Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- documentation:tools:software:canu [2017/03/31 06:57] – [Canu] cpetit
+++ documentation:tools:software:canu [2025/03/12 14:18] (Version actuelle) – supprimée ltaulell
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-<note warning>**en cours d'évaluation**</note>
-====== Canu ======
-  * a fork of the [[documentation:tools:software:celera-wgs|Celera Assembler]] designed for high-noise single-molecule sequencing (such as the PacBio RSII or Oxford Nanopore MinION).
-^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^
-|  1.4  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/Canu/1.4/Linux-amd64  |  Debian 7  |
-| | **modulefile** : Canu/1.4  ||||
-Pour utiliser les modulefiles, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]]
-<note important>Les jobs Canu doivent **impérativement** être soumis à la file d'attente ''celera'' et utiliser le [[documentation:tutorials:scratch|scratch global]] E5</note>
-  * canu.defaults "system-wide"
-<code>
-maxMemory = 250
-maxThreads = 16
-useGrid = remote
-gridEngine = sge
-gridEngineArrayMaxJobs = 7500
-gridEngineThreadsOption = -pe openmp16 THREADS
-gridEngineMemoryOption = -l h_vmem=MEMORY
-</code>
-{{INLINETOC}}
-==== Doc Admin-sys PSMN ====
-Canu est un fork de [[documentation:tools:software:celera-wgs|Celera WGS]].
-  * https://github.com/marbl/canu
-  * http://canu.readthedocs.io/en/stable/index.html

documentation/tools/software/canu.1490943440.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)

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