Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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| documentation:tools:software:lammps [2016/03/07 06:28] – [LAMMPS] cicaluga | documentation:tools:software:lammps [2025/03/12 15:04] (Version actuelle) – supprimée ltaulell | ||
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| Ligne 1: | Ligne 1: | ||
| - | ====== LAMMPS ====== | ||
| - | |||
| - | ^ Version | ||
| - | | 11Nov13 | ||
| - | | | **modèle tsch** : / | ||
| - | | | **modèle bash** : / | ||
| - | | | **modulefile** : Lammps/ | ||
| - | | 28Jun14 | ||
| - | | | **modèle tsch** : / | ||
| - | | | **modèle bash** : / | ||
| - | | | **modulefile** : Lammps/ | ||
| - | | 28Jun14 | ||
| - | | | **modulefile** : Lammps/ | ||
| - | | 15May15 | ||
| - | | | **modulefile** : Lammps/ | ||
| - | | 7Dec15 | ||
| - | | | **modulefile** : Lammps/ | ||
| - | |||
| - | |||
| - | |||
| - | |||
| - | <note important> | ||
| - | |||
| - | * Chemin d' | ||
| - | |||
| - | < | ||
| - | / | ||
| - | </ | ||
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| - | * Test de fonctionnement (version 28Jun14) | ||
| - | |||
| - | < | ||
| - | $ cp -r / | ||
| - | $ cd / | ||
| - | $ source / | ||
| - | $ module use / | ||
| - | $ module load Base/ | ||
| - | $ module load Lammps/ | ||
| - | $ mpirun -np 4 lammps < in.lj > log.out | ||
| - | </ | ||
| - | |||
| - | Vous pouvez alors consulter le fichier log.out (et le fichier log.lammps). | ||
| - | Dans ce qui précède, remplacer nom_login par votre login PSMN, le shell utilisé est tcsh (ou csh) et on charge le modulefile '' | ||
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| - | ===== Doc admin-sys PSMN ===== | ||
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| - | ==== LAMMPS_28Jun14 ==== | ||
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| - | * Construction avec Intel 14.0.1 et OpenMPI 1.6.4 | ||
| - | |||
| - | < | ||
| - | cd lammps-28Jun14 | ||
| - | cp MAKE/ | ||
| - | </ | ||
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| - | <code Modifier Makefile.openmpi-1.6.4-intel-14.0.1-debian7> | ||
| - | CC = mpic++ | ||
| - | CCFLAGS = | ||
| - | LINK = mpic++ | ||
| - | MPI_INC, MPI_PATH, MPI_LIB = | ||
| - | FFT_INC, FFT_PATH, FFT_LIB = | ||
| - | </ | ||
| - | |||
| - | <code Pour les paquets additionnels CLASS2, MOLECULE, RIGID, | ||
| - | $ make yes-class2 | ||
| - | $ make yes-molecule | ||
| - | $ make yes-rigid | ||
| - | $ make yes-user-cg-cmm | ||
| - | $ make yes-user-omp | ||
| - | </ | ||
| - | |||
| - | < | ||
| - | make openmpi-1.6.4-intel-14.0.1-debian7 | ||
| - | </ | ||