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- | Le système de batch actuellement utilisé par le PSMN est Sun Grid Engine (SGE). Sa documentation se trouve [[documentation: | + | Le système de batch actuellement utilisé par le PSMN est Sun Grid Engine (SGE). Sa documentation se trouve [[documentation: |
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<code bash> | <code bash> | ||
- | qsub script_soumission <input >output | + | qsub script_paralelle |
</ | </ | ||
Ligne 20: | Ligne 20: | ||
<note warning> | <note warning> | ||
- | D' | + | |
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#$ -V | #$ -V | ||
### mails en debut et fin d' | ### mails en debut et fin d' | ||
- | #$ -m be | + | #$ -m b |
+ | #$ -m e | ||
# donné par le système de batch | # donné par le système de batch | ||
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### configurer l' | ### configurer l' | ||
- | module | + | module |
- | module load intel/2017.4/ | + | module load GCC/7.2.0/ |
### au besoin, forcer l'env OpenMPI | ### au besoin, forcer l'env OpenMPI | ||
- | PREFIX="/ | + | PREFIX="/ |
MPIRUN=${PREFIX}/ | MPIRUN=${PREFIX}/ | ||
### execution du programme | ### execution du programme | ||
- | ### | + | |
- | ### | + | ### |
- | #mpirun -v -np ${NSLOTS} ${EXECDIR}/ | + | |
- | ${MPIRUN} -v -prefix | + | $MPIRUN -v -x LD_LIBRARY_PATH -hostfile |
# fin | # fin |