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Bismark

A tool to map bisulfite converted sequence reads and determine cytosine methylation states

Version	Compilateur	Interconnexion	chemin d'accès	OS
0.15.0	N/A	N/A	/applis/PSMN/generic/Bismark/0.15.0/bin/	Debian 7
	modulefile : Bismark/0.15.0
0.18.0	N/A	N/A	/applis/PSMN/generic/Bismark/0.18.0/bin/	Debian 7
	modulefile : Bismark/0.18.0

Pour utiliser les modulefiles, consulter Environment Modules

Dépendances sur Bowtie/2.2.4 et SAMtools/1.1 incluses dans le modulefile Bismark/0.15.0.
Dépendances sur Bowtie/2.3.3 et SAMtools/1.3.1 incluses dans le modulefile Bismark/0.18.0.

Site officiel

documentation/tools/software/bismark.1507901106.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)

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