Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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| documentation:tools:software:abinit [2020/06/17 10:08] – [Script de soumission (exemple)] cicaluga | documentation:tools:software:abinit [2025/03/12 14:14] (Version actuelle) – supprimée ltaulell | ||
|---|---|---|---|
| Ligne 1: | Ligne 1: | ||
| - | ====== Abinit ====== | ||
| - | |||
| - | * ABINIT is a software suite to calculate the optical, mechanical, vibrational, | ||
| - | |||
| - | ^ Version | ||
| - | |||
| - | | 8.6.3 | openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6 | ||
| - | | 8.6.3 | openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6-mkl-2017.4 | ||
| - | | 8.10.3 | ||
| - | |||
| - | |||
| - | |||
| - | Pour utiliser les modulefiles, | ||
| - | ===== Site officiel ===== | ||
| - | |||
| - | * http:// | ||
| - | |||
| - | ====== Script de soumission (exemple) ====== | ||
| - | |||
| - | * Pour les files d' | ||
| - | |||
| - | '' | ||
| - | |||
| - | <code bash parexemple.sh> | ||
| - | #!/bin/bash | ||
| - | ### shell du job: | ||
| - | #$ -S /bin/bash | ||
| - | ### nom du job: | ||
| - | #$ -N pouet | ||
| - | ### files d' | ||
| - | #$ -q E5-2670deb64Z | ||
| - | ### parallel environnement & nslots | ||
| - | #$ -pe mpi16_debian 48 | ||
| - | ### charge l' | ||
| - | #$ -cwd | ||
| - | ### exporte les variables d' | ||
| - | #$ -V | ||
| - | |||
| - | HOMEDIR=$SGE_O_WORKDIR | ||
| - | |||
| - | ## charge l'env | ||
| - | source / | ||
| - | module use / | ||
| - | module load Base/psmn | ||
| - | module load Abinit/ | ||
| - | |||
| - | HOSTFILE=$TMPDIR/ | ||
| - | |||
| - | cd $HOMEDIR | ||
| - | |||
| - | mpirun -np $NSLOTS -hostfile $HOSTFILE abinit-mpi < in.file > out.log | ||
| - | |||
| - | </ | ||