Ceci est une ancienne révision du document !
FASTX-Toolkit
- The FASTX-Toolkit is a collection of command line tools for Short-Reads FASTA/FASTQ files preprocessing.
| Version | Compilateur | Interconnexion | chemin d'accès | OS |
|---|---|---|---|---|
| 0.0.14-3 | gcc-6.3.0 | N/A | /usr/bin | Debian 9 |
| modulefile : aucun | ||||
| 0.0.14 | GCC/7.2.0 | N/A | ${APPLIS}/Compiler/GCC/7.2.0/FASTX-Toolkit/0.0.14 | Debian 9 |
| modulefile : GCC/7.2.0/FASTX-Toolkit/0.0.14 | ||||
APPLIS=/applis/PSMN/debian9/software
Site officiel
Remarques d'utilisation
- La version 0.0.14 utilise des fastq en version Phred33, alors que les plus anciennes versions de FASTK-Tools utilisaient phred64. L'option
-Q64permet de revenir au comportement des versions antérieures.