Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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| en:documentation:tutorials:submit:jobsequentielbash [2018/10/04 17:08] – [for sequential programs (shell bash)] cicaluga | en:documentation:tutorials:submit:jobsequentielbash [2020/05/13 14:58] – fleroux | ||
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| - | The batch system currently used at the PSMN is Sun Grid Engine (SGE). Its documentation is [[documentation: | + | The batch system currently used at the PSMN is Sun Grid Engine (SGE). Its documentation is [[documentation: |
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| - | Travailler dans le /scratch | + | Work in the |
| + | <code bash script_seq> | ||
| #!/bin/bash | #!/bin/bash | ||
| # | # | ||
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| cd ${SGE_O_WORKDIR} | cd ${SGE_O_WORKDIR} | ||
| ### configurer l' | ### configurer l' | ||
| - | + | ||
| module load GCC/ | module load GCC/ | ||
| - | + | ||
| ### definition SCRATCHDIR | ### definition SCRATCHDIR | ||
| SCRATCHDIR=/ | SCRATCHDIR=/ | ||
| ### verif SCRATCHDIR | ### verif SCRATCHDIR | ||
| echo " | echo " | ||
| - | + | ||
| ### creation du repertoire de travail dans le /scratch | ### creation du repertoire de travail dans le /scratch | ||
| if [[ ! -d " | if [[ ! -d " | ||
| Ligne 97: | Ligne 98: | ||
| / | / | ||
| fi | fi | ||
| - | + | ||
| ### copie des fichiers sources dans le /scratch | ### copie des fichiers sources dans le /scratch | ||
| /bin/cp ${SGE_O_WORKDIR}/ | /bin/cp ${SGE_O_WORKDIR}/ | ||
| Ligne 116: | Ligne 117: | ||
| # fin | # fin | ||
| + | </ | ||
| ====== Surveiller un job ====== | ====== Surveiller un job ====== | ||
| Voir [[documentation: | Voir [[documentation: | ||