Ceci est une ancienne révision du document !
RSEM
- RNA-Seq by Expectation-Maximization, accurate transcript quantification from RNA-Seq data with or without a reference genome.
| Version | Compilateur | Interconnexion | chemin d'accès | OS |
|---|---|---|---|---|
| 1.3.0 | gcc 7.2.0 | N/A | ${SITE}/Compiler/GCC/7.2.0/RSEM/1.3.0 | Debian 9 |
modulefile : GCC/7.2.0/RSEM/1.3.0 |
||||
| 1.2.19 | gcc 4.7.2 | N/A | /applis/PSMN/debian7/RSEM/1.2.19 | Debian 7 |
| modulefile : RSEM/1.2.19 | ||||
Le modulefile
GCC/7.2.0/RSEM/1.3.0 charge les dépendances GCC/6.4.0/Bowtie2/2.3.3 et R/3.4.0.
Le modulefile charge les dépendances Bowtie/2.2.4 et R/3.0.2.