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Biologie physique de la Chromatine - D. Jost
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En lien étroit avec les expériences, notre recherche aborde des questions biologiques génériques ou spécifiques sur la chromatine et la régulation des gènes en développant des modèles physiques et computationnels. Plus particulièrement, nous nous intéressons à la dynamique spatio-temporelle des chromosomes eucaryotes. Notre recherche aborde des questions importantes concernant le couplage entre l'organisation 3D et les fonctions de la chromatine. Notre objectif est de fournir des principes universels régissant le repliement et la régulation de la chromatine, tout en appliquant nos approches à des problèmes spécifiques et fondamentaux de la génomique 3D.
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Chromatin Dynamics in Mitotic Chromosome Assembly - P. Bernard
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The ability of the genome to adopt a dynamic 3D organisation underlies most DNA transactions. The profound reorganisation of long chromatin fibres into rod-shaped chromosomes in mitosis is an iconic example of this structural dynamics.The main goal of our research is to understand the cellular mechanisms that take place at the chromatin level for the assembly of segregation-competent mitotic chromosomes. We use the fission yeast Schizosaccharomyces pombe and human cultured cells as model systems.
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Comparative and Integrative Genomics of Organ Development - S.Pantalacci/M. Semon
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We compare genomes and transcriptomes to highlight general rules about the development and/or the evolution of organs.
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Complexité Génétique des Systèmes Vivants - G. Yvert
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Notre équipe étudie les mécanismes génétiques fondamentaux responsables des différences observables entre individus de la même espèce. L'enjeu est de mieux comprendre pourquoi certains individus sont plus disposés que d'autres à développer certains phénotypes.
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Evolution des Processus Cellulaires chez les Nématodes - M. Delattre
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We investigate unconventional modes of DNA transmission and genome regulation, exploring their evolutionary origins and consequences. Our primary focus is on nematode species that are lab tractable, enabling integration of bioinformatic and experimental methodologies
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Métabolisme des ARNs au cours de la réponse immunitaire et de l’infection - E. Ricci
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We are interested in post-transcriptional control mechanisms that regulate gene expression in cells of the immune system and during pathogen infections. Through the use of high-throughput sequencing and biochemical approaches we aim at identifying new regulatory layers that govern immune cell activation and host-pathogen interactions.
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Comparative and Integrative Genomics of Organ Development - CIGOGNE - S.Pantalacci/M. Sémon
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Quantitative regulatory genomics - M. Francesconi
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Why are individuals different? We address this fundamental question by studying both genetic and non-genetic sources of phenotypic variation, using both genome-wide computational and experimental systems biology approaches in model organisms. In particular, we are interested in understanding how gene expression is regulated in space and time and how perception of ancestral environment contribute to phenotypic variation.
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Quantitative regulatory genomics - M. Francesconi
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Pourquoi les individus sont-ils différents ? Nous abordons cette question fondamentale en étudiant les sources génétiques et non génétiques de variation phénotypique, à l'aide d'approches de biologie des systèmes de calcul et d'expérimentation à l'échelle du génome dans des organismes modèles. En particulier, nous voulons comprendre comment l'expression des gènes est régulée dans l'espace et dans le temps pour contribuer à la variation phénotypique.
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Regulation of Genome Architecture and Dynamics of Splicing (ReGArDS) - D. Auboeuf / C. Bourgeois
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