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faq:execution [2015/09/30 09:05] – [Error for job [...] execvp()] ltaulellfaq:execution [2018/01/24 10:09] – [Error for job [...] execvp()] ltaulell
Ligne 1: Ligne 1:
 ====== Erreurs à l'execution ====== ====== Erreurs à l'execution ======
  
-===== cannot open shared object file ===== 
  
-Le programme ne trouve pas certains fichiers ou bibliothèques 
  
-<code> 
-mpirun: error while loading shared libraries: libimf.so: cannot open shared object file: No such file or directory 
-</code> 
  
-<code> +===== Erreur dans le log "moduleline 1: syntax error" =====
-orted: error while loading shared libraries: libirng.so: cannot open shared object file: No such file or directory +
-</code>+
  
-**Vérifiez votre environnement** (~/.cshrc[[faq:modules|modules]], etc) de compilation et d'execution (ex: vasp.j) Ils doivent correspondre. +Si vous obtenezdans les premières lignes du log d'un job en cours de run les erreurs suivantes :
- +
-===== mpirun process exited on signal 10 =====+
  
 <code> <code>
-mpirun noticed that process rank 13 with PID 50067 on node c8220node202.ens-lyon.fr exited on signal 10 (User defined signal 1).+/bin/bash: module: line 1: syntax error: unexpected end of file 
 +/bin/bash: error importing function definition for `BASH_FUNC_module'
 </code> </code>
  
-''Signal 10 = Walltime atteint'' Le job a été lancé sur une file d'attente courte (E5-2670deb64h3 = 3 heures, E5-2670deb64d3 = 3 jours)+**Vous pouvez les ignorer, il s'agit juste d'un warning** (boucle shell bloquée suite à la faille de sécurité ShellShock).
  
-===== Error for job [...] execvp() ===== 
- 
-Votre job plante trés vite, avec ce message d'erreur : 
- 
-<code> 
-Error for job $JOB_ID: [...] execvp(/sge_spool/node/job_scripts/$JOB_ID, [...] failed: No such file or directory 
-</code> 
- 
-**Vérifiez votre script de soumission**, il contient probablement des caractères Windows. 
- 
-  * Diagnostique : 
-<code> 
-comp% file script.sub 
-script.sub: C shell script, ASCII text executable, with CRLF line terminators 
-</code> 
- 
-**CRLF** (Carriage Return, Line Feed) est un terminateur de ligne propre à Windows, il provoque des erreurs dans l'environnement du PSMN. 
- 
-  * Résolution : 
-<code> 
-comp% dos2unix script.sub 
-converting script.sub to Unix format ... 
-</code> 
- 
-  * Vérification : 
-<code> 
-comp% file script.sub 
-script.sub: C shell script, ASCII text executable 
-</code> 
  
-Ref: http://comments.gmane.org/gmane.comp.clustering.gridengine.users/20753