Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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documentation:tools:sge [2017/12/27 15:06] – [Accounting] ltaulell | documentation:tools:sge [2020/08/25 15:58] – modification externe 127.0.0.1 | ||
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====== GridEngine ====== | ====== GridEngine ====== | ||
- | |||
- | {{INLINETOC}} | ||
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est appliqué par GridEngine. Ceci afin de répartir plus équitablement les ressources disponibles. | est appliqué par GridEngine. Ceci afin de répartir plus équitablement les ressources disponibles. | ||
- | ===== SGE : Soumettre un job ===== | + | ===== GridEngine |
< | < | ||
Ligne 37: | Ligne 35: | ||
<code bash> | <code bash> | ||
- | qsub -V -m b -m e -e / | + | qsub -V -e / |
-V : export environment variables | -V : export environment variables | ||
- | -m b : mail @begin | ||
- | -m e : mail @end | ||
-e : where to put error files | -e : where to put error files | ||
-o : where to put output files | -o : where to put output files | ||
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</ | </ | ||
- | **Il est plus simple de soumettre un script à SGE, qui contiendra plus d' | + | **Il est plus simple de soumettre un script à GridEngine, qui contiendra plus d' |
+ | |||
+ | <note important> | ||
+ | |||
+ | Voir [[documentation: | ||
==== Comment choisir les files d' | ==== Comment choisir les files d' | ||
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Et bien sur, pour la mise au point du code, il faut choisir une file d' | Et bien sur, pour la mise au point du code, il faut choisir une file d' | ||
- | ===== SGE : Les autres commandes utiles ===== | + | ===== GridEngine |
==== Surveiller les jobs ==== | ==== Surveiller les jobs ==== | ||
Ligne 69: | Ligne 69: | ||
< | < | ||
- | * Voir l' | + | * Voir l' |
< | < | ||
+ | |||
+ | * Voir l' | ||
+ | |||
+ | < | ||
* Voir tous les jobs de tous les utilisateurs en exécution (running) : | * Voir tous les jobs de tous les utilisateurs en exécution (running) : | ||
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< | < | ||
- | * Voir toutes les queues : | ||
- | |||
- | < | ||
- | |||
- | (sql : show queues list) | ||
- | |||
- | * Voir l' | ||
- | |||
- | < | ||
- | |||
- | * Voir l' | ||
- | |||
- | < | ||
* Voir l' | * Voir l' | ||
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< | < | ||
- | * Enlever (clear) l' | ||
- | |||
- | < | ||
* Voir les informations d'un job après son achévement (long) : | * Voir les informations d'un job après son achévement (long) : | ||
- | < | + | < |
* Supprimer un job : | * Supprimer un job : | ||
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< | < | ||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | < | ||
+ | Ces commandes ne fonctionnent plus depuis la migration 2018! | ||
+ | |||
+ | * < | ||
+ | |||
+ | < | ||
+ | |||
+ | * < | ||
+ | |||
+ | < | ||
+ | |||
+ | * Voir l' | ||
+ | |||
+ | < | ||
+ | |||
+ | * < | ||
+ | |||
+ | < | ||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | </ | ||
==== Accounting ==== | ==== Accounting ==== | ||
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< | < | ||
- | |||
- | ==== Divers ==== | ||
- | |||
- | * lister les noeuds d'une queue | ||
- | * Show Queue | ||
- | < | ||
- | qconf -sq E5-2670deb64A | ||
- | </ | ||
- | | ||
- | * Show Group | ||
- | < | ||
- | qconf -shgrp @EquipatMeso64A | ||
- | </ | ||
==== Jobs qui ont des problèmes : ==== | ==== Jobs qui ont des problèmes : ==== | ||
Ligne 191: | Ligne 191: | ||
* w(aiting). | * w(aiting). | ||
- | ===== SGE : Variables d' | + | ===== GridEngine |
- | <note important>''# | + | <note important>''# |
* SGE_O_WORKDIR : répertoire d'où à été soumis le job, utilisable dans les scripts | * SGE_O_WORKDIR : répertoire d'où à été soumis le job, utilisable dans les scripts | ||
* NSLOTS : nombre de coeurs demandé | * NSLOTS : nombre de coeurs demandé | ||
- | * JOB_ID : ID du job (unique) assigné par SGE | + | * JOB_ID : ID du job (unique) assigné par GridEngine |
* JOB_NAME : nom du job (-N) | * JOB_NAME : nom du job (-N) | ||
* PE_HOSTFILE : fichier de hosts | * PE_HOSTFILE : fichier de hosts | ||
- | |||
- | ==== Refs ==== | ||
- | |||
- | * http:// | ||
- | * https:// | ||
- | * http:// | ||
===== Références : ===== | ===== Références : ===== | ||
Ligne 221: | Ligne 215: | ||
* http:// | * http:// | ||
* https:// | * https:// | ||
+ | * http:// | ||
+ |