eau
- La cyanamide et la cyanoguanidine comme agents de condensation
- Croissance de chaînes oligopeptidiques dans l’eau médiée par l’EDC
- Croissance de chaînes oligopeptidiques dans l’eau médiée par le CDI
- Croissance de chaînes peptidiques médiée par l’ARN lors de la traduction
- Aminoacylation abiotique des nucléotides
- Aminoacylation en position C-terminale des nucléotides selon Pascal
- Acides aminés et peptides nucléotidylés en position N-terminale selon Richert
Chapitre 4
- Formation abiotique des nucléosides et nucléotides
- Chimie des hétérocycles azotés et des glucides dans l’eau
- Homologation du cyanure d’hydrogène en adénine selon Oró
- Réseau réactionnel et produits de la réaction de formose selon Butlerow
- Formation abiotique des ribonucléosides et de l’ARN selon Benner
- Formation abiotique des nucléotides pyrimidiques selon Sutherland
- Formation abiotique des nucléosides puriques selon Carrell
Chapitre 5
- Polymérisation des nucléotides par matrice enzymatique
- Polymérisation et ligation abiotiques
- Polymérisation de nucléotides sur matrice selon Orgel
- Ligation d’oligonucléotides sur matrice selon von Kiedrowski
- Ligation d’oligopeptides sur matrice selon Ghadiri
- Amplification et réplication des macromolécules
Examen écrit. Les supports du cours, y-compris les notes personnelles, sont admis à l’examen en format papier (« open book exam » avec les sujets d’examen en français).
Chapter 1 - Moosmann Groll Piel_Terpene cyclase_Nature Chemistry 2020.pdf
Chapter 1 - Moran_Abiotic Reverse Krebs_Nature Ecology Evolution 2017.pdf
Chapter 1 - Moran_CO2 into reversed Krebs cycle_Nature Ecology Evolution 2018.pdf
Chapter 1 - Strazewski_The Essence of Systems Chemistry_Life 2019.pdf
Chapter 2 - Meierhenrich et al_On the origin of primitive cells_Angewandte Chemie Int. Ed. 2010
Chapter 3 - Liu Peng Zhao_Peptide-synthesis-using-unprotected-amino-acids_ChemRxiv 2023.pdf
Chapter 3 - Ritson Sutherland_Prebiotic amino acids by photoredox_Angewandte Chemie 2013.pdf
Chapter 3 - Tatsumi Oisaki Kanai_N-to-C peptide synthesis_Communications Chemistry 2023.pdf
Chapter 4 - Becker … Carell_Pyr Pur prebiotic_Science 2019.pdf
Chapter 4 - Damha_Synthesis of long and functionally active RNAs_Nucleic Acids Research 2026.pdf
Chapter 4 - Müller ... Carell_Growth of RNA-peptide chimeras_Nature 2022.pdf
Chapter 4 - Schreiner et al_Hydroxymethylene formose_Nature Chemistry 2018.pdf
Chapter 5 - Lazcano_Historical Development of Origins Research_2010.pdf
Chapter 5 - Strazewski_Low-digit and High-digit polymers_Life 2019.pdf
Chapter 5 - Szilágyi ... Czárán_Dynamics and stability of replicator systems_Life2017.pdf
Projet bibliographique
Matthias PAULY
Le rapport bibliographique constitue la première étape du stage, au cours de laquelle l'étudiant·e se met dans la peau d'un chercheur. Rédigé sur une dizaine de pages, il doit présenter un état de l'art du sujet qui sera approfondi par la suite lors du stage expérimental. Ce rapport devra aborder les points suivants :
- Contexte du sujet
- Enjeux associés
- État de l'art de la recherche à l'échelle internationale
- Contribution du laboratoire, le cas échéant, à cette thématique de recherche
- Présentation de l'approche qui sera développée par l'étudiant au cours du stage
L'étudiant·e effectue sa recherche bibliographique et rédige son rapport en autonomie, en lien avec l'équipe d'encadrement du futur stage du second semestre.
Rapport écrit + soutenance orale devant un jury de trois membres (deux experts, un représentant de la formation).
Stage de recherche en chimie
Matthias PAULY
Ce stage, qui dure tout le semestre (24 semaines), permet d'acquérir une vraie expérience en laboratoire de recherche. L'étudiant·e choisira librement son sujet et son laboratoire d'accueil, en France ou à l’étranger, avec l'accord des responsables de formation.
- Mener en laboratoire un projet de recherche individuel sur un temps "long"
- Mettre en œuvre un protocole de recherche, de sa conception à la rédaction d'un rapport
- Acquérir une expérience de recherche sur un format préparant à la thèse
- Apprendre à communiquer ses résultats avec rigueur, devant un public expert
- Débattre de ces résultats
Stage de 24 semaines à effectuer entre début janvier et mi-juillet dans le domaine de la recherche en chimie, dans un laboratoire académique (sauf cas particulier, tels que les Doubles Diplômes EPFL/Centrale/Polimi). Le sujet pourra avantageusement être dans la continuité du rapport bibliographique.
Rapport écrit + soutenance orale. Un jury est composé spécifiquement pour chaque stage en invitant deux membres experts du sujet.
Majeure Physique
Anglais 1 ou LV2
Layla Roesler
Pour chaque cours, le niveau de langue requis (B1, B2, C1, selon l’échelle du cadre européen des langues) est précisé.
L’année se structure autour de deux axes pour des cours de niveaux B1/B2/B2+/C1/C1+:
- Cours à thèmes ou compétences scientifiques : science, civilisation/histoire, littérature, anglais pour la recherche, communication orale.
- Préparation à la certification Cambridge English (CAE) en 3 étapes graduées : step 1 (B1), step 2 (B2), step 3 (C1)
L’évaluation prend en compte le contrôle continu et l’assiduité aux cours.
Les primo-arrivants doivent passer un test de niveau.
Plus d'informations sont disponibles sur le site du centre de langue.
L’évaluation est répartie équitablement entre Contrôle Continu (assiduité prise en compte) (50%) et examen final (50%). Les épreuves comprennent une présentation orale à partir d’un article de spécialité et un examen "Aural Comprehension".
Les étudiants étrangers peuvent substituer le module d’Anglais par un module de Français Langue Étrangère.
Physique experimentale 1
Osvanny Ramos
N. Bain
E. Benichou
A. Bienfait
F. Chillà
T. Emmerich
O. Cochet-Escartin
O. Ramos
P. Rigord
Les Projets Expérimentaux de M1 en Physique sont organisés sur toute l’année.
Au premier semestre, une phase de préparation a lieu sous forme d'étude bibliographique. Il s’agit d’analyser un problème physique à partir d’articles de recherches expérimentales, d'évaluer les paramètres pertinents à mesurer et leurs ordres de grandeur, puis de construire un dispositif avec l’aide de l’équipe enseignante constituée de chercheurs et d’enseignants-chercheurs et avec le soutien de l’équipe technique du département de physique de l’ENS de Lyon.
- comprendre et analyser une question à partir d’article
- proposer un montage expérimental pour répondre à la question
- mesurer un phénomène et analyser ses données de façon critique
- confronter ses résultats à une théorie ou proposer un modèle
Les projets Expérimentaux de M1 au S2 sont évalués par un rapport écrit et une soutenance orale.
Anglais 2 ou LV2
Layla Roesler
Pour chaque cours, le niveau de langue requis (B1, B2, C1, selon l’échelle du cadre européen des langues) est précisé.
L’année se structure autour de deux axes pour des cours de niveaux B1/B2/B2+/C1/C1+:
• Cours à thèmes ou compétences scientifiques : science, civilisation/histoire, littérature, anglais pour la recherche, communication orale.
• Préparation à la certification Cambridge English (CAE) en 3 étapes graduées : step 1 (B1), step 2 (B2), step 3 (C1)
L’évaluation prend en compte le contrôle continu et l’assiduité aux cours.
Plus d'informations sont disponibles sur le site du centre de langue.
L’évaluation est répartie équitablement entre Contrôle Continu (assiduité prise en compte) (50%) et examen final (50%). Les épreuves comprennent une présentation orale à partir d’un article de spécialité et un examen "Aural Comprehension".
Les étudiants étrangers peuvent substituer le module d’Anglais par un module de Français Langue Etrangère.
Seminaires et professionnalisation
Sébastien Manneville (Physique) et Jens Hasserodt (Chimie)
Dans le cadre de l'UE « Séminaires et Professionnalisation », les étudiant.e.s assistent à des séminaires ainsi qu'à quelques réunions obligatoires qui ont lieu le mercredi après-midi. Les séminaires spécifiques à la formation Sciences de la Matière ont lieu à l'ENS de Lyon et sont donnés par des chercheur.se.s invité.e.s à présenter leur domaine et leurs recherches. A ces séminaires s'ajoutent divers événements qui ont lieu sur le site de l'Université Lyon 1 à Villeurbanne : les « grandes conférences de la FRAMA » (Fédération de Physique de Lyon), les « cours du Collège de France hors les murs », ainsi que le cycle de conférences « Physique et Chimie au Printemps ». L'UE comprend également une série de présentations plus générales sur les débouchés de la formation, sur les liens entre science et société ou encore visant à l'acquisition de « soft skills » utiles quelle que soit l'orientation future des étudiant.e.s.
L'UE « Séminaires & Professionnalisation » est évaluée par un rapport écrit de 2 pages sur un des séminaires de l'année, ainsi que par l'assiduité (émargement à au moins 6 séminaires sur l'année et présence aux réunions).
Physique experimentale 2
Osvanny Ramos
N. Bain
A. Bienfait
F. Chillà
O. Cochet-Escartin
F. Montel
O. Ramos
J. Salort
Les Projets Expérimentaux de M1 en Physique sont organisés sur toute l’année.
Au second semestre, les étudiants ont ainsi accès à un matériel de recherche de pointe et développent des réalisations expérimentales en lien avec des sujets de recherche actuels. 6 journées complètes sont consacrées à la réalisation des mesures et à l’analyse des données recueillies.
- comprendre et analyser une question à partir d’article
- proposer un montage expérimental pour répondre à la question
- mesurer un phénomène et analyser ses données de façon critique
- confronter ses résultats à une théorie ou proposer un modèle
Les projets Expérimentaux de M1 au S2 sont évalués par un rapport écrit et une soutenance orale.
Stage de recherche de 3 mois en Physique
Eric Freyssingeas (Physique)
Description spécifique pour chaque étudiant.e.
Stage dans un laboratoire de recherche académique ou industriel en France ou à l'étranger constituant 12 semaines de présence à temps plein, la rédaction d'un rapport et une soutenance orale devant un jury composé de chercheurs et/ou enseignants-chercheurs. Il s'agit pour l'étudiant de prendre contact avec le monde de la recherche, encadré par un responsable, impliqué dans un réel sujet de recherche et participant aux diverses activités de l’équipe.
La note de l’examen tiendra compte du rapport écrit, de la soutenance orale (exposé + questions) et de l’avis du maître de stage.
Stage de recherche de 6 mois Physique
Le stage de recherche dure au minimum 24 semaines de début février à fin juillet.
Un projet de stage devra être déposé par chaque étudiant.e avant le 15 décembre.
Soutenances des stages : début septembre
Rapport écrit et soutenance orale
Mécanique statistique et thermodynamique II
Peter Holdsworth
E. Freyssingeas
V. Krakoviack
G. Petrillo
Thermodynamique statistique L3 ou équivalent
1. A review of thermodynamics and statistical mechanics
a. Thermodynamics potentials and experimental observation
b. Principals of statistical mechanics, microstates, ensembles, partition function
c. Thermodynamics from statistical mechanics.
d. Classical and quantum quantum limits.
e. Interacting systems
Some examples: magnets, fluids, liquid crystals, polymers and membranes.
2. Phase transitions
a. Symmetry breaking and competition between energy and entropy.
b. Mean field theory – the Ising model, liquid crystals, Van der Waals fluid.
c. Thermodynamics of phase transitions - 1st and 2nd order phase transitions.
d. Landau theory of phase transitions.
e. The lower critical dimension for phase transitions.
3. Response, correlations and fluctuations
a. Susceptibility and correlations.
b. Landau Ginzburg free energy functional G[m(r)].
c. Correlation length and correlation functions
4. Fluids in the Grand Canonical Ensemble.
a. The chemical potential for the ideal gas and for interacting systems.
b. Liquid-gas phase transition in the Van der Waals approximation.
c. The density functional.
5. Quantum Systems.
a. Introduction to the path integral method.
b. The transverse field Ising model.
c. Quantum phase transitions and quantum critical points.
d. Quantum-classical crossover in an ideal gas.
Ecrit.
Suggested reading:
“Equilibrium Statistical Mechanics” M. Plischke et B. Bergersen (World Scientifique). –
“Introduction to Modern Statistical Mechanics", David Chandler, CUP
“Introduction to Phase Transitions and Critical Phenomena”, H. E. Stanley, OUP, 1971.
“Thermodynamics and Introduction to Thermostatistics”, H. B. Callen, Wiley 1985.
“The Principles of Condensed Matter Physics”, P. M. Chaikin, T. C. Lubensky Cambridge University Press
“Basic Concepts for Simple and Complex Liquids” Jean-Louis Barrat and Jean-Pierre Hansen, CUP.
“Thermodynamique”, Claude Coulon, Sylvie le Boiteux, Patricia Segonds, (Dunod)
“Introduction à la Thermodynamique”, Claire Lhuillier et Jean Rous, (Dunod)
“Thermodynamique Statistique”, R. Castaing, (Masson et Cie)
“Physique statistique”, Bernard Diu, Claudine Guthmann, Danielle Lederer, Bernard Roulet Hermann, 1997.
“Statistical Mechanics: Entropy, Order Parameters, and Complexity”, James Sethna Oxford University Press, 2006 Free pdf: http://sethna.lassp.cornell.edu/statistical_mechanics_entropy_order_parameters_and_complexity
Physique des interfaces et de la matière complexe
Catherine Barentin
C. Barentin
A. Delory
E. Freyssingeas
Thermodynamique, physique statistique, mécanique des milieux continus, mécanique des fluides
Notre vie quotidienne implique de très nombreux matériaux dont nous ne saurions facilement dire s'ils sont liquides ou solides : gels, mousses, crèmes, pâtes, etc. Ces matériaux "mous" se retrouvent aussi en biologie, en géophysique et dans d'innombrables applications industrielles. Le premier objectif de ce cours est d'appréhender les deux principales propriétés macroscopiques qui différencient les solides élastiques et les fluides visqueux de cette matière complexe (ou "mal condensée"): la viscoélasticité et les comportements non-Newtoniens. Les interfaces jouent un rôle prépondérant en matière molle et le cours aborde ensuite de façon élémentaire les notions de capillarité et de mouillage. Enfin, la notion de microstructure de matériaux mous est évoquée à partir des techniques de caractérisation basées sur la diffusion du rayonnement. Deux exemples sont étudiés plus en détail pour illustrer l'influence de la microstructure sur les propriétés macroscopiques : les chaînes de polymères et les colloïdes. Les cours et TD sont accompagnés de diverses démonstrations expérimentales des phénomènes étudiés.
Compétences à acquérir :
- Savoir décrire et modéliser les propriétés macroscopiques des matériaux mous les plus simples
- Comprendre les phénomènes liés à la capillarité et au mouillage
- Connaître les principaux modèles de polymères et les interactions à l'échelle colloïdale
I- Introduction à la matière molle et aux fluides complexes (3h)
Rappel des différents états de le matière (G,L,S), présentation des fluides complexes, propriétés de la matière molle (grande susceptibilité, importance des interfaces, de kT, des interactions à l’échelle
II- Réponses à l'échelle macroscopique (3h)
Grandeurs d'intérêt, mesure des réponses mécaniques, modèles phénoménologiques
III- Physique à l'échelle de la microstructure
1- Sonder la structure (4h) par diffusion des rayonnements
2- Structure contrôlée par kBT (3h) : exemple des polymères
3- Dynamique contrôlée par kBT (3h) : exemple des polymères
4- Interactions à l'échelle colloïdale (4h)
IV- Rôle des interfaces (4h)
Rappel sur le mouillage partiel et notion de mouillage total. Etude des films minces - pression de déplétion.
Examen écrit de 3h
M. Doi, Soft Matter Physics, Oxford University Press (2013)
L. Hirst, Fundamentals of Soft matter Science, CRC Press (2012)
R. G. Larson, The structure and rheology of complex fluids, Oxford Univ Press (1999)
P. Oswald, Rhéophysique, Belin (2005)
M. Doi, Introduction to polymer physics, Oxford University Press (1990)
M. Doi, S; F. Edwards, The theory of polymer dynamics, Oxford Univ. Press (1986)
R. J. Hunter, Foundation of colloid science, Clarendon Press (1990)
J. N. Israelachvili, Intermolecular and surfaces forces, Academic Press (2011)
P.-G. de Gennes, F. Brochard, D. Quéré, Gouttes, Bulles, Perles et Ondes, Belin (2005)
Matière condensée
Benjamin Huard
B. Huard
D. Amans
R. Houvenaghel
S. Joubaud
Les prérequis pour suivre ce cours sont les suivants : mécanique quantique (niveau L3), thermodynamique statistique (niveau L3).
La matière condensée étudie les systèmes où les interactions et corrélations entre un grand nombre de constituants donnent naissance à des comportements collectifs et à des phénomènes émergents. Un de ses principaux sujets d’étude est l’état solide.
C’est un domaine extrêmement fertile et actif. C’est aussi le sous-domaine de physique qui compte de loin le plus de physiciennes et physiciens. C’est un domaine qui va des applications qui changent concrètement nos vies (comme les semiconducteurs pour l’éclairage, l’informatique, ou les communications) aux concepts mathématiques les plus abstraits qui tissent des liens vers d’autres disciplines (topologie, physique des hautes énergies, astrophysique, …) en passant par la chimie des matériaux.
Le cours et les travaux dirigés permettront notamment de répondre aux questions suivantes. Comment la matière est-elle structurée ? À quelle vitesse peut-on refroidir la matière en s’approchant du zéro absolu ? Qu’est-ce qui rend un matériau conducteur ou isolant ? Transparent ou opaque ? Que sont les quantas d’excitation dans la matière ? Quelle est la forme des ondes sonores classiques et quantiques ? Quels effets quantiques peut-on observer dans les conducteurs mésoscopiques ? Comment figer les électrons par le désordre ou les interactions ?
Parmi les thèmes de recherche actuels dans ce domaine, et qui nécessitent une bonne compréhension des bases données dans ce module, on peut citer le transport cohérent dans les systèmes mésoscopiques, la localisation d'Anderson et la localisation à N corps dans les systèmes désordonnés, les effets Hall quantiques entiers et fractionnaires, les phases de Berry et la topologie des bandes de Bloch, les isolants et semi-métaux topologiques, les instabilités des liquides de Fermi, les aspects modernes du magnétisme quantique (spinons, lacune de Haldane, liquides de spin et code torique), la condensation de Bose-Einstein, la superfluidité et la supraconductivité, les bits quantiques supraconducteurs et semi-conducteurs, la supraconductivité à haute température, les supraconducteurs topologiques et les fermions de Majorana. Le domaine a par ailleurs des liens directs avec d'autres domaines, en particulier les gaz atomiques ultra-froids, les cristaux photoniques et la science de l'information quantique.
Le cours de matière condensée introduit les bases de ce domaine. Il est donc essentiel pour suivre les modules plus spécialisés comme celui de supraconductivité, superfluidité et magnétisme, de physique quantique à N corps, de nanophysique et de phases topologiques.
- Introduction
- Sonder la structure de la matière
- Diffraction élastique des rayons X
- Réseau réciproque
- Diffraction inélastique des neutrons
- Types de cristaux (ionique, covalent, métallique, moléculaire, hydrogène)
- Décrire les vibrations de la matière
- Modes de vibration dans un cristal classique
- Capacité calorifique des isolants
- Excitation quantique de vibration : le phonon
- Sonder les phonons
- Structure électronique de la matière (en négligeant les interactions)
- Modèles de Drude et de Hall
- Théorème de Bloch
- Structure de bandes
- Modèle des liaisons fortes
- Fonctions de Wannier
- Graphène
- Capacité calorifique des métaux
- Transport des électrons : théorie semi-classique
- Dynamique des paquets d’onde dans les bandes de Bloch
- Trous
- Equation de Boltzmann
- Conducteurs mésoscopiques
- Bruit de grenaille
- Semiconducteurs
- Localisation d’Anderson et localisation faible
Examen écrit de 3h en fin de semestre.
Le cours est structuré suivant ce livre :
Modern Condensed Matter Physics
Steven M. Girvin, Kun Yang
Les livres suivants sont également d’excellentes références :
The Oxford Solid State Basics (introduction au domaine niveau L3)
Steven H. Simon
Solid State Physics (grand classique des années 1970)
N.W. Ashcroft, N.D. Mermin
Introduction to Solid State Physics (introduction au domaine niveau L3)
Charles Kittel
Principles of Condensed Matter Physics (bon livre pour la matière molle)
Paul Chaikin, T.C. Lubensky
Dynamique des fluides
Julien Salort
J. Salort
L. Couston
V. Mouet
G. Ricard
Solides, liquides, interfaces en L3 ou équivalent, Bases pour l'analyse de données et d'images en L3
La dynamique des fluides est au cœur de nombreux défis industriels (optimisation du mélange, énergie renouvelable, médecine, réduction du frottement) et environnementaux (prédiction de la circulation atmosphérique, fonte des glaces). Dans de nombreux cas, ces défis sont difficiles à résoudre car les comportements des fluides sous-jacents (eau, gaz, cristaux liquides, fluides biologiques) sont infiniment complexes et difficile à prédire (étant décrits, pour beaucoup d’entre eux, par l’équation de Navier-Stokes).
Ce cours présente des notions et outils indispensables pour les travaux de recherche en sciences du climat, matière molle, hydrodynamique, écoulements biologiques, écoulements astrophysiques, fluides quantiques et microfluidique.
L’objectif du cours de Dynamique des Fluides est de vous familiariser avec les outils théoriques et pratiques mathématiques permettant de décrire et prédire (de manière analytique, sous des hypothèses) le mouvement macroscopique des fluides. Plus précisément, à travers ce cours vous allez :
- Développer votre intuition permettant de reconnaître et exprimer mathématiquement les ingrédients physiques clés d'un problème de dynamique des fluides.
- Apprendre à écrire les équations décrivant l’évolution de l’état du fluide.
- Apprendre à simplifier ces équations et les résoudre (donc prédire) dans certains cas limites.
Ces connaissances seront acquises en travaillant sur des situations physiques issues (entre autres) de l’aérodynamique, l’hydrodynamique, l’ingénierie, et de la géophysique (climat).
1) La matière fluide.
2) Lois fondamentales.
3) Couches limites
4) Dissipation et irréversibilité.
5) Vorticité et tourbillons
6) Fluides géophysiques (L. Couston)
7) Ondes et instabilités
8) Mesures expérimentales et présentation des activités de recherche
Examen écrit.
Physique non-linéaire et instabilités
Sylvain Joubaud
S. Joubaud
P. Baconnier
G. Ricard
Physique du vivant
Cendrine Moskalenko
D. Jost
P.-F. Lenne
C. Moskalenko
Notions de base de physique statistique, et de biologie/biophysique.
Une cellule fonctionne avec de faibles nombres de molécules et des énergies comparables aux énergies thermiques ; comment peut-elle avoir un comportement déterministe dans ces conditions ? Comment la dynamique des tissus émerge du comportement des cellules individuelles ? Les outils physiques basés sur des concepts de matière molle, de physique statistique, de thermodynamique et de mécanique des milieux continus, permettront d’analyser comment s’auto-organisent les structures du vivant des échelles subcellulaires (nanométriques) aux échelles des tissus (millimétriques). Nous verrons en retour comment les objets biologiques génèrent de nouvelles problématiques de Physique et conduisent au développement de méthodes expérimentales et théoriques pour les traiter.
1. Physique du polymère ADN
2. Régulation des gènes et stocasticité
3. Moteurs Moléculaires et effets collectifs
4. Séparation de phase et auto-assemblage in cellulo
5. Physique du développement: signalisation et mécanique
Examen écrit sous forme de rapport (travail sur article)
Simulations numériques et thermodynamique statistique
Ralf Everaers
Ralf Everaers
Classical mechanics, and basic notions of thermodynamics and statistical mechanics (L3), Python
Statistical Physics deals with behavior that emerges from the interactions of many particles. Since exact analytical solutions of the governing equations only exist for a small number of models, computer simulations have become an indispensable tool in the field and neighboring disciplines like Condensed Matter Physics, Theoretical and Physical Chemistry, Chemical and Biological Physics.
The course introduces the methods employed for exploring the static and dynamic properties of particle based systems. Computational exercises, where these methods are applied to simple, but powerful models, form an integral part of the module. To some extent it offers a fresh start, if you found the subject interesting, but a little mysterious, because the course inverses the order in which the subject is typically taught: starting from simulations allows to "discover" the laws of Statistical Mechanics and Thermodynamics in a very direct and intuitive manner.
- From Mechanics to Statistical Mechanics: Just do it?
Lecture: A quote by Laplace defines a research program for modern science:
- identify particles, interactions and equations of motion
- Solve for many particles
- Observe/understand the emergent behavior
Modern computers allow for a quantitative implementation of such thought experiments.
- Simulating Gases
Lecture: We start with the simplest non-trivial many particle simulation technique: The combination of Exact Dynamics with Multi-particle collisions.
For some examples of non-interacting many-particle systems we can solve Newton's equations of motion exactly: free particles, harmonic oscillators, ... We can use these analytical solution to define the "streaming part" of a time step.
- The "collision part" adds the effect of confining walls and, most importantly, collisions between groups of neighboring particles.
- TD: From Newtonian dynamics to the ideal gas law
- Your mission is to achieve the great unification of the laws of Newton, Boyle, Charles, Avogadro and Gay-Lussac ...: do the latter "emerge" in a simple model, where gas "atoms" move ballistically in between energy- and momentum conserving collisions?
- To make this point you need to carry out a complete simulation project (run simulations for large variety of combinations of particle number, volume, box shape, internal energy and particle mass; analyze data for the instantaneous pressure; compare data sets to theory)
- Molecular Dynamics Simulations for Liquids and Solids: Basics
Lecture: For systems at higher density we can no longer neglect the effect of the interactions between the particles. The method of choice for their exploration are Molecular Dynamics simulations.
- time- vs event-based MD
- TD: The MD time step
The central part of most Molecular Dynamics algorithms is the integration of the equations of motions for particles interacting via continuously varying potentials. In this exercise we explore for the simple example of harmonic and non-linear oscillators
the (forward) Euler algorithm and
- the different formulations of the Verlet algorithm
- Molecular Dynamics Simulations: Lennard-Jones systems
In this practical 4h session you will explore the behavior of many-particle systems for a simple model system. During the TD part of the session you will learn how to run and analyze simulations of LJ systems. During the mini-project part of the session you will explore the emergent behavior on your own. The objective is
1) To observe the emergence of typical behavior of liquids and crystalline solids2) To explore the transition from the liquid to the solid state as a function of the density of the system.
- From Classical Mechanics to Statistical Mechanics and Thermodynamics
- TD: Heat Flow
- Following Laplace's instructions we have by now learned how to simulate ideal gases, systems composed of harmonic oscillators, and many-particle systems with WCA- and LJ-interactions. And we have seen that isolated many-particle systems evolve to equilibrium states, whose macroscopic properties are time-independent.
- But what happens, when we allow such systems to exchange energy?
- Lecture: A little review in the light of what you will have learned at this point:
- Classical Mechanics
- Collisions and conservation laws, Newton's, Lagrange's and Hamilton's mechanics, Noether's theorem: symmetries and conservation laws, Laplace's "instructions": give up, because we cannot predict the exact time evolution of all microscopic degrees of freedom?
- Thermodynamics
- Equilibrium states and equilibration, state variables, the basic problem of thermodynamics, entropy, thermodynamic potentials, the nature of the predictions made by thermodynamics
- Statistical Mechanics
- Phase space, trajectories, phase space densities and the link between the microscopic and the macroscopic view, entropy, the ensembles of statistical mechanics, equilibration and H-theorem
- Simple models for interacting systems
- Lattice gas, Lennard Jones particles, Ising spin model
- Classical Mechanics
- TD: Heat Flow
- Exact Enumeration and Monte Carlo Simulations
- Up this point we will have followed Laplace's instructions and carried out computer simulations, where we solve Newton's equations of motion for small model systems. But having discovered Gibb's formalism for calculating ensemble averages over phase space, a new question arises: can't we use a computer to calculate these averages for us numerically?
- TD: Exact Enumeration of the 2d Ising Model
- A classic example for the evaluation by hand of a partition functions and of an expectation value in the canonical ensemble is the behavior of a single spin in an external field.
- In this exercise we explore, how much farther we can go by numerically evaluating the partition function of 2d Ising models.
- Representations of Ising states (binary numbers vs matrices)
- Calculating observables
- Ising order parameters
- Enumerating all microstates of the 3x3 and the 4x4 Ising model
- Calculating EXACT equations of state
- Lecture:
- Instead of generating ALL possible microstates, it might be enough to generate representative samples. This is the idea behind Monte Carlo Simulations, which allow to calculate integrals over the high-dimensional phase or configuration spaces of Statistical Mechanics.
- After a brief discussion of Random or Simple Sampling, the lecture focuses on the Metropolis et al. Dynamic Monte Carlo method for Importance Sampling
- TD: Metropolis Monte Carlo Simulations of the Ising Model
- Use MC simulations to explore the behavior of the Ising model for different combinations of the reduced field and coupling strength (h,k).
- Explore
- the effect of increasing the external field in the absence of internal couplings
- the effect of increasing the internal coupling in the absence of an external field
- the effect of antiferromagnetic couplings k<0
- the effect of an additional magnetic field
- different initial conditions
- Learn about equilibrating simulations and assembling data.
- Calculating free energies
- Lecture: Thermodynamic integration
- Metropolis importance sampling and Molecular Dynamics simulations allow to measure averages of "mechanical observables," whose values are defined for individual microstates. However they provide no direct access to the equally important "thermodynamic observables” like the entropy or free energies, which are related to the absolute size of phase space.
- There is nothing strange about this inability of simulators, experimentalists do not dispose of free-energy-o-meters or entropy-o-meters either. Instead we all determine free energy DIFFERENCES via thermodynamic integration of measurable(!) derivatives of the free energy.
- Kirkwood coupling parameter scheme
- Lecture: Thermodynamic integration
Rapport résumant les results obtenus dans les exercises.
- Frenkel and Smit, Understanding Molecular Simulation
- Allen and Tildesley, Computer Simulation of Liquids
- Landau and Binder, A Guide to Monte Carlo Simulations in Statistical Physics
- Krauth, Algorithms and Computations
Milieux Granulaires et Divisés
Nicolas Taberlet
N. Taberlet
L. Vanel
E. Freyssingeas
Le cours de matière molle (M1) peut être utile mais pas indispensable.
Le cours vise à présenter la physique des milieux granulaires et des fractures.
Statique des milieux granulaires
Plasticité – Rupture
Théorie cinétique des gaz granulaires
Ségrégation
Critères de rupture. Impact de la taille des défauts
Dynamiques de rupture
Interactions entre fissures
Rupture dans les matériaux hétérogènes
Examen écrit sans contrôle continu.
Andreotti, B., Forterre, Y., & Pouliquen, O. (2013). Granular media: between fluid and solid. Cambridge University Press.
Biologie moléculaire et génétique
Nathalie Alazard-Dany
Tous les intervenants viennent du Département de Biologie de l'ENSL ou UCBL:
Nathalie Alazard-Dany
Patrice Gouet
Fabien Mongelard
PCB 1&2 L3 Sciences de la Matière
Le cours se concentre sur l'échelle moléculaire et décrit la structure et la fonction des acides nucléiques: la physico-chimie de l'ADN et de l'ARN, la structure et l'organisation fonctionnelle du génome, l'expression de l'information génétique. Il traite également de la manipulation de l'information génétique et de ses applications. Le concept de signaux chimiques et leur effet et leur intégration dans la cellule sont également discutés. Le cours accompagnés de TDs à l'IBCP traitent des études cristallographiques sur les protéines.
Le cours comprend également des Travaux Pratiques présentant des techniques et des applications du génie génétique in vitro.
Moyenne de 2 notes : 1 note d’examen (écrit, 2/3) sur les cours et 1 note de présentation du projet (1/3).
Cellule et tissus biologiques
Nathalie Alazard-Dany
Tous les intervenants viennent du Département de Biologie :
Nathalie Alazard-Dany
Elena Rondeaux
Aurélie Vialette
Stéphane Vincent
PCB1&2 en L3 Sciences de la Matière
Le cours se concentre sur l'échelle cellulaire et supra-cellulaire. Il inclue l'étude du cycle cellulaire et la cancérogénèse, une introduction à la virologie et à l'immunologie avec des exemples étudiés en TD. Dans le cadre des méthodes de la Biologie Moderne, seront présentés: l'utilisation d'organismes modèles animaux (ver, mouche, souris ...) ou de plantes, ainsi que les méthodes de transgénèse.
Le cours comprend également des Travaux Pratiques illustrant les techniques de culture cellulaire et des applications à l'analyse du cycle des cellules et un projet bibliographique encadré par un.e doctorant.e en biologie.
Moyenne de 2 notes : 1 note d’examen sur les cours (écrit, 2/3) et 1 note de Projet Bibliographique (1/3).
Advanced statistical mechanics
Eric Bertin
E. Bertin
F. Detchevery
This course covers advanced topics in statistical physics, mostly out of equilibrium. The relevant formalism (statistics of sums of random variables, stochastic processes,…) is first introduced. Then the course covers the standard topics of Langevin and Fokker-Planck equations, as well as linear response close to equilibrium and fluctuation-dissipation relations. Far from equilibrium extensions like fluctuation relations are also presented. In the last part, the course discusses examples of N-body distributions in out-of-equilibrium models, as well as the more versatile approach using an effective description in terms of a one-body distribution. Some examples of applications are taken from the recent literature.
Lecture 1: Sums of random variables
Statistics of sums of random variables, central limit theorem and its generalization to broadly distributed random variables. Examples of correlated or non-identically distributed random variables. Large deviations and their relevance in statistical physics.
Application of sums of random variables to equilibrium disordered systems, example of the Random Energy Model.
Lecture 2: Stochastic processes
Markov jump processes, master equation, detailed balance. Random walk on a lattice. Diffusive limit and diffusion equation. Continuous time random walks and anomalous diffusion.
Statistics of the first return time of a random walk.
Relaxation to equilibrium, increase of entropy, expansion over the eigenvectors of the Markov operator. Non-stationary dynamics at large time and aging phenomenon.
Lecture 3: Langevin and Fokker-Planck equations
Langevin equation, definition and physical motivation. Detailed balance.
Fokker-Planck equation. Derivation from a biased random walk on a lattice. Kramers-Moyal expansion. Stationary solution without flux (equilibrium) and with flux. Physical examples.
Relaxation to equilibrium and Ornstein-Uhlenbeck process.
Langevin equation with multiplicative noise, Ito and Stratonovitch discretization rules. Corresponding Fokker-Planck equation. Wong-Zakai theorem. Stochastic on-off intermittency as an example of multiplicative noise. Stochastic calculus and Ito's lemma.
Lecture 4: Response to an external field
Linear response close to equilibrium. Response function and Kubo formula. Time-correlation function and fluctuation-dissipation relation. Microreversibility and symmetry of response functions. Kramers-Krönig relation.
Statistics of trajectories and fluctuation relation far from equilibrium. Comparison of a trajectory with the time-reversed one. Statistics over trajectories. Fluctuation relation for discrete-time stochastic processes. Jarzinsky and Crooks relations.
Lecture 5: Examples of N-body distributions in stationary nonequilibrium states
One-dimensional lattice particle models, Zero-Range Process, Asymmetric Simple Exclusion Process. Matrix Product Ansatz solution.
Tapping dynamics for granular matter: Edwards postulate for the N-body distribution.
Approximate N-body distribution for interacting active particles with random self-propulsion forces.
Lecture 6: Effective description in terms of one-body problem
Dynamics with persistent interactions, approximation in terms of a non-linear Fokker-Planck equation with a self-consistent force field.
Collisional dynamics in the dilute regime, kinetic theory for the one-body distribution.
Principle of the derivation of continuum equations for the slow modes.
examen écrit 3h
Advanced soft condensed matter
Hélène Delanoë-Ayari
Kirsten Martens
Hélène Delanoë-Ayari
Kirsten Martens
Nicolas Bain
Standard M1 soft-matter/condensed-matter background (statistical physics, fluid mechanics, elasticity), e.g. the ENS de Lyon L3 course on rheology, surface tension and wetting, and the M1 course on polymers and complex fluids. No other specific prerequisite.
This course gives an in-depth, unified view of soft matter physics, in and out of equilibrium, through six topics: suspensions, dense/jammed materials, polymer and biological networks, active suspensions, cellular tissues, and active solids/gels. Each topic starts from a concrete physical problem and combines theory, simulation and experiment. By the end of the course, students will be able to build minimal statistical-physics and hydrodynamic models for passive and active soft matter, and to critically read and present a research article in the field.
Part I — Passive soft matter:
(1) Suspensions — microhydrodynamics, Stokes flow, Brownian motion and statistical description;
(2) Dense and jammed systems — concentrated suspensions, emulsions, foams and granular materials, yield-stress rheology (Bingham, Herschel–Bulkley), elastoplastic and soft-glassy-rheology models;
(3) Polymer and biological networks — polymer elasticity, gelation and sol–gel transition, rubber elasticity, swelling (Flory–Rehner), viscoelasticity, fracture and toughening of gels.
Part II — Active soft matter:
(4) Active suspensions — microswimmer hydrodynamics, pushers/pullers, kinetic theory, active stress and rheology, motility-induced phase separation (MIPS);
(5) From foams to tissues — vertex model, cell shape and rigidity transition, T1 rearrangements;
(6) Active solids and gels — active polar/nematic gel theory, active poroelasticity, spontaneous flow, oscillations and buckling instabilities.
Each lecture is paired with a tutorial session and a research article used as the basis of the final oral exam.
Continuous assessment through tutorial preparation, plus a final assessment based on a short written report and a 30-minute oral presentation of a research article introduced during the course.
M. Doi, Soft Matter Physics (Oxford University Press); P.-G. de Gennes, Scaling Concepts in Polymer Physics; M. C. Marchetti et al., “Hydrodynamics of soft active matter,” Rev. Mod. Phys. 85, 1143 (2013); selected research articles distributed during the course, e.g. Park et al., Nat. Mater. 14, 1040 (2015); Ideses et al., Nat. Commun. 9, 2461 (2018).
Advanced Computational Statistical Physics
Ralf Everaers
Ralf Everaers
Physique statistique L3 and M1
Physique numérique L3
Statistical Physics deals with behavior that emerges from the interactions of many particles. Since exact analytical solutions of the governing equations only exist for a small number of models, computer simulations have become an indispensable tool in the field and neighboring disciplines like Condensed Matter Physics, Theoretical and Physical Chemistry, Chemical and Biological Physics.
The cours introduces the methods employed for exploring the static and dynamic properties of particle based systems on an advanced level. Computational exercises, where these methods are applied to simple, but powerful models, form an integral part of the module.
- Molecular Dynamics Simulations for the exploration of emergent dynamic properties
- TD: Integrating Newton’s equations of motion for continuous potentials: The secret behind the Verlet algorithm
- Liouville formulation of symplectic and multiple-timestep integrators
- Langevin dynamics
- Thermodynamic averages, fluctuations and transformations between ensembles
- Linear response and Green-Kubo relations for transport coefficients
- TD: MD simulations of Lennard-Jones liquids
- Non-equilibrium Molecular Dynamics
- Monte Carlo Simulations for the exploration of emergent static properties
- Exact enumeration of small systems: Reweighting and the exact evaluation of partition functions
- Monte Carlo simulations
- Simple Sampling: Statistical errors and the limits of reweighting
- Importance Sampling: The Metropolis algorithm; Statistical errors, dynamical correlations and the power of well-designed trial moves: Glauber vs. Kawasaki vs Cluster moves for spin systems; Simulating polymers; Quenched disorder: spin glasses; Other ensembles.
- TD: Monte Carlo simulations of the Ising model
- Free energies
- Widom insertion and thermodynamic integration
- TD: free energy of a methane molecule in water from TI (L. Monticelli)
- Advanced techniques:
- TD: The density of states of the Ising model from Multihistogram analysis/WHAM
- TD: Protein binding energies from Umbrella Sampling and Steered Molecular Dynamics (L. Monticelli)
- Widom insertion and thermodynamic integration
- Exploring Rare events
- (sampling) transition states and paths
- Kinetic Monte Carlo
Mini-projet et examen écrit
- Frenkel and Smit, Understanding Molecular Simulation
- Allen and Tildesley, Computer Simulation of Liquids
- Landau and Binder, A Guide to Monte Carlo Simulations in Statistical Physics
- Krauth, Algorithms and Computations
Biophysics
Fabien Montel (Laboratoire de Physique, ENS de Lyon)
F. Montel
J. Derr
A.-F. Bitbol
Une cellule fonctionne avec de faibles nombres de molécules et des énergies comparables aux énergies thermiques ; comment peut-elle avoir un comportement déterministe dans ces conditions ? Comment la dynamique des tissus émerge du comportement des cellules individuelles ? Les outils physiques basés sur des concepts de matière molle, de physique statistique et de mécanique des milieux continus permettront d’analyser comment s’auto-organisent les structures du vivant des échelles subcellulaires (nanométriques) aux échelles des tissus (centimétriques). Nous verrons en retour comment les objets biologiques génèrent de nouvelles problématiques de Physique et conduisent au développement de méthodes expérimentales et théoriques pour les traiter.
- Appréhender et maîtriser les différents outils théoriques permettant de comprendre le monde vivant de l'échelle moléculaire à celle de l'individu
- Manipuler des données brutes issues d'expériences de biophysique pour intégrer les spécificités des données rencontrés issus du monde vivant (variabilités intrinsèques, corrélations, dynamique hors équilibre, ...)
1. Machines Moléculaires :
-Les moteurs moléculaires : extraire un mouvement dirigé à partir du bruit thermique.
-Les pores biologiques : canaux ioniques (modèle d'Hodgkin–Huxley), translocon (ratchet brownien), pore nucléaire (sélectivité et directionnalité), porines (séquençage de l'ADN).
2. Mécanique des plantes :
-Qu'est-ce que la croissance des plantes ?
-Processus de régulation et instabilités dynamiques
-Mouvements végétaux, mécanique et morphoélasticité
-Aspect microscopique de la formation des motifs : Auxine et phyllotaxie
3. Evolution
- Modélisation de l'évolution d'une population bien mélangée
- Evolution d'une population bien mélangée : interprétation
- Au-delà de la population bien mélangée
- L'évolution moléculaire
Nonlinear physics and instabilities
Olivier PIERRE-LOUIS
Olivier PIERRE-LOUIS
Vincent DEMERY
Familiarité avec les notions élémentaires de mathématiques appliquées (équations différentielle, algèbre linéaire).
Ondes nonlinéaires.
- Notions sur les équations de solitons. Equation de Korteweg-de Vries; compétitions entre nonlinéarité et dispersion. Existence et interactions d’ondes solitaires.
- Equation de Burgers. compétition entre nonlinéarité et dissipation.
- Notions sur les systèmes de réaction diffusion. Propagation de fronts. Croissance d’un milieu stable dans un milieu métastable ou dans un milieu instable. Notions sur les milieux excitables.
- Instabilité des trains d’onde. Développements multi-échelles et équations d’amplitude.
- Equation de Schrödinger nonlinéaire.
Morphogénèse:
- panorama de la morphogénèse dans les systèmes hors équilibre: physique, hydrodynamique, biologie, etc.
- Etude de stabilité linéaire dans les systèmes étendus
- Patterns et leurs instabilités secondaires
- Coarsening et lois d'échelle
- Chaos spatiotemporel
Ecrit (3h)
On pourra se référer au livre de Thierry Dauxois et Michel Peyrard (Physics of Solitons) ou les livres de M. Cross and H. Greenside, Pattern Formation and Dynamics in Non-equilibrium Systems, de L. Pismen, Patterns and Interfaces in Dissipative Dynamics, et de C. Misbah, Complex Dynamics and Morphogenesis, An Introduction to Nonlinear Sciences
Experimental project
Stéphane Santucci
All projects are supervised by researchers and professors from ENS de Lyon or UCBL
The experimental projects are supervised by researchers and professors from ENS de Lyon and UCBL. Students who want to take this course have to find a mentor willing to supervise and host a 48h experimental, or numerical, project in their Lab (48h is the minimal time you should be spending in the lab working on your project, eg. 12x4h, or 6x8h). Some examples of projetcs from previous years are: Construction of optical tweezers, characterization of time-reversal mirrors, liquids assembled from self-propelled particles, fracture & friction experiments, ...
Poster presentation
Projet numérique
Ralf Everaers (Physique), Agilio Padua (Chimie)
Elham Ghobadpour
Python
The module is composed of two parts:
- 24h of practical exercises (TP) introducing advanced tools of Scientific Software Development during S3A.
- Individual computational projects supervised by researchers and professors from ENS de Lyon and UCBL during S3, which further develop an aspect of a computational module of the Master: Students have to find a mentor willing to supervise and host a 24h computational project in their Lab (24h is the minimal time you should be spending with your supervisor working on your project, eg. 6x4h, or 3x8h).
- Acquire skills and a culture of best practices in Scientific Software Development
- Train in the framework of a small and individually supervised computational project in a scientific domain of the student's choice
In time to be able to apply these techniques in a computational MSc/PhD research project.
24h of practical exercises (TP) introducing advanced tools of Scientific Software Development:
- Shell scripts and Python notebooks as glue code
- Modular, reusable software design
- Effective collaborative development with multiple co-authors
- Version control and release cycles
- Automated testing frameworks
- Structured documentation
- Management of open source scientific packages
- Continuous integration & deployment
- Conversational development
- Systematic debugging
- Mixing programming languages
We expect a ten-page long report summarizing the physics concept required to understand the simulations, a clear presentation of the numerical setup, and of the main results.
Active Matter
Cécile Cottin-Bizonne
Short written on a recent research article
Active matter encompasses a broad range of systems ranging from animal groups to shaken grains, to motile colloids to cell tissues and bacteria suspensions. We will introduce some generic concepts and tools borrowed from soft condensed matter and statistical physics to account for the large-scale properties of these systems driven out of thermal equilibrium at the level of the elementary units.
The course will both cover well established results and ongoing developments in the field. The outline will be adjusted accordingly.
1- Introduction: what is active matter?
2- Self propelled bodies and persistent random walkers: statistics of active-particle trajectories.
2- Active systems in a background fluid: description of microswimmers.
3- Active Matter thermodynamics: we will address questions such as, can we a define a temperature, a pressure for those systems?
4- Continuum description of active matter.
Advanced mechanics and elasticity
Elsa Bayart
E. Bayart
Undergraduate course on continuum mechanics and elastic media
Elastic solids can deform homogeneously when submitted to stresses, but elastic energy can also be focused via non-linear processes, even when the material is described with a linearly elastic constitutive law: wrinkles, folds, fracture. In this course, we will demonstrate how geometrical constraints yield to ordered and disordered patterns in elastic media under mechanical loading. The course will cover a wide spectrum of approaches from theoretical descriptions to applications such as biological growth, foldable structures, fragmentation, geophysical patterns, earthquakes.
I.- Introduction to elasticity of continuous media
II.- Thin elastic plates
II.1.- Introduction: differential geometry of a surface, equations
II.2.- Buckling: roll-like patterns, growth-induced patterns
II.3.- Singularities: focussing of energy around points (developable cones) and lines (stretching ridges)
II.4.- Patterns from singularities and foldable structures
III.- Fracture Mechanics
III.1.- Linear Elastic Fracture Mechanics
III.2.- Quasi-static crack propagation: instabilities and crack-induced patterns
III.3.- Fast fracture: dynamics, instabilities.
III.4.- Application to friction
Presentation of a research article
Matière condensée
Benjamin Huard
B. Huard
D. Amans
R. Houvenaghel
S. Joubaud
Les prérequis pour suivre ce cours sont les suivants : mécanique quantique (niveau L3), thermodynamique statistique (niveau L3).
La matière condensée étudie les systèmes où les interactions et corrélations entre un grand nombre de constituants donnent naissance à des comportements collectifs et à des phénomènes émergents. Un de ses principaux sujets d’étude est l’état solide.
C’est un domaine extrêmement fertile et actif. C’est aussi le sous-domaine de physique qui compte de loin le plus de physiciennes et physiciens. C’est un domaine qui va des applications qui changent concrètement nos vies (comme les semiconducteurs pour l’éclairage, l’informatique, ou les communications) aux concepts mathématiques les plus abstraits qui tissent des liens vers d’autres disciplines (topologie, physique des hautes énergies, astrophysique, …) en passant par la chimie des matériaux.
Le cours et les travaux dirigés permettront notamment de répondre aux questions suivantes. Comment la matière est-elle structurée ? À quelle vitesse peut-on refroidir la matière en s’approchant du zéro absolu ? Qu’est-ce qui rend un matériau conducteur ou isolant ? Transparent ou opaque ? Que sont les quantas d’excitation dans la matière ? Quelle est la forme des ondes sonores classiques et quantiques ? Quels effets quantiques peut-on observer dans les conducteurs mésoscopiques ? Comment figer les électrons par le désordre ou les interactions ?
Parmi les thèmes de recherche actuels dans ce domaine, et qui nécessitent une bonne compréhension des bases données dans ce module, on peut citer le transport cohérent dans les systèmes mésoscopiques, la localisation d'Anderson et la localisation à N corps dans les systèmes désordonnés, les effets Hall quantiques entiers et fractionnaires, les phases de Berry et la topologie des bandes de Bloch, les isolants et semi-métaux topologiques, les instabilités des liquides de Fermi, les aspects modernes du magnétisme quantique (spinons, lacune de Haldane, liquides de spin et code torique), la condensation de Bose-Einstein, la superfluidité et la supraconductivité, les bits quantiques supraconducteurs et semi-conducteurs, la supraconductivité à haute température, les supraconducteurs topologiques et les fermions de Majorana. Le domaine a par ailleurs des liens directs avec d'autres domaines, en particulier les gaz atomiques ultra-froids, les cristaux photoniques et la science de l'information quantique.
Le cours de matière condensée introduit les bases de ce domaine. Il est donc essentiel pour suivre les modules plus spécialisés comme celui de supraconductivité, superfluidité et magnétisme, de physique quantique à N corps, de nanophysique et de phases topologiques.
- Introduction
- Sonder la structure de la matière
- Diffraction élastique des rayons X
- Réseau réciproque
- Diffraction inélastique des neutrons
- Types de cristaux (ionique, covalent, métallique, moléculaire, hydrogène)
- Décrire les vibrations de la matière
- Modes de vibration dans un cristal classique
- Capacité calorifique des isolants
- Excitation quantique de vibration : le phonon
- Sonder les phonons
- Structure électronique de la matière (en négligeant les interactions)
- Modèles de Drude et de Hall
- Théorème de Bloch
- Structure de bandes
- Modèle des liaisons fortes
- Fonctions de Wannier
- Graphène
- Capacité calorifique des métaux
- Transport des électrons : théorie semi-classique
- Dynamique des paquets d’onde dans les bandes de Bloch
- Trous
- Equation de Boltzmann
- Conducteurs mésoscopiques
- Bruit de grenaille
- Semiconducteurs
- Localisation d’Anderson et localisation faible
Examen écrit de 3h en fin de semestre.
Le cours est structuré suivant ce livre :
Modern Condensed Matter Physics
Steven M. Girvin, Kun Yang
Les livres suivants sont également d’excellentes références :
The Oxford Solid State Basics (introduction au domaine niveau L3)
Steven H. Simon
Solid State Physics (grand classique des années 1970)
N.W. Ashcroft, N.D. Mermin
Introduction to Solid State Physics (introduction au domaine niveau L3)
Charles Kittel
Principles of Condensed Matter Physics (bon livre pour la matière molle)
Paul Chaikin, T.C. Lubensky
Mécanique quantique avancée
Marc Magro
M. Magro
A. Burg
P. Holdsworth
L. Moreau-Lalaux
Mécanique quantique L3 ou équivalent.
Introduction à la relativité restreinte
L’objectif de ce cours est de maitriser toute une palette de méthodes utilisées notamment en matière condensée et en physique des hautes énergies.
Le cours est structuré en 4 parties :
Première partie : Systèmes quantiques non relativistes à N corps
• Systèmes de N particules identiques
• Particules identiques en nombre indéterminé
Deuxième partie : Diffusion
• Notions générales
• Résultat du calcul par résolvante
• Approximation de Born
• Potentiel central
Troisième partie : Symétries
• Partie générale sur les symétries
• Rotations et Moment angulaire
Quatrième partie : Mécanique quantique relativiste
• Équation de Klein-Gordon
• Équation de Dirac
Ecrit.
Mécanique statistique et thermodynamique II
Peter Holdsworth
E. Freyssingeas
V. Krakoviack
G. Petrillo
Thermodynamique statistique L3 ou équivalent
1. A review of thermodynamics and statistical mechanics
a. Thermodynamics potentials and experimental observation
b. Principals of statistical mechanics, microstates, ensembles, partition function
c. Thermodynamics from statistical mechanics.
d. Classical and quantum quantum limits.
e. Interacting systems
Some examples: magnets, fluids, liquid crystals, polymers and membranes.
2. Phase transitions
a. Symmetry breaking and competition between energy and entropy.
b. Mean field theory – the Ising model, liquid crystals, Van der Waals fluid.
c. Thermodynamics of phase transitions - 1st and 2nd order phase transitions.
d. Landau theory of phase transitions.
e. The lower critical dimension for phase transitions.
3. Response, correlations and fluctuations
a. Susceptibility and correlations.
b. Landau Ginzburg free energy functional G[m(r)].
c. Correlation length and correlation functions
4. Fluids in the Grand Canonical Ensemble.
a. The chemical potential for the ideal gas and for interacting systems.
b. Liquid-gas phase transition in the Van der Waals approximation.
c. The density functional.
5. Quantum Systems.
a. Introduction to the path integral method.
b. The transverse field Ising model.
c. Quantum phase transitions and quantum critical points.
d. Quantum-classical crossover in an ideal gas.
Ecrit.
Suggested reading:
“Equilibrium Statistical Mechanics” M. Plischke et B. Bergersen (World Scientifique). –
“Introduction to Modern Statistical Mechanics", David Chandler, CUP
“Introduction to Phase Transitions and Critical Phenomena”, H. E. Stanley, OUP, 1971.
“Thermodynamics and Introduction to Thermostatistics”, H. B. Callen, Wiley 1985.
“The Principles of Condensed Matter Physics”, P. M. Chaikin, T. C. Lubensky Cambridge University Press
“Basic Concepts for Simple and Complex Liquids” Jean-Louis Barrat and Jean-Pierre Hansen, CUP.
“Thermodynamique”, Claude Coulon, Sylvie le Boiteux, Patricia Segonds, (Dunod)
“Introduction à la Thermodynamique”, Claire Lhuillier et Jean Rous, (Dunod)
“Thermodynamique Statistique”, R. Castaing, (Masson et Cie)
“Physique statistique”, Bernard Diu, Claudine Guthmann, Danielle Lederer, Bernard Roulet Hermann, 1997.
“Statistical Mechanics: Entropy, Order Parameters, and Complexity”, James Sethna Oxford University Press, 2006 Free pdf: http://sethna.lassp.cornell.edu/statistical_mechanics_entropy_order_parameters_and_complexity
Lasers et matière
Christophe Bonnet (partie A) et Natalia Del Fatti (partie B)
C. Bonnet
N. Del Fatti
B. Marekha
J. Morville
T. Niehaus
Ondes et Optique (L3)
Comprendre et modéliser l’interaction lumière – matière, le fonctionnement de sources LASER, et la propagation des champs électromagnétiques intenses dans la matière.
PARTIE A – LASER
I. Introduction : principe général de fonctionnement d’un laser
II. Lumière et matière : description de la lumière ; la matière : description quantique ; interaction lumière - matière : processus spontanés et stimulés
III. Les cavités lasers : faisceaux gaussiens, stabilité, modes de cavité
IV. Les mécanismes d’amplification : pompage, gain et pertes
V. Fonctionnement d’un laser : continu ; Q-switching, Mode Locking
PARTIE B – INTERACTION LASER/MATIERE
I. Introduction à l'électromagnétisme non-linéaire : pourquoi l'optique non-linéaire ; classification et origines physiques des non-linéarités optiques
II. Propagation non-linéaire des ondes électromagnétiques : fonction réponse et susceptibilités linéaires et non-linéaires ; équation de propagation non-linéaire
III. Effets optiques non-linéaires du second ordre : mélange à trois ondes ; génération d'harmonique deux ; amplification paramétrique optique
IV. Effets optiques non-linéaires du troisième ordre : mélange à quatre ondes ; génération d'harmonique trois ; effet Kerr optique
examen partiel (écrit, 50%) et final (écrit, 50%).
O. Svelto, Principles of Lasers (Springer)
A. Siegman, Lasers (University Science Books)
R. Boyd, Nonlinear Optics (Academic Press)
Y. Shen, Principles of nonlinear optics (John Wiley)
Supraconductivité, superfluidité, magnétisme
Peter Holdsworth
P. Holdsworth
F. Mezzacapo
A. Rogé
Le but de ce cours est de présenter les notions essentielles dans la caractérisation d’une phase en matière condensée : nature du fondamental et ses symétries, excitations de basse énergie (quasi-particule), théorie effective décrivant ces excitations et les propriétés physique de la phase. Ces notions sont introduites à l’aide de trois exemples fondamentaux : la superfluidité, la supraconductivité, et le magnétisme. On insistera sur le lien entre la théorie, la phénoménologie et les manifestations expérimentales.
On abordera successivement :
- la seconde quantification
- la condensation de Bose-Einstein
- la théorie de Ginzburg-Landau
- la superfluidité de l’hélium IV
- la supraconductivité : phénoménologie et théorie BCS
- le magnétisme
Examen écrit
Optique Quantique
Perola Milman
P. Milman
T. Roscilde
Le cours mobilise des connaissances en électromagnétisme basique, physique statistique et thermodynamique.
Le but du cours est d’introduire les principaux axes de l’optique quantique en montrant de façon précise comment et pourquoi une telle théorie est nécéssaire pour expliquer des phénomènes observés expérimentalement.
Nous traiterons ainsi de l’émission de la radiation par un corps noir avant de présenter la quantification du champ électromagnétique. Nous verrons les conséquences de cette quantification et les propriétés de champs avec une statistique quantique. Ces applications comprennent la réduction de bruit, l’étude de la transition quantique-classique et des tests des fondements de la physique quantique.
Nous traiterons ensuite de l’interaction lumière-matière et ferons un modèle du laser, ainsi qu’une brève introduction à l’électrodynamique quantique en cavités. Finalement, nous nous intéresserons aux corrélations quantiques en amplitude et intensité, en nous appuyant sur des expériences paradigmatiques comme le dispositif Hong-Ou-Mandel et Hanbury-Brown Twiss.
- Notes de cours.
- Quantum Optics, Walls and Milburn, Springer.
- The Quantum Theory of Light, Loudon, Oxford Press.
- Quantum Optics, Scully and Zubairy, Cambridge University Press.
Point de vue sur un thème de recherche actuel : Atomes & Photons
Benjamin Besga
Audrey Bienfait
Benjamin Besga
Audrey Bienfait
Le cours nécessite d’avoir suivi le cours Mécanique quantique L3 ou équivalent. Il est conseillé mais pas obligatoire d’avoir suivi le cours de M1 Mécanique Quantique Avancée et le cours de M1 d’optique quantique.
Série de cours donné par un/plusieurs conférencier.es invité.es sur un domaine de recherche actuel en physique et/ou en chimie.
Cette année, le cours sera consacré à la thématique « Atomes & Photons ».
Le but du cours est de donner une description quantique de l’interaction lumière-matière. Cette interaction fondamentale se retrouve dans de nombreux systèmes des technologies quantiques. Nous explorerons différentes facettes de cette interaction : couplage fort, couplage faible et couplage collectif, ainsi que les applications au contrôle et aux mesures quantiques.
Cours 1 : introduction à l’interaction lumière-matière
Cours 2 : implémentations physiques
Cours 3 : systèmes quantiques ouverts
Cours 4 : un atome en cavité
Cours 5 : régime de couplage fort
Cours 6 : régime de couplage faible et interaction avec N modes.
Cours 7 : application aux mesures quantiques
Cours 8 : couplage collectif à N atomes
Examen écrit de 2h.
Exploring the Quantum (Haroche et Raimond)
Photons et atomes, Introduction à l’électrodynamique quantique (Claude Cohen-Tannoudji, Jacques Dupont-Roc)
Advanced Condensed Matter Physics
Serge Florens
S. Florens
F. Mezzacapo
The course will be self-contained, but having taken in Semester 3a the lectures "Advanced Statistical Mechanics", "Interacting quantum fields" and "Path integrals" is recommended, as well as following in parallel in Semester 3b the course "Phase transitions and critical phenomena".
Dealing with large numbers of interacting quantum particles remains currently a major challenge in physics. This course will consider electronic condensed matter systems as an illustration, yet general ideas from quantum many-body physics can also apply to other fields of research, such as quantum computing, cold atoms, quantum chemistry, open quantum systems, QCD... Selected examples will be used to introduce theoretical tools and physical concepts: quantum linear response, Green's functions and Feynman diagrams expansion, impurity scattering and transport, strong correlations and renormalization, collective modes, Fermi liquid instabilities, quantum phase transitions.
There will be a written exam at the end of the course. The text will be in English and candidates can write in French or English.
Advanced electromagnetism and ultrafast optics
Eric Constant
E. Constant
S. Skupin
Ce cours présente des concepts avancés de l'électromagnétisme et en particulier les interactions non linéaires entre la lumière et la matière.
Ces effets non linéaires interviennent lorsqu'une radiation intense se propage dans un milieu et sont particulièrement importants puisqu'ils peuvent modifier la lumière et en retour ses interactions avec la matière. Ils permettent, par exemple, de manipuler la lumière en créant de nouvelles fréquences, en modifiant sa polarisation ou son front d'onde, sa direction de propagation et meme de sonder la matière aux niveaux dynamique et structurel. Ce cours introduira le domaine de l'optique ultrarapide (génération d'impulsions ultracourtes, propagation, amplification) qui permet d'obtenir de forts éclairements et d'induire des effets très non linéaires (effets paramétriques, automodulation de phase, ionisation par effet tunnel, filamentation, génération d'harmoniques d'ordres élevés etc) que l'on peut contrôler et utiliser. Ce domaine est en forte expansion en recherche et dans l'industrie et a récemment donné lieu à plusieurs prix Nobel. Les concepts présentés seront appliqués à des domaines de recherche actuels comme la physique attoseconde (1 as = 10^-18 s) qui permet de générer des impulsions lumineuses extremement courtes, d'étudier des dynamiques dans la matière avec une très haute résolution temporelle ou même de visualiser des fonctions d'ondes par tomographie moléculaire.
Computational Quantum Physics
Fabio Mezzacapo
Fabio Mezzacapo
Nick Giovanoudis
The quantum many-body problem represents one of the biggest scientific challenges of modern science, due to the exponential growth of the complexity of quantum systems with their size. This course aims at introducing some of the most successful methods for the numerical simulation of quantum many-body systems -- from condensed matter and statistical physics to quantum chemistry.
1) Introduction to the complexity of the quantum many-body problem (1h);
2) Exact diagonalization and its limitations (3h);
3) Variational approaches; the Monte Carlo method, and variational Monte Carlo for physics and chemistry (4h);
4) Improving on the variational approach: diffusion Monte Carlo, fixed-node approximation for strongly interacting fermions (4h);
5) Density-matrix approaches and tensor-network Ansätze for lattice quantum systems and beyond (4h);
6) Path-integral Monte Carlo methods for systems in continuous space: applications to quantum fluids and solids (4h);
7) Path-integral Monte Carlo methods (and variants) for systems on lattice: applications to condensed matter, statistical physics, etc. (4h).
The TD sessions will be hands-on, aimed at programming simple instances of some of the methods presented in the course.
The exam will be based on a report (written or oral) of either a work in the recent literature, or of an original coding project chosen by the students (either as individuals, or in two-student teams).
Quantum information and quantum technologies
Benjamin Huard
B. Huard
Required: Introductory quantum mechanics (postulates, Dirac notation, harmonic oscillator, spin 1/2, time-dependent perturbation theory) and elementary statistics.
Recommended: Quantum optics, Photons and atoms
This course bridges the formalism of open quantum systems and quantum information with the experimental reality of today's quantum technologies. Starting from density matrices and decoherence, it builds up measurement theory, continuous-variable physics, quantum-limited amplification and detection, quantum metrology, quantum error correction, and quantum advantage in computing. Each lecture connects the formalism to a physical platform, among superconducting circuits, neutral atoms, trapped ions, photonics, spin qubits, and mechanical oscillators.
Week 1 — Open quantum systems. Density matrices, partial trace, purification, entropy. The real qubit, T1, T2, thermal occupation, two-level-system defects. Quantum channels, Kraus operators, the Lindblad master equation.
Week 2 — Measurement and phase space. POVMs, stochastic master equation, quantum trajectories, feedback, feedforward, heralding. Phase-space representations, Wigner, Husimi, Glauber–Sudarshan, characteristic functions, Gaussian states.
Week 3 — Linear systems, amplifiers, detectors. Coupled linear systems, cooperativity, mediated coupling, adiabatic elimination, reservoir engineering. Parametric oscillators and amplifiers, quantum limits on amplification, photon counting, homodyne and heterodyne detection, efficiency, added noise, noise temperature, mode matching.
Week 4 — Quantum metrology. Standard quantum limit, single- and two-mode squeezing, SU(1,1) interferometry, squeezed light in gravitational-wave detectors. Fisher information, Cramér–Rao bounds, atomic clocks, quantum advantage in sensing.
Week 5 — Resources and error correction. Entanglement, discord, contextuality, magic, state of the art in many-body entanglement and quantum simulation. Quantum error correction, key theorems, surface code, bosonic codes, quantum LDPC codes, cryogenics and scaling bottlenecks across platforms.
Week 6 — Quantum computing. Key quantum algorithms, quantum advantage in computing, out-of-time-order correlators as a path to practical quantum advantage.
2 hour-long written exam. 45 minutes oral exam in second session if needed.
Nielsen & Chuang, Quantum Computation and Quantum Information (Cambridge).
Haroche & Raimond, Exploring the Quantum (Oxford).
Wiseman & Milburn, Quantum Measurement and Control (Cambridge).
Jordan & Siddiqi, Quantum Measurement (Cambridge).
Degiovanni et al., Physique Quantique, Information et calcul (in French, EDP Sciences)
Clerk et al., Rev. Mod. Phys. 82, 1155 (2010).
Phase transitions and critical phenomena
Andrei Fedorenko
Peter Holdsworth
Andrei Fedorenko
Peter Holdsworth
Mandatory: statistical physics (L3)
Recommended: phase transitions (M1), non-equilibrium statistical physics (M2), quantum field theory (M2)
Phase transitions and critical phenomena are ubiquitous across physics, from statistical mechanics to condensed matter and high-energy physics. They are characterised by remarkable properties such as scale invariance and universality. While various mean-field approaches are often capable of describing different phases in terms of symmetries and spontaneous symmetry breaking, they fail to properly account for the effects of fluctuations and correlations near criticality. Understanding these effects led to the development of scaling concepts and the renormalisation group, one of the major achievements of modern theoretical physics. This course introduces these ideas and methods and demonstrates how they can be applied to a broad range of problems, from equilibrium and non-equilibrium critical phenomena in statistical mechanics to disorder-driven and quantum phase transitions in condensed matter, as well as topological phase transitions. The objective is not only to introduce critical phenomena in a variety of physical systems, but also to develop the skills needed to apply these powerful methods independently to problems encountered in one's own research.
- Phase transitions and critical phenomena: mean-field approximation and Ginzburg–Landau theory
- Fluctuations and breakdown of the mean-field approximation: Ginzburg criterion
- Scaling hypothesis, Kadanoff transformations and real-space renormalization group
- Wilson’s renormalization group and expansion near the upper critical dimension
- Critical phenomena near the lower critical dimension: nonlinear sigma model
- Critical dynamics (time-dependent Ginzburg–Landau model)
- Non-equilibrium critical dynamics (stochastic surface growth and the Kardar–Parisi–Zhang equation)
- Quantum phase transitions (transverse-field Ising model)
- Disorder-driven phase transitions (Anderson localization)
- Topological phase transitions (BKT and Kasteleyn transitions)
Written exam
- J. Cardy, Scaling and Renormalization in Statistical Physics, Cambridge University Press (1996).
- N. Goldenfeld, Lectures on Phase Transitions and the Renormalization Group, Addison-Wesley (1992).
- P. M. Chaikin and T. C. Lubensky, Principles of Condensed Matter Physics, Cambridge University Press (1995).
- M. Kardar, Statistical Physics of Fields, Cambridge University Press (2007).
- U. C. Täuber, Critical Dynamics: A Field Theory Approach to Equilibrium and Non-Equilibrium Scaling Behavior, Cambridge University Press (2014).
- S. Sachdev, Quantum Phase Transitions, Cambridge University Press (2011, 2nd ed.).
- F. Evers and A. D. Mirlin, “Anderson Transitions”, Reviews of Modern Physics 80, 1355–1417 (2008).
Experimental project
Stéphane Santucci
All projects are supervised by researchers and professors from ENS de Lyon or UCBL
The experimental projects are supervised by researchers and professors from ENS de Lyon and UCBL. Students who want to take this course have to find a mentor willing to supervise and host a 48h experimental, or numerical, project in their Lab (48h is the minimal time you should be spending in the lab working on your project, eg. 12x4h, or 6x8h). Some examples of projetcs from previous years are: Construction of optical tweezers, characterization of time-reversal mirrors, liquids assembled from self-propelled particles, fracture & friction experiments, ...
Poster presentation
Projet numérique
Ralf Everaers (Physique), Agilio Padua (Chimie)
Elham Ghobadpour
Python
The module is composed of two parts:
- 24h of practical exercises (TP) introducing advanced tools of Scientific Software Development during S3A.
- Individual computational projects supervised by researchers and professors from ENS de Lyon and UCBL during S3, which further develop an aspect of a computational module of the Master: Students have to find a mentor willing to supervise and host a 24h computational project in their Lab (24h is the minimal time you should be spending with your supervisor working on your project, eg. 6x4h, or 3x8h).
- Acquire skills and a culture of best practices in Scientific Software Development
- Train in the framework of a small and individually supervised computational project in a scientific domain of the student's choice
In time to be able to apply these techniques in a computational MSc/PhD research project.
24h of practical exercises (TP) introducing advanced tools of Scientific Software Development:
- Shell scripts and Python notebooks as glue code
- Modular, reusable software design
- Effective collaborative development with multiple co-authors
- Version control and release cycles
- Automated testing frameworks
- Structured documentation
- Management of open source scientific packages
- Continuous integration & deployment
- Conversational development
- Systematic debugging
- Mixing programming languages
We expect a ten-page long report summarizing the physics concept required to understand the simulations, a clear presentation of the numerical setup, and of the main results.
Quantum transport and mescoscopic physics
P. Glidic
P. Glidic
Mécanique quantique avancée, Matière condensée, Mécanique statistique et thermodynamique, Électrodynamique et théorie classique des champs
This course introduces the essential concepts and methods of mesoscopic physics and quantum transport. It starts from classical transport and the relevant characteristic length and energy scales, before introducing the Landauer formalism and the quantization of conductance. We will describe transport using scattering matrices and Green's functions, and then examine the role of disorder, quantum interference, weak localization, and conductance fluctuations. An introduction to interaction effects, in particular Coulomb blockade, will allow us to move beyond the independent-particle picture. The course concludes with an overview of contemporary developments, including two-dimensional materials, topological systems, superconducting hybrids, and nonequilibrium transport.
I. From Classical to Mesoscopic Transport
II. Ballistic Quantum Transport and the Landauer Formalism
III. Disorder and Quantum Interference
IV. Quantum Transport and Interaction Effects
V. Frontiers of Contemporary Quantum Transport
Written Exam
C. W. J. Beenakker and H. van Houten, Mesoscopic Physics: An Introduction.
S. Datta, Electronic Transport in Mesoscopic Systems, Cambridge University Press (1995).
T. Ihn, Semiconductor Nanostructures: Quantum States and Electronic Transport, Oxford University Press (2010).
S. Datta, Quantum Transport: Atom to Transistor, Cambridge University Press (2005).
Y. Imry and R. Landauer, Introduction to Mesoscopic Physics, Oxford University Press (2002).
Quantum systems far from equilibrium
Tommaso Roscilde, Jean-Marie Stéphan
Tommaso Roscilde, Jean-Marie Stéphan
Attendance and reading of provided research articles
Integrable models
Karol Kozłowski
Karol Kozłowski
Les systèmes intégrables constituent une classe particulière de modèles physiques pour lesquels il est possible de calculer exactement, sans aucune approximation, un grand nombre de quantités d’intérêts à la physique sous-jacente: vecteurs et valeurs propres d'un Hamiltonien quantique à N-corps, température de transition de phase dans un modèles de physique statistiques, et plus généralement, les fonctions de corrélations. Le modèle d'Ising bi-dimensionnel constitue le plus célèbre exemple de modèle intégrable. Sa résolution exacte (calcul de sont énergie libre à toute température ainsi que de plusieurs de ses fonctions de corrélations) a permis de dégager les mécanismes à la racine de l'apparition d'une transition de phase et de proposer une théorie unifié d'icelle, basée sur l'étude du groupe de renormalisation. Ce cours constitue une introductions aux méthodes modernes en intégrabilité. Les modèles à six-sommets et de la chaîne XXZ de spin 1/2 serviront d'exemples pour familiariser avec l'Ansatz de Bethe algébrique, sa variante en coordonnées ainsi qu'à la caractérisation du spectre de ces modèles via la méthode des équations intégrales non-linéaires.
Fournir une introduction à l'intégrabilité, dont les intérêts vont de la mécanique statistique à l'optique quantique et de la matière condensée à certaines théories des champs de jauge et de cordes et à la correspondance AdS/CFT. Introduire en particulier les modèles intégrables quantiques 1D et l'intégrabilité classique de certaines théories des champs intégrables 2D.
Ecrit
Dynamique des fluides
Julien Salort
J. Salort
L. Couston
V. Mouet
G. Ricard
Solides, liquides, interfaces en L3 ou équivalent, Bases pour l'analyse de données et d'images en L3
La dynamique des fluides est au cœur de nombreux défis industriels (optimisation du mélange, énergie renouvelable, médecine, réduction du frottement) et environnementaux (prédiction de la circulation atmosphérique, fonte des glaces). Dans de nombreux cas, ces défis sont difficiles à résoudre car les comportements des fluides sous-jacents (eau, gaz, cristaux liquides, fluides biologiques) sont infiniment complexes et difficile à prédire (étant décrits, pour beaucoup d’entre eux, par l’équation de Navier-Stokes).
Ce cours présente des notions et outils indispensables pour les travaux de recherche en sciences du climat, matière molle, hydrodynamique, écoulements biologiques, écoulements astrophysiques, fluides quantiques et microfluidique.
L’objectif du cours de Dynamique des Fluides est de vous familiariser avec les outils théoriques et pratiques mathématiques permettant de décrire et prédire (de manière analytique, sous des hypothèses) le mouvement macroscopique des fluides. Plus précisément, à travers ce cours vous allez :
- Développer votre intuition permettant de reconnaître et exprimer mathématiquement les ingrédients physiques clés d'un problème de dynamique des fluides.
- Apprendre à écrire les équations décrivant l’évolution de l’état du fluide.
- Apprendre à simplifier ces équations et les résoudre (donc prédire) dans certains cas limites.
Ces connaissances seront acquises en travaillant sur des situations physiques issues (entre autres) de l’aérodynamique, l’hydrodynamique, l’ingénierie, et de la géophysique (climat).
1) La matière fluide.
2) Lois fondamentales.
3) Couches limites
4) Dissipation et irréversibilité.
5) Vorticité et tourbillons
6) Fluides géophysiques (L. Couston)
7) Ondes et instabilités
8) Mesures expérimentales et présentation des activités de recherche
Examen écrit.
Mécanique statistique et thermodynamique II
Peter Holdsworth
E. Freyssingeas
V. Krakoviack
G. Petrillo
Thermodynamique statistique L3 ou équivalent
1. A review of thermodynamics and statistical mechanics
a. Thermodynamics potentials and experimental observation
b. Principals of statistical mechanics, microstates, ensembles, partition function
c. Thermodynamics from statistical mechanics.
d. Classical and quantum quantum limits.
e. Interacting systems
Some examples: magnets, fluids, liquid crystals, polymers and membranes.
2. Phase transitions
a. Symmetry breaking and competition between energy and entropy.
b. Mean field theory – the Ising model, liquid crystals, Van der Waals fluid.
c. Thermodynamics of phase transitions - 1st and 2nd order phase transitions.
d. Landau theory of phase transitions.
e. The lower critical dimension for phase transitions.
3. Response, correlations and fluctuations
a. Susceptibility and correlations.
b. Landau Ginzburg free energy functional G[m(r)].
c. Correlation length and correlation functions
4. Fluids in the Grand Canonical Ensemble.
a. The chemical potential for the ideal gas and for interacting systems.
b. Liquid-gas phase transition in the Van der Waals approximation.
c. The density functional.
5. Quantum Systems.
a. Introduction to the path integral method.
b. The transverse field Ising model.
c. Quantum phase transitions and quantum critical points.
d. Quantum-classical crossover in an ideal gas.
Ecrit.
Suggested reading:
“Equilibrium Statistical Mechanics” M. Plischke et B. Bergersen (World Scientifique). –
“Introduction to Modern Statistical Mechanics", David Chandler, CUP
“Introduction to Phase Transitions and Critical Phenomena”, H. E. Stanley, OUP, 1971.
“Thermodynamics and Introduction to Thermostatistics”, H. B. Callen, Wiley 1985.
“The Principles of Condensed Matter Physics”, P. M. Chaikin, T. C. Lubensky Cambridge University Press
“Basic Concepts for Simple and Complex Liquids” Jean-Louis Barrat and Jean-Pierre Hansen, CUP.
“Thermodynamique”, Claude Coulon, Sylvie le Boiteux, Patricia Segonds, (Dunod)
“Introduction à la Thermodynamique”, Claire Lhuillier et Jean Rous, (Dunod)
“Thermodynamique Statistique”, R. Castaing, (Masson et Cie)
“Physique statistique”, Bernard Diu, Claudine Guthmann, Danielle Lederer, Bernard Roulet Hermann, 1997.
“Statistical Mechanics: Entropy, Order Parameters, and Complexity”, James Sethna Oxford University Press, 2006 Free pdf: http://sethna.lassp.cornell.edu/statistical_mechanics_entropy_order_parameters_and_complexity
Physique des interfaces et de la matière complexe
Catherine Barentin
C. Barentin
A. Delory
E. Freyssingeas
Thermodynamique, physique statistique, mécanique des milieux continus, mécanique des fluides
Notre vie quotidienne implique de très nombreux matériaux dont nous ne saurions facilement dire s'ils sont liquides ou solides : gels, mousses, crèmes, pâtes, etc. Ces matériaux "mous" se retrouvent aussi en biologie, en géophysique et dans d'innombrables applications industrielles. Le premier objectif de ce cours est d'appréhender les deux principales propriétés macroscopiques qui différencient les solides élastiques et les fluides visqueux de cette matière complexe (ou "mal condensée"): la viscoélasticité et les comportements non-Newtoniens. Les interfaces jouent un rôle prépondérant en matière molle et le cours aborde ensuite de façon élémentaire les notions de capillarité et de mouillage. Enfin, la notion de microstructure de matériaux mous est évoquée à partir des techniques de caractérisation basées sur la diffusion du rayonnement. Deux exemples sont étudiés plus en détail pour illustrer l'influence de la microstructure sur les propriétés macroscopiques : les chaînes de polymères et les colloïdes. Les cours et TD sont accompagnés de diverses démonstrations expérimentales des phénomènes étudiés.
Compétences à acquérir :
- Savoir décrire et modéliser les propriétés macroscopiques des matériaux mous les plus simples
- Comprendre les phénomènes liés à la capillarité et au mouillage
- Connaître les principaux modèles de polymères et les interactions à l'échelle colloïdale
I- Introduction à la matière molle et aux fluides complexes (3h)
Rappel des différents états de le matière (G,L,S), présentation des fluides complexes, propriétés de la matière molle (grande susceptibilité, importance des interfaces, de kT, des interactions à l’échelle
II- Réponses à l'échelle macroscopique (3h)
Grandeurs d'intérêt, mesure des réponses mécaniques, modèles phénoménologiques
III- Physique à l'échelle de la microstructure
1- Sonder la structure (4h) par diffusion des rayonnements
2- Structure contrôlée par kBT (3h) : exemple des polymères
3- Dynamique contrôlée par kBT (3h) : exemple des polymères
4- Interactions à l'échelle colloïdale (4h)
IV- Rôle des interfaces (4h)
Rappel sur le mouillage partiel et notion de mouillage total. Etude des films minces - pression de déplétion.
Examen écrit de 3h
M. Doi, Soft Matter Physics, Oxford University Press (2013)
L. Hirst, Fundamentals of Soft matter Science, CRC Press (2012)
R. G. Larson, The structure and rheology of complex fluids, Oxford Univ Press (1999)
P. Oswald, Rhéophysique, Belin (2005)
M. Doi, Introduction to polymer physics, Oxford University Press (1990)
M. Doi, S; F. Edwards, The theory of polymer dynamics, Oxford Univ. Press (1986)
R. J. Hunter, Foundation of colloid science, Clarendon Press (1990)
J. N. Israelachvili, Intermolecular and surfaces forces, Academic Press (2011)
P.-G. de Gennes, F. Brochard, D. Quéré, Gouttes, Bulles, Perles et Ondes, Belin (2005)
Signaux et images en physique
Stéphane Roux
S. Roux
A. Meynard
Aucun
Introduction.
Place et position de la discipline.
Description des processus stochastiques.
Transformations et représentations.
Filtrage.
Analyses Temps-Fréquence et en ondelettes.
Ce cours est constitué de plusieurs sessions indépendantes de 4H (orateur différents) sur des sujets de physique avec une composante traitement du signal et de l’image. Ces séances de 4h incluent:
- 1 heure de présentation de la physique du problème;
- 1 heure de présentation de la méthode;
- 2 heures de TP (python) pour reproduire les résultats.
Contrôle continu et rendu de plusieurs TP Python
Géophysique interne
Chloé Michaut
C. Michaut
T. Alboussière
F. Chambat
S. Labrosse
Y. Ricard
UE visant à découvrir et appréhender les méthodes géophysiques permettant de caractériser la structure interne de la Terre et des Planètes et de comprendre leur évolution.
Thèmes abordés : structure globale de la Terre ; sismologie; ondes de volume, ondes de surface, principes de construction des modèles sismologiques ; pesanteur et forme de la Terre ; marées ; rotation de la Terre ; chaleur de la Terre ; convection du manteau ; structure thermique ; volcanologie physique ; éruptions volcaniques ; géomagnétisme ; géodynamo.
Examen terminal écrit.
Physique non-linéaire et instabilités
Sylvain Joubaud
S. Joubaud
P. Baconnier
G. Ricard
Introduction à la science du climat
Corentin Herbert
Corentin Herbert
Fanny Lhardy
Irena Vankova
Antoine Venaille
Thermodynamique, mécanique des fluides
Objectif 1: Exposer les principes généraux de la physique du climat à l’échelle globale. Ces principes permettront de comprendre le bilan énergétique du système climatique terrestre.
Objectif 2: Comprendre et appréhender les projections du Groupe d'Experts Intergouvernemental sur l'évolution du Climat (GIEC) ainsi que les enjeux du réchauffement climatique global.
L’originalité de ce cours sera d’aborder ces questions du point de vue du physicien, en mettant en avant les ordres de grandeurs et les mécanismes physiques et chimiques qui guident les raisonnements et contraignent les modèles, de façon à développer une vision quantitative du problème.
1. Introduction générale
2. Transfert radiatif, convection atmosphérique et bilan d'énergie de la planète
3. Rétroactions climatiques, sensibilité climatique
4. Circulation atmosphérique et océanique
5. Modélisation du climat et variabilité climatique
6. Le cycle du carbone et les climats du passé
7. Le changement climatique d’origine anthropique et ses impacts
Examen écrit
Climate and the oceans G.K. Vallis, Princeton primers in climate
Atmosphere, clouds and climate D. Randall, Princeton primers in climate
The global carbon cycle D. Archer, Princeton primers in climate
Elementary Climate Physics F.W. Taylor, Oxford University Press
Global Physical Climatology, D. Hartmann, Elsevier.
Physique numérique pour l'hydrodynamique
Guillaume Laibe
G. Laibre
A. Venaille
Outils numériques et programmation (L3)
Numerical simulations have become a key device of physicists’ toolbox, making it possible to study systems that have no analytic solutions, or for which the experiment is difficult, or even impossible. The CFD module is designed to deliver essentials of the art of computational hydrodynamics: choice and relevance of the discretisation method, design for stability and accuracy, implementation of different physical processes. The ubiquity of the principles will be demonstrated through problems ranging from flows at the laboratory scale up to the atmospheric and astrophysical flows.
- Introduce general concepts of computational fluid dynamics and numerical methods : stability and accuracy,
- Present different methods with their respective strengths and weaknesses,
- Applications to real physical systems
- Hands on with the help of sample codes and jupyter notebooks
- Geophysical fluid dynamics : Finite differences.
- Astrophysical fluid dynamics : Smooth Particle Hydrodynamics, Godunov methods.

- Toro : Riemann Solvers and Numerical Methods for Fluid Dynamics
- Violeau : Fluid Mechanics and the SPH method
- Numerical methods for fluid dynamics - with applications to geophysics, Dale Durran
Machine learning en physique et chimie
Adrien Meynard
A. Meynard
P. Petrillo
S. Roux
Mathématiques de L3 pour Physique-Chimie.
Outils de Programmation et Projets Numériques de Physique et Chimie (langage : python)
Probabilités, variables aléatoires, statistiques.
Apprendre et se familiariser avec des concepts de base d’apprentissage automatique pour les sciences physiques et chimiques, et découverte des méthodes avancées à travers des exemples appliqués à la physique et la chimie.
- Introduction aux concepts et idées d'apprentissage automatique
- Méthodes générales pour représentations, classification supervisée, clustering
- Approches actuelles en ML, réseaux de neurones
- Exemples et applications à des questions en physique et chimie (analyse de spectres, problèmes inverses en imagerie, chimioinformatique, exemples en études du climat, en astronomie, problème du repliement des protéines, etc.)
Examen écrit et projet avec rapport.
Pattern Recognition and Machine Learning. Christopher Bishop, Springer, 2006.
A high-bias, low-variance introduction to Machine Learning for physicists. Pankaj Mehta et al., Physics Reports 810 (2019) 1–124
Deep Learning. Ian Goodfellow and Yoshua Bengio and Aaron Courville. An MIT Press book, 2016
Advanced statistical mechanics
Eric Bertin
E. Bertin
F. Detchevery
This course covers advanced topics in statistical physics, mostly out of equilibrium. The relevant formalism (statistics of sums of random variables, stochastic processes,…) is first introduced. Then the course covers the standard topics of Langevin and Fokker-Planck equations, as well as linear response close to equilibrium and fluctuation-dissipation relations. Far from equilibrium extensions like fluctuation relations are also presented. In the last part, the course discusses examples of N-body distributions in out-of-equilibrium models, as well as the more versatile approach using an effective description in terms of a one-body distribution. Some examples of applications are taken from the recent literature.
Lecture 1: Sums of random variables
Statistics of sums of random variables, central limit theorem and its generalization to broadly distributed random variables. Examples of correlated or non-identically distributed random variables. Large deviations and their relevance in statistical physics.
Application of sums of random variables to equilibrium disordered systems, example of the Random Energy Model.
Lecture 2: Stochastic processes
Markov jump processes, master equation, detailed balance. Random walk on a lattice. Diffusive limit and diffusion equation. Continuous time random walks and anomalous diffusion.
Statistics of the first return time of a random walk.
Relaxation to equilibrium, increase of entropy, expansion over the eigenvectors of the Markov operator. Non-stationary dynamics at large time and aging phenomenon.
Lecture 3: Langevin and Fokker-Planck equations
Langevin equation, definition and physical motivation. Detailed balance.
Fokker-Planck equation. Derivation from a biased random walk on a lattice. Kramers-Moyal expansion. Stationary solution without flux (equilibrium) and with flux. Physical examples.
Relaxation to equilibrium and Ornstein-Uhlenbeck process.
Langevin equation with multiplicative noise, Ito and Stratonovitch discretization rules. Corresponding Fokker-Planck equation. Wong-Zakai theorem. Stochastic on-off intermittency as an example of multiplicative noise. Stochastic calculus and Ito's lemma.
Lecture 4: Response to an external field
Linear response close to equilibrium. Response function and Kubo formula. Time-correlation function and fluctuation-dissipation relation. Microreversibility and symmetry of response functions. Kramers-Krönig relation.
Statistics of trajectories and fluctuation relation far from equilibrium. Comparison of a trajectory with the time-reversed one. Statistics over trajectories. Fluctuation relation for discrete-time stochastic processes. Jarzinsky and Crooks relations.
Lecture 5: Examples of N-body distributions in stationary nonequilibrium states
One-dimensional lattice particle models, Zero-Range Process, Asymmetric Simple Exclusion Process. Matrix Product Ansatz solution.
Tapping dynamics for granular matter: Edwards postulate for the N-body distribution.
Approximate N-body distribution for interacting active particles with random self-propulsion forces.
Lecture 6: Effective description in terms of one-body problem
Dynamics with persistent interactions, approximation in terms of a non-linear Fokker-Planck equation with a self-consistent force field.
Collisional dynamics in the dilute regime, kinetic theory for the one-body distribution.
Principle of the derivation of continuum equations for the slow modes.
examen écrit 3h
Advanced fluid mechanics and turbulence
Corentin Herbert
C. Herbert
R. Volk
Connaissances de base en mécanique des fluides.
Le cours traite des phénomènes non-linéaires et hors équilibre qui dominent les écoulements des fluides lorsque le nombre de Reynolds devient grand devant l'unité : c'est la turbulence des fluides pleinement développée.
Le cours est proposé en étroite collaboration par deux physiciens de la turbulence. Il abordera différents types d'écoulements, depuis la situation idéalisée de turbulence homogène et isotrope à laquelle les théories de Kolmogorov apportent un socle théorique solide, jusqu'aux écoulements de laboratoire et naturels permettant d'appréhender, par exemple, des situations géophysiques de manière réaliste. Pour cela, il introduira les techniques expérimentales, numériques et théoriques qui ont été développées afin d'étudier ces fluides turbulents, et ouvrira sur quelques approches modernes issues de ce domaine actif de la recherche.
1. Introduction à la mécanique des fluides en général et à la turbulence en particulier
Phénoménologie et rappel de l'équation de transport d'impulsion (équations de Navier-Stokes). Présentation de quelques écoulements turbulents traditionnels (Canal, Convection de Rayleigh-Bénard, la turbulence homogène et isotrope). Introduction des échelles caractéristiques de la turbulence.
2. Approches empiriques en turbulence
Méthodes expérimentales (fil chaud et imagerie de particules) et numériques (la simulation numérique directe des équations de Navier-Stokes).
3. Une description probabiliste de la turbulence
Quelques notions sur les champs aléatoires: symétries, spectres de puissance, fonctions de corrélation. Définition de la turbulence homogène et isotrope.
4. Transport turbulent de quantité de mouvement et de chaleur
Décomposition et tenseur de Reynolds. Viscosité turbulente et modèle de longueur de mélange. Application au cas du canal. Dynamique de la température et nombre de Richardson.
5. Bilan d'énergie
Exemples de la convection de Rayleigh-Bénard et des écoulement cisaillés avec parois. Définition de la couche limite (laminaire et turbulente).
6. Turbulence homogène et isotrope
Théories de Kolmogorov. Lois de répartition spectrale de l'énergie, la cascade d'énergie vers les petites échelles. Phénomènes de transport d'énergie à travers les échelles : Relation de Kármán–Howarth et approches analytiques. Étude et modélisation du phénomène d'intermittence. Le mécanisme d'étirement de la vorticité. Invariance d'échelle – Fractalité et Multifractalité. Ouverture sur une approche stochastique de la turbulence.
Bibliographie
A first cours in turbulence, Tennekes and Lumley, MIT Press.
Turbulent Flows, S. Pope, CUP.
Turbulence, U. Frisch, CUP.
Ecrit
Phase transitions and critical phenomena
Andrei Fedorenko
Peter Holdsworth
Andrei Fedorenko
Peter Holdsworth
Mandatory: statistical physics (L3)
Recommended: phase transitions (M1), non-equilibrium statistical physics (M2), quantum field theory (M2)
Phase transitions and critical phenomena are ubiquitous across physics, from statistical mechanics to condensed matter and high-energy physics. They are characterised by remarkable properties such as scale invariance and universality. While various mean-field approaches are often capable of describing different phases in terms of symmetries and spontaneous symmetry breaking, they fail to properly account for the effects of fluctuations and correlations near criticality. Understanding these effects led to the development of scaling concepts and the renormalisation group, one of the major achievements of modern theoretical physics. This course introduces these ideas and methods and demonstrates how they can be applied to a broad range of problems, from equilibrium and non-equilibrium critical phenomena in statistical mechanics to disorder-driven and quantum phase transitions in condensed matter, as well as topological phase transitions. The objective is not only to introduce critical phenomena in a variety of physical systems, but also to develop the skills needed to apply these powerful methods independently to problems encountered in one's own research.
- Phase transitions and critical phenomena: mean-field approximation and Ginzburg–Landau theory
- Fluctuations and breakdown of the mean-field approximation: Ginzburg criterion
- Scaling hypothesis, Kadanoff transformations and real-space renormalization group
- Wilson’s renormalization group and expansion near the upper critical dimension
- Critical phenomena near the lower critical dimension: nonlinear sigma model
- Critical dynamics (time-dependent Ginzburg–Landau model)
- Non-equilibrium critical dynamics (stochastic surface growth and the Kardar–Parisi–Zhang equation)
- Quantum phase transitions (transverse-field Ising model)
- Disorder-driven phase transitions (Anderson localization)
- Topological phase transitions (BKT and Kasteleyn transitions)
Written exam
- J. Cardy, Scaling and Renormalization in Statistical Physics, Cambridge University Press (1996).
- N. Goldenfeld, Lectures on Phase Transitions and the Renormalization Group, Addison-Wesley (1992).
- P. M. Chaikin and T. C. Lubensky, Principles of Condensed Matter Physics, Cambridge University Press (1995).
- M. Kardar, Statistical Physics of Fields, Cambridge University Press (2007).
- U. C. Täuber, Critical Dynamics: A Field Theory Approach to Equilibrium and Non-Equilibrium Scaling Behavior, Cambridge University Press (2014).
- S. Sachdev, Quantum Phase Transitions, Cambridge University Press (2011, 2nd ed.).
- F. Evers and A. D. Mirlin, “Anderson Transitions”, Reviews of Modern Physics 80, 1355–1417 (2008).
Nonlinear physics and instabilities
Olivier PIERRE-LOUIS
Olivier PIERRE-LOUIS
Vincent DEMERY
Familiarité avec les notions élémentaires de mathématiques appliquées (équations différentielle, algèbre linéaire).
Ondes nonlinéaires.
- Notions sur les équations de solitons. Equation de Korteweg-de Vries; compétitions entre nonlinéarité et dispersion. Existence et interactions d’ondes solitaires.
- Equation de Burgers. compétition entre nonlinéarité et dissipation.
- Notions sur les systèmes de réaction diffusion. Propagation de fronts. Croissance d’un milieu stable dans un milieu métastable ou dans un milieu instable. Notions sur les milieux excitables.
- Instabilité des trains d’onde. Développements multi-échelles et équations d’amplitude.
- Equation de Schrödinger nonlinéaire.
Morphogénèse:
- panorama de la morphogénèse dans les systèmes hors équilibre: physique, hydrodynamique, biologie, etc.
- Etude de stabilité linéaire dans les systèmes étendus
- Patterns et leurs instabilités secondaires
- Coarsening et lois d'échelle
- Chaos spatiotemporel
Ecrit (3h)
On pourra se référer au livre de Thierry Dauxois et Michel Peyrard (Physics of Solitons) ou les livres de M. Cross and H. Greenside, Pattern Formation and Dynamics in Non-equilibrium Systems, de L. Pismen, Patterns and Interfaces in Dissipative Dynamics, et de C. Misbah, Complex Dynamics and Morphogenesis, An Introduction to Nonlinear Sciences
Advanced Computational Statistical Physics
Ralf Everaers
Ralf Everaers
Physique statistique L3 and M1
Physique numérique L3
Statistical Physics deals with behavior that emerges from the interactions of many particles. Since exact analytical solutions of the governing equations only exist for a small number of models, computer simulations have become an indispensable tool in the field and neighboring disciplines like Condensed Matter Physics, Theoretical and Physical Chemistry, Chemical and Biological Physics.
The cours introduces the methods employed for exploring the static and dynamic properties of particle based systems on an advanced level. Computational exercises, where these methods are applied to simple, but powerful models, form an integral part of the module.
- Molecular Dynamics Simulations for the exploration of emergent dynamic properties
- TD: Integrating Newton’s equations of motion for continuous potentials: The secret behind the Verlet algorithm
- Liouville formulation of symplectic and multiple-timestep integrators
- Langevin dynamics
- Thermodynamic averages, fluctuations and transformations between ensembles
- Linear response and Green-Kubo relations for transport coefficients
- TD: MD simulations of Lennard-Jones liquids
- Non-equilibrium Molecular Dynamics
- Monte Carlo Simulations for the exploration of emergent static properties
- Exact enumeration of small systems: Reweighting and the exact evaluation of partition functions
- Monte Carlo simulations
- Simple Sampling: Statistical errors and the limits of reweighting
- Importance Sampling: The Metropolis algorithm; Statistical errors, dynamical correlations and the power of well-designed trial moves: Glauber vs. Kawasaki vs Cluster moves for spin systems; Simulating polymers; Quenched disorder: spin glasses; Other ensembles.
- TD: Monte Carlo simulations of the Ising model
- Free energies
- Widom insertion and thermodynamic integration
- TD: free energy of a methane molecule in water from TI (L. Monticelli)
- Advanced techniques:
- TD: The density of states of the Ising model from Multihistogram analysis/WHAM
- TD: Protein binding energies from Umbrella Sampling and Steered Molecular Dynamics (L. Monticelli)
- Widom insertion and thermodynamic integration
- Exploring Rare events
- (sampling) transition states and paths
- Kinetic Monte Carlo
Mini-projet et examen écrit
- Frenkel and Smit, Understanding Molecular Simulation
- Allen and Tildesley, Computer Simulation of Liquids
- Landau and Binder, A Guide to Monte Carlo Simulations in Statistical Physics
- Krauth, Algorithms and Computations
Dynamics of Planetary Interiors
Stéphane Labrosse
Stéphane Labrosse
Chloé Michaut
Thierry Alboussière
Bonne connaissance de la physique classique (mécanique des milieux continus, mécanique des fluides, thermodynamique, électromagnétisme).
L'intérieur de la Terre est composé d'un manteau rocheux proche de sa température de fusion, et d'un noyau dont la partie externe est un océan profond de métal liquide. Ces enveloppes du globe restent inaccessibles aux observations directes. Leurs dynamiques sont pourtant à l'origine de phénomènes naturels majeurs : les tremblements de Terre, les volcans, la dérive des continents, la génération du champ magnétique, les variations de la durée du jour. Il s'agit dans cette unité d'enseignement d'acquérir les fondamentaux de la physique permettant de décrire la dynamique du manteau et du noyau terrestre, et de manipuler les modèles pour comprendre les observations géophysiques de premier ordre et proposer des scénarii d'évolution à long terme des planètes.
Ce cours utilise une pédagogie par projet. Il s'agira de mener un projet de modélisation en géophysique interne ou planétologie afin de répondre à une question scientifique. Le projet est construit de A à Z par l'étudiant avec l'équipe pédagogique en soutien. La première séance fixe le cadre organisationnel et scientifique avec quelques bases et les enseignants proposent quelques idées de projets. Les séances qui suivront serviront à accompagner les étudiants dans l'avancée de leur projet, que ce soit sur les concepts, les expériences/calculs ou l'acquisition d'outils techniques. L’UE est évaluée par un rapport et une soutenance début janvier. L’accent est mis sur la démarche scientifique plutôt que sur les résultats, forcément limités sur une courte durée.
Rapport de projet (50%) et soutenance orale (50%)
Projet numérique
Ralf Everaers (Physique), Agilio Padua (Chimie)
Elham Ghobadpour
Python
The module is composed of two parts:
- 24h of practical exercises (TP) introducing advanced tools of Scientific Software Development during S3A.
- Individual computational projects supervised by researchers and professors from ENS de Lyon and UCBL during S3, which further develop an aspect of a computational module of the Master: Students have to find a mentor willing to supervise and host a 24h computational project in their Lab (24h is the minimal time you should be spending with your supervisor working on your project, eg. 6x4h, or 3x8h).
- Acquire skills and a culture of best practices in Scientific Software Development
- Train in the framework of a small and individually supervised computational project in a scientific domain of the student's choice
In time to be able to apply these techniques in a computational MSc/PhD research project.
24h of practical exercises (TP) introducing advanced tools of Scientific Software Development:
- Shell scripts and Python notebooks as glue code
- Modular, reusable software design
- Effective collaborative development with multiple co-authors
- Version control and release cycles
- Automated testing frameworks
- Structured documentation
- Management of open source scientific packages
- Continuous integration & deployment
- Conversational development
- Systematic debugging
- Mixing programming languages
We expect a ten-page long report summarizing the physics concept required to understand the simulations, a clear presentation of the numerical setup, and of the main results.
Experimental project
Stéphane Santucci
All projects are supervised by researchers and professors from ENS de Lyon or UCBL
The experimental projects are supervised by researchers and professors from ENS de Lyon and UCBL. Students who want to take this course have to find a mentor willing to supervise and host a 48h experimental, or numerical, project in their Lab (48h is the minimal time you should be spending in the lab working on your project, eg. 12x4h, or 6x8h). Some examples of projetcs from previous years are: Construction of optical tweezers, characterization of time-reversal mirrors, liquids assembled from self-propelled particles, fracture & friction experiments, ...
Poster presentation
Atmospheric and Oceanic Fluid Dynamics
Corentin Herbert
- Fluid Dynamics (M1)
- Climate and the Energy Transition (M1)
- Nonlinear physics and instabilities (M2)
- Advanced fluid mechanics and turbulence (M2)
I recommend to follow the "Physics for Climate" course at the same time.
This course is an introduction to geophysical fluid dynamics, focusing on the large-scale atmospheric and oceanic circulation.
The main goals are to introduce the equations describing these flows, to study the main phenomena governing atmospheric and oceanic dynamics, and to describe their role in the climate system.
1. Introduction to the General Circulation of the Atmosphere and Ocean
2. Fundamental Equations and Phenomena
- Boussinesq approximation, primitive equations, shallow water equations, quasi-geostrophic approximation
- Rossby waves, gravity waves, barotropic instability
3. Atmospheric dynamics
- baroclinic instability and mid-latitude dynamics
- tropical dynamics: Hadley cell, convection and tropical waves
4. Oceanic dynamics
- wind-driven circulation
- thermohaline circulation
5. Predictability
Written exam.
- Atmosphere, Ocean, and Climate Dynamics, J. Marshall and R. Plumb, Academic Press.
- Atmospheric and Oceanic Fluid Dynamics, G. Vallis, Cambridge University Press.
- Fundamentals of Geophysical Fluid DYnamics, J. McWilliams, Cambridge University Press.
- Atmospheric Modeling, Data Assimilation and Predictability, E. Kalnay, Cambridge University Press.
Physics for climate
Irena Vankova
Irena Vankova
General knowledge of physics. I also recommend to follow the "Atmospheric and Oceanic Fluid Dynamics" course at the same time, though not strictly required.
This course aims to provide a physical foundation for climate science. We will explore the core physical principles governing Earth’s climate system by examining the individual climate components (atmosphere, ocean, sea ice, and ice sheets) and their interactions. A particular attention will be paid to observational systems and methods - each week there will be a practical session where students will get hands-on experience working with climate datasets and simple numerical models designed to teach them to analyze and interpret climate data and model outputs. This year, there will be a particular focus on polar climate interactions.
1) Atmosphere: Earth’s energy balance, radiative transfer, greenhouse effect, emissions and climate projection scenarios, etc.
2) Ocean: Ocean water mass structure and distribution, horizontal circulation, meridional overturning, ocean heat storage and vertical mixing, global ocean monitoring, etc.
3) Sea ice: Formation and properties, ice-albedo feedback, dense water formation, observed changes and future projections, human and geopolitical impacts, etc.
4) Ice sheets: Polar ice sheets in the coupled climate system, ice-sheet instabilities, satellite monitoring of ice sheets, sea-level change, etc.
5) Climate: Climate variability and dynamics, modes of natural variability, detection of anthropogenic signals, climate models, etc.
Assignments from weekly practical sessions will form a substantial contribution to the final grade, as well as a final presentation based on a research paper or a numerical/data project.
There is no required text book. Relevant materials for each topic will be made available to the students at the time of the course.
Large deviation theory and its main applications in physics
Vivien Lecomte
Physique statistique (L3). Suggéré : Physique statistique des processus irréversibles (M2)
Large deviation theory describes rare fluctuations beyond the central limit theorem. For twenty years, this theory progressively became the main language of contemporary statistical mechanics. Its theoretical framework also became one of the basic tools of theoretical and mathematical physics besides statistical physics, with applications in field theory, condensed matter, fluid mechanics, turbulence, and also in a number of other domains of physics, theoretical chemistry or theoretical biology.
The aim of these lectures will be to give an elementary introduction to large deviation theory, aimed at studying its main physical application, at a level appropriate for graduating physicists. We will systematically motivate each chapter by relevant physical phenomena and concepts, before tintroducing the relevant formalism and theoretical tools. The main aim will be to make the students ready for original applications of their own, in physics or related sciences. The required level in theoretical physics will be a rather elementary graduate one. We will for instance deal with the following applications:
1. The relation between large deviation theory and thermodynamical potentials
2. Computation of free energy and entropy functions for some basic problems in statistical physics
3. The relation between large deviation theory and thermodynamical potentials
4. Computation of free energy and entropy functions for some basic problems in statistical physics
5. Gallavoti, Cohen and Evans fluctuation theorems, Crooks and Jarzynski inequality and fluctuation theorem, some of the major developments of statistical mechanics basis during the last two decades
6. The relation between kinetic theory, large deviation theory, and the irreversibility paradox
7. The use of large deviation theory for dynamical system theory (finite time Lyapunov exponents)
8. Large deviation theory and disordered systems
9. propagation, transport) and turbulence (self-organization, turbulent transport)
10. The study of multistability phenomena in a multitude of physical applications (magnetic systems, physical chemistry, polymers, turbulence, and so on)
11. Application of large deviation theory for a model of Jupiter's Great Red Spot, and several applications to climate dynamics.)
Matière condensée
Benjamin Huard
B. Huard
D. Amans
R. Houvenaghel
S. Joubaud
Les prérequis pour suivre ce cours sont les suivants : mécanique quantique (niveau L3), thermodynamique statistique (niveau L3).
La matière condensée étudie les systèmes où les interactions et corrélations entre un grand nombre de constituants donnent naissance à des comportements collectifs et à des phénomènes émergents. Un de ses principaux sujets d’étude est l’état solide.
C’est un domaine extrêmement fertile et actif. C’est aussi le sous-domaine de physique qui compte de loin le plus de physiciennes et physiciens. C’est un domaine qui va des applications qui changent concrètement nos vies (comme les semiconducteurs pour l’éclairage, l’informatique, ou les communications) aux concepts mathématiques les plus abstraits qui tissent des liens vers d’autres disciplines (topologie, physique des hautes énergies, astrophysique, …) en passant par la chimie des matériaux.
Le cours et les travaux dirigés permettront notamment de répondre aux questions suivantes. Comment la matière est-elle structurée ? À quelle vitesse peut-on refroidir la matière en s’approchant du zéro absolu ? Qu’est-ce qui rend un matériau conducteur ou isolant ? Transparent ou opaque ? Que sont les quantas d’excitation dans la matière ? Quelle est la forme des ondes sonores classiques et quantiques ? Quels effets quantiques peut-on observer dans les conducteurs mésoscopiques ? Comment figer les électrons par le désordre ou les interactions ?
Parmi les thèmes de recherche actuels dans ce domaine, et qui nécessitent une bonne compréhension des bases données dans ce module, on peut citer le transport cohérent dans les systèmes mésoscopiques, la localisation d'Anderson et la localisation à N corps dans les systèmes désordonnés, les effets Hall quantiques entiers et fractionnaires, les phases de Berry et la topologie des bandes de Bloch, les isolants et semi-métaux topologiques, les instabilités des liquides de Fermi, les aspects modernes du magnétisme quantique (spinons, lacune de Haldane, liquides de spin et code torique), la condensation de Bose-Einstein, la superfluidité et la supraconductivité, les bits quantiques supraconducteurs et semi-conducteurs, la supraconductivité à haute température, les supraconducteurs topologiques et les fermions de Majorana. Le domaine a par ailleurs des liens directs avec d'autres domaines, en particulier les gaz atomiques ultra-froids, les cristaux photoniques et la science de l'information quantique.
Le cours de matière condensée introduit les bases de ce domaine. Il est donc essentiel pour suivre les modules plus spécialisés comme celui de supraconductivité, superfluidité et magnétisme, de physique quantique à N corps, de nanophysique et de phases topologiques.
- Introduction
- Sonder la structure de la matière
- Diffraction élastique des rayons X
- Réseau réciproque
- Diffraction inélastique des neutrons
- Types de cristaux (ionique, covalent, métallique, moléculaire, hydrogène)
- Décrire les vibrations de la matière
- Modes de vibration dans un cristal classique
- Capacité calorifique des isolants
- Excitation quantique de vibration : le phonon
- Sonder les phonons
- Structure électronique de la matière (en négligeant les interactions)
- Modèles de Drude et de Hall
- Théorème de Bloch
- Structure de bandes
- Modèle des liaisons fortes
- Fonctions de Wannier
- Graphène
- Capacité calorifique des métaux
- Transport des électrons : théorie semi-classique
- Dynamique des paquets d’onde dans les bandes de Bloch
- Trous
- Equation de Boltzmann
- Conducteurs mésoscopiques
- Bruit de grenaille
- Semiconducteurs
- Localisation d’Anderson et localisation faible
Examen écrit de 3h en fin de semestre.
Le cours est structuré suivant ce livre :
Modern Condensed Matter Physics
Steven M. Girvin, Kun Yang
Les livres suivants sont également d’excellentes références :
The Oxford Solid State Basics (introduction au domaine niveau L3)
Steven H. Simon
Solid State Physics (grand classique des années 1970)
N.W. Ashcroft, N.D. Mermin
Introduction to Solid State Physics (introduction au domaine niveau L3)
Charles Kittel
Principles of Condensed Matter Physics (bon livre pour la matière molle)
Paul Chaikin, T.C. Lubensky
Mécanique quantique avancée
Marc Magro
M. Magro
A. Burg
P. Holdsworth
L. Moreau-Lalaux
Mécanique quantique L3 ou équivalent.
Introduction à la relativité restreinte
L’objectif de ce cours est de maitriser toute une palette de méthodes utilisées notamment en matière condensée et en physique des hautes énergies.
Le cours est structuré en 4 parties :
Première partie : Systèmes quantiques non relativistes à N corps
• Systèmes de N particules identiques
• Particules identiques en nombre indéterminé
Deuxième partie : Diffusion
• Notions générales
• Résultat du calcul par résolvante
• Approximation de Born
• Potentiel central
Troisième partie : Symétries
• Partie générale sur les symétries
• Rotations et Moment angulaire
Quatrième partie : Mécanique quantique relativiste
• Équation de Klein-Gordon
• Équation de Dirac
Ecrit.
Dynamique des fluides
Julien Salort
J. Salort
L. Couston
V. Mouet
G. Ricard
Solides, liquides, interfaces en L3 ou équivalent, Bases pour l'analyse de données et d'images en L3
La dynamique des fluides est au cœur de nombreux défis industriels (optimisation du mélange, énergie renouvelable, médecine, réduction du frottement) et environnementaux (prédiction de la circulation atmosphérique, fonte des glaces). Dans de nombreux cas, ces défis sont difficiles à résoudre car les comportements des fluides sous-jacents (eau, gaz, cristaux liquides, fluides biologiques) sont infiniment complexes et difficile à prédire (étant décrits, pour beaucoup d’entre eux, par l’équation de Navier-Stokes).
Ce cours présente des notions et outils indispensables pour les travaux de recherche en sciences du climat, matière molle, hydrodynamique, écoulements biologiques, écoulements astrophysiques, fluides quantiques et microfluidique.
L’objectif du cours de Dynamique des Fluides est de vous familiariser avec les outils théoriques et pratiques mathématiques permettant de décrire et prédire (de manière analytique, sous des hypothèses) le mouvement macroscopique des fluides. Plus précisément, à travers ce cours vous allez :
- Développer votre intuition permettant de reconnaître et exprimer mathématiquement les ingrédients physiques clés d'un problème de dynamique des fluides.
- Apprendre à écrire les équations décrivant l’évolution de l’état du fluide.
- Apprendre à simplifier ces équations et les résoudre (donc prédire) dans certains cas limites.
Ces connaissances seront acquises en travaillant sur des situations physiques issues (entre autres) de l’aérodynamique, l’hydrodynamique, l’ingénierie, et de la géophysique (climat).
1) La matière fluide.
2) Lois fondamentales.
3) Couches limites
4) Dissipation et irréversibilité.
5) Vorticité et tourbillons
6) Fluides géophysiques (L. Couston)
7) Ondes et instabilités
8) Mesures expérimentales et présentation des activités de recherche
Examen écrit.
Géophysique interne
Chloé Michaut
C. Michaut
T. Alboussière
F. Chambat
S. Labrosse
Y. Ricard
UE visant à découvrir et appréhender les méthodes géophysiques permettant de caractériser la structure interne de la Terre et des Planètes et de comprendre leur évolution.
Thèmes abordés : structure globale de la Terre ; sismologie; ondes de volume, ondes de surface, principes de construction des modèles sismologiques ; pesanteur et forme de la Terre ; marées ; rotation de la Terre ; chaleur de la Terre ; convection du manteau ; structure thermique ; volcanologie physique ; éruptions volcaniques ; géomagnétisme ; géodynamo.
Examen terminal écrit.
Électrodynamique et théorie classique des champs
Stefan Hohenegger
Stefan Hohenegger
L. Malgrey
L. Moreau-Lalaux
électromagnétisme de base, mécanique analytique, relativité restreinte.
La première partie du module est une introduction à la formulation covariante de l'électrodynamique. Cette formulation met en évidence le caractère intrinsèquement relativiste de la théorie de Maxwell, et mène naturellement aux transformations de Lorentz du champ électromagnétique. La deuxième partie du module propose une introduction aux descriptions Lagrangienne et Hamiltonienne de la théorie classique des champs. Cette dernière, ouvre la porte aux développements majeurs de la physique du 20ème siècle: les symétries et la théorie quantique des champs, qui est à la base de toutes nos théories fondamentales actuelles.
I. Maîtriser la formulation covariante de l'électrodynamique; les transformations de Lorentz du champ e/m.
II. Maîtriser les formalismes Lagrangien et Hamiltonien de la théorie classique des champs; le principe variationnel; le théorème de Noether et ses applications.
I. Electrodynamique : potentiels e/m, fonctions de Green, sources.
II. Relativité restreinte : transformations de Lorentz, géométrie de l'espace-temps, tenseurs.
III. Formulation covariante de l'électrodynamique, transformations de Lorentz du champ e/m.
IV. Théorie classique des champs : principe variationnel, formalismes Lagrangien et Hamiltonien, exemples.
V. Symétries: théorème de Noether, applications.
Examen écrit
John David Jackson, "Classical Electrodynamics", Wiley (1998) ISBN 978-0-471-30932-1.
David J. Griffiths, "Introduction to Electrodynamics", 4th edition, Cambridge University Press (2017), ISBN 978-1-10842-041-9
L.D. Landau and E.M. Lifshitz, "The Classical Theory of Fields", Pergamon Press, Sydney (1987), Paperback ISBN: 978-0-75062-768-9, eBook ISBN: 978-0-08050-349-3
L. Susskind and A. Friedman, "Special Relativity and Classical Field Theory: The Theoretical Minimum", Basic Books, New York (2017), ISBN 978-0-46509-334-2
Horatiu Nastase, "Classical Field Theory ", Cambridge University Press (2019), ISBN 978-1-108-47701-7
Florian Scheck, "Classical Field Theory ", Second edition, Springer Graduate Texts in Physics (2018), ISBN 978-3-662-55577-4.
Mécanique statistique et thermodynamique II
Peter Holdsworth
E. Freyssingeas
V. Krakoviack
G. Petrillo
Thermodynamique statistique L3 ou équivalent
1. A review of thermodynamics and statistical mechanics
a. Thermodynamics potentials and experimental observation
b. Principals of statistical mechanics, microstates, ensembles, partition function
c. Thermodynamics from statistical mechanics.
d. Classical and quantum quantum limits.
e. Interacting systems
Some examples: magnets, fluids, liquid crystals, polymers and membranes.
2. Phase transitions
a. Symmetry breaking and competition between energy and entropy.
b. Mean field theory – the Ising model, liquid crystals, Van der Waals fluid.
c. Thermodynamics of phase transitions - 1st and 2nd order phase transitions.
d. Landau theory of phase transitions.
e. The lower critical dimension for phase transitions.
3. Response, correlations and fluctuations
a. Susceptibility and correlations.
b. Landau Ginzburg free energy functional G[m(r)].
c. Correlation length and correlation functions
4. Fluids in the Grand Canonical Ensemble.
a. The chemical potential for the ideal gas and for interacting systems.
b. Liquid-gas phase transition in the Van der Waals approximation.
c. The density functional.
5. Quantum Systems.
a. Introduction to the path integral method.
b. The transverse field Ising model.
c. Quantum phase transitions and quantum critical points.
d. Quantum-classical crossover in an ideal gas.
Ecrit.
Suggested reading:
“Equilibrium Statistical Mechanics” M. Plischke et B. Bergersen (World Scientifique). –
“Introduction to Modern Statistical Mechanics", David Chandler, CUP
“Introduction to Phase Transitions and Critical Phenomena”, H. E. Stanley, OUP, 1971.
“Thermodynamics and Introduction to Thermostatistics”, H. B. Callen, Wiley 1985.
“The Principles of Condensed Matter Physics”, P. M. Chaikin, T. C. Lubensky Cambridge University Press
“Basic Concepts for Simple and Complex Liquids” Jean-Louis Barrat and Jean-Pierre Hansen, CUP.
“Thermodynamique”, Claude Coulon, Sylvie le Boiteux, Patricia Segonds, (Dunod)
“Introduction à la Thermodynamique”, Claire Lhuillier et Jean Rous, (Dunod)
“Thermodynamique Statistique”, R. Castaing, (Masson et Cie)
“Physique statistique”, Bernard Diu, Claudine Guthmann, Danielle Lederer, Bernard Roulet Hermann, 1997.
“Statistical Mechanics: Entropy, Order Parameters, and Complexity”, James Sethna Oxford University Press, 2006 Free pdf: http://sethna.lassp.cornell.edu/statistical_mechanics_entropy_order_parameters_and_complexity
Fonctions de Green et applications
Dimitrios Tsimpis
D. Tsimpis
L. Malgrey
S. Paulin
A. Vincenti
Cours de mathématiques du L3 Sciences de la matière ou équivalent.
Réponse linéaire
Fonctions de Green indépendantes du temps
Fonctions de Green dépendantes du temps
Méthode du col
Ecrit.
Physique non-linéaire et instabilités
Sylvain Joubaud
S. Joubaud
P. Baconnier
G. Ricard
Astrophysique
Jérémy Fensch
J. Fensch
V. Desages
Objets et échelles dans l’Univers
Moyens d’observations
Physique des étoiles: structure, production et transport d'énergie, formation, évolution…
Physique des galaxies: morphologie, dynamique, structure spirale
Introduction à la cosmologie
Ecrit de 2 heures.
Tenseurs et géométrie
François Gieres
F. Gieres
G. Grenier
K. Kozlowski
F. Rondeau
Cours de mathématiques du L3 Sciences de la matière ou équivalent.
Cet enseignement a un objectif double : donner une introduction générale à différents concepts mathématiques qui interviennent dans pratiquement tous les domaines de la physique (notamment les tenseurs, variétés différentielles, connexions, structures métriques) et introduire les notions géométriques de base en termes desquelles est formulée la théorie de la relativité générale (géométrie pseudo-Riemannienne).
1) Variétés : définitions, espace tangent, topologie
2) Tenseurs : champs de vecteurs, tenseurs, formes différentielles et leur intégration
3) Connexions : transport parallèle de vecteurs, dérivées covariantes, courbure, torsion, connexion de Levi-Civita, géodésiques
4) Notions sur les fibrés.
Ecrit.
Introduction à la relativité générale
Alexandre Arbey
A. Arbey
J. Fensch
Tenseurs et géométrie, Électrodynamique et théorie classique des champs
I. Rappels sur la géométrie non-euclidienne : calcul tensoriel, dérivée covariante et transport parallèle, tenseur de Riemann
II. Principe d’équivalence et géodésiques
III. Équations d’Einstein : physique en espace-temps courbe, tenseur énergie-impulsion, formulation Lagrangienne, constante cosmologique
IV. Applications et tests : trou noir de Schwarzschild, déviation d’un rayon lumineux par le soleil et mesure de Eddington, optique gravitationnelle, dérive du périhélie de Mercure, ondes gravitationnelles
V. Notions de cosmologie
Ecrit.
Physique numérique pour l'hydrodynamique
Guillaume Laibe
G. Laibre
A. Venaille
Outils numériques et programmation (L3)
Numerical simulations have become a key device of physicists’ toolbox, making it possible to study systems that have no analytic solutions, or for which the experiment is difficult, or even impossible. The CFD module is designed to deliver essentials of the art of computational hydrodynamics: choice and relevance of the discretisation method, design for stability and accuracy, implementation of different physical processes. The ubiquity of the principles will be demonstrated through problems ranging from flows at the laboratory scale up to the atmospheric and astrophysical flows.
- Introduce general concepts of computational fluid dynamics and numerical methods : stability and accuracy,
- Present different methods with their respective strengths and weaknesses,
- Applications to real physical systems
- Hands on with the help of sample codes and jupyter notebooks
- Geophysical fluid dynamics : Finite differences.
- Astrophysical fluid dynamics : Smooth Particle Hydrodynamics, Godunov methods.

- Toro : Riemann Solvers and Numerical Methods for Fluid Dynamics
- Violeau : Fluid Mechanics and the SPH method
- Numerical methods for fluid dynamics - with applications to geophysics, Dale Durran
Introduction à la physique des particules
Imad Laktineh
I. Laktineh
J. Marteau
Y. Simon
Les cours de mécanique analytique et de mécanique quantique sont requis. Le cours de symétries et groupes est un plus.
Le but de cet enseignement est de donner un aperçu de la physique des particules et de la construction du Modèle Standard. Ce cours détaillera la classification et l'identification des particules et les caractéristiques des interactions fondamentales.
- Historique et enjeux de la physique des particules
- Rappels, diagrammes de Feynman
- Leptons et interaction faible
- Quarks et hadrons
- Symétrie et modèle des quarks
- Chromodynamique quantique, jets et gluons
- Théorie électrofaible des quarks et leptons
- Modèle Standard
- Aspects expérimentaux
Examen écrit.
Machine learning en physique et chimie
Adrien Meynard
A. Meynard
P. Petrillo
S. Roux
Mathématiques de L3 pour Physique-Chimie.
Outils de Programmation et Projets Numériques de Physique et Chimie (langage : python)
Probabilités, variables aléatoires, statistiques.
Apprendre et se familiariser avec des concepts de base d’apprentissage automatique pour les sciences physiques et chimiques, et découverte des méthodes avancées à travers des exemples appliqués à la physique et la chimie.
- Introduction aux concepts et idées d'apprentissage automatique
- Méthodes générales pour représentations, classification supervisée, clustering
- Approches actuelles en ML, réseaux de neurones
- Exemples et applications à des questions en physique et chimie (analyse de spectres, problèmes inverses en imagerie, chimioinformatique, exemples en études du climat, en astronomie, problème du repliement des protéines, etc.)
Examen écrit et projet avec rapport.
Pattern Recognition and Machine Learning. Christopher Bishop, Springer, 2006.
A high-bias, low-variance introduction to Machine Learning for physicists. Pankaj Mehta et al., Physics Reports 810 (2019) 1–124
Deep Learning. Ian Goodfellow and Yoshua Bengio and Aaron Courville. An MIT Press book, 2016
Advanced fluid mechanics and turbulence
Corentin Herbert
C. Herbert
R. Volk
Connaissances de base en mécanique des fluides.
Le cours traite des phénomènes non-linéaires et hors équilibre qui dominent les écoulements des fluides lorsque le nombre de Reynolds devient grand devant l'unité : c'est la turbulence des fluides pleinement développée.
Le cours est proposé en étroite collaboration par deux physiciens de la turbulence. Il abordera différents types d'écoulements, depuis la situation idéalisée de turbulence homogène et isotrope à laquelle les théories de Kolmogorov apportent un socle théorique solide, jusqu'aux écoulements de laboratoire et naturels permettant d'appréhender, par exemple, des situations géophysiques de manière réaliste. Pour cela, il introduira les techniques expérimentales, numériques et théoriques qui ont été développées afin d'étudier ces fluides turbulents, et ouvrira sur quelques approches modernes issues de ce domaine actif de la recherche.
1. Introduction à la mécanique des fluides en général et à la turbulence en particulier
Phénoménologie et rappel de l'équation de transport d'impulsion (équations de Navier-Stokes). Présentation de quelques écoulements turbulents traditionnels (Canal, Convection de Rayleigh-Bénard, la turbulence homogène et isotrope). Introduction des échelles caractéristiques de la turbulence.
2. Approches empiriques en turbulence
Méthodes expérimentales (fil chaud et imagerie de particules) et numériques (la simulation numérique directe des équations de Navier-Stokes).
3. Une description probabiliste de la turbulence
Quelques notions sur les champs aléatoires: symétries, spectres de puissance, fonctions de corrélation. Définition de la turbulence homogène et isotrope.
4. Transport turbulent de quantité de mouvement et de chaleur
Décomposition et tenseur de Reynolds. Viscosité turbulente et modèle de longueur de mélange. Application au cas du canal. Dynamique de la température et nombre de Richardson.
5. Bilan d'énergie
Exemples de la convection de Rayleigh-Bénard et des écoulement cisaillés avec parois. Définition de la couche limite (laminaire et turbulente).
6. Turbulence homogène et isotrope
Théories de Kolmogorov. Lois de répartition spectrale de l'énergie, la cascade d'énergie vers les petites échelles. Phénomènes de transport d'énergie à travers les échelles : Relation de Kármán–Howarth et approches analytiques. Étude et modélisation du phénomène d'intermittence. Le mécanisme d'étirement de la vorticité. Invariance d'échelle – Fractalité et Multifractalité. Ouverture sur une approche stochastique de la turbulence.
Bibliographie
A first cours in turbulence, Tennekes and Lumley, MIT Press.
Turbulent Flows, S. Pope, CUP.
Turbulence, U. Frisch, CUP.
Ecrit
General relativity and cosmology
Etera LIVINE
Etera LIVINE
Alexandre ARBEY
Tensors and Geometry M1, Introduction to General Relativity M1
The course is made of two complementary parts, general relativity and cosmology. On the one hand, we will review the motivation, scope and mathematics of general relativity, study its Hamiltonian formulation and work out its astrophysical application to black holes and cosmology. On the other hand, we will review the basic tools to describe the cosmological history, study the various cosmological eras and their main equations, and present the limitations of the current paradigm.
I. General Relativity
A. The geometry of space-timeB. The Einstein equations
C. Basic GR solutions
D. Hamiltonian formulation: Einstein equations as evolution equations
E. Black Holes
II. Cosmology
A. Standard cosmological model
B. Hot Big-Bang and primordial cosmic plasma
C. Structure formation
Written exam (3 hours)
Misner, Thorne & Wheeler, Gravitation
• Matthias Blau Lecture Notes on General Relativity, http://www.blau.itp.unibe.ch/Lecturenotes.html
• Eric Gourgoulhon, Relativité Générale and 3+1 Formalism and Bases of Numerical
Relativity, https://cel.archives-ouvertes.fr/cel-00366315v3/document, https://arxiv.org/abs/gr-qc/0703035
• Peter and J.-P. Uzan, Primordial Cosmology
• S. Weinberg, Cosmology
• S. Dodelson, Modern Cosmology
• Y. Mambrini, Particles in the Dark Universe
Dynamics of Planetary Interiors
Stéphane Labrosse
Stéphane Labrosse
Chloé Michaut
Thierry Alboussière
Bonne connaissance de la physique classique (mécanique des milieux continus, mécanique des fluides, thermodynamique, électromagnétisme).
L'intérieur de la Terre est composé d'un manteau rocheux proche de sa température de fusion, et d'un noyau dont la partie externe est un océan profond de métal liquide. Ces enveloppes du globe restent inaccessibles aux observations directes. Leurs dynamiques sont pourtant à l'origine de phénomènes naturels majeurs : les tremblements de Terre, les volcans, la dérive des continents, la génération du champ magnétique, les variations de la durée du jour. Il s'agit dans cette unité d'enseignement d'acquérir les fondamentaux de la physique permettant de décrire la dynamique du manteau et du noyau terrestre, et de manipuler les modèles pour comprendre les observations géophysiques de premier ordre et proposer des scénarii d'évolution à long terme des planètes.
Ce cours utilise une pédagogie par projet. Il s'agira de mener un projet de modélisation en géophysique interne ou planétologie afin de répondre à une question scientifique. Le projet est construit de A à Z par l'étudiant avec l'équipe pédagogique en soutien. La première séance fixe le cadre organisationnel et scientifique avec quelques bases et les enseignants proposent quelques idées de projets. Les séances qui suivront serviront à accompagner les étudiants dans l'avancée de leur projet, que ce soit sur les concepts, les expériences/calculs ou l'acquisition d'outils techniques. L’UE est évaluée par un rapport et une soutenance début janvier. L’accent est mis sur la démarche scientifique plutôt que sur les résultats, forcément limités sur une courte durée.
Rapport de projet (50%) et soutenance orale (50%)
Nonlinear physics and instabilities
Olivier PIERRE-LOUIS
Olivier PIERRE-LOUIS
Vincent DEMERY
Familiarité avec les notions élémentaires de mathématiques appliquées (équations différentielle, algèbre linéaire).
Ondes nonlinéaires.
- Notions sur les équations de solitons. Equation de Korteweg-de Vries; compétitions entre nonlinéarité et dispersion. Existence et interactions d’ondes solitaires.
- Equation de Burgers. compétition entre nonlinéarité et dissipation.
- Notions sur les systèmes de réaction diffusion. Propagation de fronts. Croissance d’un milieu stable dans un milieu métastable ou dans un milieu instable. Notions sur les milieux excitables.
- Instabilité des trains d’onde. Développements multi-échelles et équations d’amplitude.
- Equation de Schrödinger nonlinéaire.
Morphogénèse:
- panorama de la morphogénèse dans les systèmes hors équilibre: physique, hydrodynamique, biologie, etc.
- Etude de stabilité linéaire dans les systèmes étendus
- Patterns et leurs instabilités secondaires
- Coarsening et lois d'échelle
- Chaos spatiotemporel
Ecrit (3h)
On pourra se référer au livre de Thierry Dauxois et Michel Peyrard (Physics of Solitons) ou les livres de M. Cross and H. Greenside, Pattern Formation and Dynamics in Non-equilibrium Systems, de L. Pismen, Patterns and Interfaces in Dissipative Dynamics, et de C. Misbah, Complex Dynamics and Morphogenesis, An Introduction to Nonlinear Sciences
Projet numérique
Ralf Everaers (Physique), Agilio Padua (Chimie)
Elham Ghobadpour
Python
The module is composed of two parts:
- 24h of practical exercises (TP) introducing advanced tools of Scientific Software Development during S3A.
- Individual computational projects supervised by researchers and professors from ENS de Lyon and UCBL during S3, which further develop an aspect of a computational module of the Master: Students have to find a mentor willing to supervise and host a 24h computational project in their Lab (24h is the minimal time you should be spending with your supervisor working on your project, eg. 6x4h, or 3x8h).
- Acquire skills and a culture of best practices in Scientific Software Development
- Train in the framework of a small and individually supervised computational project in a scientific domain of the student's choice
In time to be able to apply these techniques in a computational MSc/PhD research project.
24h of practical exercises (TP) introducing advanced tools of Scientific Software Development:
- Shell scripts and Python notebooks as glue code
- Modular, reusable software design
- Effective collaborative development with multiple co-authors
- Version control and release cycles
- Automated testing frameworks
- Structured documentation
- Management of open source scientific packages
- Continuous integration & deployment
- Conversational development
- Systematic debugging
- Mixing programming languages
We expect a ten-page long report summarizing the physics concept required to understand the simulations, a clear presentation of the numerical setup, and of the main results.
Experimental project
Stéphane Santucci
All projects are supervised by researchers and professors from ENS de Lyon or UCBL
The experimental projects are supervised by researchers and professors from ENS de Lyon and UCBL. Students who want to take this course have to find a mentor willing to supervise and host a 48h experimental, or numerical, project in their Lab (48h is the minimal time you should be spending in the lab working on your project, eg. 12x4h, or 6x8h). Some examples of projetcs from previous years are: Construction of optical tweezers, characterization of time-reversal mirrors, liquids assembled from self-propelled particles, fracture & friction experiments, ...
Poster presentation
Advanced astrophysics
Guillaume Laibe
Nuclear and Astro-nuclear Physics
Dany Davesne
Danys Davesne
Prérequis indispensables : mécanique quantique, physique statistique
Prérequis souhaités : problème à N corps, théorie quantique des champs, transitions de phase
Les nucléons interagissent via l’interaction forte pour former les presque 3000 noyaux connus sur Terre, noyaux qui peuvent contenir jusqu’à plusieurs centaines de constituants. Les expériences actuelles sondent ces noyaux dans les situations les plus extrêmes et les théories effectives modernes peinent à reproduire l’ensemble des données. Enfin, même si les nucléons sont constitués de particules plus élémentaires (quarks et gluons), ils continuent d’être des degrés de liberté pertinents pour décrire des aspects importants des phénomènes découverts très récemment (ondes gravitationnelles). Dans ce cours, nous explorerons différents aspects de l’interaction nucléaire dans des systèmes aussi bien infinis (étoiles à neutrons) que finis en utilisant le formalisme quantique du problème à N corps et les approches de physique statistique de champ moyen. De plus, nous verrons qu’au-delà de l’interaction elle-même, le caractère fermionique des nucléons impose dans les systèmes nucléaires des comportements propres aux fermions (appariement dans les noyaux ou superfluidité des étoiles à neutrons) et permet d’utiliser la théorie des liquides de Fermi pour décrire certaines propriétés. Enfin, nous aborderons quelques aspects de thermodynamique relativiste et de phénomènes dépendant du temps (hydrodynamique relativiste et/ou superfluide).
Atmospheric and Oceanic Fluid Dynamics
Corentin Herbert
- Fluid Dynamics (M1)
- Climate and the Energy Transition (M1)
- Nonlinear physics and instabilities (M2)
- Advanced fluid mechanics and turbulence (M2)
I recommend to follow the "Physics for Climate" course at the same time.
This course is an introduction to geophysical fluid dynamics, focusing on the large-scale atmospheric and oceanic circulation.
The main goals are to introduce the equations describing these flows, to study the main phenomena governing atmospheric and oceanic dynamics, and to describe their role in the climate system.
1. Introduction to the General Circulation of the Atmosphere and Ocean
2. Fundamental Equations and Phenomena
- Boussinesq approximation, primitive equations, shallow water equations, quasi-geostrophic approximation
- Rossby waves, gravity waves, barotropic instability
3. Atmospheric dynamics
- baroclinic instability and mid-latitude dynamics
- tropical dynamics: Hadley cell, convection and tropical waves
4. Oceanic dynamics
- wind-driven circulation
- thermohaline circulation
5. Predictability
Written exam.
- Atmosphere, Ocean, and Climate Dynamics, J. Marshall and R. Plumb, Academic Press.
- Atmospheric and Oceanic Fluid Dynamics, G. Vallis, Cambridge University Press.
- Fundamentals of Geophysical Fluid DYnamics, J. McWilliams, Cambridge University Press.
- Atmospheric Modeling, Data Assimilation and Predictability, E. Kalnay, Cambridge University Press.
Physics for climate
Irena Vankova
Irena Vankova
General knowledge of physics. I also recommend to follow the "Atmospheric and Oceanic Fluid Dynamics" course at the same time, though not strictly required.
This course aims to provide a physical foundation for climate science. We will explore the core physical principles governing Earth’s climate system by examining the individual climate components (atmosphere, ocean, sea ice, and ice sheets) and their interactions. A particular attention will be paid to observational systems and methods - each week there will be a practical session where students will get hands-on experience working with climate datasets and simple numerical models designed to teach them to analyze and interpret climate data and model outputs. This year, there will be a particular focus on polar climate interactions.
1) Atmosphere: Earth’s energy balance, radiative transfer, greenhouse effect, emissions and climate projection scenarios, etc.
2) Ocean: Ocean water mass structure and distribution, horizontal circulation, meridional overturning, ocean heat storage and vertical mixing, global ocean monitoring, etc.
3) Sea ice: Formation and properties, ice-albedo feedback, dense water formation, observed changes and future projections, human and geopolitical impacts, etc.
4) Ice sheets: Polar ice sheets in the coupled climate system, ice-sheet instabilities, satellite monitoring of ice sheets, sea-level change, etc.
5) Climate: Climate variability and dynamics, modes of natural variability, detection of anthropogenic signals, climate models, etc.
Assignments from weekly practical sessions will form a substantial contribution to the final grade, as well as a final presentation based on a research paper or a numerical/data project.
There is no required text book. Relevant materials for each topic will be made available to the students at the time of the course.
Advanced mechanics and elasticity
Elsa Bayart
E. Bayart
Undergraduate course on continuum mechanics and elastic media
Elastic solids can deform homogeneously when submitted to stresses, but elastic energy can also be focused via non-linear processes, even when the material is described with a linearly elastic constitutive law: wrinkles, folds, fracture. In this course, we will demonstrate how geometrical constraints yield to ordered and disordered patterns in elastic media under mechanical loading. The course will cover a wide spectrum of approaches from theoretical descriptions to applications such as biological growth, foldable structures, fragmentation, geophysical patterns, earthquakes.
I.- Introduction to elasticity of continuous media
II.- Thin elastic plates
II.1.- Introduction: differential geometry of a surface, equations
II.2.- Buckling: roll-like patterns, growth-induced patterns
II.3.- Singularities: focussing of energy around points (developable cones) and lines (stretching ridges)
II.4.- Patterns from singularities and foldable structures
III.- Fracture Mechanics
III.1.- Linear Elastic Fracture Mechanics
III.2.- Quasi-static crack propagation: instabilities and crack-induced patterns
III.3.- Fast fracture: dynamics, instabilities.
III.4.- Application to friction
Presentation of a research article
Large deviation theory and its main applications in physics
Vivien Lecomte
Physique statistique (L3). Suggéré : Physique statistique des processus irréversibles (M2)
Large deviation theory describes rare fluctuations beyond the central limit theorem. For twenty years, this theory progressively became the main language of contemporary statistical mechanics. Its theoretical framework also became one of the basic tools of theoretical and mathematical physics besides statistical physics, with applications in field theory, condensed matter, fluid mechanics, turbulence, and also in a number of other domains of physics, theoretical chemistry or theoretical biology.
The aim of these lectures will be to give an elementary introduction to large deviation theory, aimed at studying its main physical application, at a level appropriate for graduating physicists. We will systematically motivate each chapter by relevant physical phenomena and concepts, before tintroducing the relevant formalism and theoretical tools. The main aim will be to make the students ready for original applications of their own, in physics or related sciences. The required level in theoretical physics will be a rather elementary graduate one. We will for instance deal with the following applications:
1. The relation between large deviation theory and thermodynamical potentials
2. Computation of free energy and entropy functions for some basic problems in statistical physics
3. The relation between large deviation theory and thermodynamical potentials
4. Computation of free energy and entropy functions for some basic problems in statistical physics
5. Gallavoti, Cohen and Evans fluctuation theorems, Crooks and Jarzynski inequality and fluctuation theorem, some of the major developments of statistical mechanics basis during the last two decades
6. The relation between kinetic theory, large deviation theory, and the irreversibility paradox
7. The use of large deviation theory for dynamical system theory (finite time Lyapunov exponents)
8. Large deviation theory and disordered systems
9. propagation, transport) and turbulence (self-organization, turbulent transport)
10. The study of multistability phenomena in a multitude of physical applications (magnetic systems, physical chemistry, polymers, turbulence, and so on)
11. Application of large deviation theory for a model of Jupiter's Great Red Spot, and several applications to climate dynamics.)
Introduction to Gravitational Wave Physics
Marc Geiller
Marc Geiller
At least an introductory course to General Relativity and Field Theory, and preferably also an advanced course on General Relativity and/or Cosmology (e.g. M2 level).
- 1) Acquire a general knowledge of the field of gravitational wave physics
2) Understand sources of gravitational waves and their production
3) Understand the detection of gravitational waves
4) Acquire an overview of open issues and future challenges
The detection of the Gravitational Waves (GW) emitted by a black holes binary on September 14th 2015 has opened a new window on the Universe. The observation of the kilonova explosion on August 17th 2017 through all different electromagnetic, particle and indeed, gravitational probes is worldwide recognized as the first example of Multimessenger Astronomy.
France is actively contributing to the project Virgo that is going through a large amelioration of the interferometer regarding laser, optics and quantum techniques. This experimental effort will lead to the new detector called Advanced Virgo +. At the same time the collaboration called Einstein Telescope is preparing the design of the third generation of GW detector in Europe, a generation that will detect GW emitted from all the visible Universe.
GW physics is a rapidly expanding new field and scientists are living in a very similar situation as the one at the dawn of particle physics.
As always when a new field of physics is emerging there is a difficulty to follow what’s happening: fundamental properties of GW, details of their detectors, specific vocabulary, are not in the normal background of a physics student.
This introductory course has been thought to make GW physics more approachable. We are going to familiarize with fundamental properties of GW, description of the GW source, description and status of the detector at the moment of detection, significance of the detection. The last part of the course will be focused on the future developments in the field.
The course is meant for experimental physicists. Although the parts dedicated to the properties of GW, their sources and their effects on the detectors constitute 70% of the
subjects, the approach used here is to show how to use GW as a probe to study the Universe and why this probe is complementary to the electromagnetic one.
- The nature of GW and its historical evolution
- Sources of GW
- Specific characteristics of GW: what we can read from the GW signal
- The interferometric detectors of GW
- Some challenges in the design of GW detectors
- The future of GW Astronomy
Written exam
Matière condensée
Benjamin Huard
B. Huard
D. Amans
R. Houvenaghel
S. Joubaud
Les prérequis pour suivre ce cours sont les suivants : mécanique quantique (niveau L3), thermodynamique statistique (niveau L3).
La matière condensée étudie les systèmes où les interactions et corrélations entre un grand nombre de constituants donnent naissance à des comportements collectifs et à des phénomènes émergents. Un de ses principaux sujets d’étude est l’état solide.
C’est un domaine extrêmement fertile et actif. C’est aussi le sous-domaine de physique qui compte de loin le plus de physiciennes et physiciens. C’est un domaine qui va des applications qui changent concrètement nos vies (comme les semiconducteurs pour l’éclairage, l’informatique, ou les communications) aux concepts mathématiques les plus abstraits qui tissent des liens vers d’autres disciplines (topologie, physique des hautes énergies, astrophysique, …) en passant par la chimie des matériaux.
Le cours et les travaux dirigés permettront notamment de répondre aux questions suivantes. Comment la matière est-elle structurée ? À quelle vitesse peut-on refroidir la matière en s’approchant du zéro absolu ? Qu’est-ce qui rend un matériau conducteur ou isolant ? Transparent ou opaque ? Que sont les quantas d’excitation dans la matière ? Quelle est la forme des ondes sonores classiques et quantiques ? Quels effets quantiques peut-on observer dans les conducteurs mésoscopiques ? Comment figer les électrons par le désordre ou les interactions ?
Parmi les thèmes de recherche actuels dans ce domaine, et qui nécessitent une bonne compréhension des bases données dans ce module, on peut citer le transport cohérent dans les systèmes mésoscopiques, la localisation d'Anderson et la localisation à N corps dans les systèmes désordonnés, les effets Hall quantiques entiers et fractionnaires, les phases de Berry et la topologie des bandes de Bloch, les isolants et semi-métaux topologiques, les instabilités des liquides de Fermi, les aspects modernes du magnétisme quantique (spinons, lacune de Haldane, liquides de spin et code torique), la condensation de Bose-Einstein, la superfluidité et la supraconductivité, les bits quantiques supraconducteurs et semi-conducteurs, la supraconductivité à haute température, les supraconducteurs topologiques et les fermions de Majorana. Le domaine a par ailleurs des liens directs avec d'autres domaines, en particulier les gaz atomiques ultra-froids, les cristaux photoniques et la science de l'information quantique.
Le cours de matière condensée introduit les bases de ce domaine. Il est donc essentiel pour suivre les modules plus spécialisés comme celui de supraconductivité, superfluidité et magnétisme, de physique quantique à N corps, de nanophysique et de phases topologiques.
- Introduction
- Sonder la structure de la matière
- Diffraction élastique des rayons X
- Réseau réciproque
- Diffraction inélastique des neutrons
- Types de cristaux (ionique, covalent, métallique, moléculaire, hydrogène)
- Décrire les vibrations de la matière
- Modes de vibration dans un cristal classique
- Capacité calorifique des isolants
- Excitation quantique de vibration : le phonon
- Sonder les phonons
- Structure électronique de la matière (en négligeant les interactions)
- Modèles de Drude et de Hall
- Théorème de Bloch
- Structure de bandes
- Modèle des liaisons fortes
- Fonctions de Wannier
- Graphène
- Capacité calorifique des métaux
- Transport des électrons : théorie semi-classique
- Dynamique des paquets d’onde dans les bandes de Bloch
- Trous
- Equation de Boltzmann
- Conducteurs mésoscopiques
- Bruit de grenaille
- Semiconducteurs
- Localisation d’Anderson et localisation faible
Examen écrit de 3h en fin de semestre.
Le cours est structuré suivant ce livre :
Modern Condensed Matter Physics
Steven M. Girvin, Kun Yang
Les livres suivants sont également d’excellentes références :
The Oxford Solid State Basics (introduction au domaine niveau L3)
Steven H. Simon
Solid State Physics (grand classique des années 1970)
N.W. Ashcroft, N.D. Mermin
Introduction to Solid State Physics (introduction au domaine niveau L3)
Charles Kittel
Principles of Condensed Matter Physics (bon livre pour la matière molle)
Paul Chaikin, T.C. Lubensky
Mécanique quantique avancée
Marc Magro
M. Magro
A. Burg
P. Holdsworth
L. Moreau-Lalaux
Mécanique quantique L3 ou équivalent.
Introduction à la relativité restreinte
L’objectif de ce cours est de maitriser toute une palette de méthodes utilisées notamment en matière condensée et en physique des hautes énergies.
Le cours est structuré en 4 parties :
Première partie : Systèmes quantiques non relativistes à N corps
• Systèmes de N particules identiques
• Particules identiques en nombre indéterminé
Deuxième partie : Diffusion
• Notions générales
• Résultat du calcul par résolvante
• Approximation de Born
• Potentiel central
Troisième partie : Symétries
• Partie générale sur les symétries
• Rotations et Moment angulaire
Quatrième partie : Mécanique quantique relativiste
• Équation de Klein-Gordon
• Équation de Dirac
Ecrit.
Fonctions de Green et applications
Dimitrios Tsimpis
D. Tsimpis
L. Malgrey
S. Paulin
A. Vincenti
Cours de mathématiques du L3 Sciences de la matière ou équivalent.
Réponse linéaire
Fonctions de Green indépendantes du temps
Fonctions de Green dépendantes du temps
Méthode du col
Ecrit.
Symétries et groupes
Luc Darme
L. Darmé
N. Marion
Mécanique quantique avancée.
Cet enseignement représente une introduction (illustrée par de nombreux exemples) aux groupes, et plus particulièrement aux groupes de Lie, ainsi qu'aux algèbres de Lie et aux représentations des groupes et algèbres de Lie. Ces notions jouent un rôle fondamental dans les théories physiques qu'elles soient classiques ou quantiques, relativistes ou non relativistes. (H. Weyl : “As far as I see, all a priori statements in physics have their origin in symmetry.”)
- Sur les symétries en physique
- Définition des groupes et exemples (groupe symétrique,...)
- Définition des groupes de Lie et exemples (groupe des rotations, groupe de Lorentz, groupe unitaire, groupe symplectique,...)
- Algèbre de Lie associée a un groupe de Lie; exemples
- Représentations des groupes et des algèbres de Lie
- Classification de Cartan
Ecrit.
Électrodynamique et théorie classique des champs
Stefan Hohenegger
Stefan Hohenegger
L. Malgrey
L. Moreau-Lalaux
électromagnétisme de base, mécanique analytique, relativité restreinte.
La première partie du module est une introduction à la formulation covariante de l'électrodynamique. Cette formulation met en évidence le caractère intrinsèquement relativiste de la théorie de Maxwell, et mène naturellement aux transformations de Lorentz du champ électromagnétique. La deuxième partie du module propose une introduction aux descriptions Lagrangienne et Hamiltonienne de la théorie classique des champs. Cette dernière, ouvre la porte aux développements majeurs de la physique du 20ème siècle: les symétries et la théorie quantique des champs, qui est à la base de toutes nos théories fondamentales actuelles.
I. Maîtriser la formulation covariante de l'électrodynamique; les transformations de Lorentz du champ e/m.
II. Maîtriser les formalismes Lagrangien et Hamiltonien de la théorie classique des champs; le principe variationnel; le théorème de Noether et ses applications.
I. Electrodynamique : potentiels e/m, fonctions de Green, sources.
II. Relativité restreinte : transformations de Lorentz, géométrie de l'espace-temps, tenseurs.
III. Formulation covariante de l'électrodynamique, transformations de Lorentz du champ e/m.
IV. Théorie classique des champs : principe variationnel, formalismes Lagrangien et Hamiltonien, exemples.
V. Symétries: théorème de Noether, applications.
Examen écrit
John David Jackson, "Classical Electrodynamics", Wiley (1998) ISBN 978-0-471-30932-1.
David J. Griffiths, "Introduction to Electrodynamics", 4th edition, Cambridge University Press (2017), ISBN 978-1-10842-041-9
L.D. Landau and E.M. Lifshitz, "The Classical Theory of Fields", Pergamon Press, Sydney (1987), Paperback ISBN: 978-0-75062-768-9, eBook ISBN: 978-0-08050-349-3
L. Susskind and A. Friedman, "Special Relativity and Classical Field Theory: The Theoretical Minimum", Basic Books, New York (2017), ISBN 978-0-46509-334-2
Horatiu Nastase, "Classical Field Theory ", Cambridge University Press (2019), ISBN 978-1-108-47701-7
Florian Scheck, "Classical Field Theory ", Second edition, Springer Graduate Texts in Physics (2018), ISBN 978-3-662-55577-4.
Quantification des champs libres
Henning Samtleben
H. Samtleben
M. Magro
Y. Simon
Mécanique analytique L3, Mécanique quantique L3/M1, Symétries & Groupes M1
Compréhension des outils de base des théories quantiques des champs pertinentes pour la physique des hautes énergies et des particules.
1. Groupe de Poincaré
représentation
définition des champs relativistes classiques
2. Quantification canonique des champs libres
champ scalaire et champ vectoriel
espace de Fock
propagateur et fonctions à N points
3. Couplage à une source externe
matrice de diffusion
théorème de Wick
Examen écrit
Astrophysique
Jérémy Fensch
J. Fensch
V. Desages
Objets et échelles dans l’Univers
Moyens d’observations
Physique des étoiles: structure, production et transport d'énergie, formation, évolution…
Physique des galaxies: morphologie, dynamique, structure spirale
Introduction à la cosmologie
Ecrit de 2 heures.
Tenseurs et géométrie
François Gieres
F. Gieres
G. Grenier
K. Kozlowski
F. Rondeau
Cours de mathématiques du L3 Sciences de la matière ou équivalent.
Cet enseignement a un objectif double : donner une introduction générale à différents concepts mathématiques qui interviennent dans pratiquement tous les domaines de la physique (notamment les tenseurs, variétés différentielles, connexions, structures métriques) et introduire les notions géométriques de base en termes desquelles est formulée la théorie de la relativité générale (géométrie pseudo-Riemannienne).
1) Variétés : définitions, espace tangent, topologie
2) Tenseurs : champs de vecteurs, tenseurs, formes différentielles et leur intégration
3) Connexions : transport parallèle de vecteurs, dérivées covariantes, courbure, torsion, connexion de Levi-Civita, géodésiques
4) Notions sur les fibrés.
Ecrit.
Introduction à la relativité générale
Alexandre Arbey
A. Arbey
J. Fensch
Tenseurs et géométrie, Électrodynamique et théorie classique des champs
I. Rappels sur la géométrie non-euclidienne : calcul tensoriel, dérivée covariante et transport parallèle, tenseur de Riemann
II. Principe d’équivalence et géodésiques
III. Équations d’Einstein : physique en espace-temps courbe, tenseur énergie-impulsion, formulation Lagrangienne, constante cosmologique
IV. Applications et tests : trou noir de Schwarzschild, déviation d’un rayon lumineux par le soleil et mesure de Eddington, optique gravitationnelle, dérive du périhélie de Mercure, ondes gravitationnelles
V. Notions de cosmologie
Ecrit.
Introduction à la physique des particules
Imad Laktineh
I. Laktineh
J. Marteau
Y. Simon
Les cours de mécanique analytique et de mécanique quantique sont requis. Le cours de symétries et groupes est un plus.
Le but de cet enseignement est de donner un aperçu de la physique des particules et de la construction du Modèle Standard. Ce cours détaillera la classification et l'identification des particules et les caractéristiques des interactions fondamentales.
- Historique et enjeux de la physique des particules
- Rappels, diagrammes de Feynman
- Leptons et interaction faible
- Quarks et hadrons
- Symétrie et modèle des quarks
- Chromodynamique quantique, jets et gluons
- Théorie électrofaible des quarks et leptons
- Modèle Standard
- Aspects expérimentaux
Examen écrit.
Quantum field theory: interactions
Henning Samtleben
Henning Samtleben
Karol Kozlowski
Mécanique Quantique Avancée, M1 (Advanced Quantum Mechanics)
Quantification des Champs Libres, M1 (Quantum Field Theory : Free Fields)
This course introduces the fundamental concepts and methods of quantum field theory, with particular emphasis on quantum electrodynamics (QED). By the end of the course, students should be able to understand and apply the basic formalism of relativistic quantum fields, derive and use Feynman rules, compute simple scattering amplitudes and perturbative corrections, and understand the fundamental principles of renormalisation.
Le but de ce cours est une introduction aux concepts fondamentaux des théories des champs quantiques avec notamment une introduction détaillée à l’électrodynamique quantique.
I. Free Quantum Fields (Review)
The Klein–Gordon field, Canonical commutation relations, Propagators, Generating functionals
II. Interacting Quantum Fields
The S-matrix, Scattering amplitudes and cross sections, The LSZ reduction formula
III. Perturbation Theory
The interaction picture, Dyson series, Correlation functions, The Gell-Mann–Low formula, Feynman rules, Applications and examples
IV. Quantum Electrodynamics
Spinor fields: spin (1/2), Vector fields: spin (1), Interactions (QED), Electron–electron scattering
V. Renormalisation
Electron self-energy, Dimensional regularisation, Renormalisation, One-loop divergences in QED, Higher-order corrections and renormalisability
VI. Ward–Takahashi Identities
Functional integrals for scalar and fermionic fields, The effective action, Ward–Takahashi identities
Written exam of 3 hours.
C. Itzykson and J.-B. Zuber, Quantum Field Theory, McGraw-Hill, 1980
S. Weinberg, The Quantum Theory of Fields, Vols. I–III, Cambridge University Press, 1995
L. H. Ryder, Quantum Field Theory, Cambridge University Press, 1996
M. Srednicki, Quantum Field Theory, Cambridge University Press, 2007.
M. D. Schwartz, Quantum Field Theory and the Standard Model, Cambridge University Press, 2014.
A. Zee, Quantum Field Theory in a Nutshell, Princeton University Press, 2010.
Path integrals and applications
Marc Magro
M. Magro
H. Roussille
L’objectif principal de ce cours est de donner une introduction au concept d’intégrale de chemin et de ses applications, tout d’abord dans le cadre de la mécanique quantique, puis de le généraliser à la théorie quantique des champs où il est devenu un outil essentiel pour la compréhension de divers systèmes physiques allant des interactions fondamentales à la théorie des transitions de phases. L’intégrale de chemin permet en particulier une approche alternative aux formalismes de Schrödinger et de Heisenberg de la mécanique quantique qui met en correspondance naturelle théorie classique et théorie quantique. C’est aussi un outil indispensable pour un développement systématique de la théorie des perturbations dans le cadre d’un grand nombre de degrés de liberté permettant ainsi de passer naturellement de la mécanique quantique avec un petit nombre de particules à la théorie quantique des champs et à la mécanique statistique.
1 – Introduction et motivations
2 – Intégrales de chemin en mécanique quantique
3 – Compléments sur dérivée fonctionnelle et intégrales gaussiennes
4- Intégrales de chemin gaussiennes - Déterminants fonctionnels
5- Fonctionnelle génératrice et développements perturbatifs
6 – Fonctions de corrélation
7- Indications sur l'intégrale de chemin en théorie quantique des champs
8 – États cohérents et représentation holomorphe
écrit
Advanced aspects of symmetries
François Gières
F. Gières
F. Delduc
Basic knowledge of geometry, group theory and quantum field theories
This course provides a basic introduction to conformal symmetry and supersymmetry, both of which play an important role in modern physical theories. Conformal transformations in arbitrary dimensions are characterised by leaving the space-time metric invariant up to a (local) scaling factor. They appear in a vast spectrum of physical applications, ranging from condensed matter to string theory and modern particle physics. Supersymmetry relates bosonic and fermionic fields to each other. While not yet directly observed at the energies of current collider experiments like the LHC, supersymmetry plays an important role in extending the standard model and in approaching important fundamental questions of modern high energy physics. This course starts with a mathematical description of both symmetries using a group theoretic language and explores their applications to field theories in various dimensions.
Part 1: Conformal Symmetry
- the conformal group in arbitrary dimensions
- correlation functions in conformal field theories
- two-dimensional conformal theories and the Virasoro algebra
Part 2: Supersymmetry
- Coleman-Mandula theorem and superalgebras
- superspaces
- representation theory: supermultiplets
- supersymmetric field theories
Particle physics
Imad Laktineh
Imad Laktineh
Maxime Gouzevitch
Nicolas Chanon
Introduction à la physique des particules, Mécanique analytique, Théorie Classique des champs (opt.)
Ce cours présente la physique des particules élémentaires : leurs propriétés, leurs interactions, et les moyens de les détecter. Ce cours présente également quelques outils d’analyse de données. Son objectif est de permettre à un étudiant de comprendre un article scientifique traitant de la physique des particules expérimentale, et de poursuivre en thèse dans ce domaine s’il le souhaite.
Introduction / outils théoriques
Cinématique, règles de Feynman
QED
Amplitudes d’hélicité, Renormalisation, Effets NLO
Structure du proton
Fonctions de structure, Modèle des partons
Interaction faible
Courants chargés, structure chirale, courant neutres
Physique de la saveur
Matrice CKM, violation de CP
Modèle standard
Unification électrofaible, Higgs
Physique des neutrinos
Oscillation de neutrinos, masse des neutrinos
Astrophysique et cosmologie
Multi-messagers, ondes gravitationnelles (exp.)
Outils et méthodes
Détection
Interaction particule/Matière, trajectographes, calorimètre, etc..
Outils d’analyse
Probabilité, Statistique
Ecrit
Gauge theories and applications
Henning Samtleben
H. Samtleben
N. Mahmoudi
Les théories de jauge sont des théories des champs invariantes sous des transformations de symétrie locales. Elles jouent un rôle très important en physique du fait qu'elles décrivent les interactions fondamentales (forces électromagnétique, faible, forte et gravitationnelle). Elles interviennent aussi dans d'autres domaines comme la matière condensée ou les atomes froids. Ce cours représente une introduction à ces théories et à quelques-unes de leurs applications en physique des particules.
- Introduction aux théories de jauge non-Abéliennes classiques (Champs, actions, symétries et courants conservés ; Analogie avec la relativité générale)
- Quantification BRST, diagrammes de Feynman, renormalisabilité, observables
- Quelques applications (Calculs à l'arbre et à une boucle)
- Brisure spontanée de symétrie (discrète, continue), théorème de Goldstone
- Mécanisme de Higgs, modèle de Higgs-Kibble
- Modèle standard pour l'interaction électrofaible et extensions (GUT)
- Groupe de renormalisation
Ecrit
General relativity and cosmology
Etera LIVINE
Etera LIVINE
Alexandre ARBEY
Tensors and Geometry M1, Introduction to General Relativity M1
The course is made of two complementary parts, general relativity and cosmology. On the one hand, we will review the motivation, scope and mathematics of general relativity, study its Hamiltonian formulation and work out its astrophysical application to black holes and cosmology. On the other hand, we will review the basic tools to describe the cosmological history, study the various cosmological eras and their main equations, and present the limitations of the current paradigm.
I. General Relativity
A. The geometry of space-timeB. The Einstein equations
C. Basic GR solutions
D. Hamiltonian formulation: Einstein equations as evolution equations
E. Black Holes
II. Cosmology
A. Standard cosmological model
B. Hot Big-Bang and primordial cosmic plasma
C. Structure formation
Written exam (3 hours)
Misner, Thorne & Wheeler, Gravitation
• Matthias Blau Lecture Notes on General Relativity, http://www.blau.itp.unibe.ch/Lecturenotes.html
• Eric Gourgoulhon, Relativité Générale and 3+1 Formalism and Bases of Numerical
Relativity, https://cel.archives-ouvertes.fr/cel-00366315v3/document, https://arxiv.org/abs/gr-qc/0703035
• Peter and J.-P. Uzan, Primordial Cosmology
• S. Weinberg, Cosmology
• S. Dodelson, Modern Cosmology
• Y. Mambrini, Particles in the Dark Universe
Projet numérique
Ralf Everaers (Physique), Agilio Padua (Chimie)
Elham Ghobadpour
Python
The module is composed of two parts:
- 24h of practical exercises (TP) introducing advanced tools of Scientific Software Development during S3A.
- Individual computational projects supervised by researchers and professors from ENS de Lyon and UCBL during S3, which further develop an aspect of a computational module of the Master: Students have to find a mentor willing to supervise and host a 24h computational project in their Lab (24h is the minimal time you should be spending with your supervisor working on your project, eg. 6x4h, or 3x8h).
- Acquire skills and a culture of best practices in Scientific Software Development
- Train in the framework of a small and individually supervised computational project in a scientific domain of the student's choice
In time to be able to apply these techniques in a computational MSc/PhD research project.
24h of practical exercises (TP) introducing advanced tools of Scientific Software Development:
- Shell scripts and Python notebooks as glue code
- Modular, reusable software design
- Effective collaborative development with multiple co-authors
- Version control and release cycles
- Automated testing frameworks
- Structured documentation
- Management of open source scientific packages
- Continuous integration & deployment
- Conversational development
- Systematic debugging
- Mixing programming languages
We expect a ten-page long report summarizing the physics concept required to understand the simulations, a clear presentation of the numerical setup, and of the main results.
Experimental project
Stéphane Santucci
All projects are supervised by researchers and professors from ENS de Lyon or UCBL
The experimental projects are supervised by researchers and professors from ENS de Lyon and UCBL. Students who want to take this course have to find a mentor willing to supervise and host a 48h experimental, or numerical, project in their Lab (48h is the minimal time you should be spending in the lab working on your project, eg. 12x4h, or 6x8h). Some examples of projetcs from previous years are: Construction of optical tweezers, characterization of time-reversal mirrors, liquids assembled from self-propelled particles, fracture & friction experiments, ...
Poster presentation
Nuclear and Astro-nuclear Physics
Dany Davesne
Danys Davesne
Prérequis indispensables : mécanique quantique, physique statistique
Prérequis souhaités : problème à N corps, théorie quantique des champs, transitions de phase
Les nucléons interagissent via l’interaction forte pour former les presque 3000 noyaux connus sur Terre, noyaux qui peuvent contenir jusqu’à plusieurs centaines de constituants. Les expériences actuelles sondent ces noyaux dans les situations les plus extrêmes et les théories effectives modernes peinent à reproduire l’ensemble des données. Enfin, même si les nucléons sont constitués de particules plus élémentaires (quarks et gluons), ils continuent d’être des degrés de liberté pertinents pour décrire des aspects importants des phénomènes découverts très récemment (ondes gravitationnelles). Dans ce cours, nous explorerons différents aspects de l’interaction nucléaire dans des systèmes aussi bien infinis (étoiles à neutrons) que finis en utilisant le formalisme quantique du problème à N corps et les approches de physique statistique de champ moyen. De plus, nous verrons qu’au-delà de l’interaction elle-même, le caractère fermionique des nucléons impose dans les systèmes nucléaires des comportements propres aux fermions (appariement dans les noyaux ou superfluidité des étoiles à neutrons) et permet d’utiliser la théorie des liquides de Fermi pour décrire certaines propriétés. Enfin, nous aborderons quelques aspects de thermodynamique relativiste et de phénomènes dépendant du temps (hydrodynamique relativiste et/ou superfluide).
Integrable models
Karol Kozłowski
Karol Kozłowski
Les systèmes intégrables constituent une classe particulière de modèles physiques pour lesquels il est possible de calculer exactement, sans aucune approximation, un grand nombre de quantités d’intérêts à la physique sous-jacente: vecteurs et valeurs propres d'un Hamiltonien quantique à N-corps, température de transition de phase dans un modèles de physique statistiques, et plus généralement, les fonctions de corrélations. Le modèle d'Ising bi-dimensionnel constitue le plus célèbre exemple de modèle intégrable. Sa résolution exacte (calcul de sont énergie libre à toute température ainsi que de plusieurs de ses fonctions de corrélations) a permis de dégager les mécanismes à la racine de l'apparition d'une transition de phase et de proposer une théorie unifié d'icelle, basée sur l'étude du groupe de renormalisation. Ce cours constitue une introductions aux méthodes modernes en intégrabilité. Les modèles à six-sommets et de la chaîne XXZ de spin 1/2 serviront d'exemples pour familiariser avec l'Ansatz de Bethe algébrique, sa variante en coordonnées ainsi qu'à la caractérisation du spectre de ces modèles via la méthode des équations intégrales non-linéaires.
Fournir une introduction à l'intégrabilité, dont les intérêts vont de la mécanique statistique à l'optique quantique et de la matière condensée à certaines théories des champs de jauge et de cordes et à la correspondance AdS/CFT. Introduire en particulier les modèles intégrables quantiques 1D et l'intégrabilité classique de certaines théories des champs intégrables 2D.
Ecrit
Introduction to String Theory
David Andriot
David Andriot
Interacting quantum fields (M2),
General Relativity and Cosmolgy M2
Advanced Aspects of Symmetries (M2)
Beyond a first overview of superstring theories, the course aims at getting a glimpse of the classical and quantum bosonic string, deriving in particular the critical spacetime dimension, the string spectrum, and the beta-functionals. We then make the connection to supergravity theories and show how to derive a 4-dimensional effective theory.
I. Overview: What is string theory?
II. Classical (bosonic) string
III. Quantization of bosonic string
IV. Compactification
Oral exam
M. Green, J. Schwarz, E. Witten, Superstring Theory Vol. 1, Cambridge University Press, 1988.
Basic Concepts of String Theory, R. Blumenhagen , D. Lüst , S. Theisen, Springer, 2013.
Introduction to Gravitational Wave Physics
Marc Geiller
Marc Geiller
At least an introductory course to General Relativity and Field Theory, and preferably also an advanced course on General Relativity and/or Cosmology (e.g. M2 level).
- 1) Acquire a general knowledge of the field of gravitational wave physics
2) Understand sources of gravitational waves and their production
3) Understand the detection of gravitational waves
4) Acquire an overview of open issues and future challenges
The detection of the Gravitational Waves (GW) emitted by a black holes binary on September 14th 2015 has opened a new window on the Universe. The observation of the kilonova explosion on August 17th 2017 through all different electromagnetic, particle and indeed, gravitational probes is worldwide recognized as the first example of Multimessenger Astronomy.
France is actively contributing to the project Virgo that is going through a large amelioration of the interferometer regarding laser, optics and quantum techniques. This experimental effort will lead to the new detector called Advanced Virgo +. At the same time the collaboration called Einstein Telescope is preparing the design of the third generation of GW detector in Europe, a generation that will detect GW emitted from all the visible Universe.
GW physics is a rapidly expanding new field and scientists are living in a very similar situation as the one at the dawn of particle physics.
As always when a new field of physics is emerging there is a difficulty to follow what’s happening: fundamental properties of GW, details of their detectors, specific vocabulary, are not in the normal background of a physics student.
This introductory course has been thought to make GW physics more approachable. We are going to familiarize with fundamental properties of GW, description of the GW source, description and status of the detector at the moment of detection, significance of the detection. The last part of the course will be focused on the future developments in the field.
The course is meant for experimental physicists. Although the parts dedicated to the properties of GW, their sources and their effects on the detectors constitute 70% of the
subjects, the approach used here is to show how to use GW as a probe to study the Universe and why this probe is complementary to the electromagnetic one.
- The nature of GW and its historical evolution
- Sources of GW
- Specific characteristics of GW: what we can read from the GW signal
- The interferometric detectors of GW
- Some challenges in the design of GW detectors
- The future of GW Astronomy
Written exam
Mineures interdisciplinaires
Matière condensée
Benjamin Huard
B. Huard
D. Amans
R. Houvenaghel
S. Joubaud
Les prérequis pour suivre ce cours sont les suivants : mécanique quantique (niveau L3), thermodynamique statistique (niveau L3).
La matière condensée étudie les systèmes où les interactions et corrélations entre un grand nombre de constituants donnent naissance à des comportements collectifs et à des phénomènes émergents. Un de ses principaux sujets d’étude est l’état solide.
C’est un domaine extrêmement fertile et actif. C’est aussi le sous-domaine de physique qui compte de loin le plus de physiciennes et physiciens. C’est un domaine qui va des applications qui changent concrètement nos vies (comme les semiconducteurs pour l’éclairage, l’informatique, ou les communications) aux concepts mathématiques les plus abstraits qui tissent des liens vers d’autres disciplines (topologie, physique des hautes énergies, astrophysique, …) en passant par la chimie des matériaux.
Le cours et les travaux dirigés permettront notamment de répondre aux questions suivantes. Comment la matière est-elle structurée ? À quelle vitesse peut-on refroidir la matière en s’approchant du zéro absolu ? Qu’est-ce qui rend un matériau conducteur ou isolant ? Transparent ou opaque ? Que sont les quantas d’excitation dans la matière ? Quelle est la forme des ondes sonores classiques et quantiques ? Quels effets quantiques peut-on observer dans les conducteurs mésoscopiques ? Comment figer les électrons par le désordre ou les interactions ?
Parmi les thèmes de recherche actuels dans ce domaine, et qui nécessitent une bonne compréhension des bases données dans ce module, on peut citer le transport cohérent dans les systèmes mésoscopiques, la localisation d'Anderson et la localisation à N corps dans les systèmes désordonnés, les effets Hall quantiques entiers et fractionnaires, les phases de Berry et la topologie des bandes de Bloch, les isolants et semi-métaux topologiques, les instabilités des liquides de Fermi, les aspects modernes du magnétisme quantique (spinons, lacune de Haldane, liquides de spin et code torique), la condensation de Bose-Einstein, la superfluidité et la supraconductivité, les bits quantiques supraconducteurs et semi-conducteurs, la supraconductivité à haute température, les supraconducteurs topologiques et les fermions de Majorana. Le domaine a par ailleurs des liens directs avec d'autres domaines, en particulier les gaz atomiques ultra-froids, les cristaux photoniques et la science de l'information quantique.
Le cours de matière condensée introduit les bases de ce domaine. Il est donc essentiel pour suivre les modules plus spécialisés comme celui de supraconductivité, superfluidité et magnétisme, de physique quantique à N corps, de nanophysique et de phases topologiques.
- Introduction
- Sonder la structure de la matière
- Diffraction élastique des rayons X
- Réseau réciproque
- Diffraction inélastique des neutrons
- Types de cristaux (ionique, covalent, métallique, moléculaire, hydrogène)
- Décrire les vibrations de la matière
- Modes de vibration dans un cristal classique
- Capacité calorifique des isolants
- Excitation quantique de vibration : le phonon
- Sonder les phonons
- Structure électronique de la matière (en négligeant les interactions)
- Modèles de Drude et de Hall
- Théorème de Bloch
- Structure de bandes
- Modèle des liaisons fortes
- Fonctions de Wannier
- Graphène
- Capacité calorifique des métaux
- Transport des électrons : théorie semi-classique
- Dynamique des paquets d’onde dans les bandes de Bloch
- Trous
- Equation de Boltzmann
- Conducteurs mésoscopiques
- Bruit de grenaille
- Semiconducteurs
- Localisation d’Anderson et localisation faible
Examen écrit de 3h en fin de semestre.
Le cours est structuré suivant ce livre :
Modern Condensed Matter Physics
Steven M. Girvin, Kun Yang
Les livres suivants sont également d’excellentes références :
The Oxford Solid State Basics (introduction au domaine niveau L3)
Steven H. Simon
Solid State Physics (grand classique des années 1970)
N.W. Ashcroft, N.D. Mermin
Introduction to Solid State Physics (introduction au domaine niveau L3)
Charles Kittel
Principles of Condensed Matter Physics (bon livre pour la matière molle)
Paul Chaikin, T.C. Lubensky
Dynamique des fluides
Julien Salort
J. Salort
L. Couston
V. Mouet
G. Ricard
Solides, liquides, interfaces en L3 ou équivalent, Bases pour l'analyse de données et d'images en L3
La dynamique des fluides est au cœur de nombreux défis industriels (optimisation du mélange, énergie renouvelable, médecine, réduction du frottement) et environnementaux (prédiction de la circulation atmosphérique, fonte des glaces). Dans de nombreux cas, ces défis sont difficiles à résoudre car les comportements des fluides sous-jacents (eau, gaz, cristaux liquides, fluides biologiques) sont infiniment complexes et difficile à prédire (étant décrits, pour beaucoup d’entre eux, par l’équation de Navier-Stokes).
Ce cours présente des notions et outils indispensables pour les travaux de recherche en sciences du climat, matière molle, hydrodynamique, écoulements biologiques, écoulements astrophysiques, fluides quantiques et microfluidique.
L’objectif du cours de Dynamique des Fluides est de vous familiariser avec les outils théoriques et pratiques mathématiques permettant de décrire et prédire (de manière analytique, sous des hypothèses) le mouvement macroscopique des fluides. Plus précisément, à travers ce cours vous allez :
- Développer votre intuition permettant de reconnaître et exprimer mathématiquement les ingrédients physiques clés d'un problème de dynamique des fluides.
- Apprendre à écrire les équations décrivant l’évolution de l’état du fluide.
- Apprendre à simplifier ces équations et les résoudre (donc prédire) dans certains cas limites.
Ces connaissances seront acquises en travaillant sur des situations physiques issues (entre autres) de l’aérodynamique, l’hydrodynamique, l’ingénierie, et de la géophysique (climat).
1) La matière fluide.
2) Lois fondamentales.
3) Couches limites
4) Dissipation et irréversibilité.
5) Vorticité et tourbillons
6) Fluides géophysiques (L. Couston)
7) Ondes et instabilités
8) Mesures expérimentales et présentation des activités de recherche
Examen écrit.
Mécanique quantique avancée
Marc Magro
M. Magro
A. Burg
P. Holdsworth
L. Moreau-Lalaux
Mécanique quantique L3 ou équivalent.
Introduction à la relativité restreinte
L’objectif de ce cours est de maitriser toute une palette de méthodes utilisées notamment en matière condensée et en physique des hautes énergies.
Le cours est structuré en 4 parties :
Première partie : Systèmes quantiques non relativistes à N corps
• Systèmes de N particules identiques
• Particules identiques en nombre indéterminé
Deuxième partie : Diffusion
• Notions générales
• Résultat du calcul par résolvante
• Approximation de Born
• Potentiel central
Troisième partie : Symétries
• Partie générale sur les symétries
• Rotations et Moment angulaire
Quatrième partie : Mécanique quantique relativiste
• Équation de Klein-Gordon
• Équation de Dirac
Ecrit.
Mécanique statistique et thermodynamique II
Peter Holdsworth
E. Freyssingeas
V. Krakoviack
G. Petrillo
Thermodynamique statistique L3 ou équivalent
1. A review of thermodynamics and statistical mechanics
a. Thermodynamics potentials and experimental observation
b. Principals of statistical mechanics, microstates, ensembles, partition function
c. Thermodynamics from statistical mechanics.
d. Classical and quantum quantum limits.
e. Interacting systems
Some examples: magnets, fluids, liquid crystals, polymers and membranes.
2. Phase transitions
a. Symmetry breaking and competition between energy and entropy.
b. Mean field theory – the Ising model, liquid crystals, Van der Waals fluid.
c. Thermodynamics of phase transitions - 1st and 2nd order phase transitions.
d. Landau theory of phase transitions.
e. The lower critical dimension for phase transitions.
3. Response, correlations and fluctuations
a. Susceptibility and correlations.
b. Landau Ginzburg free energy functional G[m(r)].
c. Correlation length and correlation functions
4. Fluids in the Grand Canonical Ensemble.
a. The chemical potential for the ideal gas and for interacting systems.
b. Liquid-gas phase transition in the Van der Waals approximation.
c. The density functional.
5. Quantum Systems.
a. Introduction to the path integral method.
b. The transverse field Ising model.
c. Quantum phase transitions and quantum critical points.
d. Quantum-classical crossover in an ideal gas.
Ecrit.
Suggested reading:
“Equilibrium Statistical Mechanics” M. Plischke et B. Bergersen (World Scientifique). –
“Introduction to Modern Statistical Mechanics", David Chandler, CUP
“Introduction to Phase Transitions and Critical Phenomena”, H. E. Stanley, OUP, 1971.
“Thermodynamics and Introduction to Thermostatistics”, H. B. Callen, Wiley 1985.
“The Principles of Condensed Matter Physics”, P. M. Chaikin, T. C. Lubensky Cambridge University Press
“Basic Concepts for Simple and Complex Liquids” Jean-Louis Barrat and Jean-Pierre Hansen, CUP.
“Thermodynamique”, Claude Coulon, Sylvie le Boiteux, Patricia Segonds, (Dunod)
“Introduction à la Thermodynamique”, Claire Lhuillier et Jean Rous, (Dunod)
“Thermodynamique Statistique”, R. Castaing, (Masson et Cie)
“Physique statistique”, Bernard Diu, Claudine Guthmann, Danielle Lederer, Bernard Roulet Hermann, 1997.
“Statistical Mechanics: Entropy, Order Parameters, and Complexity”, James Sethna Oxford University Press, 2006 Free pdf: http://sethna.lassp.cornell.edu/statistical_mechanics_entropy_order_parameters_and_complexity
Modélisation quantique des molécules
Tangui Le Bahers
Tangui Le Bahers
Bogdan Marekha
Modélisation Moléculaire (L3), Mécanique Quantique (L3) ou équivalent.
Ce cours présente le concept de surface d’énergie potentielle et les méthodes qui permettent de remonter à des propriétés chimiques (thermodynamiques, cinétiques…) à partir de cette surface. Sur le plan théorique, ce cours introduit la théorie de la fonctionnelle de la densité, la méthode de chimie quantique la plus utilisée aujourd’hui. Nous verrons comment la densité électronique peut servir à la fois d’objet pour déterminer l’énergie d’un système mais aussi d’objet d’analyse de la liaison chimique, comme les orbitales moléculaires dans les théories de la fonction d’onde.
Partie I : Introduction à la surface d’énergie potentielle
1- Qu’est ce qui caractérise une réaction ?
2- La surface d’énergie potentielle.
3- Comment calculer l’énergie d’un système ?
Partie II : La théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT)
1- Principe de la DFT
2- La DFT dans le cadre de la méthode Kohn-Sham
Partie III : Se déplacer sur la surface d’énergie potentielle
1- Optimisation de géométrie
2- Recherche des états de transitions
3- Extraction des grandeurs thermodynamiques et cinétiques
Partie IV : La densité électronique comme objet d’analyse
Examen écrit et évaluation des projets par un oral et un rapport écrit.
Modélisation quantique des matériaux
Tangui Le Bahers
Tangui Le Bahers
Raphael Rullan
Modélisation Quantique des Molécules (M1 S1A), Modélisation Moléculaire (L3), Mécanique Quantique (L3) ou équivalent.
Ce cours a trois objectifs généraux :
1- Familiariser les étudiants aux concepts fondamentaux de structure électronique des solides (théorie du gaz d’électron libre, théorie des liaisons fortes, modèle des bandes…).
2- Présenter la manière dont les méthodes de chimie quantique modernes (principalement la DFT) s’adaptent aux systèmes périodiques.
3- Donner une première expérience de calculs périodiques avec un code utilisant une base localisée (CRYSTAL) et un code utilisant une base d’ondes planes (VASP) sur des systèmes réalistes (matériaux semiconducteurs, surface de catalyseur…)
Partie I : Structure électronique des solides
Modèle du gaz d’électrons libre
Loi d’Ohm
Théorie des bandes
Propriétés des solides (masse effective, interaction lumière-matière)
Partie II : calcul de chimie quantique pour les solides
Maillage en points-k
Bases localisées
Bases d’ondes planes
Spécificité des calculs de chimie quantique en condition aux limites périodiques
Partie III : Quelques illustrations
Systèmes 3D-périodique (propriétés élastiques, propriétés opto-électroniques de semiconducteurs)
Systèmes 2D-périodiques (nanoparticules sur surface)
Systèmes 1D-périodique (nanotube de porphyrine)
TP :
Utilisation du code CRYSTAL pour étudier le diamant
Utilisation du code VASP pour étudier une surface de palladium
Un mini projet à réaliser parmi 7 sujets proposés (thématique : catalyse, photocatalyse, photonique, métaux moléculaires, semiconducteurs).
Les étudiants seront évalués sur la base d’un rapport lié au projet qu’ils auront réalisés lors des TD/TP.
Simulations numériques et thermodynamique statistique
Ralf Everaers
Ralf Everaers
Classical mechanics, and basic notions of thermodynamics and statistical mechanics (L3), Python
Statistical Physics deals with behavior that emerges from the interactions of many particles. Since exact analytical solutions of the governing equations only exist for a small number of models, computer simulations have become an indispensable tool in the field and neighboring disciplines like Condensed Matter Physics, Theoretical and Physical Chemistry, Chemical and Biological Physics.
The course introduces the methods employed for exploring the static and dynamic properties of particle based systems. Computational exercises, where these methods are applied to simple, but powerful models, form an integral part of the module. To some extent it offers a fresh start, if you found the subject interesting, but a little mysterious, because the course inverses the order in which the subject is typically taught: starting from simulations allows to "discover" the laws of Statistical Mechanics and Thermodynamics in a very direct and intuitive manner.
- From Mechanics to Statistical Mechanics: Just do it?
Lecture: A quote by Laplace defines a research program for modern science:
- identify particles, interactions and equations of motion
- Solve for many particles
- Observe/understand the emergent behavior
Modern computers allow for a quantitative implementation of such thought experiments.
- Simulating Gases
Lecture: We start with the simplest non-trivial many particle simulation technique: The combination of Exact Dynamics with Multi-particle collisions.
For some examples of non-interacting many-particle systems we can solve Newton's equations of motion exactly: free particles, harmonic oscillators, ... We can use these analytical solution to define the "streaming part" of a time step.
- The "collision part" adds the effect of confining walls and, most importantly, collisions between groups of neighboring particles.
- TD: From Newtonian dynamics to the ideal gas law
- Your mission is to achieve the great unification of the laws of Newton, Boyle, Charles, Avogadro and Gay-Lussac ...: do the latter "emerge" in a simple model, where gas "atoms" move ballistically in between energy- and momentum conserving collisions?
- To make this point you need to carry out a complete simulation project (run simulations for large variety of combinations of particle number, volume, box shape, internal energy and particle mass; analyze data for the instantaneous pressure; compare data sets to theory)
- Molecular Dynamics Simulations for Liquids and Solids: Basics
Lecture: For systems at higher density we can no longer neglect the effect of the interactions between the particles. The method of choice for their exploration are Molecular Dynamics simulations.
- time- vs event-based MD
- TD: The MD time step
The central part of most Molecular Dynamics algorithms is the integration of the equations of motions for particles interacting via continuously varying potentials. In this exercise we explore for the simple example of harmonic and non-linear oscillators
the (forward) Euler algorithm and
- the different formulations of the Verlet algorithm
- Molecular Dynamics Simulations: Lennard-Jones systems
In this practical 4h session you will explore the behavior of many-particle systems for a simple model system. During the TD part of the session you will learn how to run and analyze simulations of LJ systems. During the mini-project part of the session you will explore the emergent behavior on your own. The objective is
1) To observe the emergence of typical behavior of liquids and crystalline solids2) To explore the transition from the liquid to the solid state as a function of the density of the system.
- From Classical Mechanics to Statistical Mechanics and Thermodynamics
- TD: Heat Flow
- Following Laplace's instructions we have by now learned how to simulate ideal gases, systems composed of harmonic oscillators, and many-particle systems with WCA- and LJ-interactions. And we have seen that isolated many-particle systems evolve to equilibrium states, whose macroscopic properties are time-independent.
- But what happens, when we allow such systems to exchange energy?
- Lecture: A little review in the light of what you will have learned at this point:
- Classical Mechanics
- Collisions and conservation laws, Newton's, Lagrange's and Hamilton's mechanics, Noether's theorem: symmetries and conservation laws, Laplace's "instructions": give up, because we cannot predict the exact time evolution of all microscopic degrees of freedom?
- Thermodynamics
- Equilibrium states and equilibration, state variables, the basic problem of thermodynamics, entropy, thermodynamic potentials, the nature of the predictions made by thermodynamics
- Statistical Mechanics
- Phase space, trajectories, phase space densities and the link between the microscopic and the macroscopic view, entropy, the ensembles of statistical mechanics, equilibration and H-theorem
- Simple models for interacting systems
- Lattice gas, Lennard Jones particles, Ising spin model
- Classical Mechanics
- TD: Heat Flow
- Exact Enumeration and Monte Carlo Simulations
- Up this point we will have followed Laplace's instructions and carried out computer simulations, where we solve Newton's equations of motion for small model systems. But having discovered Gibb's formalism for calculating ensemble averages over phase space, a new question arises: can't we use a computer to calculate these averages for us numerically?
- TD: Exact Enumeration of the 2d Ising Model
- A classic example for the evaluation by hand of a partition functions and of an expectation value in the canonical ensemble is the behavior of a single spin in an external field.
- In this exercise we explore, how much farther we can go by numerically evaluating the partition function of 2d Ising models.
- Representations of Ising states (binary numbers vs matrices)
- Calculating observables
- Ising order parameters
- Enumerating all microstates of the 3x3 and the 4x4 Ising model
- Calculating EXACT equations of state
- Lecture:
- Instead of generating ALL possible microstates, it might be enough to generate representative samples. This is the idea behind Monte Carlo Simulations, which allow to calculate integrals over the high-dimensional phase or configuration spaces of Statistical Mechanics.
- After a brief discussion of Random or Simple Sampling, the lecture focuses on the Metropolis et al. Dynamic Monte Carlo method for Importance Sampling
- TD: Metropolis Monte Carlo Simulations of the Ising Model
- Use MC simulations to explore the behavior of the Ising model for different combinations of the reduced field and coupling strength (h,k).
- Explore
- the effect of increasing the external field in the absence of internal couplings
- the effect of increasing the internal coupling in the absence of an external field
- the effect of antiferromagnetic couplings k<0
- the effect of an additional magnetic field
- different initial conditions
- Learn about equilibrating simulations and assembling data.
- Calculating free energies
- Lecture: Thermodynamic integration
- Metropolis importance sampling and Molecular Dynamics simulations allow to measure averages of "mechanical observables," whose values are defined for individual microstates. However they provide no direct access to the equally important "thermodynamic observables” like the entropy or free energies, which are related to the absolute size of phase space.
- There is nothing strange about this inability of simulators, experimentalists do not dispose of free-energy-o-meters or entropy-o-meters either. Instead we all determine free energy DIFFERENCES via thermodynamic integration of measurable(!) derivatives of the free energy.
- Kirkwood coupling parameter scheme
- Lecture: Thermodynamic integration
Rapport résumant les results obtenus dans les exercises.
- Frenkel and Smit, Understanding Molecular Simulation
- Allen and Tildesley, Computer Simulation of Liquids
- Landau and Binder, A Guide to Monte Carlo Simulations in Statistical Physics
- Krauth, Algorithms and Computations
Dynamique moléculaire
Agilio Padua
A. Padua
T. Morosova
Statistical thermodynamics, PHYS3203.
Classical thermodynamics, PHYS3108 (recommended).
This course aims to introduce and apply molecular simulation to the study of liquids, solutions, interfaces and biomolecules. The elements making up a molecular dynamics code are presented and analysed, as well as the models describing the structures and interactions of molecules, ions and materials.
Molecular simulation enables the calculation of equilibrium and dynamic properties of complex systems, starting from a description of molecular interactions and the laws of statistical mechanics. Certain quantities are directly comparable to experiment, which is useful to validate the underlying models. Additionally, simulation gives access to many quantities that are not easily accessible through experiments, but that enhance our understanding at the microscopic scale of important aspects in physical chemistry.
Molecular dynamics methods can either be based on classical mechanics models (atomistic or coarse-grained force fields) or on forces derived from quantum mechanics (ab initio molecular dynamics). As such, it can describe matter at different scales, from the electronic structure up to the mesoscale, which in practice means (at present) length scales from the Ångstrom to the micrometer and time scales from picoseconds to the microsecond.
Through learning some of the major simulation codes presently in use, students will apply molecular dynamics to compute structural, dynamic and thermodynamic quantities, relevant to describe solvation, transport and interfacial phenomena in realistic systems.
Fundamentals of molecular dynamics: integrators, thermostats, periodic conditions.
Models describing molecular structures and interactions: force fields, bonded and nonbonded interactions; quantum chemistry methods.
Techniques and algorithms: neighbour lists, long-range forces, constraints, etc.
Using codes such as LAMMPS or Gromacs to simulate molecular and biomolecular systems.
Trajectory analysis and post-treatment.
Calculation of energetic, structural and dynamic quantities.
Written report (50%) and presentation (50%) on a case study.
Machine learning en physique et chimie
Adrien Meynard
A. Meynard
P. Petrillo
S. Roux
Mathématiques de L3 pour Physique-Chimie.
Outils de Programmation et Projets Numériques de Physique et Chimie (langage : python)
Probabilités, variables aléatoires, statistiques.
Apprendre et se familiariser avec des concepts de base d’apprentissage automatique pour les sciences physiques et chimiques, et découverte des méthodes avancées à travers des exemples appliqués à la physique et la chimie.
- Introduction aux concepts et idées d'apprentissage automatique
- Méthodes générales pour représentations, classification supervisée, clustering
- Approches actuelles en ML, réseaux de neurones
- Exemples et applications à des questions en physique et chimie (analyse de spectres, problèmes inverses en imagerie, chimioinformatique, exemples en études du climat, en astronomie, problème du repliement des protéines, etc.)
Examen écrit et projet avec rapport.
Pattern Recognition and Machine Learning. Christopher Bishop, Springer, 2006.
A high-bias, low-variance introduction to Machine Learning for physicists. Pankaj Mehta et al., Physics Reports 810 (2019) 1–124
Deep Learning. Ian Goodfellow and Yoshua Bengio and Aaron Courville. An MIT Press book, 2016
Physique numérique pour l'hydrodynamique
Guillaume Laibe
G. Laibre
A. Venaille
Outils numériques et programmation (L3)
Numerical simulations have become a key device of physicists’ toolbox, making it possible to study systems that have no analytic solutions, or for which the experiment is difficult, or even impossible. The CFD module is designed to deliver essentials of the art of computational hydrodynamics: choice and relevance of the discretisation method, design for stability and accuracy, implementation of different physical processes. The ubiquity of the principles will be demonstrated through problems ranging from flows at the laboratory scale up to the atmospheric and astrophysical flows.
- Introduce general concepts of computational fluid dynamics and numerical methods : stability and accuracy,
- Present different methods with their respective strengths and weaknesses,
- Applications to real physical systems
- Hands on with the help of sample codes and jupyter notebooks
- Geophysical fluid dynamics : Finite differences.
- Astrophysical fluid dynamics : Smooth Particle Hydrodynamics, Godunov methods.

- Toro : Riemann Solvers and Numerical Methods for Fluid Dynamics
- Violeau : Fluid Mechanics and the SPH method
- Numerical methods for fluid dynamics - with applications to geophysics, Dale Durran
Photophysique et photochimie théoriques
Thomas Niehaus
Thomas NIEHAUS
Quantum mechanics L3 or equivalent.
L’interaction entre la lumière et la matière joue un rôle essentiel dans de nombreuses applications technologiques, allant de l’optoélectronique au photovoltaïque, et revêt également une grande importance en biochimie. Ce cours s’intéresse aux processus qui se produisent après l’absorption de la lumière par la matière : comment l’énergie acquise est transportée, comment elle conduit à des photoréactions souhaitées ou indésirables, puis comment elle est finalement dissipée dans l’environnement. Situé à l’interface entre la physique et la chimie, le cours traite aussi bien des molécules que des solides et des matériaux émergents.
À l’issue de ce cours, les étudiants seront capables de comprendre et d’analyser les mécanismes fondamentaux de l’interaction lumière–matière ainsi que la dynamique des états excités dans les molécules et les solides. Ils maîtriseront les bases théoriques et numériques nécessaires à l’étude des processus photophysiques et photochimiques modernes.
Les développements théoriques, fondés sur la mécanique quantique à plusieurs corps, sont complétés par des études numériques réalisées lors des séances de travaux pratiques, qui incluent également des calculs ab-initio.
Chapter 1: Introduction to photochemistry
Keywords: Spectral irradiance, quantum yields, photochemical kinetics
Chapter 2: Molecular states
Keywords: Born-Oppenheimer approximation, Classification of excited states
Chapter 3: First principles methods for excited states
Keywords: TDDFT
Chapter 4: Electronic excitation and decay
Keywords: Vibrationally resolved spectra, Huang-Rhys factors, Kasha rule
Chapter 5: Wavepacket dynamics
Keywords: Franck-Condon excitation
Chapter 6: Non-adiabatic dynamics
Projet informatique
Giovanni Granucci and Maurizio Persico, Photochemistry: A Modern Theoretical Perspective, Springer, Cham, 2018.
Vincenzo Balzani, Paola Ceroni, and Alberto Juris, Photochemistry and Photophysics: Concepts, Research, Applications, Wiley-VCH, Weinheim, 2014.
Chimie computationnelle avancée
Agilio PADUA
Rodolphe VUILLEUMIER (ENS-PSL)
Claire LOISON (CNRS, Lyon)
Anne MILET (Univ. Grenoble Alpes)
Agilio PADUA (ENS de Lyon)
CHIM4105 – Modélisation quantique des molécules
CHIM4106 – Modélisation quantique des matériaux
CHIM4211 – Dynamique moléculaire
PHYS4213 – Simulations numériques et thermodynamique statistique
Ce cours présente des méthodes avancées de chimie computationnelle permettant de décrire les molécules et les matériaux, allant des approches quantiques et classiques aux méthodes hybrides qui les combinent. Dispensé par des chercheurs qui développent et appliquent activement ces méthodes, ce cours permet aux étudiants de se familiariser directement avec les recherches actuelles à la pointe de ce domaine.
L'enseignement associe des cours magistraux et des travaux pratiques portant sur :
- Dynamique moléculaire ab initio à l'aide du code CP2K.
- Modèles de Markov (Markov state models) pour l'analyse de trajectoires.
- Décomposition de l'énergie par théorie des perturbations adaptée à la symétrie (Symmetry-Adapted Perturbation Theory).
- Champs de force polarisables pour les ions, molécules et matériaux.
Contrôle continu.
Approche quantique de la réactivité catalytique
Pascal RAYBAUD
Pascal RAYBAUD
Céline CHIZALLET
Cours du M1optionnels : modélisation quantique des molécules (CHIM4104), modélisation quantique des matériaux (CHIM4105)
Les méthodes computationnelles quantiques (théorie de la fonctionnelle de la densité notamment) permettent d’explorer la réactivité de systèmes catalytiques complexes (hétérogènes ou homogènes) utilisés industriellement ou susceptibles de l’être. Le cours montre comment les approches quantiques modernes permettent :
- de comprendre la réactivité par le calcul de propriétés catalytiques (structure du site actif, effets de taille, morphologie, mécanismes)
- d’aider à l’interprétation de résultats expérimentaux (spectroscopie, cinétique)
- de prédire des propriétés clefs pour optimiser de nouveaux catalyseurs.
Le cours aborde de nombreuses études de cas illustrant des systèmes catalytiques d’intérêts industriels : surfaces de métaux, d’oxydes, sulfures, zéolithes, agrégats métalliques supportés, systèmes organométalliques… et réactions associées (hydrogénation, hydrogénolyse, désulfuration, isomérisation, craquage, oligomérisation, …)
L’objectif est d’acquérir des compétences pour comprendre et mettre en œuvre les techniques de modélisation de catalyseurs en soutien à l’approche expérimentale.
Le cours présentera les différents aspects suivants :
Rappels fondamentaux : théorie de la fonctionnelle de la densité (généralité), approches orbitalaires et structures de bandes en surface
Choix de modèles pertinents pour la description des sites actifs : moléculaires (organométalliques), périodiques (surfaces catalytiques)
Calculs de propriétés clefs pour la catalyse : structurales, morphologiques, spectroscopiques (fréquences, déplacements chimique…), thermodynamiques et cinétiques (états de transition, énergie d’activation, profils réactionnels)
- Modélisation micro-cinétique et multi-échelle
- « Catalysis by design » : vers la prédiction de descripteurs quantiques et relation structure-activité
Examen écrit
- R.G. Parr, W. Yang, « Density-Functional Theory of Atoms and Molecules », Oxford University Press, New York, 1989.
- Solids and Surfaces, A chemist’s View of Bonding in Extended Structures. R. Hoffmann. Book. VCH Publishers, Inc. (1988)
- A chemical and theoretical way to look at bonding on surfaces. R. Hoffmann. Review of Modern Physics. 60 (1988) 601.
- Theoretical Surface Science and Catalysis - Calculations and Concepts. B. Hammer, J. Norskov. Advances in Catalysis 45 (2000) 71.
- Modélisation Moléculaire – Bases théoriques (J 1 011, J 1 012, J 1 013) – Mise en œuvre (J 1 014) – Offre de logiciels et Perspectives (J 1 015). Hervé Toulhoat. Editions Techniques de l’Ingénieur.
- Ab-Initio Simulations of Materials Using VASP: Density-Functional Theory and Beyond. J. Hafner. Journal of Computational Chemistry 29 (2008) 2044.
- Density functional theory simulations of complex catalytic materials in reactive environments: beyond the ideal surface at low coverage. C. Chizallet and P. Raybaud. Catalysis Science & Technology 4 (2014) 2797.
Advanced Computational Statistical Physics
Ralf Everaers
Ralf Everaers
Physique statistique L3 and M1
Physique numérique L3
Statistical Physics deals with behavior that emerges from the interactions of many particles. Since exact analytical solutions of the governing equations only exist for a small number of models, computer simulations have become an indispensable tool in the field and neighboring disciplines like Condensed Matter Physics, Theoretical and Physical Chemistry, Chemical and Biological Physics.
The cours introduces the methods employed for exploring the static and dynamic properties of particle based systems on an advanced level. Computational exercises, where these methods are applied to simple, but powerful models, form an integral part of the module.
- Molecular Dynamics Simulations for the exploration of emergent dynamic properties
- TD: Integrating Newton’s equations of motion for continuous potentials: The secret behind the Verlet algorithm
- Liouville formulation of symplectic and multiple-timestep integrators
- Langevin dynamics
- Thermodynamic averages, fluctuations and transformations between ensembles
- Linear response and Green-Kubo relations for transport coefficients
- TD: MD simulations of Lennard-Jones liquids
- Non-equilibrium Molecular Dynamics
- Monte Carlo Simulations for the exploration of emergent static properties
- Exact enumeration of small systems: Reweighting and the exact evaluation of partition functions
- Monte Carlo simulations
- Simple Sampling: Statistical errors and the limits of reweighting
- Importance Sampling: The Metropolis algorithm; Statistical errors, dynamical correlations and the power of well-designed trial moves: Glauber vs. Kawasaki vs Cluster moves for spin systems; Simulating polymers; Quenched disorder: spin glasses; Other ensembles.
- TD: Monte Carlo simulations of the Ising model
- Free energies
- Widom insertion and thermodynamic integration
- TD: free energy of a methane molecule in water from TI (L. Monticelli)
- Advanced techniques:
- TD: The density of states of the Ising model from Multihistogram analysis/WHAM
- TD: Protein binding energies from Umbrella Sampling and Steered Molecular Dynamics (L. Monticelli)
- Widom insertion and thermodynamic integration
- Exploring Rare events
- (sampling) transition states and paths
- Kinetic Monte Carlo
Mini-projet et examen écrit
- Frenkel and Smit, Understanding Molecular Simulation
- Allen and Tildesley, Computer Simulation of Liquids
- Landau and Binder, A Guide to Monte Carlo Simulations in Statistical Physics
- Krauth, Algorithms and Computations
Dynamics of Planetary Interiors
Stéphane Labrosse
Stéphane Labrosse
Chloé Michaut
Thierry Alboussière
Bonne connaissance de la physique classique (mécanique des milieux continus, mécanique des fluides, thermodynamique, électromagnétisme).
L'intérieur de la Terre est composé d'un manteau rocheux proche de sa température de fusion, et d'un noyau dont la partie externe est un océan profond de métal liquide. Ces enveloppes du globe restent inaccessibles aux observations directes. Leurs dynamiques sont pourtant à l'origine de phénomènes naturels majeurs : les tremblements de Terre, les volcans, la dérive des continents, la génération du champ magnétique, les variations de la durée du jour. Il s'agit dans cette unité d'enseignement d'acquérir les fondamentaux de la physique permettant de décrire la dynamique du manteau et du noyau terrestre, et de manipuler les modèles pour comprendre les observations géophysiques de premier ordre et proposer des scénarii d'évolution à long terme des planètes.
Ce cours utilise une pédagogie par projet. Il s'agira de mener un projet de modélisation en géophysique interne ou planétologie afin de répondre à une question scientifique. Le projet est construit de A à Z par l'étudiant avec l'équipe pédagogique en soutien. La première séance fixe le cadre organisationnel et scientifique avec quelques bases et les enseignants proposent quelques idées de projets. Les séances qui suivront serviront à accompagner les étudiants dans l'avancée de leur projet, que ce soit sur les concepts, les expériences/calculs ou l'acquisition d'outils techniques. L’UE est évaluée par un rapport et une soutenance début janvier. L’accent est mis sur la démarche scientifique plutôt que sur les résultats, forcément limités sur une courte durée.
Rapport de projet (50%) et soutenance orale (50%)
Computational Quantum Physics
Fabio Mezzacapo
Fabio Mezzacapo
Nick Giovanoudis
The quantum many-body problem represents one of the biggest scientific challenges of modern science, due to the exponential growth of the complexity of quantum systems with their size. This course aims at introducing some of the most successful methods for the numerical simulation of quantum many-body systems -- from condensed matter and statistical physics to quantum chemistry.
1) Introduction to the complexity of the quantum many-body problem (1h);
2) Exact diagonalization and its limitations (3h);
3) Variational approaches; the Monte Carlo method, and variational Monte Carlo for physics and chemistry (4h);
4) Improving on the variational approach: diffusion Monte Carlo, fixed-node approximation for strongly interacting fermions (4h);
5) Density-matrix approaches and tensor-network Ansätze for lattice quantum systems and beyond (4h);
6) Path-integral Monte Carlo methods for systems in continuous space: applications to quantum fluids and solids (4h);
7) Path-integral Monte Carlo methods (and variants) for systems on lattice: applications to condensed matter, statistical physics, etc. (4h).
The TD sessions will be hands-on, aimed at programming simple instances of some of the methods presented in the course.
The exam will be based on a report (written or oral) of either a work in the recent literature, or of an original coding project chosen by the students (either as individuals, or in two-student teams).
Projet numérique
Ralf Everaers (Physique), Agilio Padua (Chimie)
Elham Ghobadpour
Python
The module is composed of two parts:
- 24h of practical exercises (TP) introducing advanced tools of Scientific Software Development during S3A.
- Individual computational projects supervised by researchers and professors from ENS de Lyon and UCBL during S3, which further develop an aspect of a computational module of the Master: Students have to find a mentor willing to supervise and host a 24h computational project in their Lab (24h is the minimal time you should be spending with your supervisor working on your project, eg. 6x4h, or 3x8h).
- Acquire skills and a culture of best practices in Scientific Software Development
- Train in the framework of a small and individually supervised computational project in a scientific domain of the student's choice
In time to be able to apply these techniques in a computational MSc/PhD research project.
24h of practical exercises (TP) introducing advanced tools of Scientific Software Development:
- Shell scripts and Python notebooks as glue code
- Modular, reusable software design
- Effective collaborative development with multiple co-authors
- Version control and release cycles
- Automated testing frameworks
- Structured documentation
- Management of open source scientific packages
- Continuous integration & deployment
- Conversational development
- Systematic debugging
- Mixing programming languages
We expect a ten-page long report summarizing the physics concept required to understand the simulations, a clear presentation of the numerical setup, and of the main results.
Winter School in Computational Chemistry or Physics
Agilio PADUA
Ralf EVERAERS
CHIM4105 – Modélisation quantique des molécules
CHIM4106 – Modélisation quantique des matériaux
CHIM4211 – Dynamique moléculaire
PHYS4213 – Simulations numériques et thermodynamique statistique
Des winter schools de niveau master/doctorat dans les domaines de la chimie ou de la physique computationnelles, visant à illustrer l'application des méthodes abordées au cours du premier semestre à des thèmes d'actualité dans le domaine de la recherche.
Une winter school du réseau RCTF/Themosia est organisée à Lyon ou à Marseille au cours des troisième et quatrième semaines de janvier ; elle aborde des thèmes d'actualité en chimie computationnelle, qui varient d'une année à l'autre.
MolSim, à Amsterdam, est une winter school prestigieuse consacrée à la simulation moléculaire, qui se tient chaque année au cours des deuxième et troisième semaines de janvier. Elle propose un programme axé sur les méthodes de simulation moléculaire, tant fondamentales qu'avancées, en physique, chimie ou biologie.
Contrôle continu.
Projet bibliographique
Matthias PAULY
Le rapport bibliographique constitue la première étape du stage, au cours de laquelle l'étudiant·e se met dans la peau d'un chercheur. Rédigé sur une dizaine de pages, il doit présenter un état de l'art du sujet qui sera approfondi par la suite lors du stage expérimental. Ce rapport devra aborder les points suivants :
- Contexte du sujet
- Enjeux associés
- État de l'art de la recherche à l'échelle internationale
- Contribution du laboratoire, le cas échéant, à cette thématique de recherche
- Présentation de l'approche qui sera développée par l'étudiant au cours du stage
L'étudiant·e effectue sa recherche bibliographique et rédige son rapport en autonomie, en lien avec l'équipe d'encadrement du futur stage du second semestre.
Rapport écrit + soutenance orale devant un jury de trois membres (deux experts, un représentant de la formation).
Mécanique statistique et thermodynamique II
Peter Holdsworth
E. Freyssingeas
V. Krakoviack
G. Petrillo
Thermodynamique statistique L3 ou équivalent
1. A review of thermodynamics and statistical mechanics
a. Thermodynamics potentials and experimental observation
b. Principals of statistical mechanics, microstates, ensembles, partition function
c. Thermodynamics from statistical mechanics.
d. Classical and quantum quantum limits.
e. Interacting systems
Some examples: magnets, fluids, liquid crystals, polymers and membranes.
2. Phase transitions
a. Symmetry breaking and competition between energy and entropy.
b. Mean field theory – the Ising model, liquid crystals, Van der Waals fluid.
c. Thermodynamics of phase transitions - 1st and 2nd order phase transitions.
d. Landau theory of phase transitions.
e. The lower critical dimension for phase transitions.
3. Response, correlations and fluctuations
a. Susceptibility and correlations.
b. Landau Ginzburg free energy functional G[m(r)].
c. Correlation length and correlation functions
4. Fluids in the Grand Canonical Ensemble.
a. The chemical potential for the ideal gas and for interacting systems.
b. Liquid-gas phase transition in the Van der Waals approximation.
c. The density functional.
5. Quantum Systems.
a. Introduction to the path integral method.
b. The transverse field Ising model.
c. Quantum phase transitions and quantum critical points.
d. Quantum-classical crossover in an ideal gas.
Ecrit.
Suggested reading:
“Equilibrium Statistical Mechanics” M. Plischke et B. Bergersen (World Scientifique). –
“Introduction to Modern Statistical Mechanics", David Chandler, CUP
“Introduction to Phase Transitions and Critical Phenomena”, H. E. Stanley, OUP, 1971.
“Thermodynamics and Introduction to Thermostatistics”, H. B. Callen, Wiley 1985.
“The Principles of Condensed Matter Physics”, P. M. Chaikin, T. C. Lubensky Cambridge University Press
“Basic Concepts for Simple and Complex Liquids” Jean-Louis Barrat and Jean-Pierre Hansen, CUP.
“Thermodynamique”, Claude Coulon, Sylvie le Boiteux, Patricia Segonds, (Dunod)
“Introduction à la Thermodynamique”, Claire Lhuillier et Jean Rous, (Dunod)
“Thermodynamique Statistique”, R. Castaing, (Masson et Cie)
“Physique statistique”, Bernard Diu, Claudine Guthmann, Danielle Lederer, Bernard Roulet Hermann, 1997.
“Statistical Mechanics: Entropy, Order Parameters, and Complexity”, James Sethna Oxford University Press, 2006 Free pdf: http://sethna.lassp.cornell.edu/statistical_mechanics_entropy_order_parameters_and_complexity
Signaux et images en physique
Stéphane Roux
S. Roux
A. Meynard
Aucun
Introduction.
Place et position de la discipline.
Description des processus stochastiques.
Transformations et représentations.
Filtrage.
Analyses Temps-Fréquence et en ondelettes.
Ce cours est constitué de plusieurs sessions indépendantes de 4H (orateur différents) sur des sujets de physique avec une composante traitement du signal et de l’image. Ces séances de 4h incluent:
- 1 heure de présentation de la physique du problème;
- 1 heure de présentation de la méthode;
- 2 heures de TP (python) pour reproduire les résultats.
Contrôle continu et rendu de plusieurs TP Python
Machine learning en physique et chimie
Adrien Meynard
A. Meynard
P. Petrillo
S. Roux
Mathématiques de L3 pour Physique-Chimie.
Outils de Programmation et Projets Numériques de Physique et Chimie (langage : python)
Probabilités, variables aléatoires, statistiques.
Apprendre et se familiariser avec des concepts de base d’apprentissage automatique pour les sciences physiques et chimiques, et découverte des méthodes avancées à travers des exemples appliqués à la physique et la chimie.
- Introduction aux concepts et idées d'apprentissage automatique
- Méthodes générales pour représentations, classification supervisée, clustering
- Approches actuelles en ML, réseaux de neurones
- Exemples et applications à des questions en physique et chimie (analyse de spectres, problèmes inverses en imagerie, chimioinformatique, exemples en études du climat, en astronomie, problème du repliement des protéines, etc.)
Examen écrit et projet avec rapport.
Pattern Recognition and Machine Learning. Christopher Bishop, Springer, 2006.
A high-bias, low-variance introduction to Machine Learning for physicists. Pankaj Mehta et al., Physics Reports 810 (2019) 1–124
Deep Learning. Ian Goodfellow and Yoshua Bengio and Aaron Courville. An MIT Press book, 2016
Simulations numériques et thermodynamique statistique
Ralf Everaers
Ralf Everaers
Classical mechanics, and basic notions of thermodynamics and statistical mechanics (L3), Python
Statistical Physics deals with behavior that emerges from the interactions of many particles. Since exact analytical solutions of the governing equations only exist for a small number of models, computer simulations have become an indispensable tool in the field and neighboring disciplines like Condensed Matter Physics, Theoretical and Physical Chemistry, Chemical and Biological Physics.
The course introduces the methods employed for exploring the static and dynamic properties of particle based systems. Computational exercises, where these methods are applied to simple, but powerful models, form an integral part of the module. To some extent it offers a fresh start, if you found the subject interesting, but a little mysterious, because the course inverses the order in which the subject is typically taught: starting from simulations allows to "discover" the laws of Statistical Mechanics and Thermodynamics in a very direct and intuitive manner.
- From Mechanics to Statistical Mechanics: Just do it?
Lecture: A quote by Laplace defines a research program for modern science:
- identify particles, interactions and equations of motion
- Solve for many particles
- Observe/understand the emergent behavior
Modern computers allow for a quantitative implementation of such thought experiments.
- Simulating Gases
Lecture: We start with the simplest non-trivial many particle simulation technique: The combination of Exact Dynamics with Multi-particle collisions.
For some examples of non-interacting many-particle systems we can solve Newton's equations of motion exactly: free particles, harmonic oscillators, ... We can use these analytical solution to define the "streaming part" of a time step.
- The "collision part" adds the effect of confining walls and, most importantly, collisions between groups of neighboring particles.
- TD: From Newtonian dynamics to the ideal gas law
- Your mission is to achieve the great unification of the laws of Newton, Boyle, Charles, Avogadro and Gay-Lussac ...: do the latter "emerge" in a simple model, where gas "atoms" move ballistically in between energy- and momentum conserving collisions?
- To make this point you need to carry out a complete simulation project (run simulations for large variety of combinations of particle number, volume, box shape, internal energy and particle mass; analyze data for the instantaneous pressure; compare data sets to theory)
- Molecular Dynamics Simulations for Liquids and Solids: Basics
Lecture: For systems at higher density we can no longer neglect the effect of the interactions between the particles. The method of choice for their exploration are Molecular Dynamics simulations.
- time- vs event-based MD
- TD: The MD time step
The central part of most Molecular Dynamics algorithms is the integration of the equations of motions for particles interacting via continuously varying potentials. In this exercise we explore for the simple example of harmonic and non-linear oscillators
the (forward) Euler algorithm and
- the different formulations of the Verlet algorithm
- Molecular Dynamics Simulations: Lennard-Jones systems
In this practical 4h session you will explore the behavior of many-particle systems for a simple model system. During the TD part of the session you will learn how to run and analyze simulations of LJ systems. During the mini-project part of the session you will explore the emergent behavior on your own. The objective is
1) To observe the emergence of typical behavior of liquids and crystalline solids2) To explore the transition from the liquid to the solid state as a function of the density of the system.
- From Classical Mechanics to Statistical Mechanics and Thermodynamics
- TD: Heat Flow
- Following Laplace's instructions we have by now learned how to simulate ideal gases, systems composed of harmonic oscillators, and many-particle systems with WCA- and LJ-interactions. And we have seen that isolated many-particle systems evolve to equilibrium states, whose macroscopic properties are time-independent.
- But what happens, when we allow such systems to exchange energy?
- Lecture: A little review in the light of what you will have learned at this point:
- Classical Mechanics
- Collisions and conservation laws, Newton's, Lagrange's and Hamilton's mechanics, Noether's theorem: symmetries and conservation laws, Laplace's "instructions": give up, because we cannot predict the exact time evolution of all microscopic degrees of freedom?
- Thermodynamics
- Equilibrium states and equilibration, state variables, the basic problem of thermodynamics, entropy, thermodynamic potentials, the nature of the predictions made by thermodynamics
- Statistical Mechanics
- Phase space, trajectories, phase space densities and the link between the microscopic and the macroscopic view, entropy, the ensembles of statistical mechanics, equilibration and H-theorem
- Simple models for interacting systems
- Lattice gas, Lennard Jones particles, Ising spin model
- Classical Mechanics
- TD: Heat Flow
- Exact Enumeration and Monte Carlo Simulations
- Up this point we will have followed Laplace's instructions and carried out computer simulations, where we solve Newton's equations of motion for small model systems. But having discovered Gibb's formalism for calculating ensemble averages over phase space, a new question arises: can't we use a computer to calculate these averages for us numerically?
- TD: Exact Enumeration of the 2d Ising Model
- A classic example for the evaluation by hand of a partition functions and of an expectation value in the canonical ensemble is the behavior of a single spin in an external field.
- In this exercise we explore, how much farther we can go by numerically evaluating the partition function of 2d Ising models.
- Representations of Ising states (binary numbers vs matrices)
- Calculating observables
- Ising order parameters
- Enumerating all microstates of the 3x3 and the 4x4 Ising model
- Calculating EXACT equations of state
- Lecture:
- Instead of generating ALL possible microstates, it might be enough to generate representative samples. This is the idea behind Monte Carlo Simulations, which allow to calculate integrals over the high-dimensional phase or configuration spaces of Statistical Mechanics.
- After a brief discussion of Random or Simple Sampling, the lecture focuses on the Metropolis et al. Dynamic Monte Carlo method for Importance Sampling
- TD: Metropolis Monte Carlo Simulations of the Ising Model
- Use MC simulations to explore the behavior of the Ising model for different combinations of the reduced field and coupling strength (h,k).
- Explore
- the effect of increasing the external field in the absence of internal couplings
- the effect of increasing the internal coupling in the absence of an external field
- the effect of antiferromagnetic couplings k<0
- the effect of an additional magnetic field
- different initial conditions
- Learn about equilibrating simulations and assembling data.
- Calculating free energies
- Lecture: Thermodynamic integration
- Metropolis importance sampling and Molecular Dynamics simulations allow to measure averages of "mechanical observables," whose values are defined for individual microstates. However they provide no direct access to the equally important "thermodynamic observables” like the entropy or free energies, which are related to the absolute size of phase space.
- There is nothing strange about this inability of simulators, experimentalists do not dispose of free-energy-o-meters or entropy-o-meters either. Instead we all determine free energy DIFFERENCES via thermodynamic integration of measurable(!) derivatives of the free energy.
- Kirkwood coupling parameter scheme
- Lecture: Thermodynamic integration
Rapport résumant les results obtenus dans les exercises.
- Frenkel and Smit, Understanding Molecular Simulation
- Allen and Tildesley, Computer Simulation of Liquids
- Landau and Binder, A Guide to Monte Carlo Simulations in Statistical Physics
- Krauth, Algorithms and Computations
Research in complex systems
Sarah Franceschelli
S. Franceschelli
P. Borgnat
When is a model a good model?
-> Epistemological perspectives on mathematical modellingHow tools are changing science; Anthropology and epistemology of technics of the intellect
Panorama of Research in Complex Systems, and a bit of history
Methods in complex systems
Nicolas Garnier (Laboratoire de Physique, ENS de Lyon)
N. Garnier
T. Nguyen-Huu
Physique statistique. Connaissances de niveau M1 en probabilité, fonctions aléatoires, statistiques.
Le module discutera de l'étude et de la modélisation des systèmes complexes à travers plusieurs variantes générales d'approches permettant leur analyse, leur description et leur modélisation :
1) Les approches par systèmes dynamiques, potentiellement multi-dimensionnels, linéaires ou non-linéaires, régis par des EDO ou des EDP (exemple : les processus épidémiologiques par des modèles compartimentaux, les modèles de dynamique des populations,...)
2) Les méthodes de description statistique de phénomènes, soit en temps que processus dynamiques tels que des marches aléatoires, les différents types de diffusion, les processus de transmission d'information (gossip, consensus, percolation,...).
3) La théorie de l'information qui perlmet de quantifier l'innovation ou l'incertitude dans des mesures, des relations entre différentes observations, et ses liens avec la physique statistique
4) Les approches multi-agents des phénomènes complexes.
L'objectif est de se familiariser sur les outils et modèles employés pour décrire des phénomènes complexes, et d'apprendre les méthodes formalisées pour cela.
Ecrit et projet.
Complex Networks
Remy Cazabet (associate professor at Sorbonne Université, Paris; on Leave from LIRIS, Université Lyon 1)
Pierre Borgnat (CNRS, LP ENSL)
Alexandre Nicolas (CNRS, ILM)
Remy Cazabet (associate professor at Sorbonne Université, Paris; on Leave from LIRIS, Université Lyon 1)
Pierre Borgnat (CNRS, LP ENSL)
Alexandre Nicolas (CNRS, ILM)
The class covers two main parts
A) Fundamentals of Network Science -- static properties of graphs (Rémy Cazabet and Pierre Borgnat)
- Classic random graph models
- Definition and use of centrality metrics
- Small-world phenomenon
- Etc.
B) Dynamic processes on networks (Alexandre Nicolas)
- Microscopic rules on the network: from physical interactions to individual decisions
- Theoretical approaches on simple networks: mean-field approach, percolation, etc.
- Flow networks: notion of capacity constraint, user vs. system equilibrium, basics of game theory
- Stochastic dynamics on networks: transition matrix, equation of evolution, mixing time, spectral properties
The course is composed of 24h of lectures, and 6 hours of tutorial (TP).
Fundamentals in computer science
Stephan Thomassé
Introduction aux graphes, théorie du calcul et applications aux automates cellulaires, complexité informatique.
Ecrit
Machine Learning
Pierre Borgnat (CNRS, LPENSL), Kinan Abbas (ENSL, LPENSL)
P. Borgnat ; K. Abbas
Introduction niveau M1 au traitement du signal
These lectures will cover modern techniques in the domain of Machine Learning, giving a glimpse into the current and actual techniques of ML and AI. It will be organised in three parts:
A modern vision about what is Machine Learning, covering topics including CNN, Deep Learning, general view of Representation Learning, how to train a model, how to leverage advances optimisation for that, and how to use (and split) data in a robust way. The students are supposed to be familiar with classical Machine Learning.
A specific part on data over networks or graphs, currently a very active research domain, and we will discuss differents versions of ML on graphs that emerged during the recent years (especially the GNNs and the message-passing framework)
Representation learning with VAE, GAN and a glimpse into transformer architectures.
Ecrit et Projet
Data analysis and modeling
Adrien Meynard (ENSL, LPENSL) ; Giuseppe Petrillo (CNRS, LPENSL et IXXI)
Adrien Meynard ; Giuseppe Petrillo
Introduction to Signal processing at M1 level.
The formation will cover advanced data analysis and modeling methods. Real-world data are more and more of a nature which escapes the simple hypotheses of low-dimensional, stationary and/or Gaussian data. They are most often multivariate, multi-dimensional, multi-scale, evolving, on sparse support (e.g. point processes), and/or involve relational properties in addition to attributes, features or labels. The lectures will cover methods to analyse and model these types of complex data. It relies on techniques coming from statistics, physics, signal processing, machine learning, spectral analysis,... They can be useful to many real-world data, including out-of-equilibrium and evolving settings, real-world sensors, acoustic data, complex data such as biological data, epidemics, earthquakes, social data or networks, technological networks (sensors, telecommunications, or transports),...
Projet et Rapport
Modeling in Biology and Medecine
Benjamin Audit
B. Audit
L. Pujo-Menjouet
O. Gandrillon
Ce cours introduit les étudiants à la modélisation en médecine et biologie, par des exempes et des méthodes. La modélisation des systèmes biologiques ou en médecine seront abordée à travers des modèles mathématiques, physiques, statistiques ou par de la simulation. Le but est d'initier concrètement les étudiants à la simulation et de les aider à comprendre sur des cas concrets les approches et les enjeux de la modélisation dans ce domaine.
Ecrit et projet
Modeling of social systems
Pablo Jensen
Ces dernières années, la modélisation des systèmes sociaux a connu une forte expansion. Le nombre de publications a été multiplié par dix en cinq ans. Les raisons sont multiples, allant de l'importance des applications possibles, la disponibilité de plus en plus grande de données numérisées (localisations, Internet, publications, téléphones portables, vélov ...) ainsi que la puissance des ordinateurs et outils mathématiques pour analyser les grandes bases de données.
Après un historique du domaine, ce cours présentera des exemples de modèles simplifiés, des sociétés virtuelles faciles à analyser:
- Schelling et la ségrégation raciale;
- Modèles d'interaction sociale entre individus à la Ising;
- Modèles multi-agents: marchés immobiliers, trafic automobile, piétons.
Il présentera ensuite des exemples de traitements de données réelles, à l'aide d'outils récents comme les réseaux.
En conclusion, le cours aborde l'épistémologie des sciences sociales, la difficulté de leur modélisation, en introduisant la notion de capacité proposée par la philosophe britannique Nancy Cartwright.
écrit
Stage de recherche de 6 mois Physique
Le stage de recherche dure au minimum 24 semaines de début février à fin juillet.
Un projet de stage devra être déposé par chaque étudiant.e avant le 15 décembre.
Soutenances des stages : début septembre
Rapport écrit et soutenance orale
Stage de recherche en chimie
Matthias PAULY
Ce stage, qui dure tout le semestre (24 semaines), permet d'acquérir une vraie expérience en laboratoire de recherche. L'étudiant·e choisira librement son sujet et son laboratoire d'accueil, en France ou à l’étranger, avec l'accord des responsables de formation.
- Mener en laboratoire un projet de recherche individuel sur un temps "long"
- Mettre en œuvre un protocole de recherche, de sa conception à la rédaction d'un rapport
- Acquérir une expérience de recherche sur un format préparant à la thèse
- Apprendre à communiquer ses résultats avec rigueur, devant un public expert
- Débattre de ces résultats
Stage de 24 semaines à effectuer entre début janvier et mi-juillet dans le domaine de la recherche en chimie, dans un laboratoire académique (sauf cas particulier, tels que les Doubles Diplômes EPFL/Centrale/Polimi). Le sujet pourra avantageusement être dans la continuité du rapport bibliographique.
Rapport écrit + soutenance orale. Un jury est composé spécifiquement pour chaque stage en invitant deux membres experts du sujet.
