Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- documentation:tools:software:genemark [2018/01/30 13:27] – cpetit
+++ documentation:tools:software:genemark [2025/03/12 15:02] (Version actuelle) – supprimée ltaulell
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-<note warning>Prior to use, you **MUST** acquire a licence key from Georgia Institute of Technology \\
-here at http://exon.gatech.edu/license_download.cgi
-</note>
-====== GeneMark ES/ET ======
-  * eukaryotic gene finder that can perform gene prediction without curated training sets.
-^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^
-|  4.32  |  N/A  |  N/A  |  ''/applis/PSMN/generic/GeneMark/4.32/bin''  |  Debian 9  |
-| | **modulefile** : GeneMark/4.32   ||||
-Pour utiliser les modulefiles, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]]
-<note important>You **MUST** have a valid licence key located at ''~/.gm_key'' \\
-Get it from http://exon.gatech.edu/license_download.cgi
-</note>
-===== Usage on PSMN =====
-GeneMark need additionals PERL modules installable from CPAN (see [[documentation:tools:langages:perl5|Perl5]] for CPAN installation/configuration ):
-<code perl>
-cpan
-> install Hash::Merge
-> install Logger::Simple
-> install Sub::Uplevel
-> install Parallel::ForkManager
-</code>
-===== Site officiel =====
-  * http://exon.gatech.edu/GeneMark/

documentation/tools/software/genemark.1517318830.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)

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