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documentation:tools:software:quip [2020/12/07 14:24] – créée cicalugadocumentation:tools:software:quip [2025/03/12 15:09] (Version actuelle) – supprimée ltaulell
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-====== QUIP ====== 
  
-^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ 
-|  30Nov20  |  openmpi-3.0.0-intel/2017.4  |  Infiniband  | /applis/PSMN/debian9/software/Local/quip_gap/30Nov20/QUIP/  |  Debian 9  | 
-| | **modulefile** : QUIP/30Nov20-gap |||| 
- 
- 
- 
- 
-<note important> Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]]</note>  
- 
-  * Test de fonctionnement  
- 
- 
-Creation du fichier test.xyz : 
- 
-<code> 
-ccalugar@e5-2670comp1:~/Tests/Test_quip_gap$ cat test.xyz 
-4 
-Lattice="3.61 0 0 0 3.61 0 0 0 3.61" Properties=species:S:1:pos:R:3 
-Cu     0.000 0.000 0.000 
-Cu     0.000 1.805 1.805 
-Cu     1.805 0.000 1.805 
-Cu     1.805 1.805 0.000 
-</code> 
- 
-Lancer quip 
- 
-<code> 
-quip atoms_filename=test.xyz init_args='IP LJ'     param_filename=/applis/PSMN/debian9/software/Local/quip_gap/30Nov20/QUIP/share/Parameters/ip.parms.LJ.xml E 
-</code> 
- 
-Output : 
- 
-<code> 
-libAtoms::Hello World: 01/12/2020   20:02:46 
-libAtoms::Hello World: git version  https://github.com/libAtoms/QUIP.git,357e28d15-dirty 
-libAtoms::Hello World: QUIP_ARCH    linux_x86_64_gfortran 
-libAtoms::Hello World: compiled on  Dec  1 2020 at 18:50:40 
-libAtoms::Hello World: Random Seed = 72166173 
-libAtoms::Hello World: global verbosity = 0 
- 
-Calls to system_timer will do nothing by default 
- 
-Using calc args: 
-Using pre-relax calc args: 
-Using param_filename: /applis/PSMN/debian9/software/Local/quip_gap/30Nov20/QUIP/share/Parameters/ip.parms.LJ.xml 
-Using init args: IP LJ 
-Potential containing potential 
-IP : 1 
-IPModel_LJ : Lennard-Jones 
-IPModel_LJ : n_types = 3 cutoff = 7.5000000000000000 only_inter_resid = F do_tail_corrections = F 
-IPModel_LJ : type 1 atomic_num 29 
-IPModel_LJ : type 2 atomic_num 79 
-IPModel_LJ : type 3 atomic_num 47 
-Energy=4915.3690398220069 
-Cell Volume: 47.045880999999994 A^3 
-AT 4 
-AT energy=4915.3690398220069 cutoff=7.50000000 nneightol=1.20000000 pbc="T T T" Lattice="3.61000000       0.00000000       0.00000000       0.00000000       3.61000000       0.00000000       0.00000000       0.00000000       3.61000000" Properties=species:S:1:pos:R:3:Z:I:1:map_shift:I:3:n_neighb:I:1 
-AT Cu              0.00000000      0.00000000      0.00000000      29                       176 
-AT Cu              0.00000000      1.80500000      1.80500000      29            -1      -1     176 
-AT Cu              1.80500000      0.00000000      1.80500000      29      -1            -1     176 
-AT Cu              1.80500000      1.80500000      0.00000000      29      -1      -1           176 
- 
-libAtoms::Finalise: 01/12/2020   20:02:46 
-libAtoms::Finalise: Bye-Bye! 
-</code> 
- 
-Note : The directory contains other examples of predefined structures : 
- 
-<code> 
-ll /applis/PSMN/debian9/software/Local/quip_gap/30Nov20/QUIP/STRUCTS_DIR 
-total 88 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp  115 Dec  1 19:14 bcc_sc.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp  101 Dec  1 19:14 bcc.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp  125 Dec  1 19:14 beta_Sn.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp  216 Dec  1 19:14 dia_sc.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp  122 Dec  1 19:14 dia.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp  124 Dec  1 19:14 fcc_100.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp  184 Dec  1 19:14 fcc_110.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp  179 Dec  1 19:14 fcc_111_rect.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp  135 Dec  1 19:14 fcc_111.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp  137 Dec  1 19:14 fcc_sc.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp   99 Dec  1 19:14 fcc.xyz 
--rwxr-xr-x 1 ccalugar cbp  230 Dec  1 19:14 hcp_ortho.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp  158 Dec  1 19:14 hcp.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp  119 Dec  1 19:14 NaCl.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp  101 Dec  1 19:14 sc.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp  125 Dec  1 19:14 sh.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp 2176 Dec  1 19:14 skutterudite_filled_sc.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp 1543 Dec  1 19:14 skutterudite_filled.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp 2055 Dec  1 19:14 skutterudite_unfilled_cubic.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp 1460 Dec  1 19:14 skutterudite_unfilled.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp  329 Dec  1 19:14 trigonal.xyz 
--rw-r--r-- 1 ccalugar cbp  126 Dec  1 19:14 zinc_blende.xyz 
-</code> 
documentation/tools/software/quip.1607351056.txt.gz · Dernière modification : 2020/12/07 14:24 de cicaluga