Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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documentation:examples:tutorials_scripts [2015/02/23 13:05] – [Script de soumission tcsh] ltaulell | documentation:examples:tutorials_scripts [2018/01/08 15:11] – [Script de soumission bash] ltaulell | ||
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Ligne 29: | Ligne 29: | ||
#$ -V | #$ -V | ||
### mails en debut et fin d' | ### mails en debut et fin d' | ||
- | #$ -m be | + | #$ -m b |
+ | #$ -m e | ||
# aller dans le repertoire de travail/ | # aller dans le repertoire de travail/ | ||
Ligne 36: | Ligne 37: | ||
### configurer l' | ### configurer l' | ||
- | source /usr/local/modeles/set_debian7-clean.csh | + | source /usr/share/lmod/lmod/init/tcsh |
- | source / | + | |
- | module use / | + | |
- | module load Base/psmn | + | |
- | module load intel/ | + | |
### execution du programme | ### execution du programme | ||
Ligne 69: | Ligne 66: | ||
#$ -V | #$ -V | ||
### mails en debut et fin d' | ### mails en debut et fin d' | ||
- | #$ -m be | + | #$ -m b |
+ | #$ -m e | ||
# aller dans le repertoire de travail/ | # aller dans le repertoire de travail/ | ||
Ligne 76: | Ligne 74: | ||
### configurer l' | ### configurer l' | ||
- | source /usr/local/modeles/set_debian7-clean.sh | + | source /usr/share/lmod/lmod/init/bash |
- | source / | + | |
- | module use / | + | |
- | module load Base/psmn | + | |
- | module load intel/ | + | |
### execution du programme | ### execution du programme | ||
Ligne 123: | Ligne 117: | ||
### configurer l' | ### configurer l' | ||
- | source / | ||
source / | source / | ||
module use / | module use / | ||
Ligne 136: | Ligne 129: | ||
### execution du programme | ### execution du programme | ||
+ | ###set EXECDIR=${HOME}/ | ||
##${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ##${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ||
mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | ||
Ligne 171: | Ligne 165: | ||
### configurer l' | ### configurer l' | ||
+ | source / | ||
source / | source / | ||
Ligne 177: | Ligne 172: | ||
### execution du programme | ### execution du programme | ||
+ | set EXECDIR=${HOME}/ | ||
${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ||
#mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | #mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | ||
Ligne 182: | Ligne 178: | ||
# fin | # fin | ||
</ | </ | ||
- | |||
==== Script de soumission bash parallèle ==== | ==== Script de soumission bash parallèle ==== | ||
Ligne 214: | Ligne 209: | ||
### configurer l' | ### configurer l' | ||
- | source / | ||
source / | source / | ||
module use / | module use / | ||
Ligne 226: | Ligne 220: | ||
### execution du programme | ### execution du programme | ||
+ | ### | ||
##${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ##${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ||
mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | ||
Ligne 231: | Ligne 226: | ||
# fin | # fin | ||
</ | </ | ||
- | |||
===== Langage C, Séquentiel ===== | ===== Langage C, Séquentiel ===== | ||
Ligne 261: | Ligne 255: | ||
### configurer l' | ### configurer l' | ||
- | source / | ||
source / | source / | ||
module use / | module use / | ||
Ligne 283: | Ligne 276: | ||
# | # | ||
### variables SGE | ### variables SGE | ||
- | # | ||
### shell du job | ### shell du job | ||
#$ -S /bin/bash | #$ -S /bin/bash | ||
Ligne 302: | Ligne 294: | ||
### configurer l' | ### configurer l' | ||
- | source / | ||
source / | source / | ||
module use / | module use / | ||
Ligne 311: | Ligne 302: | ||
## | ## | ||
## | ## | ||
- | ./ | + | ./ |
# fin | # fin | ||
</ | </ | ||
Ligne 349: | Ligne 341: | ||
### configurer l' | ### configurer l' | ||
- | source / | ||
source / | source / | ||
module use / | module use / | ||
Ligne 362: | Ligne 353: | ||
### execution du programme | ### execution du programme | ||
+ | ##set EXECDIR=${HOME}/ | ||
##${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ##${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ||
mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | ||
Ligne 367: | Ligne 359: | ||
# fin | # fin | ||
</ | </ | ||
- | |||
==== Script de soumission bash parallèle ==== | ==== Script de soumission bash parallèle ==== | ||
Ligne 400: | Ligne 391: | ||
### configurer l' | ### configurer l' | ||
- | source / | ||
source / | source / | ||
module use / | module use / | ||
Ligne 412: | Ligne 402: | ||
### execution du programme | ### execution du programme | ||
+ | ## | ||
##${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ##${MPIRUN} -v -prefix ${PREFIX} -mca btl sm, | ||
mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | mpirun -v -np ${NSLOTS} ./ | ||
Ligne 417: | Ligne 408: | ||
# fin | # fin | ||
</ | </ | ||
- |