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documentation:tools:software:breseq [2018/01/30 09:45] – [breseq] cpetitdocumentation:tools:software:breseq [2025/03/12 14:17] (Version actuelle) – supprimée ltaulell
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-====== breseq ====== 
- 
-  * a computational pipeline for finding mutations relative to a reference sequence in short-read DNA re-sequencing data for haploid microbial-sized genomes.  
- 
-^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ 
-|  0.32.0  |  N/A  |  N/A  |  ''${APPLIS}/Core/breseq/0.32.0''  |  Debian 9  | 
-| | **modulefile** : ''breseq/0.32.0''  |||| 
- 
-Pour utiliser les modulefiles, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]] 
- 
-<code bash>APPLIS=/applis/PSMN/debian9/software</code> 
- 
- 
-==== Doc Admin-sys PSMN ==== 
- 
-  * http://barricklab.org/twiki/pub/Lab/ToolsBacterialGenomeResequencing/documentation/index.html 
- 
-Dépendances sur ''Bowtie2/2.3.3'' et ''R/3.4.3'' inclusent dans le modulefile. 
- 
- 
-===== Site officiel ===== 
- 
-  * http://barricklab.org/twiki/bin/view/Lab/ToolsBacterialGenomeResequencing 
-  * https://github.com/barricklab/breseq 
  
documentation/tools/software/breseq.1517305513.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)