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Synthèse d’inhibiteurs potentiels de l’intégrase du retrovirus RAV-1

Synthèse d’inhibiteurs potentiels de l’intégrase du retrovirus RAV-1

Les rétrovirus sont des virus enveloppés à ARN simple brin, responsables de nombreuses maladies animales et humaines. Le représentant le plus connu est le Virus de l’Immunodéficience Humaine (VIH), responsable du SIDA. On trouve des virus de cette famille chez les animaux d’élevages, les chevaux et les animaux de compagnie comme le chat.  Récemment, l’équipe du Pr P. Gouet (IBCP Lyon) a découvert que le domaine catalytique central de l’integrase (IN) du rétrovirus aviaire "Rous Associated Virus type 1" (RAV-1, qui est un bon modèle d’étude du VIH) pouvait s’associer suivant un nouveau type d’interface de dimérisation stabilisée par trois paires d’hélices alpha. Cette interface moléculaire est radicalement différente de celle observée dans toutes les autres structures d’IN publiées à ce jour. De plus, une cavité enfouie dans la nouvelle interface qui accueille une molécule d’acide 2-(N-morpholino)-éthanesulfonique (MES), tampon utilisé pour la cristallisation, a été identifiée. Le MES pourrait donc participer à la stabilisation de l’interface sous cette forme.