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documentation:tools:software:canu [2017/01/23 11:30] ltaulelldocumentation:tools:software:canu [2025/03/12 14:18] (Version actuelle) – supprimée ltaulell
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-<note warning>**en cours d'évaluation**</note> 
- 
-====== Canu ====== 
- 
-^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ 
-|  1.4  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/Canu/1.4/Linux-amd64  |  Debian 7  | 
-| | **modulefile** : Canu/1.4  |||| 
- 
-Pour utiliser les modulefiles, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]] 
- 
-<note important>Les jobs Canu doivent **impérativement** être soumis à la file d'attente ''celera'' et utiliser le [[documentation:tutorials:scratch|scratch global]] E5</note> 
- 
-  * canu.defaults "system-wide" 
- 
-<code> 
-maxMemory=256 
-maxThreads=16 
-useGrid=remote 
-gridEngine=sge 
-gridEngineArrayMaxJobs=7500 
-gridEngineThreadsOption="-pe openmp16 16" 
-</code> 
- 
-{{INLINETOC}} 
- 
- 
-==== Doc Admin-sys PSMN ==== 
- 
-Canu est un fork de [[documentation:tools:software:celera-wgs|Celera WGS]]. 
- 
-  * https://github.com/marbl/canu 
-  * http://canu.readthedocs.io/en/stable/ 
documentation/tools/software/canu.1485171055.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)