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documentation:tools:software:hisat [2018/03/26 12:40] – [HISAT 2] cpetitdocumentation:tools:software:hisat [2025/03/12 15:02] (Version actuelle) – supprimée ltaulell
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-====== HISAT 2 ====== 
  
-  * a fast and sensitive spliced alignment program for mapping RNA-seq reads. 
- 
-^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ 
-|  2.1.0  |  GCC-7.2.0  |  N/A  |  ''${APPLIS}/MPI/GCC/7.2.0/OpenMPI/3.0.0/HISAT2/2.1.0''  |  Debian 9  | 
-| | **modulefile** : GCC/7.2.0/OpenMPI/3.0.0/HISAT2/2.1.0  |||| 
-|  2.0.5  |  gcc-6.3.0  |  N/A  |  /usr:bin  |  generic / debian 9  | 
-| | **modulefile** : aucun  |||| 
- 
- 
- 
-Pour utiliser les modulefiles, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]] 
-<code bash> 
-APPLIS=/applis/PSMN/debian9/software 
-</code> 
- 
- 
- 
-===== Site officiel ===== 
- 
-  * http://ccb.jhu.edu/software/hisat/index.shtml 
documentation/tools/software/hisat.1522068033.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)