Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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| documentation:examples:tutorials_scripts [2015/02/23 13:03] – [Script de soumission tcsh] ltaulell | documentation:examples:tutorials_scripts [2018/01/08 15:11] – [Script de soumission bash] ltaulell | ||
|---|---|---|---|
| Ligne 29: | Ligne 29: | ||
| #$ -V | #$ -V | ||
| ### mails en debut et fin d' | ### mails en debut et fin d' | ||
| - | #$ -m be | + | #$ -m b |
| + | #$ -m e | ||
| # aller dans le repertoire de travail/ | # aller dans le repertoire de travail/ | ||
| Ligne 36: | Ligne 37: | ||
| ### configurer l' | ### configurer l' | ||
| - | source /usr/local/modeles/set_debian7-clean.csh | + | source /usr/share/lmod/lmod/init/tcsh |
| - | source / | + | |
| - | module use / | + | |
| - | module load Base/psmn | + | |
| - | module load intel/ | + | |
| ### execution du programme | ### execution du programme | ||
| - | ###set EXECDIR=${HOME}/ | + | ##set EXECDIR=${HOME}/ |
| - | ### | + | ## |
| ./ | ./ | ||
| + | |||
| # fin | # fin | ||
| </ | </ | ||
| Ligne 57: | Ligne 55: | ||
| # | # | ||
| ### variables SGE | ### variables SGE | ||
| - | # | ||
| ### shell du job | ### shell du job | ||
| #$ -S /bin/bash | #$ -S /bin/bash | ||
| Ligne 69: | Ligne 66: | ||
| #$ -V | #$ -V | ||
| ### mails en debut et fin d' | ### mails en debut et fin d' | ||
| - | #$ -m be | + | #$ -m b |
| + | #$ -m e | ||
| # aller dans le repertoire de travail/ | # aller dans le repertoire de travail/ | ||
| Ligne 76: | Ligne 74: | ||
| ### configurer l' | ### configurer l' | ||
| - | source /usr/local/modeles/set_debian7-clean.sh | + | source /usr/share/lmod/lmod/init/bash |
| - | source / | + | |
| - | module use / | + | |
| - | module load Base/psmn | + | |
| - | module load intel/ | + | |
| ### execution du programme | ### execution du programme | ||
| ## | ## | ||
| ## | ## | ||
| - | ./ | + | ./ |
| # fin | # fin | ||
| </ | </ | ||
| Ligne 99: | Ligne 94: | ||
| # | # | ||
| ### variables SGE | ### variables SGE | ||
| - | # | ||
| ### shell du job | ### shell du job | ||
| #$ -S /bin/tcsh | #$ -S /bin/tcsh | ||
| Ligne 123: | Ligne 117: | ||
| ### configurer l' | ### configurer l' | ||
| - | source / | ||
| source / | source / | ||
| module use / | module use / | ||
| Ligne 136: | Ligne 129: | ||
| ### execution du programme | ### execution du programme | ||
| + | ###set EXECDIR=${HOME}/ | ||
| ##${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ##${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ||
| mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | ||
| Ligne 148: | Ligne 142: | ||
| # | # | ||
| ### variables SGE | ### variables SGE | ||
| - | # | ||
| ### shell du job | ### shell du job | ||
| #$ -S /bin/tcsh | #$ -S /bin/tcsh | ||
| Ligne 172: | Ligne 165: | ||
| ### configurer l' | ### configurer l' | ||
| + | source / | ||
| source / | source / | ||
| Ligne 178: | Ligne 172: | ||
| ### execution du programme | ### execution du programme | ||
| + | set EXECDIR=${HOME}/ | ||
| ${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ||
| #mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | #mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | ||
| Ligne 183: | Ligne 178: | ||
| # fin | # fin | ||
| </ | </ | ||
| - | |||
| ==== Script de soumission bash parallèle ==== | ==== Script de soumission bash parallèle ==== | ||
| Ligne 192: | Ligne 186: | ||
| # | # | ||
| ### variables SGE | ### variables SGE | ||
| - | # | ||
| ### shell du job | ### shell du job | ||
| #$ -S /bin/bash | #$ -S /bin/bash | ||
| Ligne 216: | Ligne 209: | ||
| ### configurer l' | ### configurer l' | ||
| - | source / | ||
| source / | source / | ||
| module use / | module use / | ||
| Ligne 228: | Ligne 220: | ||
| ### execution du programme | ### execution du programme | ||
| + | ### | ||
| ##${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ##${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ||
| mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | ||
| Ligne 233: | Ligne 226: | ||
| # fin | # fin | ||
| </ | </ | ||
| - | |||
| ===== Langage C, Séquentiel ===== | ===== Langage C, Séquentiel ===== | ||
| Ligne 245: | Ligne 237: | ||
| # | # | ||
| ### variables SGE | ### variables SGE | ||
| - | # | ||
| ### shell du job | ### shell du job | ||
| #$ -S /bin/tcsh | #$ -S /bin/tcsh | ||
| Ligne 264: | Ligne 255: | ||
| ### configurer l' | ### configurer l' | ||
| - | source / | ||
| source / | source / | ||
| module use / | module use / | ||
| Ligne 271: | Ligne 261: | ||
| ### execution du programme | ### execution du programme | ||
| - | ###set EXECDIR=${HOME}/ | + | ##set EXECDIR=${HOME}/ |
| - | ### | + | ## |
| ./ | ./ | ||
| + | |||
| # fin | # fin | ||
| </ | </ | ||
| Ligne 285: | Ligne 276: | ||
| # | # | ||
| ### variables SGE | ### variables SGE | ||
| - | # | ||
| ### shell du job | ### shell du job | ||
| #$ -S /bin/bash | #$ -S /bin/bash | ||
| Ligne 304: | Ligne 294: | ||
| ### configurer l' | ### configurer l' | ||
| - | source / | ||
| source / | source / | ||
| module use / | module use / | ||
| Ligne 313: | Ligne 302: | ||
| ## | ## | ||
| ## | ## | ||
| - | ./ | + | ./ |
| # fin | # fin | ||
| </ | </ | ||
| Ligne 351: | Ligne 341: | ||
| ### configurer l' | ### configurer l' | ||
| - | source / | ||
| source / | source / | ||
| module use / | module use / | ||
| Ligne 364: | Ligne 353: | ||
| ### execution du programme | ### execution du programme | ||
| + | ##set EXECDIR=${HOME}/ | ||
| ##${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ##${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ||
| mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | ||
| Ligne 369: | Ligne 359: | ||
| # fin | # fin | ||
| </ | </ | ||
| - | |||
| ==== Script de soumission bash parallèle ==== | ==== Script de soumission bash parallèle ==== | ||
| Ligne 402: | Ligne 391: | ||
| ### configurer l' | ### configurer l' | ||
| - | source / | ||
| source / | source / | ||
| module use / | module use / | ||
| Ligne 414: | Ligne 402: | ||
| ### execution du programme | ### execution du programme | ||
| + | ## | ||
| ##${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ##${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ||
| mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | ||
| Ligne 419: | Ligne 408: | ||
| # fin | # fin | ||
| </ | </ | ||
| - | |||