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TopHat 2
- a fast splice junction mapper for RNA-Seq reads.
| Version | Compilateur | Interconnexion | chemin d'accès | OS |
|---|---|---|---|---|
| 2.1.1 | N/A | N/A | /applis/PSMN/generic/TopHat/2.1.1/x86_64 | generic |
| modulefile : TopHat/2.1.1 | ||||
| 2.0.13 | N/A | N/A | /applis/PSMN/generic/TopHat/2.0.13/x86_64 | generic |
| modulefile : TopHat/2.0.13 | ||||
La dépendance sur Bowtie (2.2.4 ou 2.2.9) est incluse dans les modulefiles.
Pour utiliser les modules, consulter Environment Modules
TopHat 2.1.1 ne compile qu'avec GCC 5.4.0 (on ne peut pas utiliser une version plus récente du compilateur…)